Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
AIKQLYMDCKNEADKFDVLTELYGVMTIGSSIIFVATKKTANVLYGKLKSEGHEVSILHGDLQTQERDRLIDDFREGRSK
VLITTNVLARGIDIPTVSMVVNYDLPTLANGQADPATYIHRIGRTGGRKGVAISFVHDKNSFNILSAIQKYFGDIEMTRV
PTDDWDEVEKIVKKVLKD

The query sequence (length=178) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5elx:A 391 179 0.9888 0.4501 0.9832 4.70e-127 3peu:A, 3pev:A, 3pew:A, 3pey:A, 3rrm:A, 3rrn:A
2 6b4i:F 426 172 0.4719 0.1972 0.4884 7.49e-54 6b4i:E, 6b4j:E, 6b4j:F, 6b4k:A, 6b4k:B, 3ews:A, 3ews:B, 3fht:A, 3fht:B, 3fmo:B, 3fmp:B, 3fmp:D, 3g0h:A
3 2rb4:A 164 152 0.3708 0.4024 0.4342 9.94e-39
4 3ex7:C 392 155 0.3764 0.1709 0.4323 1.21e-37 8c6j:7, 3ex7:H, 9fmd:7, 2hyi:C, 2hyi:I, 8i0w:u, 6icz:u, 2j0q:A, 2j0q:B, 2j0s:A, 2j0u:A, 6qdv:7, 2xb2:A, 2xb2:X, 5xjc:u, 5yzg:u, 7znj:A, 7znj:a, 7znj:F, 7znj:f, 7znj:K, 7znj:k
5 2vso:A 366 162 0.3539 0.1721 0.3889 8.53e-34 1fuk:A, 2vso:B, 2vsx:A, 2vsx:B
6 6xki:A 378 119 0.2865 0.1349 0.4286 1.52e-27 5zbz:A, 5zc9:A
7 4ct4:B 378 154 0.2921 0.1376 0.3377 5.01e-24 5anr:B, 4ct4:D, 1vec:A, 2wax:C, 2way:A
8 6s8r:A 167 153 0.2753 0.2934 0.3203 3.53e-23
9 7liu:A 442 132 0.2978 0.1199 0.4015 8.64e-23 6cz5:A, 5e7j:A, 5e7m:A, 2i4i:A, 7liu:B, 4px9:A, 4px9:B, 4px9:C, 4pxa:A, 8ssw:A, 8ssw:B
10 4bru:A 375 152 0.2809 0.1333 0.3289 1.18e-22
11 8arp:C 445 112 0.2472 0.0989 0.3929 1.26e-21 8arp:A, 8arp:B, 8arp:D, 8arp:E, 8arp:F
12 7pmq:C 458 149 0.2865 0.1114 0.3423 6.41e-21 7pli:A, 7pli:B, 7pli:J, 7pli:E, 7pli:F, 7pli:I, 7pmm:A, 7pmm:B, 7pmq:D, 7pmq:A, 7pmq:B
13 5sup:B 383 167 0.3034 0.1410 0.3234 2.07e-20 5sup:A, 5sup:C, 5suq:A, 5suq:C
14 8i9v:Cb 642 126 0.2640 0.0732 0.3730 2.91e-20 8i9t:Cb, 8i9w:Cb, 8i9x:Cb
15 6uv1:A 438 112 0.2472 0.1005 0.3929 1.51e-19 6uv1:B, 6uv2:A, 6uv3:A, 6uv4:A
16 5dtu:A 404 134 0.2360 0.1040 0.3134 2.25e-19
17 6l5n:A 377 124 0.2753 0.1300 0.3952 2.73e-19 6l5m:A, 6l5m:B, 6l5m:C, 6l5m:D, 6l5m:E, 6l5n:B, 6l5o:A
18 4d26:A 430 121 0.2472 0.1023 0.3636 2.77e-19 4d25:A
19 8y6o:I 597 112 0.2753 0.0821 0.4375 6.34e-19 8qp8:G, 6qw6:5X, 6qx9:5X, 8r08:G
20 6o5f:A 417 133 0.2809 0.1199 0.3759 1.26e-18 6o5f:B
21 8enk:B 381 165 0.2809 0.1312 0.3030 1.29e-18 8enk:A, 1xtj:A, 7znk:P, 7znk:p
22 4w7s:B 448 153 0.3034 0.1205 0.3529 1.79e-18
23 2db3:A 420 107 0.2416 0.1024 0.4019 3.36e-18 2db3:B, 2db3:C, 2db3:D
24 4kbf:A 365 97 0.2135 0.1041 0.3918 3.14e-17 2gxq:A, 2gxs:A, 2gxs:B, 2gxu:A, 3mwk:B, 3mwl:B, 3nbf:A, 3nbf:B, 3nbf:C, 3nbf:D
25 7am2:BW 447 163 0.2978 0.1186 0.3252 3.93e-17
26 8v87:3 656 126 0.2360 0.0640 0.3333 3.07e-16 8v84:3
27 4ljy:A 451 151 0.2697 0.1064 0.3179 4.81e-16 7oqb:p, 7oqe:p
28 6yxy:EB 663 123 0.2584 0.0694 0.3740 2.77e-15 7aoi:XB, 6yxx:EB
29 7nac:x 539 149 0.2753 0.0909 0.3289 8.33e-15 7nad:x, 7r72:x, 7r7a:x
30 8tbx:A 458 117 0.2584 0.1004 0.3932 1.10e-13
31 3i5x:A 509 111 0.2247 0.0786 0.3604 2.77e-12 4db2:C, 4db2:A, 4db2:B, 4db2:D, 4db4:A, 3i5y:A, 3i61:A, 3i62:A, 3sqw:A, 3sqx:A, 4tyn:A, 4tyw:A, 4tyy:A, 4tz0:A, 4tz6:A
32 8i9z:CE 465 159 0.2640 0.1011 0.2956 8.47e-12 8i9p:CE, 8i9r:CE, 8i9t:CE, 8i9v:CE, 8i9w:CE, 8i9x:CE, 8i9y:CE, 8ia0:CE
33 5z3g:Y 438 120 0.2191 0.0890 0.3250 2.42e-11 6c0f:p, 6cb1:p, 8e5t:p, 7nac:D, 7ohr:D, 7ohs:D, 7ohv:D, 7ohw:D, 7ohx:D, 7r6q:D, 7r7a:D, 8v87:D
34 8fky:SW 448 185 0.2584 0.1027 0.2486 6.10e-11 8fkp:SW, 8fkq:SW, 8fkr:SW, 8fks:SW, 8fkt:SW, 8fku:SW, 8fkv:SW, 8fkw:SW, 8fkx:SW, 3ly5:A
35 8fkv:NI 647 108 0.2079 0.0572 0.3426 8.43e-11 8fkt:NI, 8fku:NI, 8fkw:NI, 8fkx:NI, 8fky:NI
36 8ia0:CW 540 96 0.2079 0.0685 0.3854 3.16e-10 8i9z:CW
37 1gm5:A 729 136 0.2416 0.0590 0.3162 3.92e-10
38 8eti:D 391 66 0.1573 0.0716 0.4242 4.01e-10
39 8esq:D 427 66 0.1573 0.0656 0.4242 4.24e-10 8esr:D, 8eth:D, 8eup:D, 8euy:D, 8ev3:D
40 5v9x:A 772 152 0.2360 0.0544 0.2763 7.14e-10
41 6o8h:A 571 74 0.1685 0.0525 0.4054 7.17e-09 6o8g:B, 6o8g:C
42 6o8e:A 592 74 0.1685 0.0507 0.4054 7.51e-09 1d9z:A, 2fdc:B, 6o8e:B, 6o8f:A, 6o8f:B, 6o8g:A
43 7yym:A 1281 106 0.1966 0.0273 0.3302 7.84e-08 4ngb:A, 4ngc:A, 4ngg:A, 4nh3:A, 4nh5:A, 4nh6:A, 7yyn:A, 7zpi:A, 7zpj:A, 7zpk:A
44 2d7d:A 621 73 0.1629 0.0467 0.3973 7.96e-08 2nmv:A, 3v4r:B, 3v4r:A
45 7oi6:x 374 113 0.2079 0.0989 0.3274 2.13e-07
46 8w0a:C 636 77 0.1461 0.0409 0.3377 4.54e-06 8w0a:A
47 9asj:A 741 77 0.1461 0.0351 0.3377 5.26e-06 9asj:B, 9bp9:A, 9bp9:C, 9bpa:A, 9bpa:C, 9bpa:E, 9bpa:G
48 9bha:A 793 77 0.1461 0.0328 0.3377 5.27e-06 5a9f:A, 5aga:A, 9bh8:A, 9bh8:B, 9bh9:A, 9bh9:B, 9bha:B, 9c5q:C, 9c5q:A
49 2fdc:A 505 74 0.1629 0.0574 0.3919 5.84e-06
50 8v83:D 423 62 0.1292 0.0544 0.3710 7.03e-06 6elz:D, 8v84:D
51 5zal:A 1314 113 0.1798 0.0244 0.2832 7.24e-06 2eb1:A, 2eb1:B, 2eb1:C, 4ngd:A, 5zam:A
52 6x2f:A 1144 47 0.0955 0.0149 0.3617 8.31e-06 7ssg:A, 6x26:A, 6x2n:A, 6x43:A, 6x4w:A, 6x4y:A, 6x50:A
53 6xeo:A 1118 47 0.0955 0.0152 0.3617 1.93e-05
54 6crm:A 512 97 0.1292 0.0449 0.2371 1.78e-04 4tmu:A
55 8dg5:A 1635 48 0.1011 0.0110 0.3750 2.41e-04 8dg7:A
56 8dfv:A 1664 48 0.1011 0.0108 0.3750 2.41e-04
57 1oyw:A 516 97 0.1292 0.0446 0.2371 2.71e-04 1oyy:A
58 5jc7:A 641 124 0.1910 0.0530 0.2742 0.001
59 5jc3:A 668 124 0.1910 0.0509 0.2742 0.001 5jc3:B, 5jc7:B, 5jcf:A, 5jcf:B, 5jch:A, 5jch:B
60 8dga:A 1629 85 0.1517 0.0166 0.3176 0.002
61 7aud:A 522 112 0.1517 0.0517 0.2411 0.003 7aud:E, 7aud:B, 7aud:C, 7aud:D, 7aud:F
62 4cgz:A 629 112 0.1517 0.0429 0.2411 0.003 4cdg:A, 4cdg:B, 4o3m:A
63 5jbj:A 627 95 0.1629 0.0463 0.3053 0.004
64 7r7j:B 574 70 0.1292 0.0401 0.3286 0.004 8h5y:B, 8h5y:A, 8h5z:B, 8h5z:A, 6jde:B, 6jde:A, 7r7j:A
65 5jb2:A 670 95 0.1629 0.0433 0.3053 0.004 5jaj:A, 5jbg:A
66 5lst:A 617 70 0.1124 0.0324 0.2857 0.004
67 7auc:A 493 112 0.1517 0.0548 0.2411 0.004
68 6p4f:C 436 59 0.0787 0.0321 0.2373 0.005 6p4f:A, 6p4w:A
69 1z63:A 468 74 0.1404 0.0534 0.3378 0.008 1z63:B
70 7v6c:A 1540 132 0.1798 0.0208 0.2424 0.013
71 6yhr:A 541 106 0.1404 0.0462 0.2358 0.014 3aaf:A, 3aaf:B, 7gqs:A, 7gqt:A, 7gqu:A, 8pfl:A, 8pfo:A, 8pfp:A, 8yle:A
72 7tra:A 572 130 0.1910 0.0594 0.2615 0.025
73 1fr6:A 361 135 0.2135 0.1053 0.2815 0.055 1fr6:B, 8jb8:A, 8jb8:B, 1rgy:A
74 5f9h:G 653 103 0.1742 0.0475 0.3010 0.056 5e3h:A, 5f98:A, 5f98:C, 5f98:E, 5f98:G, 5f98:I, 5f98:K, 5f9h:A, 5f9h:C, 5f9h:E, 5f9h:I, 5f9h:K, 6gpg:A, 7jl3:A, 7jl3:C, 7jl3:E
75 5e02:A 964 74 0.1461 0.0270 0.3514 0.058
76 7x3t:V 792 105 0.1629 0.0366 0.2762 0.083 6iro:L, 6jyl:K, 6k1p:K, 7x3w:K, 2y9z:A
77 6d6q:M 709 101 0.1573 0.0395 0.2772 0.14 6d6r:M, 7z52:B
78 6pwf:K 454 112 0.1854 0.0727 0.2946 0.14
79 7w0b:A 1586 90 0.1236 0.0139 0.2444 0.15 7w0d:F
80 4a4z:A 874 79 0.1180 0.0240 0.2658 0.15
81 5jxt:M 324 112 0.1798 0.0988 0.2857 0.15 5jxt:N, 5jxt:O, 5jxt:J, 5jxt:K, 5jxt:I, 5jxt:H
82 6c90:A 694 101 0.1573 0.0403 0.2772 0.15
83 8hf0:A 1561 90 0.1236 0.0141 0.2444 0.16 8hf0:D, 8hf1:A, 8hf1:D, 8hf1:G, 7w0a:A, 7w0a:E, 7w0c:A, 7w0d:A, 7w0e:A, 7w0f:A
84 6ro1:A 919 101 0.1573 0.0305 0.2772 0.17
85 5mc6:h 1121 79 0.1180 0.0187 0.2658 0.17 4a4k:A, 4a4k:C, 4a4k:E, 4a4k:G, 4a4k:I
86 7eld:A 1137 45 0.0730 0.0114 0.2889 0.18 7ele:A
87 6ryr:W 708 97 0.1348 0.0339 0.2474 0.18 2l75:A, 1mm2:A, 6q3m:D, 6ryu:W, 6ryu:V
88 6ieh:B 929 101 0.1573 0.0301 0.2772 0.18 6ieg:B, 7s7b:A, 7s7b:E, 7s7c:A
89 7zi4:G 682 114 0.1742 0.0455 0.2719 0.18
90 8qca:A 805 79 0.1180 0.0261 0.2658 0.18 8qcf:M
91 8x19:I 864 96 0.1348 0.0278 0.2500 0.36 8x1c:I
92 6ieg:A 872 97 0.1517 0.0310 0.2784 0.45
93 3tbk:A 524 91 0.1461 0.0496 0.2857 0.52
94 8q9t:A 1075 79 0.1180 0.0195 0.2658 0.57
95 8vxy:B 1161 48 0.0843 0.0129 0.3125 0.69
96 8vxa:A 1139 48 0.0843 0.0132 0.3125 0.72 8vxc:A
97 2zja:A 700 48 0.0787 0.0200 0.2917 0.75 2zj5:A
98 7z05:A 239 48 0.0843 0.0628 0.3125 0.93 7z2j:A
99 5xq3:A 901 57 0.0899 0.0178 0.2807 1.1 5xq3:B, 5xqg:A, 5xqg:B, 5xqg:C, 5xqg:D, 5xqg:E, 5xqg:F, 5xqg:G, 5xqg:H, 5xqj:A, 5xqj:B, 5xqj:C, 5xqj:D, 5xqj:E, 5xqj:F, 5xqj:G, 5xqj:H, 5xqo:A, 5xqo:B
100 8szq:A 861 79 0.1124 0.0232 0.2532 1.1 3llm:A, 3llm:B, 8szp:A, 8szp:B, 8szr:A, 8szs:A
101 8dvs:A 682 114 0.1742 0.0455 0.2719 1.3 7bah:A, 7bah:B, 7bai:A, 7bai:B, 7bai:E, 8dvu:A, 5f9f:A, 5f9f:C, 5f9f:E, 5f9f:G, 5f9f:I, 5f9f:K, 7jl1:A, 6kyv:B, 6kyv:D, 6kyv:F, 6kyv:H, 6kyv:J, 6kyv:L, 3lrn:A, 3lrn:B, 3lrr:A, 3lrr:B, 7mk1:A, 7mk1:B, 3ncu:A, 3ncu:B, 3og8:A, 3og8:B, 2qfb:A, 2qfb:B, 2qfb:C, 2qfb:D, 2qfb:E, 2qfb:F, 2qfb:G, 2qfb:H, 2qfb:I, 2qfb:J, 7tny:A, 7tnz:A, 7to0:A, 7to2:A
102 2jbh:B 213 38 0.0674 0.0563 0.3158 1.7 2jbh:A
103 5frd:A 256 34 0.0730 0.0508 0.3824 2.4 5frd:B
104 3s4x:A 367 104 0.1517 0.0736 0.2596 2.5 1bls:A, 1bls:B, 1ga0:A, 1onh:A, 1q2q:A, 2q9m:A, 2q9n:A, 1rgz:A, 1s6r:A, 7ti1:A, 5xhr:A, 4xux:A, 1y54:A
105 7aju:JD 811 96 0.1124 0.0247 0.2083 3.0 6zqd:JD, 6zqe:JD, 6zqf:JD
106 6znp:A 748 74 0.1124 0.0267 0.2703 3.2 6znq:A
107 7fse:A 1040 119 0.1742 0.0298 0.2605 3.3 8ofb:A, 3oiy:A, 3p4x:A
108 6zwm:B 2185 101 0.1517 0.0124 0.2673 3.4 6zwm:A
109 7yq0:A 173 21 0.0674 0.0694 0.5714 3.5 7yq0:B, 7yq1:A, 7yq1:B, 7yq1:C, 7yq1:D, 7yq1:E, 7yq1:F
110 6znq:B 711 74 0.1124 0.0281 0.2703 3.7 6znp:B
111 6dgd:A 704 71 0.1124 0.0284 0.2817 5.0 6dgd:B, 4nl4:H
112 6m6a:M 459 47 0.0618 0.0240 0.2340 5.5 6m6b:M
113 7w5s:A 302 22 0.0618 0.0364 0.5000 5.9 7w5t:A, 7w5v:A
114 6fsz:MM 978 74 0.1180 0.0215 0.2838 6.3 7ajt:EN, 7aju:EN, 6ft6:MM, 5ooq:A, 5ooq:B, 2xgj:A
115 6z7n:A 788 86 0.1461 0.0330 0.3023 6.7
116 6z7n:K 840 86 0.1461 0.0310 0.3023 6.7
117 6z7n:C 860 86 0.1461 0.0302 0.3023 6.8 6z7n:L
118 6z7n:H 894 86 0.1461 0.0291 0.3023 6.8 6z7n:G, 6z7n:D, 6z7n:E, 6z7n:F
119 6yba:E 917 86 0.1461 0.0284 0.3023 6.8 6yba:F, 6yba:D, 6yba:A, 6yba:C, 6yba:G, 6yba:I, 6yba:B, 6z7n:I, 6z7n:J
120 6nie:A 244 43 0.0843 0.0615 0.3488 7.9 6nie:B, 6nie:C, 6nie:D
121 7tn2:W 895 98 0.1573 0.0313 0.2857 8.5 9gd2:W, 9gd3:W
122 9gd1:W 849 98 0.1573 0.0330 0.2857 9.0
123 6d8v:A 269 33 0.0730 0.0483 0.3939 9.8

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218