BioLiP

>protein
AKKWVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDAKAYDTEVHNVWATHACVPTDPNPQEIVLGNVTENFNMWKNNMVEQMHEDIISL
WDQSLKPCVKLTPLCVTLNCLINCNTSVITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCNSKTFNGSGPCTNVSTVQCTHGIR
PVVSTQLLLNGSLAEEEIVIRSENITDNAKTIIVQLNEAVEINCTRPNNNTRKSIHINIRQAHCNISKARWNETLGQIVA
KLEEQFPNKTIIFNHSSGGDPEIVTHSFNCGGEFFYCNTTPLFNSTWNNTRTDDYQNITLQCRIKQIINMWQGVGKAMYA
PPIRGQIRCSSNITGLLLTRDGGRDQNGTETFRPGGGNMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGIAPTACKRRV

The query sequence (length=389) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6opp:A	389	389	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	6opo:A, 6opo:D, 6opo:J, 6opp:D, 6opp:J, 6opq:A, 6opq:D, 6opq:E, 5vn3:G, 5vn3:I, 5vn3:J
2	6ch9:G	448	451	0.9871	0.8571	0.8514	0.0	6mug:G
3	6edu:D	401	419	0.9306	0.9027	0.8640	0.0	6edu:E, 6edu:F
4	6x5b:A	353	387	0.9075	1.0000	0.9121	0.0	6opn:A, 6opn:D, 6opn:G, 6x5b:D, 6x5b:J, 6x5c:A, 6x5c:D, 6x5c:E
5	7n6u:B	595	449	0.8766	0.5731	0.7595	0.0	5fuu:A, 5fuu:D, 5fuu:E, 5fuu:F, 6j5e:K, 7n6u:C, 7n6u:A, 7n6w:A, 7n6w:B, 7n6w:C, 6olp:C, 7ska:B, 7ska:O, 7ska:Z, 6vpx:C, 5y14:C, 5y14:A, 5y14:B, 5yc0:B, 5yc0:C, 5yc0:F
6	8fae:A	468	467	0.8612	0.7158	0.7173	0.0	8fad:C, 8fad:E, 8fad:A, 8fae:C, 8fae:E
7	6meo:G	398	398	0.8226	0.8040	0.8040	0.0	6met:G
8	7txd:A	397	400	0.8046	0.7884	0.7825	0.0	7txd:E
9	7lu9:e	461	460	0.8046	0.6790	0.6804	0.0	7lu9:f
10	8d0y:G	455	453	0.8098	0.6923	0.6954	0.0	5cez:G, 6ch8:G, 6de7:G, 5i8h:A, 5i8h:C, 7l7u:A, 7l7u:C, 7l7u:E, 6mtj:G, 6mtn:G, 6mu6:G, 6mu7:G, 6mu8:G, 7pc2:A, 7rai:A, 7rai:C, 7rai:E, 8s2e:E, 5t3z:G, 8tjr:B, 8tjr:C, 8tjs:G, 8tjs:N, 8tjs:O, 8ttw:E, 8ttw:I, 8ttw:A, 4tvp:G, 5u7m:G, 5u7o:G, 7ucf:G, 5utf:G, 5v7j:G, 4zmj:G
11	8czz:A	440	444	0.7943	0.7023	0.6959	0.0	8czz:E, 8czz:I
12	6cm3:D	372	384	0.7712	0.8065	0.7812	0.0	6cm3:E, 6cm3:F, 7lo6:C, 7lo6:A, 7lo6:E, 7lok:A, 7lok:C, 7lok:E, 6u0l:B, 6u0l:C, 6u0n:A, 6u0n:C
13	8d53:G	446	442	0.7841	0.6839	0.6900	0.0
14	4laj:A	343	367	0.7789	0.8834	0.8256	0.0	4dvr:G, 2i5y:G, 2i5y:P, 2i60:G, 2i60:P, 4jzw:G, 4jzw:A, 4jzz:A, 4k0a:A, 4ka2:A, 4laj:J, 4laj:F, 4laj:B, 4r4f:A, 1yyl:G, 1yyl:P, 1yym:G, 1yym:P
15	7mxd:A	472	466	0.7738	0.6377	0.6459	0.0	7mxd:F, 7mxd:G, 7n28:A
16	8tgw:A	387	430	0.7558	0.7597	0.6837	0.0
17	3tgs:A	345	369	0.6967	0.7855	0.7344	0.0	5f4l:A, 5f4l:B, 5f4p:D, 5f4p:A, 5f4r:A, 5f4r:C, 5f4u:A, 5f4u:B, 8fly:A, 8fly:B, 8fly:C, 8fly:D, 8flz:A, 8flz:D, 8flz:B, 8flz:C, 8fm0:B, 8fm0:A, 8fm0:C, 8fm0:D, 8fm2:D, 8fm2:B, 8fm2:A, 8fm2:C, 8fm3:A, 8fm3:C, 8fm3:D, 8fm3:B, 8fm4:B, 8fm4:D, 8fm4:A, 8fm4:C, 8fm5:D, 8fm5:A, 8fm5:C, 8fm5:B, 8fm7:A, 8fm7:B, 8fm7:C, 8fm7:D, 8fm8:C, 8fm8:D, 8fm8:A, 8fm8:B, 4i53:A, 4i53:B, 7rsx:C, 7rsx:B, 7rsx:A, 7rsx:D, 7rsy:A, 7rsy:B, 7rsy:C, 7rsy:D, 7rsz:B, 7rsz:A, 7rsz:C, 7rsz:D, 3tgs:B, 7tjo:D, 7tjo:A, 7tjo:C, 7tjo:B, 7tjp:A, 7tjp:B, 7tjp:D, 7tjp:C
18	5w4l:G	357	373	0.6889	0.7507	0.7185	0.0	6bf4:G, 8dcq:A, 4dko:A, 4dko:C, 4dkp:A, 4dkp:C, 4dkq:A, 4dkr:A, 4dkr:C, 4dku:A, 4dku:B, 4dkv:A, 4dkv:B, 4dvs:A, 4dvs:B, 4dvt:A, 4dvt:B, 4dvv:A, 4dvv:B, 4dvw:A, 4dvw:B, 4dvx:A, 4dvx:B, 8f9z:A, 8fa0:A, 8gcz:A, 8gd0:A, 8gd1:A, 8gd3:A, 8gd5:A, 8gdj:A, 8gdk:A, 8gjt:A, 4i54:A, 4i54:B, 5kjr:G, 4lsq:G, 6mfp:G, 6mfp:A, 6mg7:G, 7n8q:G, 3ngb:G, 3ngb:A, 3ngb:D, 3ngb:I, 6one:A, 6onf:A, 6onh:A, 6onv:A, 6ooo:A, 6p9n:A, 4rfn:G, 4rfn:A, 4rfo:G, 4rz8:A, 4rz8:B, 4rz8:C, 4rz8:D, 3se9:G, 5u6e:A, 5u6e:B, 5uem:G, 6usw:A, 6ut1:A, 5w4l:A, 6w4m:G
19	4r4n:B	342	363	0.6838	0.7778	0.7328	0.0	4r4n:A, 4r4n:E, 4r4n:I, 4r4n:M, 4r4n:P, 4r4n:S, 4r4n:V
20	4xmp:G	337	363	0.6967	0.8042	0.7466	0.0
21	4j6r:G	343	366	0.6864	0.7784	0.7295	0.0
22	5fa2:A	336	361	0.6581	0.7619	0.7091	0.0
23	1gc1:G	297	319	0.6555	0.8586	0.7994	0.0
24	5te4:G	341	371	0.6478	0.7390	0.6792	2.64e-175
25	5fyj:G	479	464	0.6967	0.5658	0.5841	4.89e-173
26	6pwu:A	615	306	0.5553	0.3512	0.7059	1.12e-150	6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
27	6pwu:A	615	105	0.2288	0.1447	0.8476	3.65e-57	6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
28	6tyb:G	345	375	0.3085	0.3478	0.3200	3.09e-49	3fus:A
29	7t4g:A	493	314	0.2622	0.2069	0.3248	1.15e-39	7t4g:C, 7t4g:E
30	7t4g:A	493	97	0.1157	0.0913	0.4639	7.51e-21	7t4g:C, 7t4g:E
31	3lez:A	260	115	0.0848	0.1269	0.2870	0.72
32	7rsw:B	125	28	0.0308	0.0960	0.4286	3.8
33	1hi9:A	274	89	0.0488	0.0693	0.2135	4.4	1hi9:B, 1hi9:C, 1hi9:D, 1hi9:E
34	3s5m:A	1094	60	0.0488	0.0174	0.3167	4.5	7di7:A, 7dij:A, 8ho4:A, 8ho5:A, 3s5h:A, 7vpe:A, 8wxw:A, 8wxz:A, 8wyu:A
35	7dia:A	1072	60	0.0488	0.0177	0.3167	4.7	3s5k:A, 8wyt:A, 8wyx:A, 8wyy:A
36	7jgr:E	398	41	0.0360	0.0352	0.3415	5.5	7jgs:E, 7jk2:E, 7jk3:E, 7jk4:E, 7jk5:E, 7jk6:E
37	3hhi:B	260	94	0.0643	0.0962	0.2660	6.6	3hhi:A
38	3atp:A	151	34	0.0206	0.0530	0.2353	8.2	3atp:B
39	4z67:A	309	27	0.0257	0.0324	0.3704	8.4	6e13:A, 3jxp:A, 1xto:A, 4z5y:A, 4z5z:A, 4z60:A, 4z6x:A
40	8hud:A	767	50	0.0283	0.0143	0.2200	8.8

[Back]