BioLiP

>protein
AKTMKKIYVTMKTLSPLYTGEVRREDKEAAQKRVNFPVRKTATNKVLIPFKGALRSALEIMLKAKGENVCDTGESRARPC
GRCVTCSLFGSMGRAGRASVDFLISNDTKEQIVRESTHLDTFKGEEVIEGATFTATITISNPQEKDLSLIQSALKFIEEN
GIGGWLNKGYGRVSFEVKSEDVATDRFLK

The query sequence (length=189) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8yhd:B	199	199	1.0000	0.9497	0.9497	2.60e-137	8yhd:C, 8yhd:D, 8yhd:E, 8yhd:F, 8yhd:J, 8yhd:O, 8yhe:B, 8yhe:C, 8yhe:D, 8yhe:E, 8yhe:F, 8yhe:J, 8z4j:C, 8z4j:D, 8z4j:E, 8z4j:F, 8z4j:J, 8z4l:B, 8z4l:C, 8z4l:D, 8z4l:E, 8z4l:F, 8z4l:J, 8z99:B, 8z99:C, 8z99:D, 8z99:E, 8z99:F, 8z99:J, 8z99:P, 8z9c:B, 8z9c:C, 8z9c:D, 8z9c:E, 8z9c:F, 8z9c:J, 8z9e:C, 8z9e:D, 8z9e:E, 8z9e:F, 8z9e:J
2	8z9e:B	170	189	0.8995	1.0000	0.8995	7.00e-117	8yhd:A, 8z4j:B, 8z4l:A, 8z99:A, 8z9c:A
3	8yhe:A	115	187	0.6085	1.0000	0.6150	6.31e-63
4	4qts:C	186	147	0.1958	0.1989	0.2517	2.07e-06	4qts:D
5	7zol:B	1702	106	0.1746	0.0194	0.3113	3.46e-04	7zoq:B
6	7zol:B	1702	146	0.2116	0.0235	0.2740	0.092	7zoq:B
7	4n0l:A	335	36	0.0847	0.0478	0.4444	0.001	4n0l:B
8	6ifn:F	220	36	0.0794	0.0682	0.4167	0.010	6ifk:G, 6ifk:F, 6ifk:E, 6ifl:D, 6ifl:E, 6ifl:F, 6ifn:E, 6ifn:G, 6ifr:G, 6ifr:F, 6ifr:E, 6ifu:D, 6ifu:E, 6ifu:F, 6ify:G, 6ify:F, 6ify:E, 6ifz:G, 6ifz:F, 6ifz:E, 6ig0:G, 6ig0:F, 6ig0:E, 6nud:C, 6nud:E, 6nud:N, 6nud:O, 6nud:P, 6nue:C, 6nue:E, 6nue:N, 6nue:O, 6nue:P
9	8bmw:J	270	109	0.1429	0.1000	0.2477	0.079
10	7wah:A	1473	75	0.1005	0.0129	0.2533	0.16
11	7wah:A	1473	56	0.0899	0.0115	0.3036	0.80
12	8eey:A	1544	75	0.1005	0.0123	0.2533	0.16	7yna:A, 7ynb:A, 7ync:A
13	8eey:A	1544	51	0.0794	0.0097	0.2941	1.4	7yna:A, 7ynb:A, 7ync:A
14	3jyg:A	180	97	0.1376	0.1444	0.2680	0.17	3jyg:B, 3jyg:C, 3jyg:D, 3jyg:E, 3jyg:F
15	8wmi:A	1237	75	0.1005	0.0154	0.2533	0.17
16	8wmi:A	1237	53	0.0899	0.0137	0.3208	0.33
17	7y9x:A	1458	75	0.1005	0.0130	0.2533	0.17	8gs2:A
18	7y9x:A	1458	51	0.0794	0.0103	0.2941	1.4	8gs2:A
19	7yn9:A	1514	75	0.1005	0.0125	0.2533	0.17
20	7yn9:A	1514	56	0.0899	0.0112	0.3036	0.84
21	8wm4:A	1331	75	0.1005	0.0143	0.2533	0.17
22	8wm4:A	1331	56	0.0899	0.0128	0.3036	0.82
23	7ynd:A	1567	75	0.1005	0.0121	0.2533	0.17
24	7ynd:A	1567	51	0.0794	0.0096	0.2941	1.5
25	6mur:D	287	226	0.2646	0.1742	0.2212	0.18	6iqw:C, 6iqw:D, 6mur:C, 6mus:C, 6mus:D, 6mus:K, 6mut:C, 6mut:D, 6muu:C, 6muu:D, 6o7e:C, 6o7e:D, 6o7h:C, 6o7h:D, 6o7i:C, 6o7i:D, 6o7i:K
26	8wmc:A	1249	75	0.1005	0.0152	0.2533	0.19
27	8wmc:A	1249	51	0.0794	0.0120	0.2941	1.3
28	8eex:A	1284	75	0.1005	0.0148	0.2533	0.19
29	8eex:A	1284	51	0.0794	0.0117	0.2941	1.3
30	8d1v:A	1229	75	0.1005	0.0155	0.2533	0.20
31	8d1v:A	1229	62	0.0952	0.0146	0.2903	1.3
32	7xss:B	1282	129	0.1693	0.0250	0.2481	0.34	8d9f:B, 8d9h:B, 7x8a:A, 7xso:A, 7xsp:B, 7xt4:B
33	7y9y:A	1482	75	0.1005	0.0128	0.2533	1.1	8wml:A
34	7y9y:A	1482	51	0.0794	0.0101	0.2941	1.4	8wml:A
35	9ash:H	214	69	0.1164	0.1028	0.3188	1.4	9ash:F, 9ash:G, 9ash:I, 9asi:F, 9asi:H, 9asi:G, 9asi:I, 6xn3:F, 6xn3:H, 6xn3:G, 6xn3:I, 6xn4:F, 6xn4:H, 6xn4:G, 6xn5:I, 6xn5:F, 6xn5:H, 6xn5:G, 6xn7:F, 6xn7:H, 6xn7:G, 6xn7:I
36	7lt2:A	387	77	0.1005	0.0491	0.2468	1.4
37	8gna:A	1188	130	0.1640	0.0261	0.2385	1.5
38	8x5d:K	235	41	0.0741	0.0596	0.3415	1.8	8wfx:I, 8wfx:J, 8wfx:K, 8wfx:L, 8wfx:G, 8wfx:H, 8x5d:L, 8x5d:J, 8x5d:I, 8x5d:H
39	6xn7:B	277	30	0.0635	0.0433	0.4000	3.7	6xn3:B, 6xn4:B
40	9ash:B	297	28	0.0635	0.0404	0.4286	4.4	9asi:B, 6xn5:B
41	6aph:A	432	141	0.1799	0.0787	0.2411	6.5

[Back]