BioLiP

>protein
AMALEARLEQASILKKVVDAIKDLVQDCNFDCNDSGIALQAMDNSHVALVSMMLKAEGFSPYRCDRNIALGVNLTSLTKV
LRAAQNEDILTLKAEDAPDVLNLVFESSETDRISEYDLKLMDIDQEHLGIPETEYAATITMPSNEFKRITTDLMAMSESV
TIEANKDGVKFSCQGDIGNGSVTLRQHTNVEKPNESIEIELSEPVSLTFSLKYLVNFCKASALSNTVKICLSNEVPLLVE
YSLGGSSYLRFYLAPKI

The query sequence (length=257) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8q7i:A	257	257	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	7o1f:A, 7o1f:B, 7o1f:D, 7o1f:F, 8p9o:A
2	8gj5:B	257	254	0.8093	0.8093	0.8189	4.98e-158	8gj5:A, 8gj5:C, 8gjf:A, 8gjf:B, 8gjf:C
3	6qh1:C	242	253	0.6693	0.7107	0.6798	9.63e-127
4	6o09:F	262	254	0.5409	0.5305	0.5472	5.59e-106	6o09:C, 6o09:H, 6o09:A, 6o09:D, 6o09:K, 2zvv:B, 2zvv:A, 2zvw:A, 2zvw:B, 2zvw:C, 2zvw:D, 2zvw:E, 2zvw:F, 2zvw:G, 2zvw:H
5	1vyj:G	260	254	0.5331	0.5269	0.5394	5.48e-102	1axc:A, 1axc:C, 1axc:E, 6cbi:C, 6cbi:A, 6cbi:D, 6cbi:E, 8cob:A, 8cob:C, 8cob:E, 4d2g:C, 4d2g:B, 5e0u:A, 5e0u:B, 5e0u:C, 5e0v:A, 5e0v:B, 6eht:C, 6eht:B, 8f5q:A, 8f5q:C, 8f5q:E, 6gis:A, 8gl9:A, 8gl9:B, 8gla:A, 8gla:B, 6gws:C, 6gws:A, 6gws:B, 6hvo:B, 6hvo:C, 6hvo:A, 5iy4:A, 5iy4:C, 5iy4:E, 6k3a:A, 6k3a:C, 6k3a:E, 7kq0:A, 7kq0:C, 7kq0:E, 7kq1:A, 7kq1:C, 7kq1:E, 7m5l:A, 7m5l:B, 7m5l:C, 7m5m:A, 7m5m:B, 7m5n:B, 7m5n:A, 5mav:C, 5mav:A, 5mav:B, 5mav:F, 5mav:D, 5mav:E, 5mlo:A, 5mlo:C, 5mlo:E, 5mlw:A, 5mlw:C, 5mlw:E, 7nv0:D, 7nv1:D, 3p87:A, 3p87:D, 3p87:B, 3p87:C, 3p87:E, 3p87:F, 6qc0:A, 6qc0:C, 6qc0:E, 6qcg:C, 6qcg:B, 6qcg:F, 6qcg:A, 6qcg:D, 6qcg:E, 7qo1:F, 4rjf:A, 4rjf:C, 4rjf:E, 1u76:A, 1u76:C, 1u76:E, 1u7b:A, 3vkx:A, 1vyj:A, 1vyj:C, 1vyj:E, 1vyj:I, 1vyj:K, 3wgw:A, 3wgw:B, 5yco:A, 5yco:B, 5yco:C, 5yd8:Z, 5yd8:X, 5yd8:Y, 4ztd:B, 4ztd:A, 4ztd:C, 2zvk:A, 2zvk:B, 2zvk:C, 2zvl:A, 2zvl:B, 2zvl:C, 2zvl:D, 2zvl:E, 2zvl:F, 2zvm:A, 2zvm:B, 2zvm:C
6	6e49:C	254	254	0.4669	0.4724	0.4724	1.08e-83	3v61:B
7	3k4x:A	758	254	0.4669	0.1583	0.4724	2.45e-78	6e49:B, 6e49:A, 2od8:A, 3v62:B, 3v62:E, 5zut:A
8	3k4x:A	758	257	0.4708	0.1596	0.4708	2.53e-78	6e49:B, 6e49:A, 2od8:A, 3v62:B, 3v62:E, 5zut:A
9	3k4x:A	758	253	0.4669	0.1583	0.4743	3.85e-78	6e49:B, 6e49:A, 2od8:A, 3v62:B, 3v62:E, 5zut:A
10	6k2m:E	258	254	0.4241	0.4225	0.4291	3.62e-74	7wp3:A
11	7rpw:C	245	249	0.2296	0.2408	0.2369	2.54e-20
12	1rxm:A	245	250	0.2607	0.2735	0.2680	2.93e-20	1rxz:A
13	1isq:A	240	255	0.2412	0.2583	0.2431	1.43e-19
14	1ud9:A	242	246	0.2257	0.2397	0.2358	8.93e-19	1ud9:B, 1ud9:C, 1ud9:D
15	6t7y:A	238	255	0.2412	0.2605	0.2431	1.19e-18
16	5dai:A	247	235	0.2218	0.2308	0.2426	1.22e-17
17	2io4:B	246	254	0.1946	0.2033	0.1969	5.90e-12	2io4:D
18	3h77:B	338	40	0.0545	0.0414	0.3500	2.3	3h77:A, 3h78:A, 3h78:B
19	1fvs:A	72	14	0.0311	0.1111	0.5714	3.4	2ggp:B
20	2pd3:A	274	73	0.0778	0.0730	0.2740	5.0	8jfm:A, 8jfm:B, 8jfm:C, 8jfm:D, 8jfm:E, 8jfm:F, 8jfm:G, 8jfm:H, 8jfn:A, 2pd3:B, 2pd3:C, 2pd3:D, 2pd4:A, 2pd4:B, 2pd4:C, 2pd4:D
21	6djk:A	376	30	0.0428	0.0293	0.3667	7.6
22	1wmd:A	434	71	0.0856	0.0507	0.3099	8.1	5fax:A, 5fax:B, 5fbz:A, 5fbz:C, 1wme:A, 1wmf:A
23	8xd5:A	419	123	0.1206	0.0740	0.2520	8.1	8hho:A, 8hiq:A, 8hiz:A, 8hj9:A, 8xco:A, 8xcp:A, 8xcq:A, 8xcr:A, 8xcs:A, 8xct:A, 8xcu:A, 8xcv:A, 8xcw:A, 8xcx:A, 8xcy:A, 8xcz:A, 8xd0:A, 8xd1:A, 8xd2:A, 8xd3:A, 8xd4:A, 8xd6:A, 8znb:A, 8znc:A, 8znd:A, 8zne:A, 8zng:A

[Back]