Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
ALMITDECINCDGCEPECPNGAISQGDETYVIEPSLCTECVGHYETSQCVEVCPVDCIIKDPSHEETEDELRAKYERITG
E

The query sequence (length=81) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3eun:A 81 81 0.9753 0.9753 0.9753 3.41e-52 1blu:A, 3exy:A
2 2fgo:A 81 81 0.6667 0.6667 0.6667 3.16e-35
3 2zvs:A 81 76 0.5802 0.5802 0.6184 1.16e-27 2zvs:B, 2zvs:C
4 1rgv:A 80 80 0.5185 0.5250 0.5250 3.89e-25
5 1fca:A 55 56 0.3333 0.4909 0.4821 5.81e-10 1fdn:A, 2fdn:A
6 1clf:A 55 55 0.2963 0.4364 0.4364 7.30e-09
7 1dur:A 55 55 0.2716 0.4000 0.4000 5.04e-05
8 8ahx:B 113 69 0.2716 0.1947 0.3188 0.002 8rb8:B, 8rb9:B, 8rbq:B
9 6fah:E 393 67 0.2469 0.0509 0.2985 0.003 6fah:A
10 8b6f:AL 218 87 0.3333 0.1239 0.3103 0.003 8bqs:AL, 8gym:s8, 8gym:S8, 8gzu:s8, 8gzu:S8, 7tgh:S8
11 7ak5:I 178 86 0.3457 0.1573 0.3256 0.004 7ak6:I, 7b93:I, 8c2s:I, 8ca3:I, 8ca5:I, 7dgq:E, 7dgr:E, 7dgs:E, 7dgz:E, 7dh0:E, 7dkf:E2, 6g2j:I, 6g72:I, 5gpn:b, 5gup:H, 8iao:I, 8iap:I, 8ib4:I, 8ib5:I, 8ib9:I, 8iba:I, 8ibd:I, 8ibe:I, 8ic2:I, 8ic3:I, 5lc5:I, 5ldw:I, 5ldx:I, 5lnk:9, 5o31:I, 8olt:I, 8om1:I, 7psa:I, 8pw5:9, 8pw6:9, 8pw7:9, 8q0a:I, 8q0f:I, 8q0j:I, 8q0m:I, 8q0o:I, 8q0q:I, 8q1p:I, 8q1u:I, 8q1y:I, 8q25:I, 8q45:I, 8q46:I, 8q47:I, 8q48:I, 8q49:I, 8q4a:I, 6q9d:S8, 6qa9:S8, 6qbx:S8, 6qc2:S8, 6qc3:S8, 6qc4:S8, 6qc5:S8, 6qc6:S8, 6qc7:S8, 6qc8:S8, 6qc9:S8, 6qca:S8, 6qcf:S8, 7qsd:I, 7qsk:I, 7qsl:I, 7qsm:I, 7qsn:I, 7qso:I, 7r41:I, 7r42:I, 7r43:I, 7r44:I, 7r45:I, 7r46:I, 7r47:I, 7r48:I, 7r4c:I, 7r4d:I, 7r4f:I, 7r4g:I, 8rgp:9, 8rgq:9, 8rgr:9, 8rgt:9, 8ud1:1I, 8ueo:1I, 8uep:1I, 8ueq:1I, 8uer:1I, 8ues:1I, 8uet:1I, 8ueu:1I, 8uev:1I, 8uew:1I, 8uex:1I, 8uey:1I, 8uez:1I, 8ugh:1I, 8ugi:1I, 8ugj:1I, 8ugn:1I, 8ugn:5I, 8ugp:1I, 8ugr:1I, 8ugr:5I, 7v2c:B, 7v2d:B, 7v2e:B, 7v2f:B, 7v2h:B, 7v2k:B, 7v2r:B, 7v30:B, 7v31:B, 7v32:B, 7v33:B, 7v3m:B, 7vb7:B, 7vbn:B, 7vbz:B, 7vwj:B, 7vxp:B, 7vxu:B, 7vy8:B, 7vya:B, 7vyf:B, 7vyh:B, 7vyn:B, 7vz1:B, 7vzv:B, 7vzw:B, 7w00:B, 7w0h:B, 7w0r:B, 7w0y:B, 7w1o:B, 7w1p:B, 7w1t:B, 7w1u:B, 7w1v:B, 7w1z:B, 7w20:B, 7w2k:B, 7w2l:B, 7w2r:B, 7w2u:B, 7w2y:B, 7w31:B, 7w32:B, 7w35:B, 7w4c:B, 7w4d:B, 7w4e:B, 7w4f:B, 7w4g:B, 7w4j:B, 7w4k:B, 7w4l:B, 7w4m:B, 7w4n:B, 7w4q:B, 5xtb:B, 5xtd:B, 5xth:B, 5xti:B, 5xti:BB, 7zd6:9, 7zdh:9, 7zdj:9, 7zdm:9, 7zdp:9, 7zeb:9, 6zk9:9, 6zkc:9, 6zkd:9, 6zke:9, 6zkf:9, 6zkg:9, 6zkh:9, 6zki:9, 6zkj:9, 6zkk:9, 6zkl:9, 6zkm:9, 6zkn:9, 6zko:9, 6zkp:9, 6zkq:9, 6zkr:9, 6zks:9, 6zkt:9, 6zku:9, 6zkv:9, 6zr2:I, 6ztq:I
12 8b9z:I 186 86 0.3457 0.1505 0.3256 0.004 8ba0:I, 8esw:S8, 8esz:S8
13 7arc:I 199 79 0.3333 0.1357 0.3418 0.004 7ard:I
14 8qby:I 159 79 0.3333 0.1698 0.3418 0.005
15 8e73:S8 181 86 0.3457 0.1547 0.3256 0.006 7a23:D, 7a24:D, 7aqr:I, 7ar7:I, 7ar8:I, 7arb:I, 8bee:I, 8bpx:I, 8bq5:I, 8bq6:I, 6x89:S8
16 7b0n:I 191 88 0.3457 0.1466 0.3182 0.013 6gcs:I, 7o6y:I, 7o71:I, 6rfq:I, 6rfr:I, 6rfs:I, 6y79:I, 6yj4:I
17 7zm7:I 185 88 0.3457 0.1514 0.3182 0.016 7zmb:I, 7zmg:I
18 1bc6:A 77 60 0.2593 0.2727 0.3500 0.018 1bd6:A, 1bqx:A, 1bwe:A
19 1bc6:A 77 22 0.1358 0.1429 0.5000 9.9 1bd6:A, 1bqx:A, 1bwe:A
20 1a6l:A 106 24 0.1852 0.1415 0.6250 0.021 1axq:A, 1b0t:A, 1b0v:A, 1b0v:B, 1b0v:C, 1b0v:D, 1d3w:A, 1f5b:A, 1f5c:A, 1fd2:A, 1fda:A, 1fdb:A, 1fdd:A, 2fd2:A, 5fd1:A, 6fd1:A, 6fdr:A, 7fd1:A, 7fdr:A, 1fer:A, 1ff2:A, 1frh:A, 1fri:A, 1frj:A, 1frk:A, 1frl:A, 1frm:A, 1frx:A, 1ftc:A, 1ftc:B, 1g3o:A, 1g6b:A, 1gao:A, 1gao:B, 1gao:C, 1gao:D, 1pc4:A, 1pc5:A
21 1a6l:A 106 43 0.1852 0.1415 0.3488 0.47 1axq:A, 1b0t:A, 1b0v:A, 1b0v:B, 1b0v:C, 1b0v:D, 1d3w:A, 1f5b:A, 1f5c:A, 1fd2:A, 1fda:A, 1fdb:A, 1fdd:A, 2fd2:A, 5fd1:A, 6fd1:A, 6fdr:A, 7fd1:A, 7fdr:A, 1fer:A, 1ff2:A, 1frh:A, 1fri:A, 1frj:A, 1frk:A, 1frl:A, 1frm:A, 1frx:A, 1ftc:A, 1ftc:B, 1g3o:A, 1g6b:A, 1gao:A, 1gao:B, 1gao:C, 1gao:D, 1pc4:A, 1pc5:A
22 1a6l:A 106 16 0.1235 0.0943 0.6250 4.8 1axq:A, 1b0t:A, 1b0v:A, 1b0v:B, 1b0v:C, 1b0v:D, 1d3w:A, 1f5b:A, 1f5c:A, 1fd2:A, 1fda:A, 1fdb:A, 1fdd:A, 2fd2:A, 5fd1:A, 6fd1:A, 6fdr:A, 7fd1:A, 7fdr:A, 1fer:A, 1ff2:A, 1frh:A, 1fri:A, 1frj:A, 1frk:A, 1frl:A, 1frm:A, 1frx:A, 1ftc:A, 1ftc:B, 1g3o:A, 1g6b:A, 1gao:A, 1gao:B, 1gao:C, 1gao:D, 1pc4:A, 1pc5:A
23 8a6t:B 630 55 0.2593 0.0333 0.3818 0.032 8a6t:E, 8bew:B, 8bew:E
24 8a6t:B 630 20 0.1235 0.0159 0.5000 2.4 8a6t:E, 8bew:B, 8bew:E
25 6zxu:A 701 62 0.2346 0.0271 0.3065 0.041 4ras:A, 4ras:B, 4ras:C, 6zxu:B, 6zxu:C, 6zxx:A, 6zxx:B, 6zxx:C, 6zy0:A, 6zy0:B, 6zy0:C, 6zy1:A, 6zy1:B, 6zy1:C
26 6h8k:I 137 67 0.2840 0.1679 0.3433 0.058
27 8oh5:B 584 54 0.2222 0.0308 0.3333 0.069 8oh5:E, 8oh5:H, 8oh5:K, 8oh9:B, 8oh9:E, 8oh9:H, 8oh9:K
28 6cin:B 1169 62 0.2099 0.0145 0.2742 0.077 6cin:A, 6cin:C, 6cin:D, 6cin:E, 6cin:F, 6cio:A, 6cio:B, 6cio:C, 6cio:D, 6cio:E, 6cio:F, 6cip:A, 6cip:B, 6cip:C, 6cip:D, 6cip:E, 6cip:F, 6ciq:A, 6ciq:B, 6ciq:C
29 7q4v:B 599 57 0.2469 0.0334 0.3509 0.086 8a5e:B, 7q4v:F, 7q4w:B, 7q4w:F
30 2ivf:B 337 65 0.2346 0.0564 0.2923 0.086
31 7t30:A 666 56 0.2469 0.0300 0.3571 0.26 7t2r:A, 7t2r:F, 7t30:F
32 2vpw:F 193 56 0.2099 0.0881 0.3036 0.29 2vpw:B, 2vpx:F, 2vpx:B, 2vpy:F, 2vpy:B, 2vpz:F, 2vpz:B
33 2vpw:F 193 61 0.2222 0.0933 0.2951 0.30 2vpw:B, 2vpx:F, 2vpx:B, 2vpy:F, 2vpy:B, 2vpz:F, 2vpz:B
34 7np8:B 620 49 0.2346 0.0306 0.3878 0.38 7np8:A, 7np8:C, 7np8:D
35 6cfw:N 121 79 0.2840 0.1901 0.2911 0.41
36 8iuf:S8 182 70 0.2593 0.1154 0.3000 0.44 8j9h:S8, 8j9i:S8, 8j9j:S8
37 7npa:A 618 47 0.2099 0.0275 0.3617 0.50 7npa:B, 7npa:C, 7npa:D, 7npa:E, 7npa:F, 7npa:G, 7npa:H, 7npa:I, 7npa:J, 7npa:K, 7npa:L, 7npa:M, 7npa:N, 7npa:O, 7npa:P
38 3gyx:B 166 34 0.1975 0.0964 0.4706 0.53 3gyx:D, 3gyx:F, 3gyx:H, 3gyx:J, 3gyx:L
39 6mu1:A 2149 41 0.1481 0.0056 0.2927 0.72 6mu1:C, 6mu1:B, 6mu1:D
40 7lhf:C 2300 41 0.1481 0.0052 0.2927 0.75 7lhe:A, 7lhe:D, 7lhe:C, 7lhe:B, 7lhf:A, 7lhf:D, 7lhf:B
41 8ear:A 2389 41 0.1481 0.0050 0.2927 0.75 8eaq:A, 8eaq:B, 8eaq:C, 8eaq:D, 8ear:D, 8ear:B, 8ear:C
42 6f0k:B 961 36 0.1481 0.0125 0.3333 0.87
43 5gug:A 1721 41 0.1481 0.0070 0.2927 0.97 5gug:B, 1n4k:A, 3t8s:B, 3uj0:A, 3uj0:B, 5xa1:A, 5xa1:B
44 7zc6:B 202 52 0.2099 0.0842 0.3269 1.2
45 2v2k:A 104 24 0.1481 0.1154 0.5000 1.4 2v2k:B
46 1f2g:A 58 59 0.1975 0.2759 0.2712 1.5 1fxd:A
47 8q4h:A 503 30 0.1358 0.0219 0.3667 1.8 8q4h:B
48 6cz7:B 234 77 0.2716 0.0940 0.2857 1.8 6cz7:D, 6cz8:D, 6cz8:B, 6cz9:B, 6cz9:D, 6cza:B, 6cza:D
49 6cz7:B 234 28 0.1605 0.0556 0.4643 3.4 6cz7:D, 6cz8:D, 6cz8:B, 6cz9:B, 6cz9:D, 6cza:B, 6cza:D
50 1h98:A 77 63 0.2099 0.2208 0.2698 2.0
51 1h98:A 77 23 0.1605 0.1688 0.5652 2.8
52 7vzg:B 76 67 0.2346 0.2500 0.2836 2.7
53 1hfe:L 396 69 0.2593 0.0530 0.3043 3.7 8bj7:A, 8bj8:A, 1e08:A, 1gx7:A, 1hfe:M, 6sg2:AAA
54 6u8y:N 176 57 0.2222 0.1023 0.3158 3.8 6u8y:n
55 7sl4:A 786 22 0.1235 0.0127 0.4545 4.0 8dtm:B
56 7sl6:A 819 22 0.1235 0.0122 0.4545 4.1 7mqs:F, 7mqs:E, 7sl1:A, 7sl1:B, 7sl2:A, 7sl2:B, 7sl6:B, 7sl7:A, 7sl7:B
57 7plm:A 1177 20 0.0988 0.0068 0.4000 5.4 7plm:B
58 1b0p:A 1231 20 0.0988 0.0065 0.4000 5.4 1b0p:B, 2c3m:A, 2c3m:B, 2c3o:A, 2c3o:B, 2c3p:A, 2c3p:B, 2c3u:A, 2c3u:B, 2c3y:A, 2c3y:B, 2c42:A, 2c42:B, 1kek:A, 1kek:B, 2pda:A, 2pda:B, 2uza:A, 2uza:B
59 8c0z:C 158 57 0.1975 0.1013 0.2807 5.5 8c0z:F
60 7wfg:I 160 85 0.2716 0.1375 0.2588 7.2 7wg5:I
61 4u7p:A 426 48 0.2099 0.0399 0.3542 8.2 3a1a:A, 3a1b:A, 8ba5:A, 6brr:A, 6brr:D, 6f57:A, 6f57:D, 6pa7:K, 6pa7:P, 4qbq:C, 4qbq:A, 4qbr:A, 4qbr:C, 4qbs:A, 2qrv:A, 2qrv:D, 2qrv:E, 2qrv:H, 8tdr:A, 8tdr:B, 8tdr:C, 8tdr:D, 8te1:A, 8te1:B, 8te1:C, 8te1:D, 8te3:A, 8te3:B, 8te3:C, 8te3:D, 8te4:A, 8te4:B, 8te4:C, 8te4:D, 4u7t:A, 4u7t:C, 6w89:A, 6w89:D, 6w89:G, 6w89:J, 6w8b:A, 6w8b:D, 6w8b:H, 6w8b:K, 6w8d:A, 6w8d:D, 6w8j:A, 6w8j:D, 5yx2:A, 5yx2:D
62 8u4j:B 600 64 0.2099 0.0283 0.2656 8.2
63 8k9e:B 951 27 0.1481 0.0126 0.4444 8.7 8k9f:B, 8x2j:B
64 4hea:9 180 20 0.1358 0.0611 0.5500 9.1 2fug:9, 2fug:G, 2fug:P, 2fug:Y, 4hea:O, 6i0d:9, 6i0d:O, 6i1p:9, 6i1p:O, 3i9v:9, 3i9v:G, 3iam:9, 3iam:G, 3ias:9, 3ias:G, 3ias:P, 3ias:Y, 3m9s:9, 3m9s:G, 6q8o:9, 6q8o:O, 6q8w:9, 6q8w:O, 6q8x:9, 6q8x:O, 6y11:9, 6y11:O, 2ybb:8, 6ziy:9, 6zjl:9, 6zjn:9, 6zjy:9
65 7p8n:a 642 22 0.1235 0.0156 0.4545 9.3 7p5h:A, 7p5h:D, 7p5h:a, 7p5h:d, 7p8n:A, 7p91:a, 7p91:A, 7p92:A
66 1ltl:E 242 40 0.1728 0.0579 0.3500 9.6 1ltl:A, 1ltl:B, 1ltl:C, 1ltl:D, 1ltl:F
67 8a8o:D 102 58 0.1975 0.1569 0.2759 10.0 8a8o:C
68 7vw6:A 913 43 0.1605 0.0142 0.3023 10.0 7e5z:A, 8j83:A, 7xqw:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218