Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
AKLLITGGCGFLGSNLASFALSQGIDLIVFDNLSRKGATDNLHWLSSLGNFEFVHGDIRNKNDVTRLITKYMPDSCFHLA
GQVAMTTSIDNPCMDFEINVGGTLNLLEAVRQYNSNCNIIYSSTNKVYGDLEQYKYNETETRYTCVDKPNGYDESTQLDF
HSPYGCSKGAADQYMLDYARIFGLNTVVFRHSSMYGGRQFATYDQGWVGWFCQKAVEIKNGINKPFTISGNGKQVRDVLH
AEDMISLYFTALANVSKIRGNAFNIGGTIVNSLSLLELFKLLEDYCNIDMRFTNLPVRESDQRVFVADIKKITNAIDWSP
KVSAKDGVQKMYDWTSSI

The query sequence (length=338) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1orr:A 338 338 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 1orr:B, 1orr:C, 1orr:D
2 4zrn:A 309 336 0.2929 0.3204 0.2946 6.26e-41 4zrm:A, 4zrm:B, 4zrn:B
3 1keu:A 361 349 0.3018 0.2825 0.2923 1.66e-37 1g1a:A, 1g1a:B, 1g1a:C, 1g1a:D, 1keu:B, 1kew:A, 1kew:B
4 1bxk:B 344 355 0.3136 0.3081 0.2986 1.86e-32 1bxk:A
5 6bwl:A 313 337 0.2781 0.3003 0.2789 7.97e-32
6 2p5u:A 311 338 0.2692 0.2926 0.2692 3.18e-31 2p5u:B, 2p5u:C, 2p5u:D, 2p5y:A
7 2hun:A 329 348 0.2929 0.3009 0.2845 3.90e-31 2hun:B
8 8du1:A 361 359 0.2929 0.2742 0.2758 7.25e-29 8du1:B, 8du1:C, 8du1:D
9 6bi4:C 311 336 0.2899 0.3151 0.2917 1.30e-28 6bi4:B, 6bi4:D, 6bi4:A
10 1a9y:A 338 354 0.2870 0.2870 0.2740 1.51e-27 1a9z:A, 5gy7:A, 5gy7:B, 1kvq:A, 1kvr:A, 1kvs:A, 1kvt:A, 1kvu:A, 1lrj:A, 1lrk:A, 1lrl:A, 1nah:A, 1nai:A, 1uda:A, 1udb:A, 1udc:A, 2udp:A, 2udp:B, 1xel:A
11 7yst:A 312 333 0.2722 0.2949 0.2763 1.27e-26 7ys8:A, 7ys8:B, 7ys9:A, 7ys9:B, 7ysa:A, 7ysa:B, 7ysm:A, 7ysm:B, 7yst:B, 7ysy:A, 7ysy:B, 7yt0:A, 7yt0:B
12 2pk3:A 309 328 0.2633 0.2880 0.2713 1.42e-26 2pk3:B
13 8vr2:B 321 344 0.2692 0.2835 0.2645 3.43e-25 8vr2:A, 8vr2:C, 8vr2:D
14 6pnl:A 336 334 0.2456 0.2470 0.2485 4.28e-25 6pmh:A
15 7k3p:A 329 344 0.2604 0.2675 0.2558 1.68e-24 7k3p:B
16 6zll:A 321 347 0.2840 0.2991 0.2767 1.84e-23 6zl6:A, 6zl6:B, 6zla:A, 6zla:B, 6zla:C, 6zla:D, 6zld:A, 6zld:B, 6zlj:A, 6zlj:B, 6zlk:A, 6zlk:B, 6zlk:C, 6zlk:D, 6zll:B, 6zll:C, 6zll:D
17 1r66:A 322 340 0.2604 0.2733 0.2588 2.40e-23 1r6d:A
18 6wj9:B 308 332 0.2485 0.2727 0.2530 2.05e-22 6wj9:A, 6wja:A, 6wja:B, 6wjb:A, 6wjb:B
19 4twr:A 325 275 0.2219 0.2308 0.2727 3.37e-22 4wok:A
20 1sb8:A 341 346 0.2722 0.2698 0.2659 1.93e-21 1sb9:A
21 1ker:B 347 342 0.2811 0.2738 0.2778 9.20e-21 1kep:A, 1kep:B, 1ker:A, 1ket:A, 1ket:B, 1oc2:A, 1oc2:B
22 8sk0:B 330 343 0.2722 0.2788 0.2682 3.99e-20 8shh:A, 8shh:B, 8sk0:A
23 2b69:A 312 331 0.2485 0.2692 0.2538 1.23e-19 4gll:A, 4gll:B
24 6vlo:A 319 337 0.2515 0.2665 0.2522 2.15e-19 6vlo:B, 6vlo:C, 6vlo:D
25 8wov:B 341 355 0.2544 0.2522 0.2423 2.25e-19 8wop:A, 8wop:B, 8wov:A, 8wow:A, 8wow:B
26 7us5:A 346 357 0.2722 0.2659 0.2577 2.47e-19 7us5:B, 7us5:C, 7us5:D
27 3aw9:A 304 339 0.2426 0.2697 0.2419 4.89e-19 3aw9:B, 3aw9:C, 3icp:A, 3ko8:A
28 2c20:A 329 342 0.2308 0.2371 0.2281 8.50e-19 2c20:B, 2c20:C, 2c20:D, 2c20:E, 2c20:F
29 6x3b:A 300 338 0.2219 0.2500 0.2219 2.07e-18 6x3b:B, 6x3b:C, 6x3b:D
30 1i3k:A 347 352 0.2456 0.2392 0.2358 3.72e-18 1ek5:A, 1ek6:A, 1ek6:B, 1hzj:A, 1hzj:B, 1i3k:B, 1i3l:A, 1i3l:B, 1i3m:A, 1i3m:B, 1i3n:A, 1i3n:B
31 7kn1:A 336 352 0.2367 0.2381 0.2273 5.91e-18 7kn1:B
32 6dnt:A 310 320 0.2337 0.2548 0.2469 2.58e-17
33 6vo6:D 311 334 0.2633 0.2862 0.2665 3.22e-17 6vo6:A, 6vo6:B, 6vo6:C, 6vo8:A, 6vo8:B
34 5u4q:A 321 358 0.2278 0.2399 0.2151 5.02e-17
35 7xpo:A 344 348 0.2456 0.2413 0.2385 1.99e-16 7xpo:B, 7xpp:B, 7xpp:A, 7xpq:A, 7xpq:B
36 3lu1:A 336 343 0.2515 0.2530 0.2478 9.19e-16 3lu1:B, 3lu1:C, 3lu1:D, 3ru7:A, 3ru7:B, 3ru7:C, 3ru7:D, 3ru9:A, 3ru9:B, 3ru9:C, 3ru9:D, 3rua:A, 3rua:B, 3rua:C, 3rua:D, 3ruc:A, 3ruc:B, 3ruc:C, 3ruc:D, 3rud:A, 3rud:B, 3rud:C, 3rud:D, 3rue:A, 3rue:B, 3rue:S, 3rue:b, 3ruf:A, 3ruf:B, 3ruf:S, 3ruf:b, 3ruh:A, 3ruh:B, 3ruh:C, 3ruh:D
37 1z45:A 674 353 0.2396 0.1202 0.2295 1.96e-15
38 2z1m:A 338 204 0.1509 0.1509 0.2500 2.27e-15 2z1m:D, 2z95:A, 2z95:D
39 5uzh:A 345 261 0.2041 0.2000 0.2644 3.27e-15
40 1n7g:B 336 340 0.2426 0.2440 0.2412 1.55e-14 1n7g:A, 1n7g:C, 1n7g:D, 1n7h:A, 1n7h:B
41 1gy8:C 370 377 0.2485 0.2270 0.2228 2.91e-14 2cnb:A, 2cnb:B, 2cnb:C, 2cnb:D, 1gy8:A, 1gy8:B, 1gy8:D
42 6k0g:A 335 346 0.2249 0.2269 0.2197 6.95e-14 6k0h:A, 6k0i:A
43 5in4:A 355 366 0.2515 0.2394 0.2322 1.07e-13 6gpj:A, 6gpj:B, 6gpj:D, 6gpj:C, 6gpk:A, 6gpk:B, 6gpk:C, 6gpk:D, 6gpl:B, 6gpl:E, 6gpl:C, 6gpl:D, 5in4:B, 5in4:C, 5in4:D, 5in5:A, 5in5:B, 5in5:C, 5in5:D, 6q94:B, 6q94:A, 6q94:C, 6q94:E, 6q94:D, 6q94:F, 6q94:G, 6q94:H, 1t2a:A, 1t2a:D, 1t2a:B, 1t2a:C
44 5u4q:B 304 346 0.2308 0.2566 0.2254 1.93e-13
45 2q1s:A 336 349 0.2426 0.2440 0.2350 2.87e-13 2pzj:A, 2q1t:A, 2q1u:A, 2q1u:B
46 1rpn:D 322 340 0.2219 0.2329 0.2206 4.78e-13 1rpn:A, 1rpn:B, 1rpn:C
47 3sxp:D 314 343 0.2751 0.2962 0.2711 5.60e-13 3sxp:A, 3sxp:B, 3sxp:C, 3sxp:E
48 7kf3:A 362 362 0.2515 0.2348 0.2348 1.76e-12 7kf3:B, 7kf3:C, 7kf3:D
49 4lis:A 364 362 0.2396 0.2225 0.2238 7.80e-12 4lis:B, 4lis:C
50 3ehe:A 290 343 0.2456 0.2862 0.2420 1.21e-11 3ehe:B
51 4lk3:B 274 336 0.2249 0.2774 0.2262 1.77e-11 4lk3:A, 4lk3:C, 4lk3:D, 4lk3:E, 4lk3:F, 4m55:A, 4m55:B, 4m55:C, 4m55:D
52 3a1n:A 315 194 0.1391 0.1492 0.2423 4.01e-11 3a1n:B, 3a4v:A, 3a4v:B, 3a9w:A, 3a9w:B, 3ajr:A, 3ajr:B
53 3enk:A 340 331 0.2249 0.2235 0.2296 1.12e-10 3enk:B
54 1wvg:A 352 172 0.1361 0.1307 0.2674 3.12e-10 1wvg:B
55 2pzm:A 316 339 0.2426 0.2595 0.2419 5.07e-10 2pzk:A, 2pzk:B, 2pzl:A, 2pzl:B, 2pzm:B
56 1rkx:C 351 209 0.1450 0.1396 0.2344 1.15e-09 1rkx:A, 1rkx:B, 1rkx:D
57 2q1w:A 300 219 0.1893 0.2133 0.2922 1.89e-09 2q1w:B, 2q1w:C
58 6kv9:A 299 337 0.2249 0.2542 0.2255 4.12e-09 6kvc:A
59 4ej0:A 330 355 0.2574 0.2636 0.2451 6.29e-08 4ej0:B, 4ej0:C, 4ej0:D, 4ej0:E, 4ej0:F, 4ej0:G, 4ej0:H, 4ej0:I, 4ej0:J
60 1z7e:D 644 362 0.2485 0.1304 0.2320 7.15e-08 2bln:A, 2bln:B, 5j63:A, 5j63:B, 5j63:C, 5j63:D, 1z7e:A, 1z7e:B, 1z7e:C, 1z7e:E, 1z7e:F
61 6jyg:D 307 151 0.1124 0.1238 0.2517 1.19e-07 6jyg:A, 6jyg:B, 6jyg:C, 6jyg:E, 6jyg:F
62 3vps:A 303 340 0.2367 0.2640 0.2353 1.95e-07 3vps:B
63 1i24:A 392 314 0.2101 0.1811 0.2261 1.12e-06 1i2b:A, 1i2c:A, 1qrr:A
64 4m55:E 164 106 0.1006 0.2073 0.3208 1.96e-06
65 2c59:A 364 339 0.2308 0.2143 0.2301 3.49e-06 2c54:A, 2c54:B, 2c59:B, 2c5a:A, 2c5a:B, 2c5e:A, 2c5e:B, 8sg0:A, 8sg0:B, 8skb:A, 8skb:B, 8skb:C, 8skb:D
66 5z75:A 306 195 0.1331 0.1471 0.2308 7.41e-06 5z75:B, 5z75:D
67 5k4w:C 321 132 0.1124 0.1184 0.2879 8.21e-06 5k4q:A, 5k4q:B, 5k4q:C, 5k4q:D, 5k4q:E, 5k4q:F, 5k4u:A, 5k4u:C, 5k4v:A, 5k4v:C, 5k4w:A, 5k4y:A, 5k4y:B, 5k4y:C, 5k4y:D, 5k4y:E, 5k4y:F, 5k50:A, 5k50:C, 5k50:E, 5k50:G, 5k50:I, 5k50:J, 5lc1:A, 5lc1:B, 5lc1:C, 5lc1:D, 5lc1:E, 5lc1:F
68 7cgv:A 310 130 0.1036 0.1129 0.2692 2.11e-05 7cgv:B, 7cgv:C, 7cgv:D
69 8gjb:A 320 132 0.1006 0.1062 0.2576 3.05e-04 8gjb:B
70 7epr:B 310 157 0.1154 0.1258 0.2484 5.41e-04 7epr:A, 7epr:C, 7epr:D
71 3sc6:D 283 200 0.1361 0.1625 0.2300 0.001 3sc6:A, 3sc6:B, 3sc6:C, 3sc6:E, 3sc6:F
72 4j2o:C 316 130 0.1095 0.1171 0.2846 0.006 4j2o:A, 4j2o:B, 4j2o:D, 4j2o:E, 4j2o:F
73 7cxt:A 348 119 0.0828 0.0805 0.2353 0.011 7anc:A, 7cxt:B, 7m13:A, 7m13:B
74 6nbr:A 316 202 0.1420 0.1519 0.2376 0.054 6nbr:B, 6nbr:C, 6nbr:D
75 7anc:B 314 123 0.0917 0.0987 0.2520 0.063
76 5y1f:A 311 114 0.0888 0.0965 0.2632 0.083 5y1e:A, 5y1g:A
77 3hh8:A 280 52 0.0651 0.0786 0.4231 0.092 8yj6:C, 8yj7:B, 8yj7:D, 8yj7:A, 8yj7:C, 8yj8:A, 8yj8:B
78 8v4h:B 342 199 0.1420 0.1404 0.2412 0.096 8v4g:A, 8v4g:B, 8v4h:A
79 6jkh:A 212 136 0.0976 0.1557 0.2426 0.15 6jkh:B
80 2yy7:A 312 195 0.1213 0.1314 0.2103 0.15 2yy7:B
81 6ds1:B 260 67 0.0592 0.0769 0.2985 0.19 6ds1:A, 6ds1:C, 6ds1:D
82 4id9:B 328 190 0.1361 0.1402 0.2421 0.20 4id9:A, 4idg:A, 4idg:B
83 1eq2:A 273 32 0.0444 0.0549 0.4688 0.24 1eq2:C
84 2x6t:G 308 32 0.0444 0.0487 0.4688 0.26 1eq2:B, 1eq2:D, 1eq2:E, 1eq2:F, 1eq2:G, 1eq2:H, 1eq2:I, 1eq2:J, 2x6t:A, 2x6t:B, 2x6t:C, 2x6t:D, 2x6t:E, 2x6t:F, 2x6t:H, 2x6t:I, 2x6t:J, 2x86:A, 2x86:B, 2x86:C, 2x86:D, 2x86:E, 2x86:F, 2x86:G, 2x86:H, 2x86:I, 2x86:J, 2x86:K, 2x86:L, 2x86:M, 2x86:N, 2x86:O, 2x86:P, 2x86:Q, 2x86:R, 2x86:S, 2x86:T
85 7s6c:C 480 114 0.0740 0.0521 0.2193 0.37 7s6d:C
86 3m2p:B 255 201 0.1627 0.2157 0.2736 0.40
87 6uh2:B 255 113 0.0888 0.1176 0.2655 0.42 6uh2:A
88 6bwc:C 327 157 0.1065 0.1101 0.2293 0.54 6bwc:A, 6bwc:B, 6bwc:D, 6bwc:E, 6bwc:F
89 4jfr:B 340 94 0.0740 0.0735 0.2660 0.78 4h31:A, 4h31:B, 4h31:C, 4jfr:A, 4jhx:A, 4jhx:C, 4jqo:A, 4jqo:B, 4jqo:C
90 4imp:A 520 84 0.0740 0.0481 0.2976 1.2 4imp:B, 4imp:C, 4imp:D
91 3st7:A 369 60 0.0503 0.0461 0.2833 1.4 2zkl:A
92 5k87:A 389 138 0.0947 0.0823 0.2319 2.0 5k87:B, 2pvz:B, 2pvz:A, 2pw0:A
93 6vr7:A 485 30 0.0385 0.0268 0.4333 2.0
94 1kc1:A 298 175 0.1095 0.1242 0.2114 3.0 1kc3:A, 1n2s:A
95 8ewu:B 354 382 0.2249 0.2147 0.1990 3.3 8ewu:A
96 8fip:A 338 121 0.0828 0.0828 0.2314 4.0 8fio:A, 8fio:B, 8fip:B
97 5l0q:A 203 89 0.0562 0.0936 0.2135 4.4 5l0q:D
98 2gn4:A 329 164 0.1124 0.1155 0.2317 4.5 2gn4:B, 2gn6:A, 2gn6:B, 2gn8:A, 2gn8:B, 2gn9:A, 2gn9:B, 2gna:A, 2gna:B
99 3c3x:A 310 70 0.0592 0.0645 0.2857 5.0 3c3x:B, 2qw8:A, 2qw8:B, 2qx7:A, 2qx7:B, 2qzz:A, 2qzz:B, 2r2g:A, 2r2g:B, 2r6j:A, 2r6j:B
100 1bsv:A 317 153 0.0888 0.0946 0.1961 5.9 1bws:A, 1e6u:A, 1e7q:A, 1e7r:A, 1e7s:A, 1fxs:A
101 4l4x:A 503 149 0.1065 0.0716 0.2416 6.0
102 5u9c:A 288 143 0.1095 0.1285 0.2587 6.1 5u9c:C
103 1psz:A 286 28 0.0325 0.0385 0.3929 8.1 4uto:A, 4uto:B, 3zka:A, 3zka:B, 3ztt:A, 3ztt:B, 3ztt:C, 3ztt:D
104 6smz:C 295 54 0.0592 0.0678 0.3704 8.2 6smy:A, 6smy:B, 6smy:C, 6smy:D, 6smz:A, 6smz:B, 6smz:D
105 5vsu:C 81 45 0.0355 0.1481 0.2667 9.3 6aso:C, 4c8q:C, 5gan:3, 4m7a:J, 4m7a:C, 4m7d:J, 4m7d:C, 5nrl:3

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218