Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
AKALIVYGSTTGNTEYTAETIARELADAGYEVDSRDAASVEAGGLFEGFDLVLLGCSTWGDDCIELQDDFIPLFDSLEET
GAQGRKVACFGCGDSSYEYFCGAVDAIEEKLKNLGAEIVQDGLRIDGDPRAARDDIVGWAHDVRGAI

The query sequence (length=147) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7ddz:A 437 147 0.9864 0.3318 0.9864 7.87e-101
2 7k15:A 455 147 0.9864 0.3187 0.9864 8.04e-101
3 5tgz:A 439 147 0.9864 0.3303 0.9864 1.07e-100 7v3z:A, 5xr8:A, 5xra:A
4 5zkp:A 436 147 0.9864 0.3326 0.9864 1.86e-100
5 7epe:A 389 147 0.9864 0.3728 0.9864 1.89e-100 7epf:A
6 6li0:A 441 147 0.9864 0.3288 0.9864 4.11e-100 6li1:A
7 5v57:A 645 147 0.9864 0.2248 0.9864 7.46e-97 1akq:A, 1akr:A, 1akt:A, 1aku:A, 1akv:A, 1akw:A, 1azl:A, 1bu5:A, 1bu5:B, 1c7e:A, 1c7e:B, 1c7f:A, 1c7f:B, 1f4p:A, 1fx1:A, 2fx2:A, 3fx2:A, 4fx2:A, 5fx2:A, 1i1o:A, 1j8q:A, 1j9e:A, 1j9g:A, 5v56:A, 5v56:B, 5v57:B, 1wsb:A, 1wsw:A, 1xt6:A, 1xyv:A, 1xyy:A, 5yob:A, 5yoc:A, 5yoe:A, 5yog:A
8 4heq:A 145 142 0.5646 0.5724 0.5845 1.26e-53 4heq:B
9 3kap:A 147 143 0.4762 0.4762 0.4895 1.29e-45 3kaq:A
10 3f6r:A 147 143 0.4626 0.4626 0.4755 7.43e-43 3f6r:B, 3f6r:C, 3f6r:D, 3f6s:A, 3f6s:G, 3f6s:B, 3f6s:D, 3f6s:E, 3f6s:F, 3f6s:H, 3f6s:I, 3f90:A, 3f90:B, 3f90:D, 3f90:E, 3f90:F, 3f90:H, 3f90:I, 3f90:G
11 6gaq:A 146 135 0.3810 0.3836 0.4148 1.13e-23 6gaq:B
12 6fsg:A 147 130 0.2993 0.2993 0.3385 2.73e-21 6fsi:A, 6ft1:A
13 1czh:A 169 121 0.3129 0.2722 0.3802 4.15e-16 1czk:A, 1czl:A, 1czn:A, 1czo:A, 1czr:A, 1czu:A, 1d03:A, 1d04:A, 6kif:P, 6kif:X, 6kif:p, 1ofv:A
14 5lji:A 145 126 0.2857 0.2897 0.3333 3.92e-15 5lji:C
15 2mok:A 176 118 0.3333 0.2784 0.4153 3.49e-14 1ag9:A, 1ag9:B, 1ahn:A
16 2fax:A 138 142 0.2993 0.3188 0.3099 4.57e-14 2fdx:A, 1fla:A, 1fld:A, 1fln:A, 2flv:A, 2fox:A, 1fvx:A, 2fvx:A, 3nll:A, 4nll:A, 5nll:A, 4nul:A, 5nul:A, 6nul:A, 5ull:A
17 2mt9:A 173 117 0.2653 0.2254 0.3333 3.43e-10
18 3esx:B 169 145 0.3061 0.2663 0.3103 7.82e-09 3esx:A, 3esy:A, 3esy:B, 3esy:C, 3esy:D, 3esz:A, 3esz:B, 1flv:A, 5ljp:A, 1obo:A, 1obo:B, 1obv:A, 1rcf:A, 2v5u:A, 2v5u:B, 2v5v:A, 2v5v:B
19 8v2y:B 151 115 0.2449 0.2384 0.3130 1.36e-07
20 8snz:A 167 117 0.2517 0.2216 0.3162 1.52e-07 8snz:B, 8v2y:A
21 4oxx:A 153 155 0.3469 0.3333 0.3290 2.20e-07
22 2fcr:A 173 123 0.2585 0.2197 0.3089 3.83e-07
23 6j79:A 816 143 0.2653 0.0478 0.2727 5.34e-07 1amo:A, 1amo:B, 1b1c:A, 1dve:A, 1dvg:A, 1dvg:B, 2dy5:A, 2e7e:A, 5emn:A, 5emn:B, 3es9:A, 3es9:B, 3es9:C, 5fa6:A, 5fa6:B, 4g7l:A, 4g7p:A, 4g7t:A, 4g7u:A, 4g8p:A, 4g8u:A, 4g8w:A, 4g98:A, 4g99:A, 3i9t:A, 3i9u:A, 1ivj:A, 1ix3:A, 1ix4:A, 1j02:A, 1j2c:A, 6j79:B, 6j7a:A, 6j7a:B, 6j7i:A, 6j7i:B, 1j9z:A, 1j9z:B, 1ja0:A, 1ja0:B, 1ja1:A, 1ja1:B, 7l18:AAA, 7l18:BBB, 4mec:A, 4mec:B, 4mec:C, 4mec:D, 4mec:E, 6njr:A, 6njr:B, 3ojw:A, 3ojx:A, 3qe2:A, 3qe2:B, 3qfc:A, 3qfc:B, 3qfr:A, 3qfr:B, 1ubb:A, 1ulx:A, 5urd:A, 5urd:B, 5ure:A, 5ure:B, 5urg:A, 5urg:B, 5urh:A, 5urh:B, 5uri:A, 5uri:B, 1vgi:A, 3wkt:A, 3wkt:B, 3wkt:C, 3wkt:D, 4y7c:A, 4y7c:B, 4y9r:A, 4y9r:B, 4y9u:A, 4y9u:B, 4yaf:A, 4yaf:B, 4yal:A, 4yal:B, 4yao:A, 4yao:B, 4yau:A, 4yau:B, 4yaw:A, 4yaw:B, 2zvu:A
24 5veg:B 149 128 0.2109 0.2081 0.2422 1.36e-06 5veg:A, 5veg:C
25 2fz5:A 137 117 0.2653 0.2847 0.3333 3.88e-06
26 5wid:A 144 128 0.2517 0.2569 0.2891 7.33e-06 5wid:B, 5wid:C
27 6efv:A 530 127 0.2585 0.0717 0.2992 8.47e-05 1ddg:A, 1ddg:B, 1ddi:A, 1ykg:A
28 5k9b:A 179 158 0.2993 0.2458 0.2785 1.48e-04 1yob:A, 1yob:B
29 2bf4:A 645 120 0.2449 0.0558 0.3000 3.53e-04 2bf4:B, 2bn4:A, 2bn4:B, 2bpo:A, 2bpo:B
30 8dme:A 1034 143 0.3061 0.0435 0.3147 4.24e-04 5b2u:A, 5b2u:B, 5b2v:A, 5b2v:B, 5b2w:A, 5b2w:B, 5b2x:A, 5b2x:B, 5b2y:A, 5b2y:B, 3ben:A, 3ben:B, 2bmh:A, 2bmh:B, 1bu7:A, 1bu7:B, 1bvy:A, 1bvy:F, 1bvy:B, 3cbd:A, 3cbd:B, 7ckn:A, 7ckn:B, 7con:A, 7con:B, 7coo:A, 7coo:B, 7cp8:A, 7cp8:B, 7cvr:A, 7cvr:B, 7cx6:A, 7cx6:B, 7cx8:A, 7cx8:B, 7czi:A, 7czi:B, 7d0t:A, 7d0t:B, 7d0u:A, 7d0u:B, 7d1f:A, 7d1f:B, 3dgi:A, 8dme:B, 8dmg:A, 8dmg:B, 4dqk:A, 4dqk:B, 4dql:A, 4dql:B, 8dsg:A, 8dsg:B, 8dsg:C, 8dsg:D, 4dtw:B, 4dtw:A, 4dty:B, 4dty:A, 4dtz:A, 4dtz:B, 4du2:B, 4du2:A, 4dua:A, 4dua:B, 4dub:A, 4dub:B, 4duc:A, 4duc:B, 4dud:A, 4dud:B, 4due:A, 4due:B, 4duf:A, 4duf:B, 4duf:C, 4duf:D, 5dyp:A, 5dyp:C, 5dyz:A, 5dyz:C, 7e46:A, 7e46:B, 5e78:A, 5e78:B, 5e7y:A, 5e7y:B, 5e9z:A, 5e9z:B, 5e9z:C, 5e9z:D, 7egn:A, 7egn:B, 3ekb:A, 3ekb:B, 3ekd:A, 3ekd:B, 3ekf:A, 3ekf:B, 1fag:A, 1fag:B, 1fag:C, 1fag:D, 1fah:A, 1fah:B, 6h1l:A, 6h1l:B, 6h1o:A, 6h1o:B, 6h1s:A, 6h1s:B, 6h1t:A, 6h1t:B, 6h1t:C, 6h1t:D, 4h23:A, 4h23:B, 4h24:A, 4h24:B, 4h24:C, 4h24:D, 4hgf:A, 4hgf:B, 4hgg:A, 4hgg:B, 4hgh:A, 4hgh:B, 4hgi:A, 4hgi:B, 4hgj:A, 4hgj:B, 6hn8:A, 6hn8:B, 8hon:A, 8hon:B, 8hoo:A, 8hoo:B, 8hop:A, 8hop:B, 8hoq:A, 8hoq:B, 8hor:A, 8hor:B, 8hos:A, 8hos:B, 8hot:A, 8hot:B, 8hou:A, 8hou:B, 2hpd:A, 2hpd:B, 6iao:A, 6iao:B, 6iao:C, 6iao:D, 2ij2:A, 2ij2:B, 2ij3:A, 2ij3:B, 2ij4:A, 2ij4:B, 2j1m:A, 2j1m:B, 2j4s:A, 2j4s:B, 8jc3:B, 8jc3:A, 8jc4:A, 8jc4:B, 6jlv:A, 6jlv:B, 1jme:A, 1jme:B, 6jmh:A, 6jmh:B, 6jmw:A, 6jmw:B, 6jo1:A, 6jo1:B, 1jpz:A, 1jpz:B, 5jq2:A, 5jq2:B, 5jqu:A, 5jqu:B, 5jqu:C, 5jqu:D, 5jqu:E, 5jqu:F, 5jqu:G, 5jqu:H, 5jqv:A, 5jqv:B, 5jqv:C, 5jqv:D, 5jqv:E, 5jqv:F, 5jqv:G, 5jqv:H, 6js8:A, 6js8:B, 5jtd:A, 5jtd:B, 6jvc:A, 6jvc:C, 6jzs:A, 6jzs:C, 6k24:A, 6k24:B, 6k3q:A, 6k3q:B, 6k58:A, 6k58:B, 6k9s:A, 6k9s:B, 4kew:A, 4kew:B, 4key:A, 4key:B, 4kf0:A, 4kf0:B, 4kf2:A, 4kf2:B, 4kpa:A, 4kpb:A, 4kpb:B, 3kx3:A, 3kx3:B, 3kx4:A, 3kx4:B, 3kx5:A, 3kx5:B, 6l1a:A, 6l1a:B, 6l1b:A, 6l1b:B, 6ly4:A, 3m4v:A, 3m4v:B, 2nnb:A, 2nnb:B, 3npl:A, 3npl:B, 4o4p:A, 4o4p:B, 5og9:A, 5og9:B, 1p0v:A, 1p0v:B, 1p0w:A, 1p0w:B, 1p0x:A, 1p0x:B, 3qi8:B, 8qze:A, 8qze:B, 8qzf:A, 8qzf:B, 4rsn:A, 4rsn:B, 1smi:A, 1smi:B, 1smj:A, 1smj:B, 1smj:C, 1smj:D, 5ucw:A, 5ucw:B, 2uwh:A, 2uwh:B, 2uwh:C, 2uwh:D, 2uwh:E, 2uwh:F, 7w97:A, 7w97:B, 7w9d:A, 7w9d:B, 7w9j:A, 7w9j:B, 7wdd:A, 7wdd:B, 7wde:A, 7wde:B, 7wdg:A, 7wdg:B, 7wdh:A, 7wdh:B, 7wdi:A, 7wdi:B, 4wg2:A, 4wg2:B, 4wg2:C, 7wg0:A, 7wg0:B, 3wsp:A, 3wsp:B, 7wy1:A, 7wy1:B, 7wy2:A, 7wy2:B, 7wy3:A, 7wy3:B, 7wy4:A, 7wy4:B, 2x7y:A, 2x7y:B, 2x80:A, 2x80:B, 5xa3:A, 5xa3:B, 5xa3:C, 5xa3:D, 5xhj:A, 5xhj:B, 7xzk:A, 7xzk:B, 7y0p:B, 7y0p:A, 7y0q:A, 7y0q:B, 7y0r:A, 7y0r:B, 7y0s:B, 7y0s:A, 7y0t:B, 7y0t:A, 7y0u:A, 7y0u:B, 7y9j:A, 7y9j:B, 7y9k:A, 7y9k:B, 7y9l:A, 7y9l:B, 7y9m:A, 7yd9:A, 7yd9:B, 7yda:A, 7yda:B, 7ydb:A, 7ydb:B, 7ydc:A, 7ydc:B, 7ydd:A, 7ydd:B, 7yde:A, 7yde:B, 7ydl:A, 7ydl:B, 7yft:A, 7yft:B, 7yjd:A, 7yjd:B, 7yje:A, 7yje:B, 7yjf:A, 7yjf:B, 7yjg:A, 7yjg:B, 7yjh:A, 7yjh:B, 1yqo:A, 1yqo:B, 1yqp:A, 1yqp:B, 4zf6:A, 4zf8:A, 4zfa:A, 4zfb:A, 5zis:A, 5zis:B, 5zis:C, 5zis:D, 5zlh:A, 5zlh:B, 5zlh:C, 5zlh:D, 1zo4:A, 1zo4:B, 1zo9:A, 1zo9:B, 1zoa:A, 1zoa:B
31 3fjo:A 603 120 0.2449 0.0597 0.3000 5.95e-04 3qfs:A, 3qft:A
32 5gxu:A 552 152 0.2789 0.0743 0.2697 0.010 5gxu:B
33 3hr4:A 189 67 0.1633 0.1270 0.3582 0.024 3hr4:C, 3hr4:E, 3hr4:G
34 1tll:A 630 163 0.2993 0.0698 0.2699 0.040 1f20:A, 1tll:B
35 6t1t:A 635 149 0.2517 0.0583 0.2483 0.086 6t1t:B, 6t1u:A, 6t1u:B
36 2m6s:A 149 77 0.1701 0.1678 0.3247 0.11
37 7d3e:C 1380 24 0.0816 0.0087 0.5000 0.22 7d3e:A, 7d3f:C, 7d3f:A
38 1ycf:A 398 134 0.2313 0.0854 0.2537 0.67 1ycf:B, 1ycf:C, 1ycf:D, 1ycg:A, 1ycg:B, 1ycg:C, 1ycg:D, 1ych:A, 1ych:B, 1ych:C, 1ych:D
39 7aih:L 178 48 0.0952 0.0787 0.2917 1.0 7am2:L, 7ane:L
40 7ou8:AAA 714 49 0.1156 0.0238 0.3469 1.1 5abe:A, 5abe:B, 5abf:A, 5abf:B, 5abg:A, 5abg:B, 5abh:A, 5abh:B, 4ais:A, 4ais:B, 4aiu:A, 2chn:A, 2chn:B, 2cho:A, 2cho:B, 5fky:A, 5fky:B, 5fl0:A, 5fl0:B, 5fl1:A, 5fl1:B, 2j47:A, 2j4g:A, 2j4g:B, 2jiw:A, 2jiw:B, 7k41:A, 5mi4:A, 5mi5:A, 5mi6:A, 5mi7:A, 7ou8:BBB, 4ur9:A, 4ur9:B, 2vvn:A, 2vvn:B, 2vvs:A, 2w4x:A, 2w66:A, 2w66:B, 2w67:A, 2w67:B, 2wca:A, 2wzh:A, 2wzi:A, 2wzi:B, 2x0h:A, 2x0h:B, 2xj7:A, 2xj7:B, 2xm1:A, 2xm1:B, 2xm2:A, 2xm2:B
41 6hiv:AV 181 48 0.0952 0.0773 0.2917 1.7 7aoi:AV, 6hix:AV, 6yxx:AV, 6yxy:AV
42 6bdd:A 185 46 0.0952 0.0757 0.3043 2.7 6bde:A
43 3edo:A 151 84 0.1293 0.1258 0.2262 2.9 3edo:B
44 6kr3:B 836 24 0.0612 0.0108 0.3750 3.1 5k5m:A
45 6kr2:A 857 24 0.0612 0.0105 0.3750 3.1 6izx:A, 6izy:A, 6kr2:B, 6kr3:A
46 8t13:B 877 24 0.0612 0.0103 0.3750 3.2 3evg:A, 1l9k:A, 2p1d:A, 2p3l:A, 2p3o:A, 2p3q:A, 2p40:A, 2p41:A, 1r6a:A, 8t12:B, 7xd8:A, 7xd8:D, 7xd8:G, 7xd8:J, 7xd8:M, 7xd8:P, 7xd9:A, 7xd9:D, 7xd9:G, 7xd9:J, 7xd9:M, 7xd9:P, 5zqk:A, 5zqk:B
47 2pij:A 59 38 0.0952 0.2373 0.3684 3.4
48 4h2d:A 158 118 0.2041 0.1899 0.2542 4.6 4h2d:B
49 6i44:A 594 56 0.1156 0.0286 0.3036 6.8 5f8t:A, 5f8x:A, 5f8z:A, 7n7x:AAA, 6o1g:A, 6o1s:E, 7qox:B, 7qox:A, 6t7p:A, 5tjx:A
50 4xcx:A 216 50 0.1224 0.0833 0.3600 7.0 5wy0:A
51 8h72:A 328 34 0.0816 0.0366 0.3529 8.8 8h72:B
52 1fn8:A 224 49 0.0816 0.0536 0.2449 9.8 1fy4:A, 1fy5:A, 1gdn:A, 1gdq:A, 1gdu:A, 1pq5:A, 1pq7:A, 1pq8:A, 1try:A, 1xvm:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218