Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
ALVIAVYGKGGIGKSTTSSNLSAAFSKLGKKVLQIGCDPKHDSTFTLTHKMVPTVIDILEEVDFHSEELRPQDFMFEGFN
GVQCVESGGPPAGTGCGGYVTGQTVKLLKEHHLLEDTDVVIFDVLGDVVCGGFAAPLQHANYCLIVTANDFDSIFAMNRI
VAAINAKAKNYKVRLGGVIANRSAELDQIEKFNEKTGLKTMAHFRNVDAIRRSRLKKCTIFEMDPEEEGVLEVQNEYLSL
AKKMIDNVEPLEAEPLKDREIFDLLGF

The query sequence (length=267) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2ynm:B 268 267 1.0000 0.9963 1.0000 0.0 2ynm:A
2 3fwy:A 268 267 0.7079 0.7052 0.7079 1.67e-143 3fwy:B, 6uyk:A, 6uyk:B, 6uyk:C, 6uyk:D
3 2afh:E 289 271 0.4082 0.3772 0.4022 1.31e-52 2afh:F, 2afi:E, 2afi:F, 2afi:G, 2afi:H, 2afi:M, 2afi:N, 2afi:O, 2afi:P, 2c8v:A, 1de0:A, 1de0:B, 8dfc:E, 8dfc:F, 8dfd:E, 8dfd:F, 8dfd:G, 8dfd:H, 1fp6:A, 1fp6:B, 1fp6:C, 1fp6:D, 1g1m:A, 1g1m:B, 1g20:E, 1g20:F, 1g20:G, 1g20:H, 1g21:E, 1g21:F, 1g21:G, 1g21:H, 1g5p:A, 1g5p:B, 1m1y:E, 1m1y:F, 1m1y:G, 1m1y:H, 1m1y:M, 1m1y:N, 1m1y:O, 1m1y:P, 1m34:E, 1m34:F, 1m34:G, 1m34:H, 1m34:M, 1m34:N, 1m34:O, 1m34:P, 1n2c:E, 1n2c:F, 1n2c:G, 1n2c:H, 6n4j:A, 6n4j:B, 6n4k:A, 6n4k:B, 6n4l:A, 6n4m:A, 1nip:B, 1nip:A, 2nip:A, 2nip:B, 6o0b:A, 6o0b:B, 6q93:A, 6q93:B, 6q93:C, 6q93:D, 6q93:E, 6q93:F, 6q93:G, 6q93:H, 1rw4:A, 7t4h:A, 8tc3:A, 8tc3:B, 7tne:A, 7tpn:A, 7tpo:A, 7tpv:A, 7tpw:A, 7tpx:A, 7tpy:A, 7tpz:A, 7tq0:A, 7tq9:A, 7tqc:A, 7tqe:A, 7tqf:A, 7tqh:A, 7tqi:A, 7tqj:A, 7tqk:A, 7ut8:E, 7ut8:F, 7ut9:E, 7ut9:F, 7uta:E, 7uta:F, 7uta:G, 7uta:H, 4wza:E, 4wza:F, 4wza:G, 4wza:H, 4wzb:E, 4wzb:F, 4wzb:G, 4wzb:H, 1xcp:A, 1xcp:B, 1xcp:C, 1xcp:D, 1xd8:A, 1xd8:B, 1xd9:A, 1xd9:B, 1xdb:A, 1xdb:B
4 7qqa:A 273 271 0.4120 0.4029 0.4059 2.58e-49 7qqa:B, 7qqa:C, 7qqa:D
5 1cp2:A 269 269 0.3521 0.3494 0.3494 2.57e-48 1cp2:B
6 8q5x:A 280 269 0.3820 0.3643 0.3792 1.43e-47 8q5x:C, 8q5x:B, 8q5x:D
7 8q5t:A 280 270 0.3858 0.3679 0.3815 3.05e-47 8q50:A, 8q5t:B, 8q5t:C, 8q5t:D, 8q5v:A, 8q5v:B, 8q5v:C, 8q5v:D, 8q5v:E, 8q5v:F, 8q5v:G, 8q5v:H, 8q5v:J, 8q5v:K, 8q5v:L, 8q5v:M
8 8q5w:G 281 270 0.3970 0.3772 0.3926 1.31e-46 8q5w:A, 8q5w:B, 8q5w:C, 8q5w:D, 8q5w:E, 8q5w:F, 8q5w:H, 8q5w:I, 8q5w:J, 8q5w:K, 8q5w:L
9 6nzj:A 273 271 0.3970 0.3883 0.3911 9.21e-46 6nzj:B
10 8oie:D 272 267 0.3858 0.3787 0.3858 3.69e-43 8oie:E, 8oie:I, 8oie:J
11 4v02:A 244 197 0.1948 0.2131 0.2640 8.70e-06 4v02:B, 4v03:A, 4v03:B
12 2bej:A 245 39 0.0712 0.0776 0.4872 1.07e-05 2bek:A, 2bek:B, 2bek:C, 2bek:D
13 5if9:A 251 41 0.0637 0.0677 0.4146 5.41e-04 5if9:B, 5ihp:A, 5ihp:B
14 1ion:A 243 33 0.0637 0.0700 0.5152 0.001
15 6iub:A 264 46 0.0787 0.0795 0.4565 0.001 6iub:B, 6iuc:A, 6iuc:B, 6iuc:C, 6iuc:D, 6iud:B, 6iud:C, 6iud:D, 6iud:A, 8jmj:A, 8jmj:B, 8jmj:C, 8jmj:D, 8jmk:A, 8jmk:B, 8jmk:C, 8jmk:D, 8jml:A, 8jml:B
16 1g3q:A 237 33 0.0637 0.0717 0.5152 0.005 1g3r:A
17 5zme:A 638 46 0.0562 0.0235 0.3261 0.011 5zmf:A
18 4rz3:A 244 26 0.0599 0.0656 0.6154 0.053 4rz3:B
19 6nop:B 262 82 0.1049 0.1069 0.3415 0.077 6non:B, 6noo:B, 6nop:A
20 7dut:A 220 49 0.0749 0.0909 0.4082 0.13 7dv3:A, 7dv3:B, 7dwr:A, 7dwr:D, 7dwr:B, 7dwr:C
21 3q9l:A 257 34 0.0449 0.0467 0.3529 0.14 3q9l:B, 3r9i:A, 3r9i:B, 3r9i:C, 3r9i:D, 3r9j:A, 3r9j:B
22 3kb1:A 243 25 0.0524 0.0576 0.5600 0.14 3kb1:B, 6oby:A, 6oby:B
23 1ii0:B 553 65 0.0674 0.0325 0.2769 0.15 1f48:A, 1ihu:A, 1ii0:A, 1ii9:A, 1ii9:B
24 1ii0:B 553 37 0.0449 0.0217 0.3243 4.7 1f48:A, 1ihu:A, 1ii0:A, 1ii9:A, 1ii9:B
25 5k5z:D 314 45 0.0637 0.0541 0.3778 0.15 5k5z:A, 5u1j:B, 5u1j:A, 5u1j:C, 5u1j:D
26 1rpx:A 230 90 0.1124 0.1304 0.3333 0.51 1rpx:B, 1rpx:C
27 7xt2:B 388 52 0.0599 0.0412 0.3077 0.51 7xt2:A
28 6sc2:B 3930 44 0.0637 0.0043 0.3864 0.62 6rla:A, 6rla:B, 6sc2:A
29 4rh7:A 3005 44 0.0637 0.0057 0.3864 0.68
30 2oze:A 284 64 0.0824 0.0775 0.3438 0.79
31 3cwq:A 206 36 0.0599 0.0777 0.4444 0.87 3cwq:B
32 4z7u:B 169 77 0.0749 0.1183 0.2597 0.91 4gg6:B
33 8bx8:C 3947 41 0.0712 0.0048 0.4634 0.93 7k58:C, 7k5b:C, 7kek:C
34 7ejw:A 274 266 0.2360 0.2299 0.2368 0.98 7ejw:B, 5j1j:A, 5j1j:B, 8p53:A, 8p53:B, 8pb9:A, 8pb9:B
35 6g2g:B 273 31 0.0412 0.0403 0.3548 1.3 6g2g:A
36 4jyb:A 323 44 0.0562 0.0464 0.3409 1.5 8dpb:A, 8dpb:B, 4jyb:B, 4jyc:D, 4lc1:A, 4lc1:B, 2qm7:A, 2qm7:B
37 3add:A 251 37 0.0562 0.0598 0.4054 1.7 3a4l:A, 3a4l:B, 3a4m:A, 3a4m:B, 3adb:A, 3adb:B, 3adc:A, 3adc:B, 3add:B, 3am1:A
38 5z7w:B 271 42 0.0599 0.0590 0.3810 2.2 5z7w:A
39 5u1g:D 211 36 0.0487 0.0616 0.3611 2.6 4dzz:A, 4dzz:B, 4e03:A, 4e03:B, 4e07:A, 4e07:B, 4e09:A, 5u1g:B, 5u1g:C, 5u1g:A
40 5aup:I 241 37 0.0487 0.0539 0.3514 2.7 5aun:B, 5auo:B, 5aup:B, 3vx3:A, 3vx3:B
41 4iok:A 557 35 0.0524 0.0251 0.4000 3.4 1fp7:A, 1fpm:A, 1fpm:B, 4iok:B, 4iol:A, 4iol:B, 4jjz:A, 4jjz:B, 4jki:A, 3qus:A, 3qus:B
42 3kjg:A 254 36 0.0487 0.0512 0.3611 4.4 3kjg:B, 3kjh:A, 3kji:A, 3kji:B
43 6riq:C 254 37 0.0449 0.0472 0.3243 4.8 6riq:D, 6riq:G, 6riq:J, 6riq:K, 6riq:M, 6riq:N, 6riq:Q, 6riq:R, 6riq:U, 6riq:V
44 3la6:B 260 37 0.0524 0.0538 0.3784 5.5 3la6:A, 3la6:C, 3la6:D, 3la6:E, 3la6:F, 3la6:G, 3la6:H, 3la6:I, 3la6:J, 3la6:K, 3la6:L, 3la6:M, 3la6:N, 3la6:O, 3la6:P
45 6cvd:B 303 37 0.0524 0.0462 0.3784 5.6 4c7o:B, 4c7o:D, 6cs8:A, 6cs8:B, 6cvd:A, 6dlx:A, 6dlx:B, 6fqd:A, 6fqd:B, 5gad:l, 6n6n:B, 5nco:l, 6nc1:A, 6nc4:A, 6nc4:B, 5niy:A, 7o9h:A, 7o9h:B, 2xxa:D, 2xxa:B, 3zn8:D
46 1h65:A 257 35 0.0524 0.0545 0.4000 6.2 3bb1:A, 3bb1:B, 3bb1:C, 3bb1:D, 3bb1:E, 3bb1:F, 3bb1:G, 3bb1:H, 1h65:B, 1h65:C
47 4n5k:A 318 54 0.0562 0.0472 0.2778 7.6 4bsb:A, 4bsc:A, 4bsd:A, 4bse:A, 4bsf:A, 4bsh:A, 4bsi:A, 6d8d:A, 6d8d:C, 6d8d:E, 4dj7:A, 4dj7:C, 4dj7:E, 4dj8:A, 4dj8:C, 4dj8:E, 6idb:A, 6idz:A, 4kom:A, 4kon:A, 4lkg:A, 4lkg:C, 4lkg:E, 4lkh:A, 4lkj:A, 4lkk:A, 4ln6:A, 4ln6:C, 4ln6:E, 4ln6:G, 4ln6:I, 4ln6:K, 4ln8:A, 4ln8:C, 4ln8:E, 4ln8:G, 4ln8:I, 4ln8:K, 4n5k:C, 4n60:A, 4n60:C, 4n61:A, 4n61:C, 4n62:A, 4n62:C, 4n63:A, 4n63:C, 4n64:A, 4n64:C, 5t6s:A, 5t6s:C, 5t6s:E, 5t6s:I, 5t6s:K, 5t6s:G, 5vjl:A, 5vjm:A
48 6z1q:BBB 337 69 0.0599 0.0475 0.2319 7.6 4dn5:A, 4dn5:B, 4g3d:A, 4g3d:D, 4idt:A, 4idt:B, 4idv:A, 4idv:B, 4idv:C, 4idv:D, 6wpp:A, 6wpp:B, 8yhw:A, 8yhw:B, 8yhw:C, 8yhw:D, 6z1q:AAA, 6z1t:AAA, 6z1t:BBB
49 5tvk:B 242 36 0.0599 0.0661 0.4444 8.5 3k9g:A, 5tvk:A
50 4ku4:A 171 75 0.0712 0.1111 0.2533 8.6 4ku4:B
51 8vcx:B 191 96 0.0824 0.1152 0.2292 9.4 6dig:B, 4gg6:D, 1jk8:B, 7kei:B, 5ks9:D, 5ks9:B, 5ksa:B, 5ksb:D, 5ksb:B, 5ksu:B, 5ksu:E, 5ksv:B, 2nna:B, 4ozf:B, 4ozg:D, 4ozg:B, 4ozh:D, 4ozh:B, 4ozi:D, 4ozi:B, 1s9v:B, 1s9v:E, 7sg0:B, 7sg1:B, 7sg1:G, 7sg2:B, 7sg2:G, 6u3m:B, 6u3m:D, 6u3n:B, 6u3o:F, 6u3o:D, 5ujt:B, 5ujt:E, 5ujt:H, 1uvq:B, 8vcy:B, 8vd2:B, 8vdd:B, 8vdu:B, 8vdu:E, 8vdu:H, 8vdu:K, 6xp6:B, 6xp6:E, 4z7u:D, 4z7v:D, 4z7v:B, 4z7w:D, 4z7w:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218