BioLiP

>protein
AMSDSLRIIFAGTPDFAARHLGALLSSQHKIVGVFTQPDRPLTPSPVKILAEHHGIPVFQPKSLRPEENQHLVADLNADI
MVVVAYGLILPAAVLAMPRLGCINVHGSLLPRWRGAAPIQRSVWAGDEKTGITIMQMDIGLDTGAMLHKIECAIQPEDTS
ATLYDKLAQLGPQGLLITLQQLAAGTALAEVQNETQATYAEKLSKEEAKLDWTLSATQLERCIRAFNPWPVSYFIVDEQP
IKVWQAQVLPAGEDAEPGTIIHADKHGIQVATADGVLNITQLQPAGKKAMSAADLLNSRREWFIPGSQL

The query sequence (length=309) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3r8x:A	309	309	1.0000	1.0000	1.0000	0.0
2	2fmt:A	314	313	0.7508	0.7389	0.7412	1.07e-175	2fmt:B
3	1z7e:D	644	289	0.2848	0.1366	0.3045	5.03e-36	2bln:A, 2bln:B, 5j63:A, 5j63:B, 5j63:C, 5j63:D, 1z7e:A, 1z7e:B, 1z7e:C, 1z7e:E, 1z7e:F
4	2cfi:A	310	254	0.2718	0.2710	0.3307	1.55e-33	1s3i:A
5	4qpd:A	308	250	0.2557	0.2565	0.3160	3.62e-31	4qpd:B, 4tt8:A, 4tts:A
6	8gjh:A	639	277	0.2589	0.1252	0.2888	9.22e-31	8gjh:B, 8gjh:C, 8gjh:D, 8gjh:E, 8gjh:F
7	5uin:A	399	174	0.1489	0.1153	0.2644	6.72e-15	5uij:A, 5uij:B, 5uik:A, 5uik:B, 5uil:A, 5uil:B, 5uim:A, 5uim:B, 5uin:B
8	4xcz:A	397	174	0.1424	0.1108	0.2529	2.63e-14	4xd0:A, 4xd1:A
9	5vyt:C	256	184	0.1586	0.1914	0.2663	2.82e-14	5vyr:A, 5vyr:B, 5vys:A, 5vys:B, 5vyt:A, 5vyt:B, 5vyt:D, 5vyu:A, 5vyu:B
10	6mfz:A	1789	117	0.1359	0.0235	0.3590	3.42e-09	5es7:A, 5es8:A, 5es8:B, 5es9:A, 6mfw:A, 6mfx:A, 6mfy:A, 6mg0:A, 6ulz:A
11	6mg0:B	1687	117	0.1359	0.0249	0.3590	3.95e-09
12	6edk:A	193	95	0.1003	0.1606	0.3263	8.78e-09	6ci4:A, 6ci5:A
13	5vyq:A	235	153	0.1553	0.2043	0.3137	9.90e-09	4q12:A, 4q12:B, 5vyq:B
14	7n7b:B	271	233	0.1553	0.1771	0.2060	6.39e-08	7n7b:A, 7n7c:A, 7n7c:B
15	4lxq:B	274	151	0.1036	0.1168	0.2119	2.20e-06	4lxq:A, 4lxt:A, 4lxt:B, 4lxu:A, 4lxu:B, 4lxx:A, 4lxx:B, 4lxy:A, 4lxy:B, 4ly0:A, 4ly0:B, 4ly3:A, 4ly3:B
16	6v2t:B	251	123	0.1197	0.1474	0.3008	4.88e-05	6v2t:A
17	4yfy:A	241	108	0.1036	0.1328	0.2963	6.86e-05	4yfy:B
18	2ywr:A	216	106	0.0906	0.1296	0.2642	3.02e-04
19	4ew2:A	205	115	0.0874	0.1317	0.2348	0.001	4ew3:A, 8fdx:A, 8fdy:A, 8fdz:A, 8fe0:A, 8fjv:A, 8fjw:A, 8fjx:A, 8fjy:A, 5j9f:A, 7jg0:A, 7jg3:A, 7jg4:A, 1men:A, 1men:B, 1men:C, 1njs:A, 1njs:B, 1rbm:A, 1rbm:B, 1rbq:A, 1rbq:B, 1rbq:C, 1rbq:D, 1rby:A, 1rby:B, 1rby:C, 1rby:D, 1rbz:A, 1rbz:B, 1rc0:A, 1rc0:B, 1rc1:A, 1rc1:B, 1zly:A, 4zyt:A, 4zyu:A, 4zyv:A, 4zyw:A, 4zyx:A, 4zyy:A, 4zyz:A, 4zz0:A, 4zz1:A, 4zz2:A, 4zz3:A
20	6nbp:A	246	89	0.0971	0.1220	0.3371	0.003
21	3da8:A	213	89	0.0777	0.1127	0.2697	0.008	3da8:B, 3dcj:A, 3dcj:B
22	1c2t:A	209	89	0.0712	0.1053	0.2472	0.017	1c2t:B, 1c3e:A, 1c3e:B, 1cde:A, 1cde:B, 1cde:C, 1cde:D, 1gar:A, 1gar:B, 1jkx:A, 1jkx:B, 1jkx:C, 1jkx:D
23	6v33:A	246	92	0.0841	0.1057	0.2826	0.019	6v33:B
24	6c32:A	209	140	0.1100	0.1627	0.2429	0.27	6c37:A
25	8tj5:T	801	39	0.0453	0.0175	0.3590	1.3	8tj5:R
26	2x3b:A	295	115	0.0971	0.1017	0.2609	1.5	2x3a:A, 2x3b:B, 2x3c:A
27	7nkg:B	432	131	0.0939	0.0671	0.2214	2.9	7nkg:E, 7nkg:H, 7nkg:K
28	1jju:B	337	121	0.1100	0.1009	0.2810	3.5	1pby:B
29	2vxc:A	223	54	0.0583	0.0807	0.3333	4.4
30	4egs:A	147	94	0.0744	0.1565	0.2447	8.0	4egs:B

[Back]