Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
AKAEEMLSKQRHDGAFLIREGDFSLSVKFGNDVQHFKVLRDGAGKYFLWVVKFNSLNELVDYHRSTSVSRNQQIFLR

The query sequence (length=77) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8dgo:B 218 82 1.0000 0.3532 0.9390 7.61e-49 2aoa:A, 2aoa:B, 2aob:A, 2aob:B, 2aob:C, 2aob:D, 1aze:A, 1bm2:A, 1bmb:A, 3c7i:A, 5cdw:B, 5cdw:K, 5cdw:O, 5cdw:Y, 5cdw:d, 5cdw:Z, 5cdw:V, 5cdw:P, 5cdw:L, 5cdw:H, 5cdw:C, 5cdw:E, 5cdw:U, 5cdw:c, 5cdw:A, 5cdw:G, 1cj1:A, 1cj1:B, 1cj1:C, 1cj1:D, 1cj1:E, 1cj1:F, 1cj1:G, 1cj1:H, 1cj1:I, 1cj1:J, 1cj1:K, 1cj1:L, 1fyr:A, 1fyr:B, 1fyr:C, 1fyr:D, 1gbq:A, 2gbq:A, 3gbq:A, 4gbq:A, 2h5k:A, 2huw:A, 2huw:B, 3imd:A, 3imd:B, 3imj:A, 3imj:B, 3in7:A, 3in7:C, 3in8:A, 1io6:A, 1jyq:A, 1jyq:B, 1jyr:A, 3kfj:A, 7mph:A, 7mph:B, 7mph:C, 7mph:D, 7mph:E, 7mph:F, 3mxc:A, 3mxy:A, 3n7y:A, 3n7y:B, 3n7y:C, 3n84:A, 3n84:B, 3n84:C, 3n84:D, 3n84:E, 3n84:F, 3n8m:A, 3ov1:A, 3ove:A, 4p9v:A, 4p9z:A, 1qg1:E, 3s8l:A, 3s8n:A, 3s8o:A, 1tze:E, 2vwf:A, 2w0z:A, 3wa4:A, 6wm1:A, 6wm1:C, 6wo2:A, 6wo2:B, 1x0n:A, 1zfp:E
2 4jmh:A 200 55 0.6494 0.2500 0.9091 2.81e-29 4jmg:A
3 4jmh:A 200 27 0.3377 0.1300 0.9630 1.61e-11 4jmg:A
4 5gjh:A 97 69 0.5455 0.4330 0.6087 3.29e-24 5gjh:C
5 1r1p:B 100 69 0.5325 0.4100 0.5942 3.61e-24 1r1p:A, 1r1p:D, 1r1p:C, 1r1q:A, 1r1q:B, 1r1s:A, 1r1s:C, 1r1s:E, 1r1s:G
6 2lnw:A 113 67 0.3117 0.2124 0.3582 1.86e-06 7rnv:A, 4roj:A, 4roj:B, 4roj:C, 7wfy:C
7 7uy0:A 448 70 0.3506 0.0603 0.3857 1.86e-06 7uy0:B, 7uy3:A
8 2ci9:A 102 78 0.3377 0.2549 0.3333 3.78e-06 2ci9:B
9 4k2r:A 551 63 0.2987 0.0417 0.3651 5.23e-06 2oq1:A, 2ozo:A, 1u59:A, 4xz0:A, 4xz1:A
10 8t7c:A 1001 78 0.3766 0.0290 0.3718 5.97e-06
11 3ps5:A 529 66 0.3247 0.0473 0.3788 6.93e-06 1fpr:A, 4gry:A, 4grz:A, 4gs0:B, 4hjq:A, 4hjq:B
12 3ps5:A 529 91 0.3766 0.0548 0.3187 0.018 1fpr:A, 4gry:A, 4grz:A, 4gs0:B, 4hjq:A, 4hjq:B
13 4xey:B 359 70 0.3117 0.0669 0.3429 1.69e-05 7n9g:C, 4wa9:A
14 2ror:A 138 74 0.3247 0.1812 0.3378 3.09e-05 2lct:A, 2mc1:A
15 3cxl:A 402 53 0.2338 0.0448 0.3396 1.51e-04
16 6bn5:B 448 64 0.3247 0.0558 0.3906 1.68e-04
17 6bn5:B 448 61 0.2987 0.0513 0.3770 0.088
18 1xa6:A 399 64 0.2597 0.0501 0.3125 2.26e-04
19 7t8t:A 1086 78 0.2857 0.0203 0.2821 2.35e-04
20 8dgq:A 272 71 0.3247 0.0919 0.3521 2.35e-04 8dgq:B, 6pxc:A, 6way:A
21 8dgq:A 272 59 0.1818 0.0515 0.2373 0.033 8dgq:B, 6pxc:A, 6way:A
22 6pbc:A 1070 78 0.2857 0.0206 0.2821 2.37e-04
23 7z3j:A 1119 78 0.2857 0.0197 0.2821 2.37e-04 2fci:A, 4k45:A, 7nxe:A, 2pld:A, 2ple:A, 5tq1:A, 5tqs:A, 5tqs:B, 5tqs:D, 5tqs:C, 1ywo:A
24 7t1u:B 107 67 0.3117 0.2243 0.3582 2.80e-04 7t1u:A
25 1fu5:A 111 77 0.3506 0.2432 0.3506 3.85e-04 1oo4:A
26 1pic:A 112 72 0.3247 0.2232 0.3472 4.43e-04 5aul:A, 7cio:A, 1h9o:A
27 7r7l:A 490 67 0.3247 0.0510 0.3731 4.64e-04 6bmr:B, 6bmu:A, 6bmu:B, 6bmv:A, 6bmv:B, 6bmw:A, 6bmw:B, 6bmx:A, 6bmx:B, 6bmy:A, 6bmy:B, 8cbh:A, 8cbh:B, 6crg:A, 5ehp:B, 5ehr:A, 5ehr:B, 8gww:A, 8gww:B, 7jvm:A, 7jvm:B, 7jvn:A, 7jvn:B, 6md9:A, 6md9:B, 6mda:A, 6mda:B, 6mdb:A, 6mdb:B, 6mdc:A, 6mdc:B, 6mdd:A, 6mdd:B, 7r7i:B, 7r7l:B, 8s0s:B, 8t7q:B, 7vxg:A, 7vxg:B, 7vxg:C, 7vxg:D, 8wx7:A, 7xhq:A, 7xhq:B
28 7r7l:A 490 69 0.2987 0.0469 0.3333 0.002 6bmr:B, 6bmu:A, 6bmu:B, 6bmv:A, 6bmv:B, 6bmw:A, 6bmw:B, 6bmx:A, 6bmx:B, 6bmy:A, 6bmy:B, 8cbh:A, 8cbh:B, 6crg:A, 5ehp:B, 5ehr:A, 5ehr:B, 8gww:A, 8gww:B, 7jvm:A, 7jvm:B, 7jvn:A, 7jvn:B, 6md9:A, 6md9:B, 6mda:A, 6mda:B, 6mdb:A, 6mdb:B, 6mdc:A, 6mdc:B, 6mdd:A, 6mdd:B, 7r7i:B, 7r7l:B, 8s0s:B, 8t7q:B, 7vxg:A, 7vxg:B, 7vxg:C, 7vxg:D, 8wx7:A, 7xhq:A, 7xhq:B
29 2rmx:A 118 91 0.3766 0.2458 0.3187 5.25e-04 2yu7:A
30 2cia:A 98 73 0.3117 0.2449 0.3288 6.57e-04
31 6crg:B 462 73 0.3506 0.0584 0.3699 6.65e-04 6bn5:A
32 6crg:B 462 56 0.2857 0.0476 0.3929 0.009 6bn5:A
33 5swo:B 267 64 0.2857 0.0824 0.3438 0.003 5gji:A, 2iuh:A, 2iui:A, 2iui:B, 7rns:A, 5sxk:B
34 5xzr:A 519 67 0.3117 0.0462 0.3582 0.004 1aya:A, 1aya:B, 1ayb:A, 1ayc:A, 8b5y:A, 8b5y:B, 9blg:A, 9blg:B, 6bmr:A, 6cmr:A, 6cms:A, 5df6:A, 5ehp:A, 6md7:A, 6md7:B, 3mow:A, 3o5x:A, 7ppl:A, 7ppm:A, 7ppn:A, 4pvg:A, 4qsy:A, 6r5g:A, 7r75:A, 7r7d:A, 7r7d:B, 7r7i:A, 7rct:B, 7rct:A, 4rdd:A, 6roy:A, 6roy:B, 6roz:A, 6roz:C, 8rzw:A, 8rzw:B, 8rzy:A, 8rzy:B, 8s01:A, 8s01:B, 8s04:A, 8s04:B, 8s06:A, 8s06:B, 8s07:A, 8s07:B, 8s0h:A, 8s0h:B, 8s0i:A, 8s0i:B, 8s0j:A, 8s0j:B, 8s0k:A, 8s0k:B, 8s0o:A, 8s0o:B, 8s0p:A, 8s0p:B, 8s0q:A, 8s0q:B, 8s0s:A, 2shp:A, 2shp:B, 8t6d:A, 8t6d:B, 8t6g:A, 8t6g:B, 8t7q:A, 8t8q:A, 8t8q:B, 3tkz:A, 3tl0:A, 8u7w:A, 8u7w:B, 8u7x:A, 8u7x:B, 8wfy:A, 8wfy:B, 6wu8:A, 6wu8:B, 8wx7:B, 5x7b:A, 5x94:A, 5x94:B
35 5xzr:A 519 36 0.2078 0.0308 0.4444 0.012 1aya:A, 1aya:B, 1ayb:A, 1ayc:A, 8b5y:A, 8b5y:B, 9blg:A, 9blg:B, 6bmr:A, 6cmr:A, 6cms:A, 5df6:A, 5ehp:A, 6md7:A, 6md7:B, 3mow:A, 3o5x:A, 7ppl:A, 7ppm:A, 7ppn:A, 4pvg:A, 4qsy:A, 6r5g:A, 7r75:A, 7r7d:A, 7r7d:B, 7r7i:A, 7rct:B, 7rct:A, 4rdd:A, 6roy:A, 6roy:B, 6roz:A, 6roz:C, 8rzw:A, 8rzw:B, 8rzy:A, 8rzy:B, 8s01:A, 8s01:B, 8s04:A, 8s04:B, 8s06:A, 8s06:B, 8s07:A, 8s07:B, 8s0h:A, 8s0h:B, 8s0i:A, 8s0i:B, 8s0j:A, 8s0j:B, 8s0k:A, 8s0k:B, 8s0o:A, 8s0o:B, 8s0p:A, 8s0p:B, 8s0q:A, 8s0q:B, 8s0s:A, 2shp:A, 2shp:B, 8t6d:A, 8t6d:B, 8t6g:A, 8t6g:B, 8t7q:A, 8t8q:A, 8t8q:B, 3tkz:A, 3tl0:A, 8u7w:A, 8u7w:B, 8u7x:A, 8u7x:B, 8wfy:A, 8wfy:B, 6wu8:A, 6wu8:B, 8wx7:B, 5x7b:A, 5x94:A, 5x94:B
36 1a81:E 220 61 0.2468 0.0864 0.3115 0.076 1a81:G, 1a81:K
37 4fl2:A 555 39 0.1818 0.0252 0.3590 0.25 1a81:A, 1a81:C, 1a81:I, 8bi2:A, 5c26:A, 5c27:A, 1csy:A, 1csz:A, 5cxh:A, 5cxz:A, 5cy3:A, 4dfl:A, 4dfn:A, 3emg:A, 4f4p:A, 4fl1:A, 4fl3:A, 3fqe:A, 3fqh:A, 3fqh:B, 3fqs:A, 4fyn:A, 4fyo:A, 4fz6:A, 4fz7:A, 4gfg:A, 5ghv:A, 5ghv:B, 6hm6:A, 6hm7:A, 4i0r:A, 4i0s:A, 4i0t:A, 5lma:A, 5lmb:A, 5lmb:B, 4puz:A, 4puz:B, 4pv0:A, 4px6:A, 7q5t:EEE, 7q5t:CCC, 7q5t:DDD, 7q5t:AAA, 7q5t:BBB, 7q5t:FFF, 7q5u:FFF, 7q5u:DDD, 7q5u:BBB, 7q5u:CCC, 7q5u:EEE, 7q5u:AAA, 7q5w:BBB, 7q5w:DDD, 7q5w:FFF, 7q5w:EEE, 7q5w:AAA, 7q5w:CCC, 8rrq:A, 8rrz:A, 4rss:A, 4rx7:A, 4rx8:A, 4rx9:A, 3srv:A, 3srv:B, 6ssb:A, 5t68:A, 5t68:B, 5tiu:A, 5tr6:A, 5tt7:A, 3tub:A, 3tuc:A, 3tud:A, 3vf8:A, 3vf9:A, 6vov:A, 6vov:B, 4wnm:A, 8x5k:A, 1xbb:A, 1xbc:A, 4xg3:A, 4xg3:B, 4xg4:A, 4xg6:A, 4xg7:A, 4xg8:A, 4xg8:C, 4xg9:A, 4xg9:B, 5y5t:A, 5y5u:A, 5y5u:B, 4yjo:A, 4yjp:A, 4yjq:A, 4yjr:A, 4yjs:A, 4yjt:A, 4yju:A, 4yjv:A, 6zc0:A, 6zcp:A, 6zcq:A, 6zcr:A, 6zcs:A, 6zcu:A, 6zcx:A, 6zcy:A
38 7qqg:D 496 38 0.2078 0.0323 0.4211 0.29
39 7qqg:B 623 38 0.2078 0.0257 0.4211 0.29 7qqg:A, 7qqg:C, 7qqh:A, 7qqh:B, 7qqh:C, 7qqh:D
40 2etz:A 108 79 0.2857 0.2037 0.2785 0.66 2eu0:A
41 1h1i:B 346 33 0.1558 0.0347 0.3636 0.93 1gqg:A, 1gqg:B, 1gqg:C, 1gqg:D, 1gqh:A, 1gqh:B, 1gqh:C, 1gqh:D, 1h1i:A, 1h1i:C, 1h1i:D, 1h1m:A, 1h1m:B, 1h1m:C, 1h1m:D, 1juh:A, 1juh:B, 1juh:C, 1juh:D
42 4oau:C 692 37 0.1688 0.0188 0.3514 3.2 4g8l:A, 4g8l:B, 4g8l:C, 4g8l:D, 4oav:B, 4oav:D, 1wdy:A
43 6m13:b 688 40 0.1948 0.0218 0.3750 4.7 7dsy:a, 7dsy:b, 7dts:a, 7dts:b, 7elw:a, 7elw:b, 6m11:a, 6m11:b, 6m12:a, 6m12:b, 6m13:a, 4o1o:A, 4o1o:B, 4o1o:C, 4o1o:D, 4o1p:A, 4o1p:B, 4o1p:C, 4o1p:D
44 2hdx:A 108 61 0.1688 0.1204 0.2131 5.4 2hdx:B, 2hdx:C, 2hdx:D, 2hdx:E, 2hdx:F
45 5tmb:A 451 58 0.2597 0.0443 0.3448 5.7 6bk0:A, 6bk1:A, 6bk2:A, 6bk3:A, 5tmd:A, 5tme:A
46 6le7:A 381 29 0.1299 0.0262 0.3448 7.1 6le8:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218