Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
AIGYVWNTLYGWVDTGTGSLAAANLTARMQPISHHLAHPDTKRRFHELVCASGQIEHLTPIAAVAATDADILRAHSAAHL
ENMKRVSNLPTGGDTGDGITMMGNGGLEIARLSAGGAVELTRRVATGELSAGYALVNPPGHHAPHNAAMGFCIFNNTSVA
AGYARAVLGMERVAILDWDVHHGNGTQDIWWNDPSVLTISLHQHLCFPPDSGYSTERGAGNGHGYNINVPLPPGSGNAAY
LHAMDQVVLPALRAYRPQLIIVGSGFDASMLDPLARMMVTADGFRQMARRTIDCAADICDGRIVFVQEGGYSPHYLPFCG
LAVIEELTGVRSLPDPYHEFLAGMGGNTLLDAERAAIEEIVPLLADI

The query sequence (length=367) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2vcg:D 375 367 1.0000 0.9787 1.0000 0.0 5g17:A, 5g17:B, 5g1a:A, 5g1a:B, 5g1b:A, 5g1b:B, 5g1c:A, 5g1c:B, 5g3w:A, 5g3w:B, 5g3w:C, 5g3w:D, 2gh6:A, 2gh6:B, 2gh6:C, 2gh6:D, 6gjk:A, 6gjk:B, 2vcg:A, 2vcg:B, 2vcg:C, 1zz0:A, 1zz0:B, 1zz0:C, 1zz0:D, 1zz1:A, 1zz1:B, 1zz1:C, 1zz1:D, 1zz3:A, 1zz3:B, 1zz3:C, 1zz3:D
2 8szu:A 366 367 0.6376 0.6393 0.6376 0.0 8szt:B, 8szt:A, 8szt:C, 8szt:D, 8szu:B
3 5g0y:B 377 328 0.4387 0.4271 0.4909 1.57e-97 5g0x:A, 5g0x:C, 5g0y:A, 5g10:A, 5g10:B, 5g11:A, 5g11:B, 5g12:A, 5g12:B, 5g13:A, 5g13:B, 5li3:A, 5li3:B
4 5edu:B 723 292 0.2943 0.1494 0.3699 1.05e-47 5edu:A, 5iqz:A
5 6j6t:B 356 343 0.3324 0.3427 0.3557 5.19e-47 6j6t:A, 6j6t:C, 6j6t:D
6 5g0i:A 722 290 0.2807 0.1427 0.3552 9.19e-47 5g0i:B
7 5g0i:A 722 289 0.2752 0.1399 0.3495 2.71e-46 5g0i:B
8 3c0z:C 359 288 0.2943 0.3008 0.3750 1.05e-46 3c0y:C, 3c10:C, 3znr:C, 3zns:C
9 6z6f:B 661 344 0.3188 0.1770 0.3401 1.42e-46 6z6f:A, 6z6h:A, 6z6h:B, 6z6h:F, 6z6h:G, 6z6o:A, 6z6o:B, 6z6o:E, 6z6o:F, 6z6o:I, 6z6o:J, 6z6o:M, 6z6o:N, 6z6p:K, 6z6p:L
10 5g0j:A 756 290 0.2807 0.1362 0.3552 1.62e-46 8a8z:A, 8a8z:B, 8bjk:A, 9cbk:A, 9cbk:B, 6cgp:A, 8cj7:A, 8cj7:B, 6csp:A, 6csp:B, 6csq:A, 6csq:B, 6csr:A, 6csr:B, 6css:A, 6css:B, 6cw8:A, 6cw8:B, 8d98:A, 8d98:B, 8d99:A, 8d99:B, 8d9a:A, 8d9a:B, 8d9b:A, 8d9b:B, 8d9c:A, 8d9c:B, 6dvl:A, 6dvl:B, 6dvm:A, 6dvm:B, 6dvm:C, 6dvm:D, 6dvn:A, 6dvn:B, 6dvn:C, 6dvn:D, 6dvo:A, 5eef:A, 5eef:B, 5eei:A, 5eei:B, 5eek:A, 5eem:B, 5eem:A, 5een:B, 5een:A, 5ef7:A, 5ef7:B, 5ef8:A, 5ef8:B, 5efb:D, 5efg:D, 5efg:A, 5efh:D, 5efh:A, 5efj:D, 5efk:B, 5efn:B, 5efn:A, 8eqi:A, 8eqi:B, 5g0g:A, 5g0h:A, 8g1z:A, 8g20:A, 8g20:B, 8gd4:A, 8gd4:B, 7jom:A, 7jom:B, 6mr5:A, 6mr5:B, 7o2p:A, 7o2p:B, 7o2r:A, 6pye:A, 6pye:B, 6pzo:A, 6pzo:B, 6pzr:A, 6pzr:B, 6pzs:A, 6pzu:A, 6pzu:B, 6q0z:A, 6q0z:B, 8qa7:A, 8qa7:B, 8qh9:A, 7qno:A, 6r0k:A, 6tcy:AAA, 6tcy:BBB, 6thv:A, 8tq0:A, 8tq0:B, 7u8z:A, 7u8z:B, 7u8z:C, 7u8z:D, 7uk2:A, 6uo2:A, 6uo2:B, 6uo3:A, 6uo4:A, 6uo4:B, 6uo5:A, 6uo7:A, 6uob:A, 6uob:B, 6uoc:A, 6v79:A, 6v79:B, 6v7a:A, 6vnr:A, 6vnr:B, 5w5k:A, 5w5k:B, 5w5k:C, 5wgi:A, 5wgk:A, 5wgl:A, 5wgl:B, 5wgm:A, 5wgm:B, 5wgm:C, 6wsj:A, 6wyo:A, 6wyo:B, 6wyp:A, 6wyq:A, 6wyq:B, 6zw1:A
11 5g0j:A 756 289 0.2752 0.1336 0.3495 4.29e-46 8a8z:A, 8a8z:B, 8bjk:A, 9cbk:A, 9cbk:B, 6cgp:A, 8cj7:A, 8cj7:B, 6csp:A, 6csp:B, 6csq:A, 6csq:B, 6csr:A, 6csr:B, 6css:A, 6css:B, 6cw8:A, 6cw8:B, 8d98:A, 8d98:B, 8d99:A, 8d99:B, 8d9a:A, 8d9a:B, 8d9b:A, 8d9b:B, 8d9c:A, 8d9c:B, 6dvl:A, 6dvl:B, 6dvm:A, 6dvm:B, 6dvm:C, 6dvm:D, 6dvn:A, 6dvn:B, 6dvn:C, 6dvn:D, 6dvo:A, 5eef:A, 5eef:B, 5eei:A, 5eei:B, 5eek:A, 5eem:B, 5eem:A, 5een:B, 5een:A, 5ef7:A, 5ef7:B, 5ef8:A, 5ef8:B, 5efb:D, 5efg:D, 5efg:A, 5efh:D, 5efh:A, 5efj:D, 5efk:B, 5efn:B, 5efn:A, 8eqi:A, 8eqi:B, 5g0g:A, 5g0h:A, 8g1z:A, 8g20:A, 8g20:B, 8gd4:A, 8gd4:B, 7jom:A, 7jom:B, 6mr5:A, 6mr5:B, 7o2p:A, 7o2p:B, 7o2r:A, 6pye:A, 6pye:B, 6pzo:A, 6pzo:B, 6pzr:A, 6pzr:B, 6pzs:A, 6pzu:A, 6pzu:B, 6q0z:A, 6q0z:B, 8qa7:A, 8qa7:B, 8qh9:A, 7qno:A, 6r0k:A, 6tcy:AAA, 6tcy:BBB, 6thv:A, 8tq0:A, 8tq0:B, 7u8z:A, 7u8z:B, 7u8z:C, 7u8z:D, 7uk2:A, 6uo2:A, 6uo2:B, 6uo3:A, 6uo4:A, 6uo4:B, 6uo5:A, 6uo7:A, 6uob:A, 6uob:B, 6uoc:A, 6v79:A, 6v79:B, 6v7a:A, 6vnr:A, 6vnr:B, 5w5k:A, 5w5k:B, 5w5k:C, 5wgi:A, 5wgk:A, 5wgl:A, 5wgl:B, 5wgm:A, 5wgm:B, 5wgm:C, 6wsj:A, 6wyo:A, 6wyo:B, 6wyp:A, 6wyq:A, 6wyq:B, 6zw1:A
12 3c0y:A 386 260 0.2834 0.2694 0.4000 2.05e-46 3c0y:B, 3c0z:A, 3c0z:B, 3c10:A, 3c10:B, 3znr:A, 3znr:B, 3zns:A, 3zns:B
13 2vqq:A 361 210 0.2507 0.2548 0.4381 2.74e-46 4cbt:A, 4cbt:B, 4cbt:C, 6fyz:A, 6fyz:C, 2vqo:A, 2vqo:B, 2vqq:B, 2vqv:A, 2vqv:B
14 2vqj:A 402 210 0.2507 0.2289 0.4381 7.76e-46 5a2s:A, 5a2s:B, 4cby:A, 4cby:B, 4cby:C, 4cby:D, 6fyz:B, 2vqm:A, 2vqw:G, 5zoo:G, 5zop:G
15 6uij:A 620 326 0.3052 0.1806 0.3436 2.14e-45 9cbf:A, 9cbg:A, 9cbi:A, 9cbj:A, 6uhv:A, 6uii:A, 6uil:A, 6uim:A
16 7sgg:A 644 326 0.3052 0.1739 0.3436 2.79e-45 9cbh:A, 7kuq:A, 7kur:A, 7kus:A, 7kut:A, 7kuv:A, 7sgi:A, 7sgj:A, 7sgk:A, 5td7:A, 7u3m:A, 7u59:A, 7u69:A, 7u6a:A, 7u6b:B, 6ufn:A, 6ufo:A, 6uhu:A, 6vnq:A, 6wbq:A, 6wdv:A, 6wdw:A, 6wdx:A, 6wdy:A
17 5zmp:A 305 297 0.2616 0.3148 0.3232 7.82e-42
18 5ji5:A 305 301 0.2943 0.3541 0.3588 1.29e-39
19 5ikk:A 594 318 0.2807 0.1734 0.3239 2.76e-39
20 6pi8:B 348 214 0.2125 0.2241 0.3645 1.05e-34 6phr:A, 6phr:B, 6pht:A, 6pht:B, 6pht:C, 6pht:D, 6phz:A, 6phz:B, 6pi1:A, 6pi1:B, 6pi1:C, 6pi1:D, 6pi8:A, 6pia:A, 6pia:B, 6pia:C, 6pia:D, 6pic:A, 6pic:B, 6pic:C, 6pic:D, 6pic:E, 6pic:F, 6pic:G, 6pic:H, 6pid:A, 6pid:B
21 3men:B 342 185 0.2098 0.2251 0.4162 1.36e-31 3men:A, 3men:C, 3men:D
22 1c3r:A 372 272 0.2098 0.2070 0.2831 1.00e-26 1c3r:B, 1c3s:A
23 8i03:C 370 262 0.2071 0.2054 0.2901 1.91e-25 8i02:B, 8i03:D, 8ifg:C
24 3q9b:A 341 235 0.2153 0.2317 0.3362 1.45e-24 3q9b:B, 3q9b:C, 3q9b:D, 3q9b:E, 3q9b:F, 3q9b:G, 3q9b:H, 3q9b:I, 3q9b:J, 3q9b:K, 3q9b:L, 3q9c:A, 3q9c:B, 3q9c:C, 3q9c:D, 3q9c:E, 3q9c:F, 3q9c:G, 3q9c:H, 3q9c:I, 3q9c:J, 3q9c:K, 3q9c:L, 3q9e:A, 3q9e:I, 3q9e:B, 3q9e:C, 3q9e:D, 3q9e:E, 3q9e:F, 3q9e:G, 3q9e:H, 3q9e:J, 3q9e:K, 3q9e:L, 3q9f:A, 3q9f:B, 3q9f:C, 3q9f:D, 3q9f:E, 3q9f:F, 3q9f:G, 3q9f:H, 3q9f:I, 3q9f:J, 3q9f:K, 3q9f:L, 4zum:A, 4zum:B, 4zun:A, 4zun:B, 4zuo:A, 4zuo:B, 4zup:A, 4zup:B, 4zuq:A, 4zuq:B, 4zur:A, 4zur:B
25 8ihn:L 410 259 0.1935 0.1732 0.2741 1.15e-22 8ga8:B, 8ga8:E, 8hpo:F, 8hpo:G, 8hxx:L, 8hxy:L, 8hy0:L, 8iht:L, 8jho:L, 8tof:B, 8w9c:B, 8w9d:B, 8w9e:B, 8w9f:B, 7yi0:B, 7yi2:B, 7yi3:B, 7yi4:B, 7yi5:B
26 6whn:A 375 261 0.1771 0.1733 0.2490 1.43e-19 8a0b:A, 8a0b:B, 8a0b:C, 7ao8:E, 7ao8:B, 7ao9:E, 7ao9:B, 7aoa:E, 7aoa:B, 4bkx:B, 8bpa:B, 8bpb:B, 8bpc:B, 8c60:B, 6g3o:A, 6g3o:B, 6g3o:C, 5icn:B, 5iwg:A, 5iwg:B, 5iwg:C, 5ix0:A, 5ix0:B, 5ix0:C, 7js8:A, 7js8:B, 7js8:C, 7kbg:A, 7kbg:B, 7kbg:C, 7kbh:A, 7kbh:B, 7kbh:C, 7ltg:A, 7ltg:B, 7ltg:C, 7ltk:A, 7ltk:B, 7ltk:C, 7ltl:A, 7ltl:B, 7ltl:C, 4lxz:A, 4lxz:B, 4lxz:C, 4ly1:A, 4ly1:B, 4ly1:C, 3max:A, 3max:B, 3max:C, 7mos:A, 7mos:B, 7mos:C, 7mot:A, 7mot:B, 7mot:C, 7mox:A, 7mox:B, 7mox:C, 7moy:A, 7moy:B, 7moy:C, 7moz:A, 7moz:B, 7moz:C, 6wbw:A, 6wbw:B, 6wbw:C, 6wbz:A, 6wbz:B, 6wbz:C, 6whn:B, 6whn:C, 6who:A, 6who:B, 6who:C, 6whq:A, 6whq:B, 6whq:C, 6whz:A, 6whz:B, 6whz:C, 6wi3:A, 6wi3:B, 6wi3:C, 6xdm:A, 6xdm:B, 6xdm:C, 6xeb:A, 6xeb:B, 6xeb:C, 6xec:A, 6xec:B, 6xec:C, 6z2j:C, 6z2j:E, 6z2k:C, 6z2k:E, 6z2k:K, 6z2k:I, 7zzo:A, 7zzo:B, 7zzo:C, 7zzp:A, 7zzp:B, 7zzp:C, 7zzr:A, 7zzr:B, 7zzr:C, 7zzs:A, 7zzs:B, 7zzs:C, 7zzt:A, 7zzt:B, 7zzt:C, 7zzu:A, 7zzu:B, 7zzu:C, 7zzw:A, 7zzw:B, 7zzw:C
27 4a69:A 369 262 0.1962 0.1951 0.2748 1.79e-19 4a69:B
28 7wjl:A 453 230 0.1662 0.1347 0.2652 2.02e-19
29 3sfh:A 342 321 0.2125 0.2281 0.2430 6.82e-19 3f07:C, 3sff:A
30 7q1c:A 427 176 0.1553 0.1335 0.3239 1.04e-18 7q1b:A, 7q1c:B
31 4qa0:A 371 326 0.2180 0.2156 0.2454 7.21e-18 5bwz:A, 5bwz:B, 5d1b:A, 5d1b:B, 5d1c:A, 5d1c:B, 5d1d:A, 5d1d:B, 5dc5:A, 5dc5:B, 5dc6:A, 5dc6:B, 5dc7:A, 5dc7:B, 5dc8:A, 5dc8:B, 3ew8:A, 3ewf:A, 3ewf:B, 3ewf:C, 3ewf:D, 3ezp:A, 3ezp:B, 3ezt:A, 3ezt:B, 3f06:A, 3f06:B, 3f07:A, 3f07:B, 3f0r:A, 3f0r:B, 3f0r:C, 5fcw:A, 5fcw:B, 6hsk:A, 6hsk:B, 7jvu:A, 7jvu:B, 7jvv:A, 7jvv:B, 7jvw:A, 7jvw:B, 3mz3:A, 3mz3:B, 3mz4:A, 3mz4:B, 3mz6:A, 3mz7:A, 6oda:A, 6oda:B, 6oda:C, 6odb:A, 6odb:B, 6odb:C, 6odc:A, 6odc:B, 6odc:C, 4qa0:B, 4qa1:A, 4qa1:B, 4qa1:C, 4qa1:D, 4qa2:A, 4qa2:B, 4qa3:A, 4qa3:B, 4qa4:A, 4qa5:A, 4qa5:B, 4qa6:A, 4qa6:B, 4qa7:A, 4rn0:A, 4rn0:B, 4rn1:A, 4rn1:B, 4rn2:A, 4rn2:B, 3rqd:A, 3rqd:B, 1t64:A, 1t64:B, 1t67:A, 1t69:A, 5ths:A, 5ths:B, 5tht:A, 5tht:B, 5tht:C, 5tht:D, 5thu:A, 5thu:B, 5thv:A, 5thv:B, 2v5w:B, 2v5w:A, 2v5x:A, 2v5x:B, 5vi6:A, 1vkg:A, 1vkg:B, 1w22:A, 1w22:B
32 4bz5:B 419 223 0.1580 0.1384 0.2601 6.53e-10 4bz5:A, 4bz5:C, 4bz5:D, 4bz6:A, 4bz6:B, 4bz6:C, 4bz6:D, 4bz7:A, 4bz7:B, 4bz7:C, 4bz7:D, 4bz8:A, 4bz8:B, 4bz8:C, 4bz8:D, 4bz9:A, 4bz9:B, 4bz9:C, 4bz9:D, 4cqf:A, 4cqf:B, 4cqf:C, 4cqf:D, 5fue:A, 5fue:B, 5fue:C, 5fue:D, 6fu1:A, 6fu1:C, 6fu1:B, 6fu1:D, 6gx3:A, 6gx3:B, 6gx3:C, 6gx3:D, 6gxa:A, 6gxa:B, 6gxa:C, 6gxa:D, 6gxu:A, 6gxu:B, 6gxu:C, 6gxu:D, 6gxw:A, 6gxw:B, 6gxw:C, 6gxw:D, 6hqy:A, 6hqy:B, 6hqy:C, 6hqy:D, 6hrq:A, 6hrq:B, 6hrq:C, 6hrq:D, 6hsf:A, 6hsf:B, 6hsf:C, 6hsf:D, 6hsg:A, 6hsg:B, 6hsg:C, 6hsg:D, 6hsh:A, 6hsh:B, 6hsh:C, 6hsh:D, 6hsz:A, 6hsz:B, 6hsz:C, 6hsz:D, 6ht8:A, 6ht8:B, 6ht8:C, 6ht8:D, 6htg:A, 6htg:B, 6htg:C, 6htg:D, 6hth:A, 6hth:B, 6hth:C, 6hth:D, 6hti:A, 6hti:B, 6hti:C, 6hti:D, 6htt:A, 6htt:B, 6htt:C, 6htt:D, 6htz:A, 6htz:B, 6htz:C, 6htz:D, 6hu0:A, 6hu0:B, 6hu0:C, 6hu0:D, 6hu1:A, 6hu1:B, 6hu1:C, 6hu1:D, 6hu2:A, 6hu2:B, 6hu2:C, 6hu2:D, 6hu3:A, 6hu3:B, 6hu3:C, 6hu3:D, 7p2s:A, 7p2t:A, 7p2t:B, 7p2t:C, 7p2u:A, 7p2v:A, 7p3s:A, 7p3s:B, 7p3s:C, 7p3s:D, 7poz:A, 6tld:A, 6tld:B, 6tld:C, 6tld:D, 7zw7:A
33 7p2t:D 374 222 0.1635 0.1604 0.2703 1.16e-09
34 6zbq:A 89 32 0.0327 0.1348 0.3750 1.2 6zc4:A
35 3dra:B 364 34 0.0381 0.0385 0.4118 3.1
36 3orj:A 429 120 0.0817 0.0699 0.2500 3.5
37 3lag:A 96 20 0.0300 0.1146 0.5500 4.4
38 7nvo:E 249 46 0.0490 0.0723 0.3913 6.5 7nvo:e

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218