BioLiP

>protein
AMGSRVVILFTDIEESTALNERIGDRAWVKLISSHDKLVSDLVRRQSGHVVESQGDGFMVAFARPEQAVRCGIELQRALR
RNAIRVRIGIHMGRSVRRGDGLFGRNVAMAYRVAAQAAGGEILVSQPVRDALSRSDGIRFDDGREVELKGFSGTYRLFAV
LA

The query sequence (length=162) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4wp8:B	166	168	0.9630	0.9398	0.9286	2.03e-104	5d0e:A, 5d0e:B, 5d0g:A, 5d0g:B, 5d0h:A, 5d0h:B, 5d15:A, 5d15:B, 4wp8:A, 4wp9:A, 4wp9:B, 4wpa:A, 4wpa:B
2	1ybu:A	166	159	0.3704	0.3614	0.3774	7.28e-25	1ybu:D
3	1fx4:A	231	184	0.3148	0.2208	0.2772	9.18e-13
4	6fht:B	735	170	0.2778	0.0612	0.2647	3.83e-11	5ajg:A, 8avv:A, 8avv:B, 8avx:A, 8avx:B, 8bor:A, 8bor:B, 8bor:C, 8bor:D, 8c3i:B, 8c3i:A, 5c5k:A, 5c5k:B, 5c5k:C, 5c5k:D, 4cqh:A, 6fht:A, 6ftd:A, 6ftd:B, 4ijg:A, 5k5b:A, 5l8m:A, 5lbr:A, 5mg0:A, 5mg1:A, 5nfx:A, 5nm3:A, 5nm3:B, 5nm3:C, 5nm3:D, 5nwn:A, 5nwn:B, 5nwn:C, 5nwn:D, 4o01:A, 4o01:B, 4o01:C, 4o01:D, 4o0p:A, 4o0p:B, 4o8g:A, 2o9b:A, 2o9c:A, 4q0h:A, 4q0i:A, 4q0j:A, 3s7n:A, 3s7o:A, 3s7p:A, 3s7q:A, 8sgk:A, 8sgk:B, 6t3l:B, 6t3l:A, 6t3u:B, 6t3u:A, 4y3i:A, 4y5f:A, 4z1w:A, 7z9d:A, 7z9e:A, 4zrr:A, 1ztu:A
5	1y10:C	363	158	0.2778	0.1240	0.2848	3.49e-08	2ev1:A, 2ev1:B, 2ev2:A, 2ev2:B, 2ev3:A, 2ev3:B, 2ev4:A, 2ev4:B, 1y10:A, 1y10:B, 1y10:D
6	8bv5:A	437	158	0.2099	0.0778	0.2152	0.17
7	1wc4:A	199	183	0.2716	0.2211	0.2404	0.20	2bw7:A, 2bw7:B, 2bw7:C, 2bw7:D, 1wc0:A, 1wc0:B, 1wc1:A, 1wc1:C, 1wc1:B, 1wc3:A, 1wc3:B, 1wc4:B, 1wc5:A, 1wc5:D, 1wc5:B, 1wc5:C, 1wc6:A, 1wc6:C, 1wc6:B
8	6pas:B	576	132	0.2037	0.0573	0.2500	0.47	6pat:B
9	1zov:A	381	29	0.0802	0.0341	0.4483	0.61	1zov:B
10	4ijs:A	232	74	0.0988	0.0690	0.2162	1.00	4ijs:B, 4ijs:C, 4ijs:D, 3zla:A, 3zla:B, 3zla:C, 3zla:D, 3zla:E, 3zla:F, 3zla:G, 3zla:H
11	4urs:A	162	85	0.1420	0.1420	0.2706	1.2	4urg:A, 4urs:B
12	4yut:A	351	178	0.2469	0.1140	0.2247	1.7	8qfe:A, 8qff:A, 8qfg:A, 8qfh:A, 8qfi:A, 8qfj:A, 5x4t:A, 5x4u:A, 5x4v:A, 4yus:A, 4yut:B
13	4o27:A	325	57	0.0926	0.0462	0.2632	2.2	4fzd:A, 1upk:A
14	1azs:A	190	155	0.2222	0.1895	0.2323	2.6	3c14:A, 3c15:A, 3c16:A, 1cjk:A, 1cjt:A, 1cju:A, 1cjv:A, 1cs4:A, 1cul:A, 3g82:A, 2gvd:A, 2gvz:A, 3maa:A, 1tl7:A, 1u0h:A
15	7n81:B	307	78	0.1049	0.0554	0.2179	4.3	3x01:B
16	4bhh:F	232	60	0.0988	0.0690	0.2667	4.7	4bhh:B, 4bhh:D, 4bhh:Z
17	5duf:A	245	30	0.0802	0.0531	0.4333	7.4	5dtw:A, 5dtw:D, 5du4:A, 5du6:A, 5du6:B, 5du6:C, 5du8:A, 5du8:B, 5du8:C, 5duc:A, 5duc:B, 5duc:C
18	3n33:A	367	63	0.1111	0.0490	0.2857	7.4	3n33:B, 3n33:C, 3n33:D, 3ndv:A, 3ndv:B, 3ndv:C, 3ndv:D, 3nfb:A, 3nfb:C, 3nfb:B, 3nfb:D
19	6ktk:C	368	50	0.1111	0.0489	0.3600	7.4	6ktk:A, 6ktk:B, 6ktk:D, 6ktl:A, 6ktl:B, 6ktl:C, 6ktl:D, 5ya8:A, 5ya8:B, 5ya8:C, 5ya8:D, 5yap:A, 5yap:B, 5yap:C, 5yap:D, 5yaq:A, 5yaq:B, 5yaq:C, 5yaq:D
20	7em5:B	297	67	0.0926	0.0505	0.2239	8.5	7em6:B

[Back]