Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
AKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGLWRFKENVEDGRASIYQSVITNTSKEMSCFSDFPMPEHFPNF
LHNSKLLEYFRIFAKKFDLLKYIQFQTTVLSVKKCPDGQWEIVTESNGKEQSAVFDAVMVCSGHHILPHIPLQSFPGIER
FKGQYFHSRQYKHPEGFEGKRILVIGIGNSASDIAVELSKKAAQVFISTRHGSWVMSRISDDGYPWDMVFHTRFSSMLRN
VLPRTVVKWMMEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYLMKEPVLNDDLPSRLLYGAIKVKSRVKELTETSAIFEDGTVEEDIDVI
VFATGYTFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYMFPPHLEKPTLACIGLIQPLGSIFPTVELQARWVTRVFKGLCTLPSESTM
MADIIKRNEKRIDLFGESQSQILQTNYIDYLDELALEIGAKPDLLSLLLKDPKLAMKLYFGPCNSYQYRLVGPGQWEGAR
NAIFTQKQRILKPLKTRALKALLKILGLLAVVVAFFFQL

The query sequence (length=519) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6sem:B 530 527 1.0000 0.9792 0.9848 0.0 6sem:A, 6sem:C, 6sem:D, 6sf0:B, 6sf0:A, 6sf0:C, 6sf0:D
2 7al4:D 524 505 0.5857 0.5802 0.6020 0.0 7al4:C, 7al4:B, 7al4:A
3 6sek:A 504 503 0.5973 0.6151 0.6163 0.0 6sek:B
4 6se3:D 528 502 0.5934 0.5833 0.6135 0.0 6se3:A, 6se3:B, 6se3:C, 6se3:E, 6se3:F
5 8odw:A 612 406 0.2389 0.2026 0.3054 1.83e-48 8odw:B
6 5nmx:D 409 216 0.1484 0.1883 0.3565 6.48e-36 5nmw:A, 5nmw:B, 5nmw:C, 5nmw:D, 5nmx:A, 5nmx:B, 5nmx:C
7 5nmx:D 409 194 0.1214 0.1540 0.3247 1.11e-12 5nmw:A, 5nmw:B, 5nmw:C, 5nmw:D, 5nmx:A, 5nmx:B, 5nmx:C
8 6hns:A 443 451 0.2254 0.2641 0.2594 1.84e-27 6hns:B
9 6wpu:A 439 227 0.1310 0.1549 0.2996 1.73e-26
10 6wpu:A 439 145 0.1021 0.1207 0.3655 6.88e-16
11 5gsn:A 445 244 0.1522 0.1775 0.3238 4.19e-26 5gsn:B, 5gsn:C, 5gsn:D, 5ipy:A, 5ipy:B, 5iq1:A, 5iq1:B, 5iq4:A, 5iq4:B
12 5gsn:A 445 145 0.0867 0.1011 0.3103 5.52e-09 5gsn:B, 5gsn:C, 5gsn:D, 5ipy:A, 5ipy:B, 5iq1:A, 5iq1:B, 5iq4:A, 5iq4:B
13 2xlr:C 452 245 0.1445 0.1659 0.3061 7.23e-25 8b2d:A, 8b2d:B, 2vq7:A, 2vq7:B, 2vq7:C, 2vq7:D, 2vqb:A, 2vqb:B, 2vqb:C, 2vqb:D, 2xlp:A, 2xlp:B, 2xlp:C, 2xlp:D, 2xlr:A, 2xlr:B, 2xlr:D, 2xls:A, 2xls:B, 2xls:C, 2xls:D, 2xlt:A, 2xlt:B, 2xlt:C, 2xlt:D, 2xlu:A, 2xlu:B, 2xlu:C, 2xlu:D, 2xve:B, 2xve:C, 2xvf:A, 2xvf:B, 2xvf:C, 2xvh:A, 2xvh:B, 2xvh:C, 2xvi:A, 2xvi:B, 2xvi:C, 2xvj:A, 2xvj:B, 2xvj:C
14 2xlr:C 452 130 0.0848 0.0973 0.3385 7.10e-09 8b2d:A, 8b2d:B, 2vq7:A, 2vq7:B, 2vq7:C, 2vq7:D, 2vqb:A, 2vqb:B, 2vqb:C, 2vqb:D, 2xlp:A, 2xlp:B, 2xlp:C, 2xlp:D, 2xlr:A, 2xlr:B, 2xlr:D, 2xls:A, 2xls:B, 2xls:C, 2xls:D, 2xlt:A, 2xlt:B, 2xlt:C, 2xlt:D, 2xlu:A, 2xlu:B, 2xlu:C, 2xlu:D, 2xve:B, 2xve:C, 2xvf:A, 2xvf:B, 2xvf:C, 2xvh:A, 2xvh:B, 2xvh:C, 2xvi:A, 2xvi:B, 2xvi:C, 2xvj:A, 2xvj:B, 2xvj:C
15 2gv8:A 442 234 0.1349 0.1584 0.2991 3.47e-23 2gv8:B, 2gvc:A, 2gvc:B, 2gvc:D, 2gvc:E, 1vqw:A, 1vqw:B
16 2gv8:A 442 105 0.0617 0.0724 0.3048 2.08e-06 2gv8:B, 2gvc:A, 2gvc:B, 2gvc:D, 2gvc:E, 1vqw:A, 1vqw:B
17 7d4k:A 444 231 0.1426 0.1667 0.3203 2.11e-21 7d4k:B, 7d4m:A, 7d4m:B, 7d4n:A, 7d4n:B
18 7d4k:A 444 145 0.0809 0.0946 0.2897 1.93e-06 7d4k:B, 7d4m:A, 7d4m:B, 7d4n:A, 7d4n:B
19 6kbw:A 446 228 0.1310 0.1525 0.2982 1.08e-18 6kbw:B
20 6kbw:A 446 147 0.0848 0.0987 0.2993 1.03e-05 6kbw:B
21 1w4x:A 533 208 0.1156 0.1126 0.2885 1.63e-17 4c74:A, 4c77:A, 4d03:A, 4d04:A, 4ovi:A, 2ylr:A, 2yls:A, 2ylt:A, 2ylw:A, 2ylx:A, 2ylz:A, 2ym1:A, 2ym2:A
22 7v4x:A 529 461 0.1985 0.1947 0.2234 8.64e-16 6a37:A, 7v50:A, 7v51:A
23 6jdk:B 516 207 0.1175 0.1182 0.2947 1.19e-15 6jdk:A
24 4aos:A 523 215 0.1175 0.1166 0.2837 4.22e-15 4aox:A, 4ap1:A, 4ap3:A
25 6er9:A 531 211 0.0983 0.0960 0.2417 2.55e-13 6er9:B, 6era:A, 6era:B, 3gwd:A, 3gwf:A, 4rg3:A, 4rg4:A, 3ucl:A
26 6er9:A 531 37 0.0289 0.0282 0.4054 3.3 6er9:B, 6era:A, 6era:B, 3gwd:A, 3gwf:A, 4rg3:A, 4rg4:A, 3ucl:A
27 6y48:B 538 212 0.1156 0.1115 0.2830 6.28e-13 6y48:A, 6y48:C, 6y48:D
28 4usr:A 357 350 0.1522 0.2213 0.2257 6.61e-13
29 4usq:F 341 300 0.1329 0.2023 0.2300 4.00e-12 4usq:A
30 3uoz:A 540 228 0.1098 0.1056 0.2500 2.64e-11 3uov:A, 3uov:B, 3uox:A, 3uox:B, 3uoy:A, 3uoy:B, 3uoz:B, 3up4:A, 3up4:B, 3up5:A, 3up5:B
31 8acs:A 598 287 0.1329 0.1154 0.2404 2.64e-11 8acs:B, 8acs:C, 8acs:D
32 6gqi:A 529 206 0.1002 0.0983 0.2524 1.75e-10 6gqi:B, 5m0z:A, 5m10:A, 7v8o:A, 7v8o:B, 7v8r:A, 7v8s:A, 7v8s:B
33 4c5o:D 333 207 0.1040 0.1622 0.2609 5.15e-10 4a9w:A, 4a9w:B, 4c5o:A, 4c5o:B, 4c5o:C, 4c5o:E, 4c5o:F, 4c5o:G, 4c5o:H
34 5j7x:A 527 212 0.1060 0.1044 0.2594 8.78e-09
35 5mq6:A 636 167 0.0829 0.0676 0.2575 1.16e-05
36 5ygq:A 341 125 0.0674 0.1026 0.2800 2.43e-04 5ygq:B
37 3ab1:B 336 108 0.0617 0.0952 0.2963 8.51e-04 3ab1:A
38 7mfm:I 490 245 0.1040 0.1102 0.2204 0.001 7mfm:J, 7mft:I
39 8c3m:A 346 108 0.0694 0.1040 0.3333 0.001 8c3m:B, 6gar:A, 6gar:B
40 3lzw:A 329 134 0.0694 0.1094 0.2687 0.014 3lzx:A, 3lzx:B
41 5jca:L 471 221 0.1060 0.1168 0.2489 0.036 5jfc:L
42 1sez:A 465 41 0.0405 0.0452 0.5122 0.051 1sez:B
43 7a76:A 326 244 0.1002 0.1595 0.2131 0.098 7a76:B, 7a76:C, 7a76:D
44 2zbw:B 334 89 0.0520 0.0808 0.3034 0.13 2zbw:A
45 3kve:A 484 48 0.0347 0.0372 0.3750 0.16 3kve:B, 3kve:C, 3kve:D
46 8c16:D 327 136 0.0694 0.1101 0.2647 0.17 8c16:A, 8c16:B, 8c16:C, 6gas:A, 6gas:B, 6gas:C, 6gas:D
47 7jyp:A 305 167 0.0867 0.1475 0.2695 0.21
48 5ts5:A 483 48 0.0308 0.0331 0.3333 0.22 4e0v:A, 4e0v:B, 5ts5:B, 5ts5:C, 5ts5:D
49 4k28:A 266 84 0.0482 0.0940 0.2976 0.39 4k28:B
50 1q13:A 322 53 0.0405 0.0652 0.3962 0.43 1q13:B, 1q5m:A, 1q5m:B
51 5xhu:A 329 130 0.0694 0.1094 0.2769 0.50
52 7a7b:A 323 49 0.0347 0.0557 0.3673 0.51 7a7b:B, 7a7b:C, 7a7b:D, 7a7b:E, 7a7b:F, 7a7b:H, 7apr:A, 7apr:B, 7apr:C, 7apr:D, 7apr:E, 7apr:F, 7apr:H
53 6fw8:B 417 57 0.0347 0.0432 0.3158 0.70 6esd:B, 6esd:A, 6fw7:B, 6fw7:A, 6fw8:A, 6fw9:B, 6fw9:A, 6fwa:B, 6fwa:A, 6g2p:B, 6g2p:A, 5g3s:A, 5g3s:B, 5g3t:A, 5g3t:B, 5g3t:C, 5g3t:D, 5g3u:A, 5g3u:B, 5zbc:A, 5zbc:B, 5zbd:A, 5zbd:B
54 1reo:A 484 53 0.0366 0.0393 0.3585 0.73 1tdk:A, 1tdn:A, 1tdo:A
55 3itj:B 319 169 0.0771 0.1254 0.2367 0.74 3d8x:A, 3d8x:B, 3itj:A, 3itj:C, 3itj:D
56 5vt3:B 319 110 0.0559 0.0909 0.2636 0.91 5usx:A, 5usx:B, 5vt3:A
57 7uqc:A 219 106 0.0482 0.1142 0.2358 0.91 7k7r:A, 7k7r:D, 7uqc:D
58 1f8r:A 483 48 0.0328 0.0352 0.3542 0.95 1f8r:B, 1f8r:C, 1f8r:D, 1f8s:A, 1f8s:B, 1f8s:C, 1f8s:D, 1f8s:E, 1f8s:F, 1f8s:G, 1f8s:H, 2iid:A, 2iid:B, 2iid:C, 2iid:D
59 1f6m:A 320 111 0.0501 0.0813 0.2342 0.97 1cl0:A, 1f6m:B, 1f6m:E, 1f6m:F, 1tde:A, 1tdf:A, 1trb:A
60 8dow:D 217 106 0.0443 0.1060 0.2170 1.1 8dow:H, 8dow:L, 8dp1:M, 8dp1:F, 8dp1:O
61 5yb6:A 556 50 0.0328 0.0306 0.3400 1.2 3we0:A, 3we0:B, 5yb6:C, 5yb6:B, 5yb6:D, 5yb7:A, 5yb7:C, 5yb7:B, 5yb7:D, 5yb8:A, 5yb8:D, 5yb8:B, 5yb8:C
62 4i58:A 451 47 0.0328 0.0377 0.3617 1.8 4i58:B, 4i58:C, 4i58:D, 4i59:A, 4i59:B, 4i59:C, 4i59:D
63 5vj7:A 462 226 0.1156 0.1299 0.2655 2.0
64 8er0:A 371 34 0.0250 0.0350 0.3824 2.0 8er0:B, 8er1:A, 6wg9:A, 6wg9:B
65 5z2g:A 477 37 0.0270 0.0294 0.3784 2.2 5z2g:B
66 7c4k:A 614 59 0.0424 0.0358 0.3729 2.3 7c4l:A, 7c4m:A, 7c4n:A
67 4hix:L 219 118 0.0520 0.1233 0.2288 2.4 2eh8:L, 7eyc:L, 7eyc:B, 8fas:B, 8fg0:D, 8fg0:B, 4jn2:A, 4jn2:L, 7o33:L, 6obd:A, 6obd:L, 4ojf:L, 3u0t:C, 3u0t:A, 6x8p:L, 6x8q:L, 6x8s:L, 6x8u:L
68 4em3:A 437 37 0.0289 0.0343 0.4054 2.6 4em3:B, 4em4:A, 4em4:B, 4emw:A, 4emw:B, 4eqr:A, 4eqr:B, 4eqs:A, 4eqs:B, 4eqw:A, 4eqw:B, 4eqx:A, 4eqx:B, 1yqz:B, 1yqz:A
69 4bay:A 670 36 0.0270 0.0209 0.3889 2.9 3abt:A, 3abu:A, 8bop:A, 8box:A, 7cdc:A, 7cdd:A, 7cde:A, 7cdf:A, 7cdg:A, 4czz:A, 7e0g:A, 2ejr:A, 8f2z:A, 8f30:A, 8f59:A, 8f6s:A, 8fdv:A, 8fj4:A, 8fj6:A, 8fj7:A, 8fqj:A, 8fri:A, 8frq:A, 8frv:A, 8fsk:A, 9fwg:A, 5h6q:A, 5h6r:A, 2h94:A, 2hko:A, 8inl:A, 2iw5:A, 8jf5:A, 6k3e:A, 6kgk:A, 6kgl:A, 6kgm:A, 6kgn:A, 6kgo:A, 6kgp:A, 6kgq:A, 6kgr:A, 4kum:A, 5l3b:A, 5l3c:A, 5l3d:A, 5l3e:A, 5l3f:A, 5l3g:A, 5lbq:A, 5lgn:A, 5lgt:A, 5lgu:A, 5lhg:A, 5lhh:A, 5lhi:A, 6nqm:A, 6nqu:A, 6nr5:A, 8q1g:A, 8q1h:A, 8q1j:A, 6s35:A, 6te1:A, 6tuy:A, 4uv8:A, 4uv9:A, 4uva:A, 4uvb:A, 4uvc:A, 2uxn:A, 2uxx:A, 4uxn:A, 2v1d:A, 7vqs:A, 7vqt:A, 7vqu:A, 6vyp:k, 6vyp:m, 6vyp:M, 6vyp:K, 7w3l:A, 6w4k:A, 6wc6:A, 2x0l:A, 5x60:A, 2xaf:A, 2xag:A, 2xah:A, 2xaj:A, 2xaq:A, 2xas:A, 4xbf:A, 7xw8:A, 2y48:A, 5yjb:A, 8ym7:A, 2z3y:A, 2z5u:A, 3zms:A, 3zmt:A, 3zmu:A, 3zmv:A, 3zmz:A, 3zn0:A, 3zn1:A, 7zry:A
70 7y5e:z6 60 16 0.0173 0.1500 0.5625 2.9 7y5e:ZL, 7y7a:Z9, 7y7a:ZE, 7y7a:zO, 7y7a:zZ, 7y7a:Zm
71 2dw4:A 634 36 0.0270 0.0221 0.3889 3.0
72 5mog:B 472 36 0.0250 0.0275 0.3611 3.1 5mog:A, 5mog:C, 5mog:D, 5mog:E
73 7aaw:A 315 46 0.0328 0.0540 0.3696 3.3 7aaw:B
74 5yhw:D 387 110 0.0636 0.0853 0.3000 3.4 5yhw:H, 5yhw:E, 5yhw:G
75 5yhw:A 453 110 0.0636 0.0728 0.3000 3.6 5yhw:B, 5yhw:C, 5yhw:F
76 6qkg:B 664 37 0.0289 0.0226 0.4054 3.8 6qkg:A, 6qkr:A, 6qkr:B, 6qkx:A
77 1hyu:A 521 29 0.0270 0.0269 0.4828 4.0 1fl2:A, 4o5q:A, 4o5u:A, 4xvg:A, 4ykf:A, 4ykg:A
78 8eeg:B 440 36 0.0270 0.0318 0.3889 4.0 8eef:A, 8eef:B, 8eeg:A, 8eeh:A, 8eeh:B, 8eei:A, 8eei:B, 8eej:B, 8eej:A, 8eek:A, 8eek:B, 8eel:A, 8eel:B, 8eem:A, 8eem:B, 8een:B, 8een:A, 8eeo:A, 8eeo:B
79 4gcm:B 309 220 0.1060 0.1780 0.2500 4.4 4gcm:A
80 5fn0:A 455 35 0.0231 0.0264 0.3429 4.4 5fn0:B, 5fn0:C, 5fn0:D, 6fox:A, 6fox:B, 6foy:A, 6foy:B, 6foz:A, 6foz:B, 6fp0:A, 6fp0:B, 6fp1:A, 6fp1:B, 6fph:A, 6fph:B, 5mzc:A, 5mzc:B, 5mzi:A, 5mzi:B, 5mzk:A, 5mzk:B, 5n7t:A, 5n7t:B, 5na5:A, 5na5:B, 5nab:A, 5nab:B, 5nae:A, 5nae:B, 5nag:A, 5nag:B, 5nah:A, 5nah:B, 5nak:A, 5nak:B, 5x6p:A, 5x6p:B, 5x6q:A, 5y66:A, 5y77:A, 5y77:B, 5y7a:A
81 7epw:A 373 34 0.0250 0.0349 0.3824 4.6 4a6n:A, 4a6n:B, 4a6n:C, 4a6n:D, 4a99:A, 4a99:C, 4a99:B, 4a99:D, 7epv:A, 4guv:A, 4guv:B, 4guv:C, 4guv:D, 3p9u:A, 3p9u:B, 3p9u:C, 3p9u:D, 3v3n:A, 3v3n:B, 3v3n:C, 3v3n:D, 3v3o:A, 3v3o:B, 3v3o:C, 3v3o:D, 2xdo:A, 2xdo:B, 2xdo:C, 2xdo:D, 2xyo:A, 2xyo:B, 2xyo:C, 2xyo:D, 2y6q:A, 2y6q:B, 2y6q:C, 2y6q:D, 2y6r:A, 2y6r:B, 2y6r:C, 2y6r:D
82 5b5t:B 190 52 0.0443 0.1211 0.4423 4.7 5b5t:D, 2dbw:B, 2dbw:D, 2dbx:B, 2dbx:D, 2dg5:B, 2dg5:D, 2e0x:B, 2e0x:D, 2z8i:B, 2z8i:D, 2z8j:B, 2z8j:D, 2z8k:B, 2z8k:D
83 4jdr:A 471 37 0.0289 0.0318 0.4054 5.2 4jdr:B, 4jq9:A, 4jq9:B, 4jq9:C, 4jq9:D, 4jq9:E, 4jq9:F
84 3l8k:A 458 50 0.0289 0.0328 0.3000 6.1 3l8k:B
85 5y0t:A 414 123 0.0617 0.0773 0.2602 6.2 5y0t:B, 5y0t:C, 5y0t:D
86 3cty:B 305 31 0.0250 0.0426 0.4194 6.8 3cty:A
87 2yg3:B 450 37 0.0250 0.0289 0.3514 7.4 2yg3:A, 2yg4:A, 2yg4:B, 2yg5:A, 2yg6:A, 2yg6:B, 2yg7:A, 2yg7:B
88 6go1:A 318 52 0.0289 0.0472 0.2885 7.8 6go1:B
89 7plo:K 639 106 0.0539 0.0438 0.2642 8.0 8b9d:K, 7pfo:K
90 7og2:A 622 38 0.0308 0.0257 0.4211 8.4 7og2:B
91 7l28:C 375 38 0.0328 0.0453 0.4474 8.4 7eg0:A, 7eg0:C, 7eg1:A, 7eg1:C, 7eg4:C, 7eg4:A, 7kwe:A, 7kwe:D, 7kwe:C, 7kwe:B, 7l27:A, 7l27:B, 7l27:C, 7l27:D, 7l28:A, 7l28:B, 7l28:D, 7l29:A, 7l29:B, 7l29:C, 7l29:D, 7lrc:B, 7lrc:C, 7lrd:B, 7lrd:D
92 7rk0:B 262 38 0.0289 0.0573 0.3947 8.7 7rk0:A, 7rk0:C, 7rk0:D
93 8p5d:LR0 164 122 0.0578 0.1829 0.2459 8.8 8p60:LR0, 8p60:KR0, 7qca:LR0
94 3l31:A 234 49 0.0308 0.0684 0.3265 8.9 3l2b:A, 3l2b:B, 3l31:B
95 2fvl:A 323 53 0.0405 0.0650 0.3962 9.2 2fvl:B, 2fvl:C
96 2whd:B 319 43 0.0328 0.0533 0.3953 9.7 2whd:A
97 6l2i:A 324 80 0.0347 0.0556 0.2250 9.9 6l2i:B, 6l2z:A, 6l2z:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218