BioLiP

>protein
ALAAPPGELTLALTPDDKTLDPASLDRALAILAEHGILVLTGMLRTRLTDQLRTAMLDDLPEVLRQQDVPTNFVPGHVQQ
DPPVRESLLFPDVLLNPVVYQITHAVLGADARNAVYSGNMNLPGSHEQPVHLDEPHLWPGISHPPYCLCVDVPLIDFTLE
NGSTEYWPGSHVLNPDECYDERGCVLPAELERRRAVAPPVRFPIPVGSVVIRDGRLWHRGVPNLSAAPRPLLAMTHYTEW
FDMPPIQLPDTVKSWVDGSDRHTHAHFVAGDVDHLTGDHPFA

The query sequence (length=282) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6s0v:B	284	282	1.0000	0.9930	1.0000	0.0	7cl3:A, 7cl3:B, 7cl3:C, 7cl3:D, 7cl3:E, 7cl3:F, 7cl5:A, 7cl5:B, 7cl5:C, 7cl5:D, 7cl5:E, 7cl5:F, 7cl6:A, 7cl6:B, 7cl6:C, 7cl6:D, 7cl6:E, 7cl6:F, 6s0s:A, 6s0s:B, 6s0s:C, 6s0s:D, 6s0s:E, 6s0s:F, 6s0u:A, 6s0u:B, 6s0u:C, 6s0u:D, 6s0u:E, 6s0u:F, 6s0v:A, 6s0v:C, 6s0v:D, 6s0v:E, 6s0v:F, 6s0w:A, 6s0w:B, 6s0w:C, 6s0w:D, 6s0w:E, 6s0w:F
2	7eyr:C	279	223	0.1950	0.1971	0.2466	1.41e-07	7eyr:A, 7eyr:B, 7eyr:D, 7eys:C, 7eyt:C, 7eyt:A, 7eyt:B, 7eyt:D, 7eyu:B, 7eyu:A, 7eyw:C, 7eyw:A, 7eyw:B, 7eyw:D, 7fcb:C
3	7etl:A	294	241	0.2340	0.2245	0.2739	5.40e-07	7de0:B, 7de0:A, 7de0:C, 7de0:D, 7etk:A, 7etk:B, 7etl:B, 6oxh:A, 6oxh:B, 6oxj:A, 6oxj:B, 7wsb:A, 7wsb:B, 7wsb:C, 7wsb:D, 7wsb:E, 7wsb:F, 4y5s:A, 4y5s:B, 4y5t:A, 4y5t:B
4	5zm3:B	286	226	0.2021	0.1993	0.2522	6.08e-05	7wpy:A, 7wpy:B, 7wpy:C, 7wpy:D, 5zm3:A, 5zm3:C, 5zm3:D, 5zm4:A, 5zm4:B, 5zm4:C, 5zm4:D
5	5m0t:A	287	156	0.1454	0.1429	0.2628	1.76e-04	5m0t:B
6	5ybn:A	296	223	0.1844	0.1757	0.2332	3.50e-04	5ybn:B, 5ybo:A, 5ybo:B, 5ybp:A, 5ybp:B, 5ybq:A, 5ybq:B, 5ybr:A, 5ybr:B, 5ybs:A, 5ybs:B, 5ybt:A, 5ybt:B
7	4nao:A	282	217	0.2021	0.2021	0.2627	5.53e-04
8	7vbq:A	276	165	0.1383	0.1413	0.2364	0.022
9	5ybl:B	273	196	0.1560	0.1612	0.2245	0.024	5ybl:A, 5ybl:C, 5ybl:D
10	7vbq:B	271	165	0.1418	0.1476	0.2424	0.029
11	7dt0:H	241	92	0.0993	0.1162	0.3043	0.21
12	8yo4:A	442	100	0.1064	0.0679	0.3000	0.45	8ylu:A, 8ylu:B, 8yo4:B, 8yo7:A, 8yo7:B, 8yon:A, 8yon:B
13	5nci:B	264	104	0.1064	0.1136	0.2885	1.8	5nci:A, 5ncj:A, 5ncj:B
14	5yvm:A	403	30	0.0355	0.0248	0.3333	2.6	5yvr:A, 5yvs:A
15	4fer:A	207	39	0.0496	0.0676	0.3590	3.0	4fft:A, 4fg2:A, 4fg2:B, 4fg4:B
16	7dzz:B	268	108	0.1099	0.1157	0.2870	3.0	7dt0:A, 7dt0:B, 7dt0:C, 7dt0:D, 7dt0:E, 7dt0:F, 7dt0:G, 7dzz:A, 7e00:A, 7e00:B, 7e01:A, 7e06:A, 7e06:B, 7e07:A, 7e07:B, 7e08:A, 7e09:A, 8h7v:A, 8h7v:B, 8h7y:A, 8h7y:B, 8h81:A, 8h85:A
17	2ash:A	361	46	0.0532	0.0416	0.3261	3.5	2ash:B, 2ash:C, 2ash:D
18	2okk:A	483	46	0.0567	0.0331	0.3478	4.2
19	5d0f:A	1526	26	0.0426	0.0079	0.4615	4.5	5d0f:B, 7eim:A, 7eim:B, 7ejp:A, 7ejp:B, 7ejt:A, 7ejt:B, 7ekw:B, 7ekx:B, 7ekx:A
20	5erl:D	258	86	0.0851	0.0930	0.2791	4.6	5ep9:A, 5ep9:B, 5ep9:C, 5ep9:D, 5equ:A, 5equ:B, 5equ:C, 5equ:D, 5erl:A, 5erl:B, 5erl:C
21	2yba:B	382	56	0.0638	0.0471	0.3214	4.9	3c9c:A, 2xyi:A, 2yb8:B
22	2rdn:A	275	118	0.1099	0.1127	0.2627	5.6	2rdq:A, 2rdr:A, 2rds:A
23	4xac:A	245	112	0.1170	0.1347	0.2946	5.6

[Back]