Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ALLEIIHYPSKILRTISKEVVSFDAKLHQQLDDMYETMIASEGIGLAAIQVGLPLRMLIINLPQEDGVQHKEDCLEIINP
KFIETGGSMMYKEGCLSVPGFYEEVERFEKVKIEYQNRFAEVKVLEASELLAVAIQHEIDHLNGVLFVDKLSILKRKKFE
KEL

The query sequence (length=163) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2ew5:A 166 163 1.0000 0.9819 1.0000 1.33e-117 4e9a:A, 4e9b:A, 2ew6:A, 2ew7:A
2 1ix1:A 169 168 0.4908 0.4734 0.4762 8.63e-41 1ix1:B, 1lry:A, 1n5n:A, 1n5n:B, 1s17:A, 1s17:B
3 1ws1:A 151 152 0.4356 0.4702 0.4671 1.75e-40
4 6ck7:A 172 163 0.4172 0.3953 0.4172 4.14e-39 6ck7:B, 6ck7:C, 6ck7:D
5 5j46:A 169 164 0.4294 0.4142 0.4268 1.53e-38
6 6jex:A 172 159 0.4479 0.4244 0.4591 8.13e-38 6jer:A, 6jer:B, 6jet:A, 6jet:B, 6jeu:A, 6jeu:B, 6jev:A, 6jev:B, 6jew:A, 6jew:B, 6jex:B
7 1bs4:A 168 163 0.4110 0.3988 0.4110 1.30e-36 2ai8:A, 2ai8:B, 2ai8:C, 4al2:B, 4al3:A, 4az4:A, 1bs4:B, 1bs4:C, 1bs5:A, 1bs5:B, 1bs5:C, 1bs6:A, 1bs6:B, 1bs6:C, 1bs8:A, 1bs8:B, 1bs8:C, 1bsj:A, 1bsk:A, 1bsz:A, 1bsz:B, 1bsz:C, 7d6z:g, 1def:A, 2def:A, 1dff:A, 1g27:A, 1g27:B, 1g27:C, 1g2a:A, 1g2a:B, 1g2a:C, 3k6l:A, 3k6l:B, 2kmn:A, 1lru:A, 1lru:B, 1lru:C, 8ofe:A, 8rhr:A, 2w3t:A, 2w3u:A, 1xem:A, 1xen:A, 1xeo:A
8 3fwx:A 165 162 0.3988 0.3939 0.4012 1.36e-35 3fwx:B
9 3oca:A 179 164 0.3988 0.3631 0.3963 6.57e-35 3oca:B, 3u04:A
10 4wxl:C 165 161 0.3926 0.3879 0.3975 7.01e-35 4wxl:A, 4wxl:B, 4wxl:D
11 4dr8:A 188 148 0.3988 0.3457 0.4392 9.19e-34 4dr8:B, 4dr8:C, 4dr8:D, 4dr9:A, 4dr9:B, 4dr9:C, 4dr9:D
12 3qu1:A 168 164 0.4049 0.3929 0.4024 4.12e-33 3qu1:B
13 3cpm:A 184 151 0.3742 0.3315 0.4040 1.54e-29 3m6o:A, 3m6o:B, 3m6p:A, 3m6p:B, 3m6q:A, 3m6r:A, 3m6r:B, 3m6r:C, 3m6r:D, 3o3j:A, 3pn2:A, 3pn3:A, 3pn3:B, 3pn4:A, 3pn5:A, 3pn6:A, 3pn6:B
14 3uwb:A 149 149 0.3681 0.4027 0.4027 3.08e-25 3uwa:A
15 1jym:A 179 164 0.3681 0.3352 0.3659 5.99e-22 1jym:B, 1jym:C, 1jym:D, 1jym:E, 1jym:F, 1jym:G, 1jym:H, 1jym:I, 1jym:J, 1rl4:A, 1rl4:B, 1rqc:A, 1rqc:B, 1rqc:C, 1rqc:D, 1rqc:E, 1rqc:F, 1rqc:G, 1rqc:H, 1rqc:I, 1rqc:J
16 6jes:A 159 129 0.2945 0.3019 0.3721 7.99e-19 6jes:B, 6jf3:A, 6jf3:B, 6jf4:B, 6jf4:A, 6jf5:B, 6jf5:A, 6jf6:C, 6jf6:A, 6jf6:B, 6jf6:D, 6jf7:A, 6jf7:B, 6jf8:A, 6jf8:B, 6jf8:C, 6jf8:D
17 1y6h:A 177 173 0.3313 0.3051 0.3121 2.09e-18 1sv2:A, 1sv2:B, 1szz:A, 1szz:B, 1szz:C, 1szz:D, 1szz:E, 1szz:F, 1szz:G, 1szz:H, 1vev:A, 1vev:B, 1vey:A, 1vey:B, 1vez:A, 1vez:B, 1y6h:B
18 4je6:A 193 165 0.3129 0.2642 0.3091 1.56e-16 4je6:B, 4je7:A, 4je7:B, 4je8:A, 4je8:B, 1zxz:A, 1zxz:B, 1zy0:A, 1zy0:B, 1zy1:A, 1zy1:B
19 5mtc:A 137 142 0.3067 0.3650 0.3521 1.90e-16 5mtc:B, 5mtd:A, 5mtd:B, 5mte:A, 5mte:B
20 5kob:A 171 158 0.3129 0.2982 0.3228 4.53e-16 5kob:B, 5kob:C, 5kob:D, 5vcp:A, 5vcp:B, 5vcp:C, 5vcp:D
21 2okl:A 185 145 0.3006 0.2649 0.3379 6.76e-16 2okl:B
22 3e3u:A 196 153 0.2883 0.2398 0.3072 1.07e-15
23 2os3:A 205 172 0.3313 0.2634 0.3140 4.00e-14
24 3g5k:A 183 130 0.2699 0.2404 0.3385 6.61e-14 3g5k:B, 3g5k:C, 3g5k:D, 3g5p:A, 3g5p:B, 3g5p:C, 3g5p:D
25 1lqy:A 184 117 0.2454 0.2174 0.3419 7.01e-14
26 6jfc:B 161 156 0.2822 0.2857 0.2949 1.81e-13 6jfa:A, 6jfc:A, 6jfd:C, 6jfe:B, 6jff:B, 6jfn:B
27 5hgw:A 174 157 0.3252 0.3046 0.3376 9.83e-13 5hgw:B, 5i2b:A, 5t8z:A
28 5cy7:A 171 169 0.2945 0.2807 0.2840 1.02e-12 5cp0:A, 5cpd:A, 5cvk:A, 5cvp:A, 5cvq:A, 5cwx:A, 5cwy:A, 5cx0:A, 5cxj:A, 5cy8:A, 6ikt:A, 6iky:A, 6il0:A, 6il2:A, 4nt8:A
29 3l87:A 200 123 0.2515 0.2050 0.3333 1.98e-12
30 6ow7:P 196 170 0.3067 0.2551 0.2941 6.25e-12 2ai7:A, 2aia:A, 2aie:P, 4eox:P, 1lm6:A, 6ow2:P, 6ow7:Q, 3str:P, 3svj:P, 3sw8:P
31 5jex:A 203 138 0.2577 0.2069 0.3043 1.44e-11 5jez:A, 5jf0:A, 5jf1:A, 5jf2:A, 5jf3:A, 5jf4:A, 5jf5:A, 5jf6:A, 5jf7:A, 5jf8:A
32 1lm4:A 190 114 0.2393 0.2053 0.3421 4.81e-11 6jfg:A, 6jfo:A, 6jfq:A, 6jfr:A, 6jfs:A, 1lm4:B, 1lmh:A, 1lqw:A, 1lqw:B, 1q1y:A, 3u7k:A, 3u7l:A, 3u7m:A, 3u7n:A
33 3cmd:B 188 169 0.2822 0.2447 0.2722 1.77e-10 3cmd:A, 3g6n:A, 3g6n:B
34 2os1:A 179 169 0.2883 0.2626 0.2781 3.23e-10
35 5w8x:A 366 47 0.0798 0.0355 0.2766 1.7
36 6xzd:BP1 712 37 0.0920 0.0211 0.4054 1.8 6xzp:BP1, 6xzq:B, 6xzr:BP1, 6y0c:B
37 6u9d:B 607 54 0.0920 0.0247 0.2778 3.2 6bd3:A, 6bd3:B, 6bd9:A, 6bd9:B, 5fem:A, 5fem:B, 5ims:A, 5ims:B, 1jsc:A, 1jsc:B, 1n0h:A, 1n0h:B, 1t9a:A, 1t9a:B, 1t9b:B, 1t9c:A, 1t9c:B, 1t9d:A, 1t9d:D, 6u9d:A, 6u9d:E, 6u9d:F, 6u9d:I, 6u9d:J, 6u9d:M, 6u9d:N, 6u9d:Q, 6u9d:U, 6u9d:V, 5wkc:A, 5wkc:D, 5wkc:B, 5wkc:E
38 1t9b:A 583 54 0.0920 0.0257 0.2778 3.3 1t9d:B, 1t9d:C
39 2vtb:A 500 20 0.0613 0.0200 0.5000 5.6 2ijg:X, 2j4d:A, 2j4d:B, 2vtb:B, 2vtb:C, 2vtb:D, 2vtb:E, 2vtb:F
40 6gej:M 688 73 0.1227 0.0291 0.2740 6.3 6gen:M
41 7xn7:m 1187 40 0.0859 0.0118 0.3500 7.5 7xse:m, 7xsx:m, 7xsz:m, 7xt7:m, 7xtd:m, 7xti:m
42 7qh2:C 467 65 0.1043 0.0364 0.2615 7.8 7qh2:F

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218