BioLiP

>protein
AMHPRKDWYELTRATNWTPSYVTEEQLFPERMSGHMGIPLEKWESYDEPYKTSYPEYVSIQREKDAGAYSVKAALERAKI
YENSDPGWISTLKSHYGAIAVGEYAAVTGEGRMARFSKAPGNRNMATFGMMDELRHGQLQLFFPHEYCKKDRQFDWAWRA
YHSNEWAAIAAKHFFDDIITGRDAISVAIMLTFSFETGFTNMQFLGLAADAAEAGDYTFANLISSIQTDESRHAQQGGPA
LQLLIENGKREEAQKKVDMAIWRAWRLFAVLTGPVMDYYTPLEDRSQSFKEFMYEWIIGQFERSLIDLGLDKPWYWDLFL
KDIDELHHSYHMGVWYWRTTAWWNPAAGVTPEERDWLEEKYPGWNKRWGRCWDVITENVLNDRMDLVSPETLPSVCNMSQ
IPLVGVPGDDWNIEVFSLEHNGRLYHFGSEVDRWVFQQDPVQYQNHMNIVDRFLAGQIQPMTLEGALKYMGFQSIEEMGK
DAHDFAWAD

The query sequence (length=489) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3dhi:A	498	489	1.0000	0.9819	1.0000	0.0	3dhg:A, 3dhg:D, 3dhh:A, 3ge3:A, 3ge8:A, 3ge8:D, 3i5j:A, 3i63:A, 4p1b:A, 4p1b:D, 4p1c:A, 4p1c:D, 3q14:A, 3q2a:A, 3q3m:A, 3q3m:D, 3q3n:A, 3q3o:A, 3ri7:A, 3rmk:A, 3rmk:D, 5tds:A, 5tds:D, 5tdt:A, 5tdt:D, 5tdu:A, 5tdv:A, 5tdv:D
2	2inc:A	491	488	0.6830	0.6802	0.6844	0.0	2ind:A, 3n1x:A, 3n1y:A, 3n1z:A, 3n20:A, 2rdb:A, 3rn9:A, 3rna:A, 3rnb:A, 3rnc:A, 3rne:A, 3rnf:A, 3rng:A, 1t0q:A, 1t0r:A, 1t0s:A
3	2inn:A	496	471	0.2618	0.2581	0.2718	9.19e-38	2inn:B, 2inp:A, 2inp:B, 3u52:A, 3u52:B
4	1fzi:A	512	333	0.1616	0.1543	0.2372	7.23e-15	1fyz:A, 1fyz:B, 1fz0:A, 1fz0:B, 1fz1:A, 1fz1:B, 1fz2:A, 1fz2:B, 1fz3:A, 1fz3:B, 1fz4:A, 1fz4:B, 1fz5:A, 1fz5:B, 1fz6:A, 1fz6:B, 1fz7:A, 1fz7:B, 1fz8:A, 1fz8:B, 1fz9:A, 1fz9:B, 1fzh:A, 1fzh:B, 1fzi:B, 4gam:A, 4gam:F, 4gam:K, 4gam:P, 1mmo:D, 1mmo:E, 1mty:D, 1mty:E, 7tc7:D, 7tc7:E, 7tc8:D, 7tc8:E, 1xmf:A, 1xmf:B, 1xmh:A, 1xmh:B, 1xu3:A, 1xu3:B, 1xu5:A, 1xu5:B, 1xvb:A, 1xvb:B, 1xvc:A, 1xvc:B, 1xvd:A, 1xvd:B, 1xve:A, 1xve:B, 1xvf:A, 1xvf:B, 1xvg:A, 1xvg:B
5	7m8q:A	515	336	0.1554	0.1476	0.2262	9.60e-13	6d7k:A, 6d7k:E, 7m8q:E, 7m8r:A, 7m8r:E, 1mhy:D, 1mhz:D, 7s6q:A, 7s6q:E, 7s6r:A, 7s6r:E, 7s6s:A, 7s6s:E, 7s6t:A, 7s6t:E, 7s7h:A, 7s7h:E, 6vk4:A, 6vk4:E, 6vk5:A, 6vk5:E, 6vk6:A, 6vk7:A, 6vk8:A, 6vk8:E, 6yd0:D, 6ydi:D, 6ydu:D, 6yy3:D
6	2y27:B	427	78	0.0511	0.0585	0.3205	0.17	2y27:A, 2y4n:A, 2y4n:B
7	5zrd:A	534	137	0.0634	0.0581	0.2263	0.87	5zrd:B, 5zrd:C, 5zrd:D
8	5w6y:A	244	86	0.0409	0.0820	0.2326	0.94	5w6y:B
9	6zu5:LD0	258	113	0.0613	0.1163	0.2655	1.6
10	5zre:B	474	139	0.0716	0.0738	0.2518	2.0	5zre:A, 5zre:C
11	8q3b:B	1104	85	0.0470	0.0208	0.2706	2.4
12	3edd:B	597	66	0.0450	0.0369	0.3333	4.3	3edd:A, 3ede:A, 3ede:B, 3edf:A, 3edf:B, 3edj:A, 3edj:B, 3edk:A, 3edk:B, 1h3g:A, 1h3g:B
13	6zxf:z	373	106	0.0573	0.0751	0.2642	5.5	6zxg:z, 6zxh:z
14	1r3q:A	357	63	0.0307	0.0420	0.2381	9.4	2q71:A, 1r3s:A, 1r3t:A, 1r3v:A, 1r3w:A, 1r3y:A

[Back]