BioLiP

>protein
AGPEIRRAADNLEAAIKGKPLTDVWFAFPQLKTYQSQLIGQHVTHVETRGKALLTHFSNDLTLYSHNQLYGVWRVVDTGE
TTRVLRVKLQTADKTILLYSASDIEMLRPEQLTTHPFLQRVGPDVLDPNLTPEVVKERLLSPRFRNRQFAGLLLDQAFLA
GLGNYLRVEILWQVGLTGNHKAKDLNAAQLDALAHALLEIPRFSYATRGENKHHGALFRFKVFHRDGEPCERCGSIIEKT
PFYWCPGCQH

The query sequence (length=250) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1q3b:A	259	257	0.9960	0.9614	0.9689	0.0	2ea0:A, 6fbu:A, 1k3w:A, 1k3x:A, 2opf:A, 2oq4:A, 2oq4:B, 1q39:A, 1q3c:A
2	8tjg:A	250	256	0.3080	0.3080	0.3008	5.10e-23
3	4g4n:A	253	264	0.3000	0.2964	0.2841	2.85e-20	2f5n:A, 2f5o:A, 4g4o:A, 4g4r:A, 3go8:A, 3gp1:A, 3gpp:A, 3gpu:A, 3gpx:A, 3gq3:A, 3gq5:A, 3sar:A, 3sas:A, 3sat:A, 3sau:A, 3sav:A, 3saw:A, 3sbj:A, 3u6c:A, 3u6d:A, 3u6e:A, 3u6l:A, 3u6m:A, 3u6o:A, 3u6p:A, 3u6q:A, 3u6s:A
4	2f5q:A	273	278	0.3080	0.2821	0.2770	1.39e-19	2f5p:A, 2f5s:A, 4g4q:A, 3gpy:A, 3gq4:A, 3jr4:A, 3jr5:A, 1l1t:A, 1l1z:A, 1l2b:A, 1l2c:A, 1l2d:A, 1r2y:A, 1r2z:A
5	4pd2:A	272	271	0.2320	0.2132	0.2140	6.11e-14	3c58:A, 4cis:A, 4cis:B, 6fl1:A, 6h0s:A, 1kfv:A, 1kfv:B, 1nnj:A, 4pcz:A, 4pdg:A, 4pdi:A, 1pji:A, 1pjj:A, 1pm5:A, 6rnm:A, 6rno:A, 6rnr:A, 6ro2:A, 6rok:A, 6rp0:A, 6rp7:A, 1tdz:A, 1xc8:A, 2xzf:A, 2xzu:A
6	6tc9:A	259	267	0.2560	0.2471	0.2397	8.09e-12	6tc6:A, 6tc6:C, 6tc9:C
7	1ee8:A	266	272	0.2720	0.2556	0.2500	2.44e-10	1ee8:B
8	1k82:A	260	146	0.1440	0.1385	0.2466	3.84e-07	1k82:B, 1k82:C, 1k82:D
9	3a46:A	288	302	0.2760	0.2396	0.2285	3.51e-06	3a46:B, 4nrw:A, 4nrw:B, 3vk7:A, 3vk7:B, 3vk8:A, 3vk8:B
10	4mb7:A	273	106	0.1200	0.1099	0.2830	4.00e-05
11	3twm:A	261	83	0.1040	0.0996	0.3133	4.56e-05	3twm:B
12	6lwn:G	237	56	0.0880	0.0928	0.3929	6.96e-04	6lwa:G, 6lwb:G, 6lwd:G, 6lwh:G, 6lwi:G, 6lwj:G, 6lwk:G, 6lwl:G, 6lwm:G, 6lwo:G, 6lwp:G, 6lwq:G
13	5itt:A	271	64	0.1000	0.0923	0.3906	0.003	8ftj:A, 5itr:A, 5itr:B, 5itr:C, 5itt:B, 5itt:C, 5itu:A, 5itu:B, 5itu:C, 5itx:A, 5itx:B, 5itx:E, 5ity:A, 5ity:B, 5ity:C, 6lwa:A, 6lwa:D, 6lwb:A, 6lwb:D, 6lwc:A, 6lwc:D, 6lwd:A, 6lwd:D, 6lwf:A, 6lwf:D, 6lwg:A, 6lwg:D, 6lwh:A, 6lwh:D, 6lwi:A, 6lwi:D, 6lwj:A, 6lwj:D, 6lwk:A, 6lwk:D, 6lwl:A, 6lwl:D, 6lwm:A, 6lwm:D, 6lwn:A, 6lwn:D, 6lwo:A, 6lwo:D, 6lwp:A, 6lwp:D, 6lwq:A, 6lwq:D, 6lwr:A, 6lwr:E
14	6lwg:G	205	40	0.0680	0.0829	0.4250	0.004
15	7z5a:A	264	219	0.2280	0.2159	0.2603	0.004	3w0f:A
16	8b9n:A	239	231	0.2440	0.2552	0.2641	0.004	8b9n:C
17	7m4u:m	115	49	0.0600	0.1304	0.3061	0.019	7m4w:m, 7m4x:m, 7m4y:m, 7m4z:m, 7ryf:m, 7ryg:m, 7ryh:m, 7uvv:m, 7uvw:m, 7uvx:m, 7uvy:m, 7uvz:m, 7uw1:m, 6v39:m, 6v3a:m, 6v3b:m, 6v3e:m, 6ys5:n, 6ytf:n
18	5gws:B	214	90	0.0760	0.0888	0.2111	0.23	5gws:C, 5gws:D
19	5gwr:A	243	90	0.0760	0.0782	0.2111	0.29	5gwr:B, 5gwr:C, 5gwr:D, 5gws:A, 5gwt:A, 5gwt:B, 5gwt:C, 5gwt:D
20	6vji:A	255	104	0.1120	0.1098	0.2692	0.29	8th9:A, 6vji:B
21	1ffy:A	917	93	0.1080	0.0294	0.2903	1.2	1qu2:A, 1qu3:A
22	7nhk:n	114	42	0.0440	0.0965	0.2619	1.4	6o8w:m, 6o8x:m, 6o8y:m, 6o8z:m, 6o90:m, 7p7q:n, 7p7r:n, 7p7s:n, 7p7t:n, 7p7u:n, 6w6p:m, 6wua:m
23	7ntg:A	402	101	0.1200	0.0746	0.2970	2.2
24	8rbq:C	477	31	0.0440	0.0231	0.3548	3.0	8ahx:C, 8rb8:C, 8rb9:C, 8rbm:C
25	4il1:A	529	107	0.0960	0.0454	0.2243	4.5	1aui:A, 1aui:B, 9b9g:H, 9b9g:J, 5c1v:A, 5c1v:B, 4f0z:B, 4il1:B, 4il1:C, 4il1:D, 2jog:A, 3ll8:A, 3ll8:B, 3ll8:C, 3ll8:D, 1m63:A, 1m63:B, 1m63:E, 1m63:F, 1mf8:A, 1mf8:B, 6nuc:A, 6nuc:B, 6nuf:A, 6nuf:B, 6nuu:A, 6nuu:B, 4or9:B, 4ora:B, 4orb:A, 4orb:B, 4orc:B, 2p6b:A, 2p6b:C, 2p6b:B, 2p6b:D, 5sve:A, 5sve:B, 1tco:A, 1tco:B, 6uuq:A
26	7op8:A	1118	43	0.0520	0.0116	0.3023	5.7	7op1:A, 7op3:A, 7op5:A
27	8eyt:W	254	39	0.0520	0.0512	0.3333	6.1	4adv:V, 7afo:Y, 7o5h:V
28	7ubq:A	228	36	0.0440	0.0482	0.3056	7.5	7u9c:A, 7uat:A, 7uau:A, 7ub4:A, 7ub8:A, 7ub8:B, 7ubp:A, 1w8g:A

[Back]