BioLiP

>protein
AHIVYDDVRDLKAIIQALLKLVDEALFDIKPEGIQLVAIDKAHISLIKIELPKEMFKEYDVPEEFKFGFNTQYMSKLLKA
AKRKEEIIIDADSPEVVKLTLSGALNRVFNVNNIEVLPPEFDIKATINASGLKNAIGEIAEVADTLLISGNEEKVVVKGE
GENKVEVEFSKDTGSLADIEFNKESSSAYDVEYLNDIISLTKLSDYVKVAFADQKPMQLEFNMEGGGKVTYLLAPKLS

The query sequence (length=238) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1ud9:A	242	242	1.0000	0.9835	0.9835	1.99e-168	1ud9:B, 1ud9:C, 1ud9:D
2	7rpw:C	245	242	0.6092	0.5918	0.5992	5.69e-104
3	1isq:A	240	238	0.3193	0.3167	0.3193	5.38e-40
4	6t7y:A	238	237	0.3109	0.3109	0.3122	1.50e-38
5	5dai:A	247	244	0.3025	0.2915	0.2951	8.56e-34
6	2io4:B	246	239	0.2605	0.2520	0.2594	2.23e-19	2io4:D
7	8q7i:A	257	244	0.2479	0.2296	0.2418	2.61e-19	7o1f:A, 7o1f:B, 7o1f:D, 7o1f:F, 8p9o:A
8	1vyj:G	260	245	0.2521	0.2308	0.2449	5.01e-18	1axc:A, 1axc:C, 1axc:E, 6cbi:C, 6cbi:A, 6cbi:D, 6cbi:E, 8cob:A, 8cob:C, 8cob:E, 4d2g:C, 4d2g:B, 5e0u:A, 5e0u:B, 5e0u:C, 5e0v:A, 5e0v:B, 6eht:C, 6eht:B, 8f5q:A, 8f5q:C, 8f5q:E, 6gis:A, 8gl9:A, 8gl9:B, 8gla:A, 8gla:B, 6gws:C, 6gws:A, 6gws:B, 6hvo:B, 6hvo:C, 6hvo:A, 5iy4:A, 5iy4:C, 5iy4:E, 6k3a:A, 6k3a:C, 6k3a:E, 7kq0:A, 7kq0:C, 7kq0:E, 7kq1:A, 7kq1:C, 7kq1:E, 7m5l:A, 7m5l:B, 7m5l:C, 7m5m:A, 7m5m:B, 7m5n:B, 7m5n:A, 5mav:C, 5mav:A, 5mav:B, 5mav:F, 5mav:D, 5mav:E, 5mlo:A, 5mlo:C, 5mlo:E, 5mlw:A, 5mlw:C, 5mlw:E, 7nv0:D, 7nv1:D, 3p87:A, 3p87:D, 3p87:B, 3p87:C, 3p87:E, 3p87:F, 6qc0:A, 6qc0:C, 6qc0:E, 6qcg:C, 6qcg:B, 6qcg:F, 6qcg:A, 6qcg:D, 6qcg:E, 7qo1:F, 4rjf:A, 4rjf:C, 4rjf:E, 1u76:A, 1u76:C, 1u76:E, 1u7b:A, 3vkx:A, 1vyj:A, 1vyj:C, 1vyj:E, 1vyj:I, 1vyj:K, 3wgw:A, 3wgw:B, 5yco:A, 5yco:B, 5yco:C, 5yd8:Z, 5yd8:X, 5yd8:Y, 4ztd:B, 4ztd:A, 4ztd:C, 2zvk:A, 2zvk:B, 2zvk:C, 2zvl:A, 2zvl:B, 2zvl:C, 2zvl:D, 2zvl:E, 2zvl:F, 2zvm:A, 2zvm:B, 2zvm:C
9	6o09:F	262	243	0.2395	0.2176	0.2346	2.36e-17	6o09:C, 6o09:H, 6o09:A, 6o09:D, 6o09:K, 2zvv:B, 2zvv:A, 2zvw:A, 2zvw:B, 2zvw:C, 2zvw:D, 2zvw:E, 2zvw:F, 2zvw:G, 2zvw:H
10	6qh1:C	242	240	0.2395	0.2355	0.2375	1.69e-16
11	8gj5:B	257	244	0.2353	0.2179	0.2295	2.22e-16	8gj5:A, 8gj5:C, 8gjf:A, 8gjf:B, 8gjf:C
12	1rxm:A	245	235	0.2563	0.2490	0.2596	4.48e-16	1rxz:A
13	6k2m:E	258	238	0.2227	0.2054	0.2227	1.56e-14	7wp3:A
14	2izo:C	244	244	0.2269	0.2213	0.2213	3.82e-10
15	3k4x:A	758	244	0.2227	0.0699	0.2172	1.18e-09	6e49:B, 6e49:A, 2od8:A, 3v62:B, 3v62:E, 5zut:A
16	3k4x:A	758	245	0.2185	0.0686	0.2122	3.37e-09	6e49:B, 6e49:A, 2od8:A, 3v62:B, 3v62:E, 5zut:A
17	3k4x:A	758	243	0.2185	0.0686	0.2140	3.87e-09	6e49:B, 6e49:A, 2od8:A, 3v62:B, 3v62:E, 5zut:A
18	6e49:C	254	244	0.2185	0.2047	0.2131	1.64e-09	3v61:B
19	3h87:A	136	66	0.0924	0.1618	0.3333	0.003
20	6dm6:A	378	49	0.0798	0.0503	0.3878	0.079	6dm6:B, 6ptv:B, 6ptv:C
21	6djk:A	376	30	0.0630	0.0399	0.5000	0.080
22	7li0:A	312	77	0.0924	0.0705	0.2857	1.2	7li0:B, 7li1:A, 7li1:B, 7li1:C, 7li1:D
23	6fpc:C	188	50	0.0756	0.0957	0.3600	1.4	6fpc:A, 6fpc:B, 6fpc:D
24	8v6g:A	1050	90	0.1008	0.0229	0.2667	3.4	8v6h:A, 8v6i:A, 8v6j:A
25	8g99:A	1063	90	0.1008	0.0226	0.2667	3.5	8g9f:A, 8g9l:A, 8g9n:A, 8g9o:A, 8ucu:A, 8ucv:A, 8ucw:A, 8v5m:A, 8v5n:A, 8v5o:A
26	3tts:A	675	60	0.0756	0.0267	0.3000	4.6	3tts:B, 3tts:C, 3tts:D, 3tts:E, 3tts:F, 3tty:A, 3tty:B, 3tty:C, 3tty:D, 3tty:E, 3tty:F
27	5k8b:A	394	154	0.1597	0.0964	0.2468	5.6	5k8b:B, 5k8b:C, 5k8b:D
28	6ig2:D	278	77	0.0798	0.0683	0.2468	9.0	6ig4:A, 6ig4:B

[Back]