BioLiP

>protein
AMGSRVVILFTDIEESTALNERIGDRAWVKLISSHDKLVSDLVRRQSGHVVKSQGDGFMVAFARPEQAVRCGIELQRALR
RNEIRVRIGIHMGRSVRRGDDLFGRNVAMAARVAAQAAGGEILVSQPVRDALRSDGIRFDDGREVELKGFSGTYRLFAVL
AS

The query sequence (length=162) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4wp8:B	166	167	0.9753	0.9518	0.9461	2.05e-106	5d0e:A, 5d0e:B, 5d0g:A, 5d0g:B, 5d0h:A, 5d0h:B, 5d15:A, 5d15:B, 4wp8:A, 4wp9:A, 4wp9:B, 4wpa:A, 4wpa:B
2	1ybu:A	166	158	0.3765	0.3675	0.3861	3.44e-27	1ybu:D
3	1fx4:A	231	169	0.3086	0.2165	0.2959	2.55e-14
4	6fht:B	735	169	0.2716	0.0599	0.2604	1.08e-09	5ajg:A, 8avv:A, 8avv:B, 8avx:A, 8avx:B, 8bor:A, 8bor:B, 8bor:C, 8bor:D, 8c3i:B, 8c3i:A, 5c5k:A, 5c5k:B, 5c5k:C, 5c5k:D, 4cqh:A, 6fht:A, 6ftd:A, 6ftd:B, 4ijg:A, 5k5b:A, 5l8m:A, 5lbr:A, 5mg0:A, 5mg1:A, 5nfx:A, 5nm3:A, 5nm3:B, 5nm3:C, 5nm3:D, 5nwn:A, 5nwn:B, 5nwn:C, 5nwn:D, 4o01:A, 4o01:B, 4o01:C, 4o01:D, 4o0p:A, 4o0p:B, 4o8g:A, 2o9b:A, 2o9c:A, 4q0h:A, 4q0i:A, 4q0j:A, 3s7n:A, 3s7o:A, 3s7p:A, 3s7q:A, 8sgk:A, 8sgk:B, 6t3l:B, 6t3l:A, 6t3u:B, 6t3u:A, 4y3i:A, 4y5f:A, 4z1w:A, 7z9d:A, 7z9e:A, 4zrr:A, 1ztu:A
5	1y10:C	363	158	0.2901	0.1295	0.2975	1.66e-08	2ev1:A, 2ev1:B, 2ev2:A, 2ev2:B, 2ev3:A, 2ev3:B, 2ev4:A, 2ev4:B, 1y10:A, 1y10:B, 1y10:D
6	8bv5:A	437	138	0.2284	0.0847	0.2681	0.001
7	8bv5:A	437	148	0.2099	0.0778	0.2297	0.002
8	5m2a:A	346	130	0.1852	0.0867	0.2308	0.002	5m27:A, 5m27:B, 5m2a:B, 5mbb:A, 5mbb:B, 5mbc:A, 5mbc:B, 5mbd:A, 5mbd:B, 5mbe:A, 5mbe:B, 5mbh:A, 5mbj:A, 5mbk:A, 5nby:A
9	8buz:A	890	138	0.2284	0.0416	0.2681	0.002
10	8buz:A	890	150	0.2037	0.0371	0.2200	0.045
11	1wc4:A	199	153	0.2531	0.2060	0.2680	0.005	2bw7:A, 2bw7:B, 2bw7:C, 2bw7:D, 1wc0:A, 1wc0:B, 1wc1:A, 1wc1:C, 1wc1:B, 1wc3:A, 1wc3:B, 1wc4:B, 1wc5:A, 1wc5:D, 1wc5:B, 1wc5:C, 1wc6:A, 1wc6:C, 1wc6:B
12	1azs:A	190	157	0.2407	0.2053	0.2484	0.007	3c14:A, 3c15:A, 3c16:A, 1cjk:A, 1cjt:A, 1cju:A, 1cjv:A, 1cs4:A, 1cul:A, 3g82:A, 2gvd:A, 2gvz:A, 3maa:A, 1tl7:A, 1u0h:A
13	4yut:A	351	178	0.2654	0.1225	0.2416	0.27	8qfe:A, 8qff:A, 8qfg:A, 8qfh:A, 8qfi:A, 8qfj:A, 5x4t:A, 5x4u:A, 5x4v:A, 4yus:A, 4yut:B
14	4urs:A	162	85	0.1420	0.1420	0.2706	0.78	4urg:A, 4urs:B
15	7y4l:MI	275	38	0.0864	0.0509	0.3684	2.0	7ezx:MA, 7ezx:MG, 7ezx:MN, 7ezx:MQ, 6kgx:M1, 6kgx:21, 6kgx:M4, 6kgx:24, 7y4l:ZI, 7y4l:M9, 7y4l:Z9, 7y5e:Z9, 7y5e:M5, 7y5e:Z5, 7y5e:M9, 7y7a:MH, 7y7a:ZH, 7y7a:Ma, 7y7a:Mf, 7y7a:Za, 7y7a:Zf, 7y7a:Mh, 7y7a:Zh
16	4o27:A	325	54	0.0926	0.0462	0.2778	2.2	4fzd:A, 1upk:A
17	4hr6:C	264	32	0.0926	0.0568	0.4688	2.8	5y97:C
18	5duf:A	245	50	0.0864	0.0571	0.2800	4.0	5dtw:A, 5dtw:D, 5du4:A, 5du6:A, 5du6:B, 5du6:C, 5du8:A, 5du8:B, 5du8:C, 5duc:A, 5duc:B, 5duc:C
19	8jsz:A	259	34	0.0802	0.0502	0.3824	4.5	8jsz:B
20	6yx5:B	339	42	0.1173	0.0560	0.4524	4.5
21	4o7p:B	451	107	0.2099	0.0754	0.3178	8.1
22	5hsq:A	488	35	0.0864	0.0287	0.4000	9.7	8co5:A, 5i5l:A, 6r26:A, 6r27:A, 6r27:B, 6r27:C, 6r27:D

[Back]