BioLiP

>protein
AMKLMEVSPLFPCIFLRRVNRFVGLVRIKERIERALITNTGRLNEFMIPGRIGYCTPKAGGKTRYILLGFEDHGKIAIID
TRLQGKAFEKIIEKELLPELEGCRIIKREPRVGESRLDYLIECSKGEIFVETKSAVLREGEYAMYPDCPSVRGQRHIKEL
IKLARDGKRAMIVFIGALPNVSKFKPYKKGDPKIAELLKEALEAGVEIRALGLHMELSGEIIYRGELGVEI

The query sequence (length=231) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4da2:A	231	231	1.0000	1.0000	1.0000	1.17e-165	4da2:B, 4dav:A, 4dav:B
2	5nno:A	484	157	0.1515	0.0723	0.2229	0.052	5nno:B
3	7nvo:D	247	103	0.1255	0.1174	0.2816	0.20	7nvo:d
4	7x3j:D	469	103	0.1255	0.0618	0.2816	0.22
5	8sfe:d	489	103	0.1255	0.0593	0.2816	0.26	8sfe:D
6	7x0s:I	521	103	0.1255	0.0557	0.2816	0.28	8i1u:D, 8i1u:L, 8i9u:D, 8i9u:L, 7nvl:D, 7nvl:d, 7nvm:D, 7nvm:d, 7nvn:D, 7nvn:d, 8sff:D, 8sff:d, 8sg8:D, 8sg8:d, 8sg9:D, 8sg9:d, 8sgc:D, 8sgc:d, 8sgl:D, 8sgl:d, 8sgq:D, 8sgq:d, 8sh9:D, 8sh9:d, 8sha:D, 8sha:d, 8shd:D, 8shd:d, 8she:D, 8she:d, 8shf:D, 8shf:d, 8shg:D, 8shg:d, 8shl:D, 8shl:d, 8shn:D, 8shn:d, 8sho:D, 8sho:d, 8shp:D, 8shp:d, 8shq:D, 8shq:d, 8sht:D, 8sht:d, 7trg:F, 7ttn:F, 7ttt:F, 7tub:F, 7x0s:M, 7x0v:I, 7x0v:M, 7x3j:d, 7x3u:d
7	7x3u:D	439	103	0.1255	0.0661	0.2816	0.35
8	1onk:B	263	58	0.0606	0.0532	0.2414	0.92	3d7w:B, 1oql:B, 1pum:B, 1puu:B, 2r9k:B, 2rg9:B, 1sz6:B, 1tfm:B, 1yf8:B
9	4v8p:AP	66	56	0.0779	0.2727	0.3214	1.7	4v8p:DP, 4v8p:FP, 4v8p:HP
10	4f66:A	478	93	0.1039	0.0502	0.2581	2.2	4f66:B, 4f79:A, 4gpn:A, 4gpn:B
11	9ft0:G	243	79	0.0866	0.0823	0.2532	6.9	5ahj:G, 5bou:G, 8bw1:G, 5bxl:G, 5bxn:G, 5cgf:G, 5cgg:G, 5cgh:G, 5cgi:G, 5cz4:G, 5cz5:G, 5cz6:G, 5cz7:G, 5cz8:G, 5cz9:G, 5cza:G, 5d0s:G, 5d0t:G, 5d0v:G, 5d0w:G, 5d0x:G, 5d0z:G, 5dki:G, 5dkj:G, 5fg7:G, 5fg9:G, 5fga:G, 5fgd:G, 5fge:G, 5fgf:G, 5fgg:G, 5fgh:G, 5fgi:G, 5fhs:G, 9fst:G, 9fsv:G, 9ft1:G, 1g0u:G, 1g0u:U, 4g4s:A, 1g65:G, 6g7f:G, 6g8m:G, 6g8n:G, 6gop:G, 6h39:G, 6htb:G, 6htc:G, 6htd:G, 6htp:G, 6htr:G, 6hub:G, 6huc:G, 6huq:G, 6huu:G, 6huv:G, 6hv3:G, 6hv4:G, 6hv5:G, 6hv7:G, 6hva:G, 6hvr:G, 6hvs:G, 6hvt:G, 6hvu:G, 6hvv:G, 6hvw:G, 6hvx:G, 6hvy:G, 6hw0:G, 6hw3:G, 6hw4:G, 6hw5:G, 6hw6:G, 6hw7:G, 6hw8:G, 6hw9:G, 6hwa:G, 6hwb:G, 6hwc:G, 6hwd:G, 6hwe:G, 6hwf:G, 1jd2:G, 5jhr:G, 5jhs:G, 5l52:G, 5l54:G, 5l55:G, 5l5a:G, 5l5b:G, 5l5d:G, 5l5e:G, 5l5f:G, 5l5h:G, 5l5i:G, 5l5j:G, 5l5o:G, 5l5p:G, 5l5q:G, 5l5r:G, 5l5s:G, 5l5t:G, 5l5u:G, 5l5v:G, 5l5w:G, 5l5x:G, 5l5y:G, 5l5z:G, 5l60:G, 5l61:G, 5l62:G, 5l63:G, 5l64:G, 5l65:G, 5l66:G, 5l67:G, 5l68:G, 5l69:G, 5l6a:G, 5l6b:G, 5l6c:G, 5lai:G, 5laj:G, 5ltt:G, 5m2b:G, 3mg4:G, 3mg6:G, 3mg7:G, 3mg8:G, 4nnn:G, 4nnw:G, 4no1:G, 4no6:G, 4no8:G, 4no9:G, 7o2l:G, 3oeu:G, 3oev:G, 8ohz:G, 8oi1:G, 8olr:G, 4qby:G, 4qlq:G, 4qls:G, 4qlt:G, 4qlu:G, 4qlv:G, 4qux:G, 4quy:G, 4qv0:G, 4qv1:G, 4qv3:G, 4qv4:G, 4qv5:G, 4qv6:G, 4qv7:G, 4qv8:G, 4qv9:G, 4qvl:G, 4qvm:G, 4qvn:G, 4qvp:G, 4qvq:G, 4qvv:G, 4qvw:G, 4qvy:G, 4qw0:G, 4qw1:G, 4qw3:G, 4qw4:G, 4qw5:G, 4qw6:G, 4qw7:G, 4qwf:G, 4qwg:G, 4qwi:G, 4qwj:G, 4qwk:G, 4qwl:G, 4qwr:G, 4qwu:G, 4qwx:G, 4qxj:G, 4qz0:G, 4qz2:G, 4qz3:G, 4qz4:G, 4qz5:G, 4qz6:G, 4qz7:G, 4qzw:G, 4qzx:G, 4qzz:G, 4r00:G, 4r02:G, 4r17:G, 4r18:G, 8rhj:G, 8rhk:G, 8rhl:G, 4rur:G, 1ryp:A, 1ryp:O, 3sdi:G, 3sdi:U, 3sdk:G, 4y69:G, 4y6a:G, 4y6v:G, 4y6z:G, 4y70:G, 4y74:G, 4y75:G, 4y77:G, 4y78:G, 4y7w:G, 4y7x:G, 4y7y:G, 4y80:G, 4y81:G, 4y82:G, 4y84:G, 4y8g:G, 4y8h:G, 4y8i:G, 4y8j:G, 4y8k:G, 4y8l:G, 4y8m:G, 4y8n:G, 4y8o:G, 4y8p:G, 4y8q:G, 4y8r:G, 4y8s:G, 4y8t:G, 4y8u:G, 4y9y:G, 4y9z:G, 4ya0:G, 4ya1:G, 4ya2:G, 4ya3:G, 4ya4:G, 4ya5:G, 4ya7:G, 4ya9:G, 4z1l:G, 6zou:G, 6zp6:G, 6zp8:G

[Back]