BioLiP

>protein
AMKIKIQKIHPNALIPKYQTDGSSGFDLHAVEEVMIKPHSVGLVKIGICLSLEVGYELQVRTRSGLALNHQVMVLNSPGT
VDNDYRGEIKVILANLSDKDFKVQVGDRIAQGVVQKTYKAEFIECEQLDETSRGSGGFGSTGVSK

The query sequence (length=145) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8hrv:B	145	145	1.0000	1.0000	1.0000	1.44e-105	8hrv:A, 8hrv:C
2	7n6s:C	147	146	0.4828	0.4762	0.4795	3.58e-40	7n6s:A, 7n6s:B, 7n6s:F, 7n6s:D, 7n6s:E
3	4oop:B	142	140	0.3793	0.3873	0.3929	8.70e-31	4oop:A, 4oop:C
4	6mjk:A	144	138	0.3655	0.3681	0.3841	1.11e-28
5	3f4f:A	138	137	0.3310	0.3478	0.3504	2.54e-25	3f4f:B, 3f4f:C, 3p48:A, 3p48:C, 3p48:B
6	4gcy:A	163	133	0.3517	0.3129	0.3835	3.84e-25	8cga:A, 5ect:A, 5edd:A, 3h6d:A, 3hza:A, 3i93:A, 3loj:A, 2py4:A, 1six:A, 1sjn:A, 1sjn:C, 1sjn:B, 1sm8:A, 1sm8:B, 1sm8:C, 1smc:A, 1smc:B, 1smc:C, 1snf:A, 1snf:C, 1snf:B
7	5f9k:B	130	128	0.3034	0.3385	0.3438	1.49e-23	5f9k:A, 5f9k:C
8	6hde:B	152	131	0.3172	0.3026	0.3511	2.47e-21	1eu5:A, 1euw:A, 6hde:A, 6hde:C, 2hrm:A, 1rn8:A, 1rnj:A, 1seh:A, 1syl:A
9	6ljj:A	150	135	0.3172	0.3067	0.3407	2.93e-19	3ara:A, 3ara:C, 3ara:B, 3arn:A, 3arn:C, 3arn:B, 3ehw:A, 3ehw:B, 3ehw:C, 3ehw:X, 3ehw:Y, 3ehw:Z, 5h4j:A, 2hqu:A, 2hqu:B, 2hqu:C
10	2y8c:C	136	118	0.3172	0.3382	0.3898	4.58e-19	2y8c:B
11	3t64:A	153	135	0.3310	0.3137	0.3556	9.02e-17	3t60:A, 3t60:B, 3t60:C, 3t64:B, 3t64:C, 3t6y:A, 3t6y:B, 3t6y:C, 3t70:A, 3t70:B, 3t70:C, 1vyq:A, 1vyq:B, 1vyq:C, 2y8c:A
12	2ol1:C	125	113	0.2828	0.3280	0.3628	3.54e-16	2oke:A, 2oke:C, 2oke:B, 2ol1:A, 2ol1:B
13	4aoo:A	143	119	0.3034	0.3077	0.3697	5.15e-15	4ao5:A, 4ao5:B, 4ao5:C, 4ao5:D, 4ao5:E, 4ao5:F, 4aoo:B, 4aoo:C, 4aoo:D, 4aoz:A, 4aoz:B, 4aoz:C, 4apz:1, 4apz:Y, 4apz:2, 4apz:3, 4apz:4, 4apz:5, 4apz:7, 4apz:6, 4apz:8, 4apz:9, 4apz:a, 4apz:A, 4apz:C, 4apz:B, 4apz:D, 4apz:E, 4apz:F, 4apz:G, 4apz:I, 4apz:H, 4apz:J, 4apz:K, 4apz:L, 4apz:M, 4apz:N, 4apz:O, 4apz:P, 4apz:R, 4apz:Q, 4apz:S, 4apz:U, 4apz:T, 4apz:V, 4apz:W, 4apz:X, 4apz:Z, 4apz:b, 4apz:d, 4apz:c, 4apz:e, 4apz:g, 4apz:f, 4apz:h, 4apz:j, 4apz:i, 4apz:k, 4apz:m, 4apz:l, 4b0h:A, 4b0h:B, 4b0h:C, 2xce:A, 2xce:B, 2xce:C, 2xce:D, 2xce:E, 2xce:F, 2xy3:A, 2xy3:B, 2xy3:C, 2xy3:D, 2xy3:E, 2xy3:F
14	6mao:A	137	124	0.2897	0.3066	0.3387	5.18e-15
15	5y5p:D	171	154	0.3586	0.3041	0.3377	1.01e-13	5y5p:A, 5y5p:B, 5y5p:C, 5y5p:E, 5y5p:F, 5y5q:A, 5y5q:B, 5y5q:C
16	5cct:A	169	168	0.2552	0.2189	0.2202	2.20e-11	5cco:A, 5nyz:A, 5nz2:A, 3zez:A, 3zf0:A, 3zf1:A, 3zf4:A, 3zf5:A, 3zf6:A
17	1f7r:A	133	135	0.2828	0.3083	0.3037	5.94e-11	1f7k:A, 1f7k:B, 1f7n:A, 1f7n:B, 1f7p:A, 1f7p:C, 1f7p:B, 1f7q:A, 1f7q:C, 1f7q:B
18	4wrk:A	158	155	0.2138	0.1962	0.2000	3.46e-07	4gv8:A, 4gv8:C, 4gv8:B, 4gv8:D, 4gv8:F, 4gv8:E, 4wrk:B, 4wrk:C, 4wrk:D, 4wrk:E, 4wrk:F
19	6lj3:A	164	144	0.2414	0.2134	0.2431	2.48e-06	6ky9:A, 6ky9:B, 6ky9:C, 6kz6:C, 6kz6:B, 6kz6:A, 6lis:A, 6lis:B, 6lis:C, 6lis:D, 6lis:F, 6lis:E, 6lj3:C, 6lj3:B
20	3tp1:A	114	94	0.2207	0.2807	0.3404	2.14e-04	2d4n:A, 3tpn:A, 3tps:A, 3tpw:A, 3tpy:A, 3tq3:A, 3tq4:A, 3tq5:A, 3trl:A, 3trn:A, 3ts6:A, 3tsl:A, 3tta:A
21	2ckf:E	433	60	0.1241	0.0416	0.3000	0.70	2ckf:C
22	2gbw:A	449	50	0.1241	0.0401	0.3600	1.1	2ckf:A, 2gbw:C, 2gbw:E, 2gbx:A, 2gbx:C, 2gbx:E
23	3ffz:A	1246	28	0.0759	0.0088	0.3929	3.3	3d3x:A, 3d3x:B, 3ffz:B, 7ovw:AAA, 7ovw:BBB, 1t3a:A, 1t3a:B, 1t3c:A, 1t3c:B, 7uib:D, 7uib:A, 1zkw:A, 1zkw:B, 1zkx:A, 4zkt:A, 4zkt:C, 4zkt:E, 1zl6:A, 1zn3:A
24	4r0m:A	637	128	0.2483	0.0565	0.2812	3.3	4r0m:B
25	8qqf:A	121	35	0.0828	0.0992	0.3429	7.1	8qqf:C

[Back]