BioLiP

>protein
AMTTYTSIANVIKERRSVRTFTDKAVEKDLLIELLNDATWAPNHKHREPWNCKLYIGEGRKKLVDAVLNSFTEEERAKRG
KILSDRFLSTPAQIVVYMNEDPRQIQRDEDYAATCAFMQNFQLLAWERGLGCVWKSGGLNYNPLFIEGIGLTRGQRIVGI
LHIGYFDKAPEGKARTPITEKMEIIEG

The query sequence (length=187) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2i7h:A	187	187	1.0000	1.0000	1.0000	1.81e-141	2i7h:B, 2i7h:C, 2i7h:D
2	3bm1:A	177	154	0.2460	0.2599	0.2987	4.06e-13	3bm1:B
3	7tmf:B	183	173	0.2406	0.2459	0.2601	5.26e-11	7tmf:A, 7tmg:A, 7tmg:B
4	3k6h:A	191	184	0.2460	0.2408	0.2500	1.49e-09	3k6h:B
5	4dn2:A	191	181	0.2781	0.2723	0.2873	3.52e-09	4dn2:B
6	8dil:A	175	158	0.2086	0.2229	0.2468	1.01e-07	8dil:B, 8dil:C, 8dil:D, 8dil:E, 8dil:F
7	7dp0:A	223	61	0.1176	0.0987	0.3607	2.69e-06	7dp0:B, 7dp1:A, 7dp1:B, 7dp2:A, 7dp2:B
8	3e39:A	175	133	0.1925	0.2057	0.2707	2.97e-06	3e39:B
9	3ek3:A	187	189	0.2353	0.2353	0.2328	8.53e-06
10	2wzv:B	223	64	0.1016	0.0852	0.2969	2.26e-05	2wzv:A, 2wzw:A, 2wzw:B
11	3ge5:A	176	164	0.2353	0.2500	0.2683	2.79e-05	3ge5:B
12	3gfa:A	197	197	0.2193	0.2081	0.2081	7.92e-05	3gfa:B
13	5j6c:A	173	123	0.1818	0.1965	0.2764	1.51e-04	5j6c:B
14	4xoq:A	204	186	0.2620	0.2402	0.2634	2.72e-04	4xoo:A, 4xoo:B, 4xoo:C, 4xoo:D, 4xoq:B, 4xoq:C, 4xoq:D
15	3koq:A	173	182	0.2727	0.2948	0.2802	3.66e-04	3h4o:A, 3koq:B, 3koq:C, 3koq:D
16	3eo8:A	219	219	0.2406	0.2055	0.2055	5.46e-04	3eo8:B, 3eo8:C, 3eo8:D, 3eo8:E, 3eo8:F
17	3m5k:A	168	126	0.1818	0.2024	0.2698	5.80e-04	3m5k:B
18	3kwk:A	168	126	0.1818	0.2024	0.2698	0.001
19	2isj:A	219	179	0.2193	0.1872	0.2291	0.002	2isj:B, 2isj:C, 2isj:D, 2isj:E, 2isj:F, 2isj:G, 2isj:H, 2isk:A, 2isk:B, 2isk:C, 2isk:D, 2isk:E, 2isk:F, 2isk:G, 2isk:H, 2isl:A, 2isl:B, 2isl:C, 2isl:D, 2isl:E, 2isl:F, 2isl:G, 2isl:H
20	3gr3:A	226	56	0.0963	0.0796	0.3214	0.002	3gr3:B
21	3ge6:A	210	48	0.0856	0.0762	0.3333	0.002	3ge6:B
22	2b67:A	201	198	0.2353	0.2189	0.2222	0.003	2b67:B, 2b67:C, 2b67:D
23	3eof:A	248	193	0.2460	0.1855	0.2383	0.007	3eof:B
24	5uu6:C	236	184	0.2193	0.1737	0.2228	0.008	5uu6:A, 5uu6:B, 5uu6:D
25	5ko7:B	200	40	0.0642	0.0600	0.3000	0.008
26	5j62:B	209	42	0.0802	0.0718	0.3571	0.009	5j62:A
27	5ko8:B	218	40	0.0642	0.0550	0.3000	0.012	5ko7:A, 5ko8:A, 5krd:A, 5krd:B
28	3e10:B	167	127	0.1872	0.2096	0.2756	0.023	3e10:A
29	4g8s:A	182	184	0.2620	0.2692	0.2663	0.086	4g8s:B
30	2fre:A	200	37	0.0695	0.0650	0.3514	0.11	2fre:B
31	3gag:A	206	44	0.0802	0.0728	0.3409	0.19	3gag:B, 3gag:C, 3gag:D
32	1bkj:A	230	59	0.1070	0.0870	0.3390	0.24	1bkj:B, 2bkj:A, 2bkj:B
33	4ttb:A	189	40	0.0695	0.0688	0.3250	0.25	4ttb:B
34	8uc3:A	180	116	0.1551	0.1611	0.2500	0.29	8uc3:B
35	4ttc:A	220	40	0.0695	0.0591	0.3250	0.30	4ttc:B, 4ttc:C, 4ttc:D, 4ttc:E, 4ttc:F, 5yak:A, 5yak:F, 5yak:B, 5yak:C, 5yak:D, 5yak:E
36	3gb5:A	185	41	0.0695	0.0703	0.3171	0.34	3to0:A, 3to0:B
37	3gbh:B	213	96	0.1123	0.0986	0.2188	0.58	3gbh:A, 3gbh:C, 3gbh:D
38	3tnz:A	222	41	0.0695	0.0586	0.3171	0.91	3gfd:A, 3gfd:B, 3gh8:A, 3gh8:B, 3gh8:C, 3gh8:D, 3gh8:E, 3gh8:F, 3gh8:G, 3gh8:H, 3tnz:B
39	1nox:A	200	39	0.0749	0.0700	0.3590	1.5
40	4ewv:B	492	45	0.0802	0.0305	0.3333	2.7	4ewv:A
41	6pz0:A	185	175	0.2139	0.2162	0.2286	4.7	6pz0:B, 6q1b:A, 6q1b:B, 6q1l:A, 6q1l:B, 6tyk:A, 6tyk:B
42	4m7j:H	219	64	0.0856	0.0731	0.2500	8.8	2d03:H, 4m93:B, 4ma1:B
43	5xxb:L	131	34	0.0749	0.1069	0.4118	9.6

[Back]