Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ALFEPTLVVQALKEAVKKLNPQAQWRNPVMFIVWIGSLLTTCISIAMASGAMPGNALFSAAISGWLWITVLFANFAEALA
EGRSKAQANSLKGVKKTAFARKLREPKYGAAADKVPADQLRKGDIVLVEAGDIIPCDGEVIEGGASVDESAITGEAAPVI
RESGGDFASVTGGTRILSDWLVIECSVNPGETFLDRMIAMVEGAQRRKTPNEIALTILLIALTIVFLLATATLWPFSAWG
GNAVSVTVLVALLVCLIPTTIGGLLSAIGVAGMSRMLGANVIATSGRAVEAAGDVDVLLLDKTGTITLGNRQASEFIPAQ
GVDEKTLADAAQLASLADETPEGRSIVILAKQRFNLRERDVQSLHATFVPFTAQSRMSGINIDNRMIRKGSVDAIRRHVE
ANGGHFPTDVDQKVDQVARQGATPLVVVEGSRVLGVIALKDIVKGGIKERFAQLRKMGIKTVMITGDNRLTAAAIAAEAG
VDDFLAEATPEAKLALIRQYQAEGRLVAMTGDGTNDAPALAQADVAVAMNSGTQAAKEAGNMVDLDSNPTKLIEVVHIGK
QMLMTRGSLTTFSIANDVAKYFAIIPAAFAATYPQLNALNIMCLHSPDSAILSAVIFNALIIVFLIPLALKGVSYKPLTA
SAMLRRNLWIYGLGGLLVPFIGIKVIDLLLTVCGLV

The query sequence (length=676) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7nnl:B 682 676 0.9970 0.9883 0.9970 0.0 2a00:A, 2a29:A, 7bgy:B, 7bh1:B, 7bh2:B, 6hra:B, 6hrb:B, 7lc3:B, 7lc6:B, 5mrw:B, 5mrw:F, 5mrw:J, 7nnp:B, 7zrd:B, 7zre:B, 7zrg:B, 7zrh:B, 7zri:B, 7zrj:B, 7zrk:B, 7zrl:B, 7zrm:B
2 7r0h:A 654 524 0.2367 0.2446 0.3053 1.08e-53 3a1c:A, 3a1c:B, 3a1d:A, 3a1d:B, 3a1e:A, 3a1e:B
3 7si6:A 873 482 0.1997 0.1546 0.2801 1.82e-45 7si3:A, 7si7:A
4 4bbj:A 664 451 0.2071 0.2108 0.3104 3.90e-42 4bev:A, 4byg:A, 3rfu:A, 3rfu:B, 3rfu:C, 3rfu:D
5 8ioy:A 816 541 0.2160 0.1789 0.2699 4.05e-41
6 7qbz:A 638 495 0.2175 0.2304 0.2970 4.41e-41 7qc0:A
7 8q74:A 783 540 0.2056 0.1775 0.2574 3.45e-39 8q75:A, 8q76:A
8 4umv:A 605 520 0.2160 0.2413 0.2808 2.42e-38 4umw:A
9 3sky:A 261 279 0.1331 0.3448 0.3226 1.64e-32
10 6zhh:A 883 554 0.2012 0.1540 0.2455 5.10e-31 6zhf:A, 6zhg:A, 6zhh:B, 6zhh:C, 6zhh:D, 6zhh:E, 6zhh:F, 6zhh:G, 6zhh:H
11 7vh6:A 768 518 0.2012 0.1771 0.2625 3.52e-27 7vh6:B, 7vh6:C, 7vh6:D, 7vh6:E, 7vh6:F
12 8iwp:A 896 688 0.2456 0.1853 0.2413 1.31e-24 8iwr:A, 8iws:A, 8iwt:A, 8iwu:A, 8iww:A, 7yag:A, 7yah:A, 7yai:A, 7yaj:A, 7yam:A
13 7nxf:A 829 581 0.2145 0.1749 0.2496 2.54e-24 7ny1:A, 7ny1:B, 7ny1:C, 7ny1:D, 7ny1:E, 7ny1:F
14 5ksd:A 833 517 0.1893 0.1537 0.2476 2.89e-23 5ksd:B
15 8k1l:A 979 210 0.0843 0.0582 0.2714 8.17e-16
16 8k1l:A 979 299 0.1154 0.0797 0.2609 8.13e-06
17 5zmw:A 1000 183 0.0784 0.0530 0.2896 2.66e-15 5a3q:A, 5a3r:A, 5a3s:A, 5a3s:B, 2agv:A, 2agv:B, 3ar2:A, 3ar3:A, 3ar4:A, 3ar5:A, 3ar6:A, 3ar7:A, 3ar8:A, 3ar9:A, 3b9b:A, 3b9r:A, 3b9r:B, 3ba6:A, 4bew:A, 4bew:B, 2by4:A, 2c88:A, 2c8k:A, 2c8l:A, 2c9m:A, 2c9m:B, 2dqs:A, 2ear:A, 2eat:A, 2eau:A, 3fgo:A, 3fgo:B, 3fpb:A, 3fps:A, 4h1w:A, 6hef:A, 1iwo:A, 1iwo:B, 4j2t:A, 3j7t:A, 4kyt:A, 3n5k:A, 3n5k:B, 3n8g:A, 3nal:A, 3nam:A, 3nan:A, 4nab:A, 5ncq:A, 2o9j:A, 2oa0:A, 8owa:A, 8owl:A, 6rb2:A, 1su4:A, 1t5s:A, 1t5t:A, 3tlm:A, 4uu0:A, 4uu1:A, 1vfp:A, 1vfp:B, 3w5a:A, 3w5a:B, 3w5b:A, 1wpg:A, 1wpg:B, 1wpg:C, 1wpg:D, 5xa7:A, 5xa8:A, 5xa9:A, 5xaa:A, 4xou:A, 1xp5:A, 6yaa:A, 4ycl:A, 4ycm:A, 4ycn:A, 2yfy:A, 6yso:A, 6yso:B, 2zbd:A, 2zbe:A, 2zbe:B, 2zbf:A, 2zbg:A
18 5zmw:A 1000 318 0.1124 0.0760 0.2390 0.001 5a3q:A, 5a3r:A, 5a3s:A, 5a3s:B, 2agv:A, 2agv:B, 3ar2:A, 3ar3:A, 3ar4:A, 3ar5:A, 3ar6:A, 3ar7:A, 3ar8:A, 3ar9:A, 3b9b:A, 3b9r:A, 3b9r:B, 3ba6:A, 4bew:A, 4bew:B, 2by4:A, 2c88:A, 2c8k:A, 2c8l:A, 2c9m:A, 2c9m:B, 2dqs:A, 2ear:A, 2eat:A, 2eau:A, 3fgo:A, 3fgo:B, 3fpb:A, 3fps:A, 4h1w:A, 6hef:A, 1iwo:A, 1iwo:B, 4j2t:A, 3j7t:A, 4kyt:A, 3n5k:A, 3n5k:B, 3n8g:A, 3nal:A, 3nam:A, 3nan:A, 4nab:A, 5ncq:A, 2o9j:A, 2oa0:A, 8owa:A, 8owl:A, 6rb2:A, 1su4:A, 1t5s:A, 1t5t:A, 3tlm:A, 4uu0:A, 4uu1:A, 1vfp:A, 1vfp:B, 3w5a:A, 3w5a:B, 3w5b:A, 1wpg:A, 1wpg:B, 1wpg:C, 1wpg:D, 5xa7:A, 5xa8:A, 5xa9:A, 5xaa:A, 4xou:A, 1xp5:A, 6yaa:A, 4ycl:A, 4ycm:A, 4ycn:A, 2yfy:A, 6yso:A, 6yso:B, 2zbd:A, 2zbe:A, 2zbe:B, 2zbf:A, 2zbg:A
19 5ztf:A 972 193 0.0799 0.0556 0.2798 1.68e-14
20 5ztf:A 972 292 0.1065 0.0741 0.2466 0.005
21 7w7t:A 1021 193 0.0799 0.0529 0.2798 2.01e-14 7bt2:A, 7e7s:A, 6hxb:A, 6jju:A, 6lle:A, 6lly:A, 6ln5:A, 6ln6:A, 6ln7:A, 6ln8:A, 6ln9:A, 5mpm:A, 2voy:B, 2voy:H, 2voy:E, 2voy:K, 7w7u:A, 7w7v:A, 7w7w:A
22 7w7t:A 1021 306 0.1124 0.0744 0.2484 0.009 7bt2:A, 7e7s:A, 6hxb:A, 6jju:A, 6lle:A, 6lly:A, 6ln5:A, 6ln6:A, 6ln7:A, 6ln8:A, 6ln9:A, 5mpm:A, 2voy:B, 2voy:H, 2voy:E, 2voy:K, 7w7u:A, 7w7v:A, 7w7w:A
23 7wyu:A 993 225 0.0814 0.0554 0.2444 5.90e-14 3a3y:A, 5avq:A, 5avr:A, 5avs:A, 5avt:A, 5avu:A, 5avv:A, 5avw:A, 5avx:A, 5avy:A, 5avz:A, 5aw0:A, 5aw1:A, 5aw2:A, 5aw3:A, 5aw4:A, 5aw5:A, 5aw6:A, 5aw7:A, 5aw8:A, 5aw9:A, 8jfz:C, 8jfz:A, 7wyu:C, 7wyv:A, 7wyv:C, 7wyw:A, 7wyw:C, 7wyx:A, 7wyx:C, 7wyy:A, 7wyy:C, 7wyz:A, 7wyz:C, 7wz0:A, 7wz0:C, 7y45:C, 7y45:A, 7y46:C, 7y46:A, 2zxe:A
24 7wyu:A 993 296 0.1139 0.0775 0.2601 1.01e-05 3a3y:A, 5avq:A, 5avr:A, 5avs:A, 5avt:A, 5avu:A, 5avv:A, 5avw:A, 5avx:A, 5avy:A, 5avz:A, 5aw0:A, 5aw1:A, 5aw2:A, 5aw3:A, 5aw4:A, 5aw5:A, 5aw6:A, 5aw7:A, 5aw8:A, 5aw9:A, 8jfz:C, 8jfz:A, 7wyu:C, 7wyv:A, 7wyv:C, 7wyw:A, 7wyw:C, 7wyx:A, 7wyx:C, 7wyy:A, 7wyy:C, 7wyz:A, 7wyz:C, 7wz0:A, 7wz0:C, 7y45:C, 7y45:A, 7y46:C, 7y46:A, 2zxe:A
25 8d3x:A 989 225 0.0784 0.0536 0.2356 2.25e-13 8d3u:A, 8d3w:A
26 8d3x:A 989 298 0.1154 0.0789 0.2617 8.19e-07 8d3u:A, 8d3w:A
27 7x20:A 986 201 0.0754 0.0517 0.2537 2.95e-13 8ijl:A, 8ijm:A, 7x21:A, 7x22:A, 7x23:A, 7x24:A
28 7x20:A 986 296 0.1080 0.0740 0.2466 1.66e-08 8ijl:A, 8ijm:A, 7x21:A, 7x22:A, 7x23:A, 7x24:A
29 7efl:A 987 180 0.0754 0.0517 0.2833 4.02e-13 7efm:A, 7efn:A, 7et1:A, 8ijv:A, 8ijw:A, 8ijx:A, 8jmn:A, 6jxh:A, 6jxi:A, 6jxj:A, 6jxk:A, 6jxk:E, 7w47:A, 7w48:A, 7w49:A, 7w4a:A, 8wa5:A, 5ylu:A, 5ylv:A
30 7efl:A 987 207 0.0843 0.0578 0.2754 3.14e-10 7efm:A, 7efn:A, 7et1:A, 8ijv:A, 8ijw:A, 8ijx:A, 8jmn:A, 6jxh:A, 6jxi:A, 6jxj:A, 6jxk:A, 6jxk:E, 7w47:A, 7w48:A, 7w49:A, 7w4a:A, 8wa5:A, 5ylu:A, 5ylv:A
31 3b8e:A 998 225 0.0799 0.0541 0.2400 5.05e-13 3b8e:C, 7d91:A, 7d92:A, 7d93:A, 7d93:C, 7d94:A, 7d94:C, 7ddf:A, 7ddf:C, 7ddh:A, 7ddh:C, 7ddi:A, 7ddi:C, 7ddk:A, 7ddk:C, 7ddl:A, 7ddl:C, 7e1z:A, 7e20:A, 7e21:A, 4hqj:A, 4hqj:C, 4hyt:A, 4hyt:C, 8jbk:A, 8jbk:C, 8jbl:A, 8jbl:C, 8jbm:A, 8jbm:C, 3kdp:A, 3kdp:C, 1mo8:A, 3n23:A, 3n23:C, 7qtv:A, 7qtv:C, 4res:A, 4res:C, 4ret:A, 4ret:C, 3wgu:A, 3wgu:C, 3wgv:A, 3wgv:C, 7wys:A, 7wys:C, 7wyt:A, 7wyt:C, 4xe5:A, 7yzr:A, 7yzr:C, 7z04:A, 7z04:C
32 3b8e:A 998 296 0.1169 0.0792 0.2669 1.81e-07 3b8e:C, 7d91:A, 7d92:A, 7d93:A, 7d93:C, 7d94:A, 7d94:C, 7ddf:A, 7ddf:C, 7ddh:A, 7ddh:C, 7ddi:A, 7ddi:C, 7ddk:A, 7ddk:C, 7ddl:A, 7ddl:C, 7e1z:A, 7e20:A, 7e21:A, 4hqj:A, 4hqj:C, 4hyt:A, 4hyt:C, 8jbk:A, 8jbk:C, 8jbl:A, 8jbl:C, 8jbm:A, 8jbm:C, 3kdp:A, 3kdp:C, 1mo8:A, 3n23:A, 3n23:C, 7qtv:A, 7qtv:C, 4res:A, 4res:C, 4ret:A, 4ret:C, 3wgu:A, 3wgu:C, 3wgv:A, 3wgv:C, 7wys:A, 7wys:C, 7wyt:A, 7wyt:C, 4xe5:A, 7yzr:A, 7yzr:C, 7z04:A, 7z04:C
33 2yj4:B 252 271 0.0962 0.2579 0.2399 5.14e-13 2iye:A, 2iye:C, 2yj3:A, 2yj4:A, 2yj5:A, 2yj5:B, 2yj6:A, 2yj6:B
34 7m5x:A 1000 630 0.2012 0.1360 0.2159 9.22e-13 7fjp:B, 7fjq:A, 8ien:P, 7m5y:A
35 8ieo:P 1031 649 0.2056 0.1348 0.2142 3.62e-10 8iem:P
36 7vpk:A 1055 674 0.2086 0.1336 0.2092 7.68e-10 8iek:P, 8ies:P, 7m5v:A, 7n70:A, 7n72:A, 7n73:A, 7n74:A, 7n77:A, 7n78:A, 7vpi:A, 7vpj:A, 7vpl:A
37 6xmt:A 1092 430 0.1464 0.0907 0.2302 1.76e-05 6xmq:A, 6xms:A, 6xmu:A
38 6xmt:A 1092 49 0.0296 0.0183 0.4082 0.009 6xmq:A, 6xms:A, 6xmu:A
39 7op8:A 1118 89 0.0370 0.0224 0.2809 0.001 7op1:A, 7op3:A, 7op5:A
40 7op8:A 1118 296 0.0976 0.0590 0.2230 0.002 7op1:A, 7op3:A, 7op5:A
41 7op8:A 1118 105 0.0429 0.0259 0.2762 2.4 7op1:A, 7op3:A, 7op5:A
42 7rd6:A 929 239 0.0740 0.0538 0.2092 0.022 7rd7:A, 7rd8:A
43 7rd6:A 929 38 0.0192 0.0140 0.3421 10.0 7rd7:A, 7rd8:A
44 7vgh:B 1183 68 0.0311 0.0178 0.3088 0.11 7vgi:B
45 8oxa:A 1035 68 0.0311 0.0203 0.3088 0.11 8ox5:A, 8oxb:A, 8oxc:A
46 8ox4:A 870 68 0.0311 0.0241 0.3088 0.11
47 8ox8:A 1125 68 0.0311 0.0187 0.3088 0.11 8ox7:A, 8ox9:A, 7py4:A, 7vgj:A
48 6ef8:A 407 90 0.0340 0.0565 0.2556 0.93 6ef8:B, 6ef8:C, 6ef8:D, 6ef8:E, 6ef8:F, 6ef8:G, 6nef:A
49 6kdv:B 283 45 0.0266 0.0636 0.4000 1.5 6kdv:D, 6kdv:C, 6kdv:A
50 6roh:A 1112 64 0.0281 0.0171 0.2969 1.9 7oh4:A, 7oh5:A, 7oh6:A, 7oh7:A, 7pem:A, 6roi:A, 6roj:A
51 5a79:A 177 110 0.0488 0.1864 0.3000 2.0 5a7a:A
52 1nf2:A 267 44 0.0207 0.0524 0.3182 2.2 1nf2:B, 1nf2:C
53 6k7l:A 992 153 0.0488 0.0333 0.2157 2.4 6k7i:A, 6k7j:A, 6k7k:A, 6k7m:A, 6k7n:A
54 2bjf:A 328 66 0.0281 0.0579 0.2879 6.3 2rlc:A
55 2go7:C 205 103 0.0429 0.1415 0.2816 6.6 2go7:A, 2go7:B, 2go7:D
56 3gyg:B 230 83 0.0325 0.0957 0.2651 7.0
57 6n7e:D 319 79 0.0311 0.0658 0.2658 8.1 4iy0:A, 5lxq:A, 5lxq:H, 6n7e:A, 4p1g:A, 4p1o:A, 4p1o:B
58 3r4c:A 268 44 0.0192 0.0485 0.2955 8.9
59 5gan:B 1781 44 0.0207 0.0079 0.3182 9.1 4bgd:A, 5gao:B, 5gap:B, 5nrl:B, 5zwm:D, 5zwo:D
60 6ao1:A 354 101 0.0459 0.0876 0.3069 9.3 6ao1:B, 6ao1:C, 6ao1:D
61 5g5x:A 119 73 0.0296 0.1681 0.2740 9.6

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218