Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
AMKKKVLLMGKSGSGKTSMRSIIFANYIARDTRRLGATIDVEHSHVRFLGNLVLNLWDCGGLDTFMENYFTSQRDNIFRN
VEVLIYVFDVESRELEKDMHYYQSCLEAILQNSPDAKIFCLVHKMDLVQEDQRDLIFKEREEDLRRLSRPLECACFRTSI
WDETLYKAWSSIVYQLIPNVQQLEMNLRNFAQIIEADEVLLFERATFLVISHYQCKEQRDVHRFEKISNIIKQFKLSCSK
LAASFQSMEVRNSNFAAFIDIFTSNTYVMVVMSDPSIPSAATLINIRNARKHFEKLER

The query sequence (length=298) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6ces:A 300 296 0.9899 0.9833 0.9966 0.0 8dhb:B, 6s6a:A, 6s6a:B, 6s6d:A, 6s6d:B, 6sb0:C, 6sb0:I, 6sb2:C, 6sb2:I, 7t3a:K, 7t3b:D, 7t3c:D, 7t3c:K, 6u62:B, 6ulg:F, 7ux2:B, 7ux2:I, 7uxc:D, 7uxc:K, 7uxh:F, 7uxh:M, 7uxh:V, 7uxh:c, 6wj2:F, 6wj3:F
2 6nzd:F 227 286 0.7617 1.0000 0.7937 5.07e-155
3 8fw5:D 301 295 0.6544 0.6478 0.6610 3.93e-145
4 4arz:A 291 296 0.5336 0.5464 0.5372 3.69e-106 6jwp:A, 6jwp:F, 3r7w:A, 3r7w:C
5 4arz:B 304 214 0.2114 0.2072 0.2944 6.91e-17 6jwp:B, 3r7w:B, 3r7w:D
6 6ulg:G 310 215 0.1980 0.1903 0.2744 7.55e-15 8dhb:A, 3llu:A, 6nzd:G, 2q3f:A, 2q3f:B, 6s6a:C, 6s6a:D, 6s6d:D, 6sb0:D, 6sb0:J, 6sb2:D, 6sb2:J, 7t3b:E, 7t3c:E, 6u62:C, 7ux2:C, 7ux2:J, 7uxc:E, 7uxc:L, 7uxh:G, 7uxh:N, 7uxh:W, 7uxh:d, 6wj2:G, 6wj3:G
7 6s6d:C 284 215 0.1913 0.2007 0.2651 1.99e-10
8 8fw5:E 285 194 0.1611 0.1684 0.2474 3.55e-07
9 3m1i:A 200 113 0.1074 0.1600 0.2832 4.43e-06 8dyo:B, 8f19:B, 8f1e:D, 8f7a:B, 3icq:B, 3icq:C, 3wyf:A, 3wyf:D, 3wyg:A, 2x19:A, 5xoj:A
10 5xc3:A 168 150 0.1242 0.2202 0.2467 3.40e-05 5xc5:A
11 8tzf:A 1589 134 0.1141 0.0214 0.2537 3.95e-04
12 1byu:B 215 111 0.0940 0.1302 0.2523 8.39e-04 6a38:A, 6a3a:A, 6a3b:A, 6a3c:A, 6a3e:A, 3a6p:C, 3a6p:H, 7b51:B, 2bku:A, 2bku:C, 5bxq:C, 5bxq:D, 5bxq:E, 1byu:A, 4c0q:C, 4c0q:D, 3ch5:A, 5ciq:A, 5ciq:B, 5cit:A, 5cit:B, 5ciw:A, 5ciw:B, 6cit:A, 5cj2:A, 5cj2:B, 5cj2:C, 5cj2:D, 5cj2:E, 5cj2:F, 5cj2:G, 5cj2:H, 5cll:A, 5cll:C, 5clq:A, 5clq:C, 7cnd:A, 7dbg:A, 5dh9:A, 5dha:A, 5dhf:A, 5di9:A, 5dif:A, 5dis:B, 5dlq:C, 5dlq:D, 3ea5:A, 3ea5:C, 3gj0:A, 3gj0:B, 3gj3:A, 3gj4:A, 3gj4:C, 3gj5:A, 3gj5:C, 3gj6:A, 3gj7:A, 3gj7:C, 3gj8:A, 3gj8:C, 3gjx:C, 3gjx:F, 4gmx:A, 4gpt:A, 4hat:A, 4hau:A, 4hav:A, 4haw:A, 4hax:A, 4hay:A, 4haz:A, 4hb0:A, 4hb2:A, 4hb3:A, 4hb4:A, 8hq3:A, 8hq4:A, 8hq5:A, 8hq6:A, 8huf:A, 8hug:A, 1ibr:A, 1ibr:C, 8itv:A, 5jlj:A, 1k5d:A, 1k5d:D, 1k5d:G, 1k5d:J, 1k5g:A, 1k5g:D, 1k5g:G, 1k5g:J, 6kft:A, 7l5e:A, 6lq9:A, 6m60:A, 6m6x:A, 7mnp:A, 7mnp:C, 7mnq:A, 7mnr:A, 7mns:A, 7mnt:A, 7mnt:C, 7mnu:A, 7mnv:A, 7mnw:A, 7mnw:C, 7mnw:E, 7mnw:G, 7mnx:A, 7mnx:C, 7mnx:E, 7mnx:G, 7mnx:I, 7mnx:K, 7mny:A, 7mny:C, 7mny:E, 7mny:G, 7mny:I, 7mny:K, 7mnz:A, 7mnz:C, 7mnz:E, 7mnz:G, 7mnz:I, 7mnz:K, 7mo0:A, 7mo0:C, 7mo1:A, 7mo2:A, 7mo2:C, 7mo3:A, 7mo3:C, 7mo4:A, 7mo4:C, 7mo5:A, 3nby:C, 3nby:F, 3nbz:C, 3nbz:F, 3nc0:C, 3nc0:F, 3nc1:C, 4ol0:A, 6q82:B, 6q84:B, 6q84:E, 1qbk:C, 1qg2:A, 1qg4:A, 1qg4:B, 3ran:A, 3ran:B, 3ran:C, 3ran:D, 1rrp:A, 1rrp:C, 6tvo:B, 5uwh:A, 5uwi:A, 5uwj:A, 5uwo:A, 5uwp:A, 5uwq:A, 5uwr:A, 5uws:A, 5uwt:A, 5uwu:A, 5uww:A, 3w3z:B, 1wa5:A, 4wvf:A, 6x2m:A, 6x2o:A, 6x2p:A, 6x2r:A, 6x2s:A, 6x2u:A, 6x2v:A, 6x2w:A, 6x2x:A, 6x2y:A, 6xjp:A, 6xjr:A, 6xjs:A, 6xjt:A, 6xju:A, 7ypz:A, 5yro:A, 5yst:A, 5ysu:A, 5ytb:A, 5yu6:B, 5yu6:D, 3zjy:A, 3zjy:D, 3zjy:F, 5zpu:A
13 6vij:B 191 165 0.1409 0.2199 0.2545 0.002 6vii:B, 6vii:A, 6vij:A, 6vik:B
14 1ek0:A 170 147 0.1208 0.2118 0.2449 0.003
15 4zi2:A 185 90 0.0906 0.1459 0.3000 0.005 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
16 2oil:A 174 64 0.0805 0.1379 0.3750 0.007 3tso:A, 3tso:B
17 6l6o:A 165 163 0.1309 0.2364 0.2393 0.009 8jqu:A
18 1vg8:A 184 131 0.1141 0.1848 0.2595 0.017 7f6j:A, 7f6j:B, 6iyb:A, 6iyb:C, 8kb8:C, 8kb8:D, 3law:A, 3law:B, 3law:C, 3law:D, 3law:E, 1t91:A, 1t91:B, 1t91:C, 1t91:D, 1vg0:B, 1vg1:A, 1vg8:B, 1vg8:C, 1vg8:D, 1vg9:B, 1vg9:D, 1vg9:F, 1vg9:H, 6wcw:B, 1yhn:A, 5z2m:A, 5z2m:C, 8zq3:A
19 6y09:A 176 89 0.0906 0.1534 0.3034 0.019 2g77:B, 6sur:A, 6sur:B, 6sur:C, 6sur:D, 6sur:E, 6sur:F, 6y09:B, 1z06:A, 6zay:A, 6zay:B
20 2zet:A 181 164 0.1443 0.2376 0.2622 0.031 2f7s:A, 2f7s:B, 2iey:A, 2iey:B, 2iez:A, 2iez:B, 2iez:H, 2iez:I, 2if0:A, 2if0:B, 2zet:B
21 6ian:E 167 99 0.0973 0.1737 0.2929 0.032 6ia7:A, 6iae:A
22 6iae:B 148 95 0.0839 0.1689 0.2632 0.041 6ia7:B
23 7kdc:A 180 94 0.0940 0.1556 0.2979 0.050 7kdc:B
24 4ile:A 176 134 0.1208 0.2045 0.2687 0.050 2al7:A, 2h18:A, 8jc5:A, 8jc5:B, 8jca:A, 1zd9:A
25 3doe:A 189 129 0.1174 0.1852 0.2713 0.068 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
26 8tzh:A 1485 98 0.0872 0.0175 0.2653 0.069 3d6t:B
27 1yzg:A 168 93 0.0805 0.1429 0.2581 0.080
28 8u8b:A 1712 102 0.0872 0.0152 0.2549 0.083 8u7l:B, 8u7l:A, 8u8a:B, 8u8a:C, 8u8b:B, 2zej:A
29 8smc:C 1084 138 0.1141 0.0314 0.2464 0.090
30 2ew1:A 171 134 0.1275 0.2222 0.2836 0.10
31 8u7h:C 1111 138 0.1141 0.0306 0.2464 0.11
32 8fo9:A 1173 138 0.1141 0.0290 0.2464 0.13 8fo9:C
33 7rll:B 177 89 0.0772 0.1299 0.2584 0.15 7rll:A
34 5jcp:A 361 121 0.1074 0.0886 0.2645 0.18 5jcp:B
35 6hxu:A 182 133 0.1007 0.1648 0.2256 0.20 2fv8:A, 6sge:A, 6sge:C
36 2ocb:A 173 102 0.0940 0.1618 0.2745 0.21
37 7e1t:B 174 93 0.0940 0.1609 0.3011 0.22 7e1t:A, 4qxa:A, 1s8f:A, 1s8f:B, 1wms:A, 1wms:B, 1yzl:A
38 8d4c:C 180 91 0.0772 0.1278 0.2527 0.23 8d4c:H, 8d4c:D, 8d4c:F, 8d4d:C, 8d4d:H, 8d4d:D, 8d4d:F, 8d4e:C, 8d4e:H, 8d4e:Z, 8d4f:C, 8d4f:H, 8d4f:Z, 8d4f:D, 8d4f:F, 8d4f:Q, 8d4g:C, 8d4g:H, 8d4g:Z, 8d4g:D, 8d4g:F, 8d4g:Q, 8d9r:C, 8d9r:H, 8d9r:Z, 8d9r:J, 8d9r:X, 8d9r:3, 8d9r:K, 8d9r:a, 8d9r:4, 8d9r:O, 8d9r:b, 8d9r:5, 8d9r:P, 8d9r:c, 8d9r:6, 8d9r:Q, 8d9r:d, 8d9r:7, 8d9s:C, 8d9s:H, 8d9s:Z, 8d9s:J, 8d9s:X, 8d9s:3, 8d9s:K, 8d9s:a, 8d9s:4, 8d9s:O, 8d9s:b, 8d9s:5, 8d9s:P, 8d9s:c, 8d9s:6, 8d9s:Q, 8d9s:d, 8d9s:7, 8d9t:C, 8d9t:H, 8d9t:J, 8d9t:X, 8d9t:K, 8d9t:Z, 8d9t:O, 8d9t:a, 8d9t:P, 8d9t:b, 8d9t:Q, 8d9t:c, 8d9u:C, 8d9u:H, 8d9u:J, 8d9u:X, 8d9u:K, 8d9u:Z, 8d9u:O, 8d9u:a, 8d9u:P, 8d9u:b, 8d9u:Q, 8d9u:c, 8d9v:C, 8d9v:H, 8d9v:D, 8d9v:F, 8d9w:F, 8d9w:I, 1hur:A, 1hur:B, 7ux3:C, 7ux3:H
39 1z6x:A 175 91 0.0772 0.1314 0.2527 0.23 1z6x:B
40 1zj6:A 173 93 0.0805 0.1387 0.2581 0.25 2h16:A, 2h16:B, 2h16:C, 2h16:D, 2h17:A, 1z6y:A, 1z6y:B
41 2hxs:A 178 126 0.0839 0.1404 0.1984 0.27 3e5h:A
42 6o62:A 169 176 0.1309 0.2308 0.2216 0.27
43 6hh2:A 174 147 0.1242 0.2126 0.2517 0.30 8fo2:B
44 6kyk:C 169 151 0.1174 0.2071 0.2318 0.32 3brw:D, 1c1y:A, 7c7i:A, 7c7i:B, 7c7j:A, 7c7j:B, 4dxa:A, 1gua:A, 4hdo:B, 4hdq:B, 5kho:C, 5kho:D, 3kuc:A, 4kvg:A, 4kvg:C, 6kyk:D, 6kyk:E, 6kyk:F, 4m8n:E, 4m8n:F, 4m8n:G, 4m8n:H, 6oq3:B, 6oq4:B, 8su8:B, 8t09:B, 8t7v:B, 6uzk:B, 3x1w:A, 3x1x:A, 3x1y:A, 3x1z:A, 3x1z:B
45 2o52:A 167 136 0.1040 0.1856 0.2279 0.35 2o52:B
46 6a8d:A 181 132 0.1040 0.1713 0.2348 0.36
47 8fo9:F 2289 104 0.0940 0.0122 0.2692 0.36 9c61:A, 9c61:B, 8fo2:E, 8fo7:C, 8fo8:C, 8fo8:E, 8fo9:E, 7lht:A, 7lht:B, 7lhw:A, 7li3:A, 7li4:A, 6oje:A, 6oje:B, 6ojf:A, 6ojf:B, 7thy:A, 7thz:A, 6xaf:A, 6xaf:B, 2zej:B
48 1x3s:A 177 95 0.0973 0.1638 0.3053 0.41
49 1ky2:A 180 147 0.1208 0.2000 0.2449 0.48 1ky3:A, 4phf:A, 4phg:A, 4phh:A, 4phh:B, 4phh:C, 4phh:D
50 3q8x:D 271 18 0.0436 0.0480 0.7222 0.50
51 1upt:G 170 86 0.0705 0.1235 0.2442 0.64 4dcn:A, 4dcn:B, 5ee5:B, 5j5c:A, 1r4a:A, 1r4a:B, 1r4a:C, 1r4a:D, 1upt:A, 1upt:C, 1upt:E
52 6bbp:A 520 94 0.0772 0.0442 0.2447 0.68 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
53 2k5u:A 181 90 0.0738 0.1215 0.2444 0.69 2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
54 6vno:A 1084 132 0.1107 0.0304 0.2500 0.77 6vp6:A
55 3cpj:B 164 179 0.1208 0.2195 0.2011 0.87
56 6cc9:B 185 66 0.0570 0.0919 0.2576 0.99 121p:A, 221p:A, 421p:A, 521p:A, 621p:A, 721p:A, 821p:A, 7a1w:A, 7a1x:A, 7a1y:A, 7a47:A, 7a47:C, 7a47:E, 1aa9:A, 7aca:A, 7aca:C, 7aca:B, 7aca:D, 7acf:A, 7acf:D, 7acf:B, 7acf:C, 7ach:A, 7ach:B, 7acq:A, 7acq:B, 7acq:C, 8afb:A, 8afc:A, 8afd:A, 8afd:B, 8afd:C, 8afd:D, 1agp:A, 6amb:A, 8aq5:A, 8aq7:A, 8aq7:B, 6ark:A, 6asa:A, 6ase:A, 9ax6:A, 9ax6:B, 8azr:A, 8azv:A, 8azx:A, 8azy:A, 8azz:A, 6b0v:A, 6b0v:B, 6b0y:A, 6b0y:B, 8b00:A, 5b2z:A, 5b30:A, 8b69:B, 8b69:D, 8b6i:A, 8b6i:B, 8b78:A, 8be3:R, 8be3:A, 9bfy:A, 9bfy:B, 9bg1:A, 9bg1:B, 8blr:A, 6bof:A, 6bof:B, 8bos:R, 6bvi:A, 6bvj:A, 6bvk:A, 6bvl:A, 6bvm:A, 8bwg:R, 7c40:A, 7c41:A, 7c41:J, 7c41:M, 7c41:G, 2c5l:A, 2c5l:B, 6cch:B, 6ccx:B, 2ce2:X, 1clu:A, 2cl0:X, 2cl6:X, 2cl7:X, 2clc:X, 2cld:X, 8cnj:A, 8cnj:B, 8cnn:A, 8cpr:A, 1crp:A, 1crq:A, 1crr:A, 1ctq:A, 6cu6:A, 6cu6:B, 6cuo:A, 6cup:A, 6cur:A, 8cx5:A, 8cx5:B, 6d55:A, 6d56:A, 6d59:A, 6d5e:A, 6d5g:A, 6d5h:A, 6d5j:A, 6d5l:A, 6d5m:Q, 6d5v:Q, 6d5w:Q, 3ddc:A, 8dgs:E, 8dgt:F, 4dlr:A, 4dls:A, 4dlt:A, 4dlu:A, 4dlv:A, 4dlw:A, 4dlx:A, 4dly:A, 4dlz:A, 8dni:A, 8dnj:A, 8dnj:B, 8dnj:C, 8dnk:A, 7dph:A, 7dpj:A, 4dsn:A, 4dso:A, 4dst:A, 4dsu:A, 6dzh:A, 6dzh:B, 6dzh:C, 6e6c:A, 6e6f:A, 6e6f:B, 6e6g:A, 6e6p:A, 6e6p:B, 6e6p:C, 5e95:A, 8ebz:A, 8ecr:A, 8ecr:B, 8edy:A, 8eer:A, 4efl:A, 4efm:A, 4efn:A, 8eie:A, 8elk:A, 8elr:A, 8els:A, 8elt:A, 8elu:A, 8elv:A, 8elw:A, 8elx:A, 8ely:A, 8elz:A, 8em0:A, 4epr:A, 4ept:A, 4epv:A, 4epw:A, 4epx:A, 4epy:A, 8epw:A, 2evw:X, 7ew9:A, 7ew9:B, 7ew9:C, 7ewa:A, 7ewa:B, 7ewa:C, 7ewb:A, 7ewb:B, 7ewb:C, 7eyx:A, 8ezg:A, 7f0w:A, 8f0m:A, 8f0m:C, 5f2e:A, 6f76:B, 6f76:A, 6f76:C, 6f76:D, 6f76:E, 6f76:F, 6fa1:B, 6fa1:A, 6fa1:C, 6fa1:D, 6fa1:E, 6fa1:F, 6fa2:A, 6fa2:B, 6fa2:C, 6fa2:D, 6fa2:E, 6fa2:F, 6fa3:B, 6fa3:A, 6fa3:C, 6fa3:D, 6fa3:E, 6fa3:F, 6fa4:B, 6fa4:A, 6fa4:C, 6fa4:D, 6fa4:E, 6fa4:F, 8fg3:A, 8fg4:A, 8fmi:A, 8fmj:A, 8fmk:A, 4g0n:A, 4g3x:A, 8g42:B, 8g47:B, 8g4f:B, 8g4h:B, 8g9p:A, 8g9p:B, 8g9q:A, 3gft:A, 3gft:B, 3gft:C, 3gft:D, 3gft:E, 3gft:F, 6gj5:A, 6gj5:B, 6gj6:A, 6gj7:A, 6gj8:A, 1gnp:A, 1gnq:A, 1gnr:A, 6god:A, 6goe:A, 6gof:A, 6gog:A, 6gog:B, 6gog:C, 6gog:D, 6gog:E, 6gog:F, 6gom:A, 6gom:B, 6gom:C, 6gom:D, 6gom:E, 6gom:F, 6gqt:A, 6gqt:B, 6gqt:C, 6gqt:D, 6gqt:E, 6gqt:F, 6gqw:A, 6gqw:B, 6gqw:C, 6gqw:D, 6gqw:E, 6gqw:F, 6gqx:A, 6gqx:B, 6gqx:E, 6gqx:C, 6gqx:D, 6gqx:F, 6gqy:A, 6gqy:B, 6gqy:C, 6gqy:D, 6gqy:F, 6gqy:E, 6h46:A, 1he8:B, 3i3s:R, 1iaq:A, 1iaq:B, 1iaq:C, 1ioz:A, 1jah:A, 1jai:A, 8jgd:A, 7jhp:A, 8jhl:A, 7jif:A, 7jig:A, 7jih:A, 7jih:B, 7jii:A, 7jii:B, 8jjs:A, 1k8r:A, 3k8y:A, 4k81:B, 4k81:D, 4k81:F, 4k81:H, 3k9l:A, 3k9l:B, 3k9l:C, 3k9n:A, 7kfz:C, 3kkm:A, 3kkn:A, 7kmr:A, 3kud:A, 5kyk:A, 5kyk:B, 5kyk:C, 6kyh:F, 6kyh:G, 6kyh:H, 6kyh:E, 7l0f:E, 7l0f:A, 7l0f:G, 7l0f:L, 7l0g:A, 7l0g:B, 7l0g:E, 7l0g:G, 3l8y:A, 3l8z:A, 4l8g:A, 4l9s:A, 4l9w:A, 3lbh:A, 3lbi:A, 3lbn:A, 2lcf:A, 7lc1:A, 7lc1:C, 7lc2:A, 7lc2:B, 4ldj:A, 1lf0:A, 1lf5:A, 1lfd:B, 1lfd:D, 7lgi:A, 3lo5:C, 3lo5:E, 4lpk:A, 4lpk:B, 4lrw:A, 4lrw:B, 4luc:A, 4luc:B, 4lv6:A, 4lv6:B, 2lwi:A, 4lyf:A, 4lyf:B, 4lyf:C, 4lyh:A, 4lyh:B, 4lyh:C, 4lyj:A, 4m1o:A, 4m1o:B, 4m1o:C, 4m1s:A, 4m1s:B, 4m1t:A, 4m1t:B, 4m1t:C, 4m1w:A, 4m1w:B, 4m1w:C, 4m1y:A, 4m1y:B, 4m1y:C, 4m21:A, 4m21:B, 4m22:A, 4m22:B, 4m22:C, 6m9w:A, 6mbq:A, 6mbt:A, 6mbt:B, 6mbu:A, 6mbu:B, 7mdp:A, 5mla:A, 5mlb:A, 5mlb:C, 5mlb:E, 5mlb:G, 6mnx:A, 6mnx:B, 6mnx:C, 6mnx:D, 6mnx:E, 6mnx:F, 6mqg:A, 6mqn:A, 6mqn:B, 6mqn:C, 6mqt:A, 6mqt:B, 6mqt:C, 6mqt:D, 6mqt:E, 6mqt:F, 6mqt:G, 6mqt:H, 7mqu:A, 2msc:B, 2msd:B, 2mse:B, 6ms9:C, 6ms9:B, 6ms9:A, 6mta:A, 6mta:B, 6n2j:A, 6n2k:A, 4nmm:A, 6ntc:A, 6ntd:A, 1nvu:Q, 1nvv:Q, 1nvw:Q, 1nvx:Q, 4nyi:Q, 4nyj:Q, 4nym:Q, 7ny8:A, 7ny8:B, 5o2s:A, 5o2s:C, 5o2s:E, 5o2s:G, 5o2t:A, 6o36:A, 6o36:B, 6o36:C, 6o46:A, 6o46:B, 6o46:C, 7o70:A, 7o70:D, 7o83:A, 7o83:B, 4obe:A, 4obe:B, 6ob2:A, 6ob2:C, 6ob3:A, 6ob3:C, 5ocg:A, 5oco:B, 5oco:A, 5oco:C, 5oco:D, 5oco:E, 5oco:F, 5oct:A, 5oct:B, 5oct:C, 5oct:D, 5oct:E, 5oct:F, 7og9:A, 7oga:A, 7ogb:A, 7ogc:A, 7ogd:A, 7oge:A, 7ogf:A, 3oiu:A, 3oiv:A, 3oiw:A, 6oim:A, 7ok3:A, 7ok4:A, 8onv:A, 7oo7:A, 7oo7:D, 8osm:A, 8osn:A, 8oso:A, 6p0z:A, 6p0z:B, 1p2s:A, 1p2t:A, 1p2u:A, 1p2v:A, 5p21:A, 6p8w:A, 6p8w:B, 6p8x:A, 6p8x:B, 6p8x:C, 6p8x:D, 6p8y:A, 6p8y:B, 6p8z:A, 6p8z:B, 6pgo:A, 6pgo:B, 6pgp:A, 6pgp:B, 8pi0:A, 8piy:A, 1pll:A, 6pq3:A, 6pts:B, 6ptw:B, 4pzy:A, 4pzy:B, 4pzz:A, 4q01:A, 4q01:B, 4q02:A, 4q03:A, 1q21:A, 2q21:A, 4q21:A, 6q21:A, 6q21:B, 6q21:C, 7q9u:AAA, 7q9u:BBB, 8qdk:A, 8qdp:A, 8qds:A, 8qdw:A, 8qe7:A, 8qei:A, 8qej:A, 4ql3:A, 1qra:A, 2quz:A, 6quu:A, 6quu:B, 6quv:A, 6quv:B, 6quw:A, 6quw:B, 6qux:A, 6qux:B, 8qu8:F, 8qug:A, 8qvu:A, 8qvu:E, 8qw6:E, 8qw6:A, 8qw7:A, 8qw7:E, 7r0m:A, 7r0m:B, 7r0n:A, 7r0q:A, 7r0q:B, 2rga:A, 2rgb:A, 2rgc:A, 2rgd:A, 2rge:A, 2rgg:A, 7rov:A, 7rov:B, 7rp2:A, 7rp3:A, 7rp4:A, 7rp4:B, 7rpz:A, 3rry:A, 3rrz:A, 3rs0:A, 3rs2:A, 3rs3:A, 3rs4:A, 3rs5:A, 3rs7:A, 3rsl:A, 3rso:A, 4rsg:A, 7rsc:A, 7rsc:B, 7rse:A, 7rse:B, 7rt1:A, 7rt2:A, 7rt3:A, 7rt4:A, 7rt5:A, 1rvd:A, 8s8c:A, 7scw:A, 7scx:A, 8stm:A, 8stm:B, 8stm:C, 8stm:D, 8stn:A, 8stn:B, 7t1f:A, 7t1f:B, 7t1f:C, 7t47:A, 8t4v:A, 8t4v:B, 6t5b:A, 6t5u:A, 6t5u:B, 6t5v:A, 8t71:A, 8t71:B, 8t72:A, 8t72:B, 8t73:A, 8t73:B, 8t74:A, 8t75:A, 8t75:C, 8t75:E, 8t75:G, 5tar:A, 6tam:A, 6tan:A, 7tam:A, 5tb5:A, 5tb5:C, 8tbf:A, 8tbf:B, 8tbg:A, 8tbg:B, 8tbh:A, 8tbh:B, 8tbj:A, 8tbj:B, 8tbk:A, 8tbk:B, 8tbl:A, 8tbl:B, 8tbm:A, 8tbm:B, 8tbn:A, 8tbn:B, 3tgp:A, 7tle:A, 7tlg:A, 7tlg:B, 7tlk:A, 7tlk:B, 8tlr:A, 4tq9:A, 4tq9:B, 4tqa:A, 4tqa:B, 8tvk:A, 8txe:A, 8txe:B, 8txg:A, 8txh:A, 8txh:B, 8txj:A, 8txk:A, 8ty2:A, 8ty8:A, 8ty9:A, 7u8h:A, 7u8h:B, 7u8h:C, 7u8h:D, 5ufe:A, 5ufq:A, 5ufq:B, 5uk9:A, 8un3:A, 8un3:B, 8un3:C, 8un3:D, 8un4:A, 8un5:A, 8un5:B, 5uqw:A, 5uqw:B, 4ury:R, 4urz:R, 4us0:R, 4us1:R, 4us2:R, 5us4:A, 5us4:B, 5usj:A, 5usj:B, 5usj:C, 5usj:D, 5usj:E, 5usj:F, 6usx:A, 6usx:B, 6usz:A, 6ut0:A, 6ut0:B, 6ut0:C, 6ut0:D, 2uzi:R, 3v4f:A, 6v5l:A, 5v6s:A, 5v6v:A, 5v6v:B, 6v65:C, 6v6f:C, 5v71:A, 5v71:B, 5v71:C, 5v71:D, 5v71:E, 5v71:F, 5v9l:A, 5v9l:B, 5v9l:C, 5v9o:A, 5v9u:A, 5v9u:B, 6v94:A, 6v9f:A, 6v9j:A, 6v9l:A, 6v9m:A, 6v9n:A, 6v9o:A, 5vbe:A, 5vbm:A, 5vbz:A, 5vbz:B, 5vbz:C, 6vc8:A, 6vc8:B, 2vh5:R, 6vjj:A, 5vp7:A, 5vp7:F, 5vpi:A, 5vpi:B, 5vpy:A, 5vpy:B, 5vpz:A, 5vpz:B, 5vq0:A, 5vq0:B, 5vq1:A, 5vq1:B, 5vq2:A, 5vq2:B, 5vq6:A, 5vq6:B, 5vq8:A, 5vq8:B, 7vv8:A, 7vv9:A, 7vvb:A, 7vvg:A, 5w22:A, 5w22:B, 6w4e:B, 6w4e:C, 6w4f:B, 6w4f:C, 7w5r:A, 7w5r:E, 7w5r:I, 7w5r:M, 7w5r:Q, 7w5r:U, 4wa7:A, 8wb1:A, 5wdo:A, 5wdp:A, 5wdq:A, 5wfo:Q, 5wfp:Q, 5wfq:Q, 5wfr:Q, 6wgn:C, 6wgn:A, 6wgn:B, 5wha:D, 5wha:J, 5wha:A, 5wha:G, 5whb:G, 5whb:A, 5whb:J, 5whb:D, 5whd:A, 5whd:B, 5whd:C, 5whd:D, 5whe:A, 5whe:D, 5whe:G, 5whe:J, 5wlb:A, 5wlb:D, 5wpl:A, 5wpl:G, 5wpl:D, 5wpl:J, 5wpm:A, 1wq1:R, 6ws2:A, 6ws2:B, 6ws2:C, 6ws2:D, 6ws4:A, 6ws4:B, 6ws4:C, 6ws4:D, 8x6r:A, 8x6r:B, 8x6r:C, 8x6r:D, 8x6r:E, 8x6r:F, 5x9s:A, 1xcm:A, 5xco:A, 1xd2:A, 6xgu:A, 6xgv:A, 6xha:A, 6xhb:A, 6xi7:A, 1xj0:A, 7xkj:A, 4xvq:A, 4xvr:A, 7ycc:A, 7ycc:B, 7ycc:C, 7yce:A, 6yr8:A, 7yuz:A, 7yv1:A, 5yxz:A, 6yxw:A, 6yxw:C, 5yy1:A, 5zc6:A, 6zj0:A, 6zl3:A, 6zl5:A, 6zli:A, 6zli:B, 1zvq:A, 1zw6:A
57 8ij9:A 168 153 0.1342 0.2381 0.2614 1.2 3bbp:A, 3bbp:B, 3bbp:C, 3cwz:A, 4dkx:A, 4dkx:B, 2e9s:A, 2e9s:B, 2e9s:C, 2fe4:A, 2ffq:A, 2gil:A, 2gil:B, 2gil:C, 2gil:D, 8ij9:B, 5lef:A, 5lef:B, 2y8e:A, 2y8e:B, 1yzq:A
58 2efc:B 165 135 0.1074 0.1939 0.2370 1.3 2efc:D, 2efe:B, 2efe:D, 2efh:B, 2efh:D, 4g01:B
59 8dmf:A 718 85 0.0738 0.0306 0.2588 1.5 7uvp:A
60 5c2k:A 382 127 0.1074 0.0838 0.2520 1.5 5a0f:A, 1a2b:A, 6bc0:F, 6bca:F, 6bca:C, 6bcb:F, 5bwm:A, 5c4m:A, 1cc0:A, 1cc0:C, 1cxz:A, 4d0n:A, 1dpf:A, 5ez6:B, 4f38:A, 8fc7:E, 8fc7:F, 8fc7:G, 8fc7:H, 8fc9:E, 8fc9:F, 8fc9:G, 8fc9:H, 8fcb:E, 8fcb:F, 8fcb:G, 8fcb:H, 8fpw:A, 8fpx:A, 5fr1:A, 5fr2:A, 1ftn:A, 7g80:A, 7g81:A, 7g82:A, 7g83:A, 7g84:A, 7g85:A, 7g86:A, 7g87:A, 7g88:A, 7g89:A, 7g8a:A, 7g8b:A, 7g8c:A, 7g8d:A, 7g8e:A, 7g8f:A, 7g8g:A, 7g8h:A, 7g8i:A, 7g8j:A, 7g8k:A, 7g8l:A, 7g8m:A, 7g8n:A, 7g8o:A, 7g8p:A, 7g8q:A, 7g8r:A, 7g8s:A, 7g8u:A, 7g8v:A, 7g8w:A, 7g8x:A, 7g8y:A, 7g90:A, 7g92:A, 7g93:A, 7g94:A, 7g95:A, 7g96:A, 7g97:A, 7g99:A, 7g9i:A, 7g9j:A, 2gcn:A, 2gco:A, 2gco:B, 2gcp:A, 8gi3:A, 8gi6:A, 5hpy:B, 5hpy:F, 5irc:F, 5irc:D, 5jhh:B, 5jhh:F, 1kmq:A, 6kx2:A, 6kx3:A, 3kz1:E, 3kz1:F, 3lw8:A, 3lw8:B, 3lw8:C, 3lw8:D, 3lwn:A, 3lwn:B, 3lxr:A, 5m6x:B, 5m6x:I, 5m70:B, 5m70:G, 3msx:A, 1ow3:B, 7qsc:B, 7qsc:D, 7qtm:B, 7qtm:I, 6r3v:B, 1s1c:A, 1s1c:B, 8t1c:E, 3tvd:A, 3tvd:B, 1tx4:B, 7u2p:B, 6v6m:A, 6v6u:A, 6v6v:A, 7wza:A, 7wzc:A, 4xoi:A, 4xoi:C, 7xqv:A, 4xsg:A, 4xsh:A, 1z2c:A, 1z2c:C
61 2bme:A 176 93 0.0839 0.1420 0.2688 1.6 2bmd:A, 2bme:B, 2bme:C, 2bme:D, 1yu9:A, 1z0k:A, 1z0k:C
62 2kwi:A 178 91 0.0805 0.1348 0.2637 1.8 2ke5:A, 6zqt:A, 6zqt:B, 6zrn:A, 6zrn:B
63 7nvr:l 501 98 0.0805 0.0479 0.2449 1.8
64 3cph:A 175 148 0.1174 0.2000 0.2365 2.4 1g16:A, 1g16:B, 1g16:C, 1g16:D, 1g17:A, 1g17:B, 4z8y:A, 4z8y:B, 4zdw:A
65 3sfv:A 179 91 0.0772 0.1285 0.2527 2.5 8alk:B, 7eq2:A, 7eq2:B, 4fmb:B, 4fmb:D, 4fmb:F, 4fmc:B, 4fmc:D, 4fmd:B, 4fmd:D, 4fmd:F, 4fme:B, 4fme:E, 2fol:A, 4hlq:B, 4hlq:D, 4hlq:F, 4hlq:H, 4hlq:J, 4i1o:A, 4i1o:C, 4i1o:E, 4i1o:G, 4iru:B, 4iru:D, 4iru:F, 4jvs:B, 3nkv:A, 3nkv:B, 5o74:B, 5o74:D, 5o74:F, 5o74:H, 5o74:J, 5o74:L, 6sku:B, 5szh:B, 5szk:B, 3tkl:A
66 7b7z:A 340 66 0.0470 0.0412 0.2121 2.7 7b80:A, 6i7g:A, 6i7g:B, 6i7i:A, 6i7k:A, 6i7l:A, 4u07:A, 4u07:B, 4u0s:A, 4u0s:B, 4u0u:A, 4u0u:B, 4u0z:A, 4u0z:B, 4u0z:C, 4u0z:D, 4u0z:E, 4u0z:F, 4u0z:G, 4u0z:H, 6zmd:B
67 7z15:K 224 23 0.0369 0.0491 0.4783 3.2 7z15:L
68 3lvq:E 420 94 0.0738 0.0524 0.2340 3.5 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
69 4rke:A 176 94 0.0872 0.1477 0.2766 3.6 1z0a:C
70 5a22:A 2002 40 0.0503 0.0075 0.3750 3.6
71 6u1x:A 2059 40 0.0503 0.0073 0.3750 3.6
72 8sgd:A 291 73 0.0638 0.0653 0.2603 3.8 8fwp:A, 8pfh:A, 8sgd:C
73 4wnr:A 323 125 0.0973 0.0898 0.2320 4.3
74 8buu:9 573 51 0.0604 0.0314 0.3529 4.5
75 3dhh:E 102 20 0.0403 0.1176 0.6000 4.7 3q14:E, 3q3m:E, 3q3m:H
76 3hda:P 382 27 0.0403 0.0314 0.4444 4.9 3hbv:P
77 1ukv:Y 197 91 0.0805 0.1218 0.2637 5.0 2bcg:Y, 1yzn:A
78 1go7:P 462 27 0.0403 0.0260 0.4444 5.1 1go8:P, 3hb2:P, 3hbu:P, 1k7g:A, 1k7i:A, 1k7q:A
79 5dgx:A 233 20 0.0403 0.0515 0.6000 5.3
80 2bov:A 173 147 0.1208 0.2081 0.2449 5.4 2a78:A, 2a9k:A, 8fjh:B, 8fji:B, 6p0i:B, 6p0j:B, 6p0k:B, 6p0l:B, 6p0m:B, 6p0n:B, 6p0o:B, 1u8y:A, 1u8y:B, 1u8z:A, 1u8z:B, 1u90:A, 1u90:B, 1uad:A, 1uad:B, 1zc3:A, 1zc3:C, 1zc4:A, 1zc4:C
81 8tzc:A 872 74 0.0671 0.0229 0.2703 5.7
82 8pfh:C 289 29 0.0403 0.0415 0.4138 6.5
83 7opr:A 218 175 0.1510 0.2064 0.2571 7.2 3bc1:A, 3bc1:E, 6huf:A, 6huf:O, 6huf:N, 6huf:B, 6huf:E, 6huf:C, 6huf:K, 6huf:M, 6huf:D, 6huf:P, 6huf:F, 6huf:J, 6huf:G, 6huf:I, 6huf:H, 6huf:L, 7opp:A, 7opp:C, 7opq:A, 7opq:B, 7opr:B
84 5cyo:A 272 75 0.0638 0.0699 0.2533 7.6 5cyo:B, 4yqf:B, 4yqf:A
85 8bx8:C 3947 152 0.1342 0.0101 0.2632 7.7 7k58:C, 7k5b:C, 7kek:C
86 2gj8:D 172 58 0.0604 0.1047 0.3103 8.7 2gj8:A, 2gj8:B, 2gj8:C, 2gj9:A, 2gj9:B, 2gj9:C, 2gj9:D, 2gja:A, 2gja:B
87 6ha8:V 541 29 0.0369 0.0203 0.3793 9.9

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218