BioLiP

>protein
AIKVGAWGGNGGSAFDMGPAYRIISVKIFSGDVVDAVDVTFTYYGKTETRHFGGSGGTPHEIVLQEGEYLVGMKGEFGNY
HGVVVVGKLGFSTNKKSYGPFGNTGGTPFSLPIAAGKISGFFGRGGDFIDAIGVYLEP

The query sequence (length=138) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4pit:B	144	138	0.9203	0.8819	0.9203	4.20e-88	2bmz:A, 2bmz:B, 2bn0:A, 2bn0:B, 8hyf:A, 3mit:A, 3mit:B, 3miu:A, 3miu:B, 3miv:B, 4pik:B, 4pik:C, 4pik:D, 4pik:A, 4pit:A, 4pit:C, 4pit:D, 1x1v:A, 1x1v:B
2	6fly:A	144	140	0.4275	0.4097	0.4214	2.09e-29	6fly:B, 6flz:A, 6flz:B
3	7v4s:A	143	144	0.4203	0.4056	0.4028	1.16e-25
4	1c3m:A	145	144	0.3986	0.3793	0.3819	1.78e-23	1c3n:A
5	1zgs:A	442	146	0.3768	0.1176	0.3562	3.65e-20	4mq0:A, 1zgs:B
6	1zgs:A	442	146	0.3406	0.1063	0.3219	5.54e-17	4mq0:A, 1zgs:B
7	1zgs:A	442	149	0.3696	0.1154	0.3423	2.74e-16	4mq0:A, 1zgs:B
8	1xxr:B	154	149	0.4348	0.3896	0.4027	9.31e-20	1xxr:C, 1xxr:D
9	5gvy:A	145	144	0.3696	0.3517	0.3542	5.77e-18	5gvy:B, 5xfh:A
10	4ddn:A	154	141	0.3696	0.3312	0.3617	1.49e-16	4ddn:B, 4ddn:C, 4ddn:D, 3r51:A, 3r52:A, 3r52:B, 3r52:C, 3r52:D
11	4ak4:A	133	84	0.2971	0.3083	0.4881	6.68e-16	4ak4:C, 4ak4:E, 4ak4:G, 4ak4:I, 4ak4:K, 4ak4:M, 4ak4:O, 4akb:A, 4akb:C, 4akb:E, 4akb:G, 4akc:A, 4akc:C, 4akc:E, 4akc:G, 5bn6:E, 5bn6:F, 5bn6:H, 5bn6:G, 5j4t:A, 5j4t:C, 5j4t:E, 5j4t:G, 5j4x:A, 5j4x:C, 5j4x:E, 5j4x:G, 5j50:A, 5j50:C, 5j50:E, 5j50:G, 5j51:A, 5j51:C, 5j51:E, 5j51:G, 1jac:A, 1jac:C, 1jac:E, 1jac:G, 5jm1:A, 5jm1:C, 5jm1:E, 5jm1:G, 1ku8:A, 1ku8:C, 1ku8:E, 1ku8:G, 1kuj:A, 1kuj:C, 1kuj:E, 1kuj:G, 1m26:A, 1m26:C, 1m26:E, 1m26:G, 1pxd:A, 4r6n:A, 4r6n:C, 4r6n:E, 4r6n:G, 4r6o:A, 4r6o:C, 4r6o:E, 4r6o:G, 4r6p:A, 4r6p:C, 4r6p:E, 4r6p:G, 4r6q:A, 4r6q:C, 4r6q:E, 4r6q:G, 4r6r:A, 4r6r:C, 4r6r:E, 4r6r:G, 1toq:A, 1toq:C, 1toq:E, 1toq:G, 1tp8:A, 1tp8:C, 1tp8:E, 1tp8:G, 1ugw:A, 1ugw:C, 1ugw:E, 1ugw:G, 1ugx:A, 1ugy:A, 1ugy:C, 1ugy:E, 1ugy:G, 1uh0:A, 1uh0:C, 1uh0:E, 1uh0:G, 1uh1:A, 1uh1:C, 1uh1:E, 1uh1:G, 1ws4:A, 1ws4:C, 1ws4:E, 1ws4:G, 1ws5:A, 1ws5:C, 1ws5:E, 1ws5:G
12	5m6o:A	150	144	0.3623	0.3333	0.3472	8.69e-16	5m6o:B, 5m6o:C, 5m6o:D, 5tqz:A, 5tqz:B, 5tqz:C, 5tqz:D
13	5xfi:A	152	142	0.3768	0.3421	0.3662	1.68e-15	5av7:A, 5av7:B, 5av7:C, 5av7:D, 5xfi:B
14	1jot:A	133	83	0.2754	0.2857	0.4578	2.57e-15	3lly:A, 3llz:A, 3lm1:A, 3lm1:E, 3lm1:M, 3lm1:C, 3lm1:G, 3lm1:K, 3lm1:I, 3lm1:O
15	1j4u:A	149	74	0.2319	0.2148	0.4324	8.09e-11	1j4u:B, 1j4u:C, 1j4u:D, 1vbo:A, 1vbo:B, 1vbo:C, 1vbo:E, 1vbo:G, 1vbo:H, 1vbo:D, 1vbo:F, 1vbp:A, 1vbp:B
16	3apa:A	138	96	0.2464	0.2464	0.3542	3.36e-09	3vy6:A, 3vy7:A, 3vze:A, 3vzf:A, 3vzg:A
17	3woc:A	138	99	0.1812	0.1812	0.2525	0.007	3woc:B, 3woc:C, 3woc:D, 3woc:E, 3woc:F
18	5fr8:A	707	44	0.1232	0.0240	0.3864	0.12	5fr8:B
19	3ll2:A	123	42	0.0942	0.1057	0.3095	2.2	2guc:A, 2guc:B, 2gud:A, 2gud:B, 2hyq:A, 2hyq:B, 2hyr:A, 2hyr:B, 2nuo:A, 2nuo:B, 7ria:A, 7ria:B, 7rib:A, 7rib:B, 7rib:C, 7rkg:A, 7rkg:B, 7rki:A, 7rki:B
20	1px8:A	500	86	0.1667	0.0460	0.2674	5.4	1px8:B, 1uhv:A, 1uhv:B, 1uhv:C, 1uhv:D
21	6qzk:A	746	98	0.2029	0.0375	0.2857	5.5
22	8rkg:A	170	37	0.1087	0.0882	0.4054	7.4	8rkg:B, 8rkg:C, 8rkg:D, 8rkg:E, 8rkg:F, 8rkg:G, 8rkg:H
23	1xoc:A	504	77	0.1667	0.0456	0.2987	7.9

[Back]