BioLiP

>protein
AMFHYTVDVSTGMNETIERLEESLKQEGFGVLWQFSVTEKLQEKGLDFSTPMVILEVCNPQEAARVLNENLLVGYFLPCK
LVVYQENGTTKIGMPKPTMLVGMMNDPALKEIAADIEKRLAACLDRCR

The query sequence (length=128) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1q9u:B	128	128	1.0000	1.0000	1.0000	4.31e-94
2	1j3m:A	127	118	0.2891	0.2913	0.3136	6.59e-11
3	7wzf:A	243	26	0.0859	0.0453	0.4231	0.77
4	7nvo:A	249	36	0.1172	0.0602	0.4167	1.8	7nvo:a
5	6wm5:A	337	61	0.1484	0.0564	0.3115	3.6	6wm5:C, 6wmv:A, 6wmv:C
6	4o6m:B	341	61	0.1484	0.0557	0.3115	3.6	4o6m:A, 4o6n:A, 4o6n:B, 4q7c:A, 4q7c:B
7	7ood:p	114	45	0.1016	0.1140	0.2889	4.5	7p6z:p, 7pah:p, 7pai:p, 7paj:p, 7pak:p, 7pal:p, 7pam:p, 7pan:p, 7pao:p, 7paq:p, 7par:p, 7pas:p, 7pat:p, 7pau:p, 7ph9:p, 7pha:p, 7phb:p, 7phc:p, 7pi8:p, 7pi9:p, 7pia:p, 7pib:p, 7pic:p, 7pio:p, 7pip:p, 7piq:p, 7pir:p, 7pis:p, 7pit:p
8	6h0h:A	410	14	0.0781	0.0244	0.7143	5.4	6h0h:B
9	4gq0:A	318	122	0.2500	0.1006	0.2623	6.4	4ga8:A, 4gab:A, 4gqg:A, 4i5x:A, 4icc:X, 4jih:A, 4jii:X, 5lik:X, 5liu:X, 5liw:X, 5lix:X, 5liy:X, 5m2f:X, 4wev:X, 4xzl:X, 4xzm:X, 4xzn:X, 5y7n:A, 1zua:X
10	2a06:E	196	49	0.1016	0.0663	0.2653	7.1	2a06:R, 1bcc:E, 2bcc:E, 3bcc:E, 1be3:E, 1bgy:Q, 4d6t:R, 4d6u:R, 7dkf:Q1, 2fyu:E, 5gpn:E, 5gpn:Q, 5gup:2, 5gup:4, 6haw:E, 8iog:C, 8iog:c, 5j4z:AE, 5j4z:AP, 5j7y:AE, 5j7y:AP, 5j8k:AE, 5j8k:AP, 5klv:E, 1l0l:E, 1l0n:E, 5luf:q, 6nhg:E, 5nmi:E, 1ntk:E, 1ntm:E, 1ntz:E, 1nu1:E, 7o37:E, 7o37:P, 7o3c:E, 7o3c:P, 7o3h:E, 7o3h:P, 5okd:E, 8p65:E, 8p65:R, 1pp9:R, 1pp9:E, 1ppj:R, 1ppj:E, 8pw5:E, 8pw5:P, 8pw6:E, 8pw6:P, 8pw7:E, 8pw7:P, 6q9e:f1, 6q9e:f2, 6qbx:f1, 6qbx:f2, 6qc2:f1, 6qc2:f2, 6qc3:f1, 6qc3:f2, 6qc4:f1, 6qc4:f2, 7r3v:E, 1rie:A, 1sqb:E, 1sqp:E, 1sqq:E, 1sqv:E, 1sqx:E, 7tay:E, 7tz6:E, 7tz6:R, 8ugd:3E, 8ugd:3R, 8uge:3E, 8uge:3R, 8ugf:3E, 8ugf:3R, 8ugg:3E, 8ugg:3R, 8ugh:3E, 8ugh:3R, 8ugi:3E, 8ugi:3R, 8ugj:3E, 8ugj:3R, 8ugk:3E, 8ugk:3R, 8ugn:3E, 8ugn:3R, 8ugr:3E, 8ugr:3R, 8ugr:6E, 8ugr:6R, 5xte:C, 5xte:P, 5xth:AC, 5xth:AP, 5xti:AC, 5xti:AP, 6xvf:E, 2ybb:e, 2ybb:E, 6zfs:E, 6zft:E, 6zfu:E
11	8pv1:CI	152	20	0.0781	0.0658	0.5000	7.5	8i9p:CI, 8i9r:CI, 8i9t:CI, 8i9v:CI, 8i9w:CI, 8i9x:CI, 8i9y:CI, 8i9z:CI, 8ia0:CI, 8pv3:CI, 8pv4:CI, 8pv7:CI, 8pvk:CI
12	5d92:D	342	61	0.1484	0.0556	0.3115	7.5	5d91:A, 5d92:A, 5d92:B, 5d92:C
13	3edd:B	597	29	0.0781	0.0168	0.3448	8.9	3edd:A, 3ede:A, 3ede:B, 3edf:A, 3edf:B, 3edj:A, 3edj:B, 3edk:A, 3edk:B, 1h3g:A, 1h3g:B

[Back]