Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
AKHVVVIGGGVGGIATAYNLRNLMPDLKITLISDRPYFGFTPAFPHLAMGWRKFEDISVPLAPLLPKFNIEFINEKAESI
DPDANTVTTQSGKKIEYDYLVIATGPKLVFGAEGQEENSTSICTAEHALETQKKLQELYANPGPVVIGAIPGVSCFGPAY
EFALMLHYELKKRGIRYKVPMTFITSEPYLGHFGVGGIGASKRLVEDLFAERNIDWIANVAVKAIEPDKVIYEDLNGNTH
EVPAKFTMFMPSFQGPEVVASAGDKVANPANKMVIVNRCFQNPTYKNIFGVGVVTAIPPIEKTPIPTGVPKTGMMIEQMA
MAVAHNIVNDIRNNPDKYAPRLSAICIADFGEDAGFFFADPVIPPRERVITKMGKWAHYFKTAFEKYFLWKVRNGNIAPS
FEEKVLEIFLKVHPIELCKDCEGAPGSRC

The query sequence (length=429) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3hyv:A 429 429 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 3hyv:B, 3hyv:C, 3hyv:D, 3hyv:E, 3hyv:F, 3hyw:A, 3hyw:B, 3hyw:C, 3hyw:D, 3hyw:E, 3hyw:F, 3hyx:A, 3hyx:B, 3hyx:C, 3hyx:D, 3hyx:E, 3hyx:F
2 3t2z:A 427 418 0.4056 0.4075 0.4163 1.55e-98 3kpk:A, 3sx6:A, 3sxi:A, 3sy4:A, 3syi:A, 3sz0:A, 3szc:A, 3szf:A, 3szw:A, 3t0k:A, 3t14:A, 3t2k:A, 3t2y:A, 3t2z:B, 3t31:A
3 3h8i:A 356 374 0.2308 0.2781 0.2647 4.20e-29 3h8i:B, 3h8l:A, 3h8l:B
4 5na1:A 398 424 0.2308 0.2487 0.2335 5.08e-14 5na4:A
5 6mo6:B 414 308 0.1702 0.1763 0.2370 3.89e-13 8dhk:A, 8dhk:B, 6mo6:A, 6mo6:C, 6mo6:D, 6mp5:A, 6mp5:B, 6mp5:C, 6mp5:D, 6oi5:A, 6oi5:B, 6oi6:A, 6oi6:B, 6oib:A, 6oib:B, 6oic:A, 6oic:B, 6wh6:A, 6wh6:B
6 6bdo:D 395 349 0.1841 0.2000 0.2264 4.24e-11 6bdo:B, 6bdo:A, 6bdo:C, 5kmp:A, 5kmp:B, 5kmq:A, 5kmq:B, 5kmq:C, 5kmq:D, 5kmr:B, 5kmr:A, 5kmr:C, 5kmr:D, 5kms:A, 5kms:B, 5kms:C, 5kms:D, 4nwz:A, 4nwz:B, 4nwz:C, 4nwz:D, 5wed:B, 5wed:A, 5wed:C, 5wed:D
7 5yjy:B 465 108 0.0862 0.0796 0.3426 4.37e-08 5yjw:A, 5yjx:A, 5yjx:B, 5yjy:A
8 5n1t:A 393 188 0.1445 0.1578 0.3298 2.24e-07
9 4g6h:A 472 125 0.0862 0.0784 0.2960 5.15e-06 4g6g:A, 4g6g:B, 4g6h:B, 4g73:A, 4g73:B, 4g74:A, 4g74:B, 4g9k:A, 4g9k:B, 4gap:A, 4gap:B, 4gav:A, 4gav:B
10 5jwa:A 495 143 0.0909 0.0788 0.2727 5.43e-06 5jwa:H, 5jwb:A, 5jwb:H, 5jwc:A, 5jwc:H
11 3klj:A 378 108 0.0769 0.0873 0.3056 8.04e-06
12 4emj:A 406 114 0.0793 0.0837 0.2982 1.76e-05 3ef6:A, 4emi:A
13 8a56:B 539 112 0.0746 0.0594 0.2857 1.03e-04 8a56:A
14 8a56:B 539 105 0.0583 0.0464 0.2381 3.1 8a56:A
15 1fcd:A 401 291 0.1678 0.1796 0.2474 2.35e-04 1fcd:B
16 1q1w:A 422 154 0.0932 0.0948 0.2597 5.71e-04 3lb8:A, 3lb8:B, 1q1r:A, 1q1r:B, 1q1w:B
17 3fg2:P 404 108 0.0769 0.0817 0.3056 7.58e-04
18 8pxk:A 403 139 0.0909 0.0968 0.2806 0.004 1d7y:A, 1f3p:A, 2gqw:A, 2gr0:A, 2gr1:A, 2gr2:A, 2gr3:A, 4h4p:A, 4h4q:A, 4h4r:A, 4h4s:A, 4h4t:A, 4h4u:A, 4h4v:A, 4h4w:A, 4h4x:A, 4h4y:A, 4h4z:A, 4h50:A, 8pxl:A, 2yvf:A, 2yvg:A, 2yvj:A, 2yvj:P
19 3lov:A 451 32 0.0350 0.0333 0.4688 0.020
20 6ynv:e 417 318 0.1585 0.1631 0.2138 0.027 6ynx:e, 6ynx:E, 6yny:e, 6yny:E, 6ynz:e, 6ynz:E, 6ynz:e3, 6ynz:E3
21 7xpi:A 363 279 0.1445 0.1708 0.2222 0.030 7ytl:A
22 7xpi:A 363 156 0.0816 0.0964 0.2244 5.4 7ytl:A
23 5ipx:A 282 128 0.0816 0.1241 0.2734 0.034
24 3vrd:B 400 86 0.0536 0.0575 0.2674 0.17
25 3jsk:A 292 29 0.0303 0.0445 0.4483 0.19 3jsk:B, 3jsk:C, 3jsk:D, 3jsk:E, 3jsk:F, 3jsk:G, 3jsk:H, 3jsk:I, 3jsk:J, 3jsk:K, 3jsk:L, 3jsk:M, 3jsk:N, 3jsk:O, 3jsk:P
26 2r9z:B 453 217 0.1235 0.1170 0.2442 0.20 2r9z:A, 2rab:A, 2rab:B
27 6tuk:B 393 105 0.0653 0.0712 0.2667 0.23
28 6rkf:A 335 39 0.0373 0.0478 0.4103 0.23 6rkf:B, 6rkf:C, 6rkf:D, 6rkf:E, 6rkf:F
29 3i6d:B 419 42 0.0373 0.0382 0.3810 0.23 3i6d:A
30 4x9m:A 384 39 0.0373 0.0417 0.4103 0.57 4x9n:A
31 8q74:A 783 58 0.0396 0.0217 0.2931 0.74 8q75:A, 8q76:A
32 7d9f:A 591 36 0.0326 0.0237 0.3889 0.76 7d9f:B, 7d9g:A, 7d9g:B, 7d9h:A, 7d9h:B, 7d9i:A, 7d9i:B, 7d9j:A, 7d9j:B
33 8jhe:A 508 87 0.0559 0.0472 0.2759 0.86 8jhe:B, 8jhe:C, 8jhe:D
34 1f8r:A 483 50 0.0373 0.0331 0.3200 0.95 1f8r:B, 1f8r:C, 1f8r:D, 1f8s:A, 1f8s:B, 1f8s:C, 1f8s:D, 1f8s:E, 1f8s:F, 1f8s:G, 1f8s:H, 2iid:A, 2iid:B, 2iid:C, 2iid:D
35 2apg:A 517 96 0.0629 0.0522 0.2812 1.2 2aqj:A, 2ar8:A, 2ard:A, 2jkc:A, 4z43:A, 4z44:A
36 3omc:A 217 99 0.0629 0.1244 0.2727 1.5 5m9o:A, 3omc:B, 3omg:A, 3omg:B
37 3lxd:A 409 55 0.0443 0.0465 0.3455 1.6
38 6krt:A 433 65 0.0490 0.0485 0.3231 1.7 6krt:B
39 8h62:A 462 76 0.0606 0.0563 0.3421 1.8 1o6t:A
40 3out:B 264 149 0.0816 0.1326 0.2349 2.0 3out:A, 3out:C
41 7jyp:A 305 235 0.1305 0.1836 0.2383 2.1
42 4dsg:A 473 26 0.0280 0.0254 0.4615 2.6 4dsg:B, 4dsh:A, 4dsh:B
43 4im0:A 619 33 0.0280 0.0194 0.3636 2.9 6bny:A, 6bod:A, 6boe:A, 6cq0:A, 6cq4:A, 6cq5:A, 4im2:A, 4im3:A, 6nt9:A, 6nt9:B, 5w5v:A
44 8c0z:E 424 108 0.0699 0.0708 0.2778 3.0
45 6o8b:B 657 33 0.0280 0.0183 0.3636 3.1 4eut:A, 4eut:B, 4euu:A, 4euu:B, 4iw0:A, 4jl9:A, 4jlc:A, 6o8b:A, 6o8c:B
46 2hjr:B 314 104 0.0606 0.0828 0.2500 3.3 2hjr:A, 2hjr:C, 2hjr:D, 2hjr:E, 2hjr:F, 2hjr:G, 2hjr:H, 2hjr:I, 2hjr:J, 2hjr:K, 2hjr:L
47 1sez:A 465 21 0.0303 0.0280 0.6190 3.5 1sez:B
48 7btj:C 435 43 0.0326 0.0322 0.3256 3.7 7bq6:A, 7btj:A, 7btj:B, 7btj:D, 7buz:A, 7buz:B, 7bvi:A, 7bvi:B, 7bvi:C, 7bvi:D, 5jci:A, 5jck:A, 5jcl:A, 5jcl:B, 5jcm:A, 5jcm:B, 5jcn:A, 5jcn:B
49 5ygq:A 341 116 0.0699 0.0880 0.2586 4.2 5ygq:B
50 8gri:F 482 42 0.0350 0.0311 0.3571 4.5 8gri:A, 8gri:B, 8gri:D, 8gri:C, 8gri:E, 8gri:G, 8gri:H, 7xqa:A, 7xqa:B, 7xqa:C, 7xqa:D, 7xqa:E, 7xqa:F, 7xqa:G, 7xqa:H, 7xx0:A, 7xx0:B, 7xx0:C, 7xx0:D, 7xx0:E, 7xx0:G, 7xx0:F, 7xx0:H, 7xxc:A, 7xxc:C, 7xxc:B, 7xxc:D, 7xxc:E, 7xxc:G, 7xxc:F, 7xxc:H, 7xxd:A, 7xxd:B, 7xxd:C, 7xxd:D, 7xxd:E, 7xxd:F, 7xxd:G, 7xxd:H, 7xxm:A, 7xxm:C, 7xxm:B, 7xxm:D, 7xxm:E, 7xxm:G, 7xxm:F, 7xxm:H, 7xxp:A, 7xxp:B, 7xxp:C, 7xxp:D, 7xxp:E, 7xxp:F, 7xxp:G, 7xxp:H, 7xxr:A, 7xxr:C, 7xxr:B, 7xxr:D, 7xxr:E, 7xxr:G, 7xxr:F, 7xxr:H, 7xye:A, 7xye:B, 7xye:C, 7xye:D, 7xye:E, 7xye:F, 7xye:G, 7xye:H, 7xyl:A, 7xyl:C, 7xyl:B, 7xyl:D, 7xyl:E, 7xyl:G, 7xyl:F, 7xyl:H, 7y0x:A, 7y0x:C, 7y0x:B, 7y0x:D, 7y0x:E, 7y0x:G, 7y0x:F, 7y0x:H
51 6o8c:A 636 33 0.0256 0.0173 0.3333 5.2 4iwo:A, 4iwp:A, 4iwq:A, 6rsr:A, 6rst:A, 6rsu:A
52 1reo:A 484 34 0.0303 0.0269 0.3824 5.4 1tdk:A, 1tdn:A, 1tdo:A
53 3fpz:A 311 29 0.0256 0.0354 0.3793 5.7 3fpz:B, 4y4l:A, 4y4l:B, 4y4l:C, 4y4l:D
54 3nks:A 465 38 0.0303 0.0280 0.3421 7.2 4ivm:B, 4ivo:B
55 5ts5:A 483 50 0.0350 0.0311 0.3000 7.7 4e0v:A, 4e0v:B, 5ts5:B, 5ts5:C, 5ts5:D
56 3atq:A 452 96 0.0676 0.0642 0.3021 7.7 3atr:A, 4opc:A, 4opd:A, 4opd:B, 4opg:A, 4opi:A, 4opl:A, 4opt:A, 4opu:A
57 5z2g:A 477 19 0.0256 0.0231 0.5789 7.7 5z2g:B
58 7mfm:I 490 107 0.0536 0.0469 0.2150 8.0 7mfm:J, 7mft:I
59 3kve:A 484 34 0.0303 0.0269 0.3824 8.4 3kve:B, 3kve:C, 3kve:D
60 6eqo:A 1804 93 0.0653 0.0155 0.3011 9.4 6eqo:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218