Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
AGMIIDADYITEDGKPIIRIFKKEKGEFKVEYDRTFRPYIYALLKDDSAIDEVKKITAERHGKIVRITEVEKVQKKFLGR
PIEVWKLYLEHPQDVPAIREKIREHPAVVDIFEYDIPFAKRYLIDKGLTPMEGNEELTFLAVDIETLYHEGEEFGKGPII
MISYADEEGAKVITWKSIDLPYVEVVSSEREMIKRLVKVIREKDPDVIITYNGDNFAFPYLLKRAEKLGIKLPLGRDNSE
PKMQRMGDSLAVEIKGRIHFDLFPVIRRTINLPTYTLEAVYEAIFGKSKEKVYAHEIAEAWETGKGLERVAKYSMEDAKV
TFELGKEFFPMEAQLARLVGQPVWDVSRSSTGNLVEWFLLRKAYERNELAPNKPDEREYERRLRESYKEPEKGLWEGIVS
LDFRSLYPSIIITHNVSPDTLNRENCKEYDVAPQVGHRFCKDFPGFIPSLLGNLLEERQKIKKRMKESKDPVEKKLLDYR
QRAIKILANSYYGYYGYAKARWYCKECAESVTAWGRQYIDLVRRELESRGFKVLYIDTDGLYATIPGAKHEEIKEKALKF
VEYINSKLPGLLELEYEGFYARGFFVTKKKYALIDEEGKIVTRGLEIVRRDWSEIAKETQAKVLEAILKHGNVDEAVKIV
KEVTEKLSKYEIPPEKLVIYEQITRPLSEYKAIGPHVAVAKRLAAKGVKVKPGMVIGYIVLRGDGPISKRAIAIEEFDPK
KHKYDAEYYIENQVLPAVERILRAFGYRKEDLKY

The query sequence (length=754) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4flu:A 758 757 1.0000 0.9947 0.9960 0.0 4flt:A, 4flv:A, 4flw:A, 4flx:A, 4fly:A, 4flz:A, 4fm0:A, 4fm1:A, 4fm2:A
2 4ail:C 750 754 0.8196 0.8240 0.8196 0.0 2jgu:A
3 4k8x:A 759 758 0.8090 0.8037 0.8047 0.0 6is7:A, 6is7:B, 6isf:A, 6isf:B, 6isg:A, 6ish:A, 6isi:A, 4k8z:A, 5omf:A, 5omq:A, 5omv:A, 7om3:A, 7omb:A, 7omg:A, 6q4t:A, 7rsr:A, 7rss:A, 7rsu:A, 8t3x:A, 7tqw:A, 5vu6:A, 5vu7:A, 5vu9:A
4 7b0h:F 762 758 0.8050 0.7966 0.8008 0.0 7b07:A, 7b08:A, 7b0f:A, 7b0g:A, 7b0h:E, 1qqc:A, 5vu8:A, 2vwj:A, 2xhb:A
5 6wya:A 756 756 0.7971 0.7950 0.7950 0.0 6wyb:A
6 1d5a:A 733 757 0.7719 0.7940 0.7688 0.0
7 5mdn:A 761 794 0.3767 0.3732 0.3577 2.25e-125 5mdn:B
8 7kc0:A 1004 838 0.2865 0.2151 0.2578 9.81e-58 3iay:A, 6p1h:A
9 6s1m:A 1010 705 0.2573 0.1921 0.2752 4.43e-56 6s1n:A, 6s1o:A, 6tny:A, 6tnz:A
10 7opl:A 1070 588 0.2162 0.1523 0.2772 5.23e-47 6as7:A, 9c8v:C, 8d96:C, 8d9d:C, 5exr:C, 5exr:G, 5iud:A, 5iud:D, 5iud:G, 5iud:J, 7n2m:A, 4q5v:A, 4q5v:E, 4qcl:A, 8qj7:A, 7u5c:C, 8vy3:C, 4y97:B, 4y97:D, 4y97:F, 4y97:H
11 8v6g:A 1050 588 0.2268 0.1629 0.2908 6.41e-47 8v6h:A, 8v6i:A, 8v6j:A
12 8g99:A 1063 588 0.2228 0.1580 0.2857 4.13e-46 8g9f:A, 8g9l:A, 8g9n:A, 8g9o:A, 8ucu:A, 8ucv:A, 8ucw:A, 8v5m:A, 8v5n:A, 8v5o:A
13 3k57:A 782 736 0.2599 0.2506 0.2663 2.25e-45 3k58:A, 3k59:A, 3k5l:A, 3k5m:A, 3maq:A
14 3k5n:A 759 714 0.2507 0.2490 0.2647 4.48e-45
15 8fok:1 1046 594 0.2095 0.1511 0.2660 1.88e-38 3flo:B, 3flo:D, 3flo:F, 3flo:H, 4fxd:A, 4fxd:B, 4fyd:A, 4fyd:B
16 1s5j:A 727 753 0.2520 0.2613 0.2523 5.37e-38
17 8tlq:A 1283 621 0.2029 0.1193 0.2464 2.95e-36 8tlt:A, 6v93:A
18 7uy7:E 783 415 0.1538 0.1481 0.2795 6.64e-33
19 7lxd:A 1190 604 0.1963 0.1244 0.2450 8.00e-33 6v8p:A
20 8v1t:A 1064 569 0.1883 0.1335 0.2496 1.20e-32
21 9enp:A 1072 557 0.1830 0.1287 0.2478 1.33e-32 9enq:A, 8oja:A
22 8v1q:A 1097 574 0.1870 0.1285 0.2456 2.17e-32 8exx:A, 7luf:A, 7luf:B, 8oj6:A, 8oj7:A, 8ojb:A, 8ojd:A, 8v1r:A, 8v1s:A, 8vq2:A, 8vq2:B
23 7s0t:A 1231 641 0.1976 0.1210 0.2324 1.08e-31
24 8d0b:F 915 442 0.1512 0.1246 0.2579 1.42e-27 8d0k:F
25 8wpe:A 1006 324 0.1034 0.0775 0.2407 1.02e-12 8hg1:A, 8hpa:A, 8j86:A, 8j8f:A, 8j8g:A, 8k8s:A, 8k8u:A, 5n2g:A, 8wpf:A, 8wpk:A, 8wpp:A
26 8wpe:A 1006 121 0.0371 0.0278 0.2314 0.13 8hg1:A, 8hpa:A, 8j86:A, 8j8f:A, 8j8g:A, 8k8s:A, 8k8u:A, 5n2g:A, 8wpf:A, 8wpk:A, 8wpp:A
27 6g0a:A 1104 433 0.1379 0.0942 0.2402 5.23e-12 8b67:A, 6fwk:B, 6i8a:B, 7r3y:B
28 6g0a:A 1104 371 0.1114 0.0761 0.2264 9.83e-08 8b67:A, 6fwk:B, 6i8a:B, 7r3y:B
29 6s2e:A 1006 403 0.1273 0.0954 0.2382 2.46e-11 6s2f:A
30 6s2e:A 1006 415 0.1233 0.0924 0.2241 1.94e-10 6s2f:A
31 8ojc:A 395 226 0.0729 0.1392 0.2434 7.06e-11
32 9b8t:A 1146 443 0.1353 0.0890 0.2302 6.90e-10 9b8s:A, 9f6d:A, 9f6e:A, 9f6f:A, 9f6i:A, 9f6j:A, 9f6k:A, 9f6l:A
33 9b8t:A 1146 321 0.1074 0.0707 0.2523 1.21e-09 9b8s:A, 9f6d:A, 9f6e:A, 9f6f:A, 9f6i:A, 9f6j:A, 9f6k:A, 9f6l:A
34 4m8o:A 1126 324 0.1101 0.0737 0.2562 1.68e-09 8b6k:A, 8b6k:B, 8b76:B, 8b76:A, 8b77:A, 8b79:B, 8b79:A, 8b7e:B, 8b7e:A, 6fwk:A, 6h1v:A, 6i8a:A, 5oki:B, 4ptf:A, 6qib:A, 7r3x:A, 7r3y:A, 8tw9:E, 8twa:E
35 4m8o:A 1126 373 0.1154 0.0773 0.2332 7.22e-09 8b6k:A, 8b6k:B, 8b76:B, 8b76:A, 8b77:A, 8b79:B, 8b79:A, 8b7e:B, 8b7e:A, 6fwk:A, 6h1v:A, 6i8a:A, 5oki:B, 4ptf:A, 6qib:A, 7r3x:A, 7r3y:A, 8tw9:E, 8twa:E
36 2oyq:A 848 419 0.1207 0.1073 0.2172 2.96e-09 4i9q:A, 2oyq:B, 2p5g:B, 2p5o:B
37 4i9q:B 873 443 0.1247 0.1077 0.2122 3.76e-07 4khn:B, 2p5o:A, 2p5o:C
38 3cfo:A 906 468 0.1220 0.1015 0.1966 4.32e-04 2atq:A, 3cfp:A, 3cfr:A, 1clq:A, 3cq8:A, 2dtu:A, 2dtu:B, 2dtu:C, 2dtu:D, 4dtj:A, 4dtm:A, 4dtn:A, 4dto:A, 4dtp:A, 4dtr:A, 4dts:A, 4dtu:A, 4dtx:A, 4du1:A, 4du3:A, 4du4:A, 2dy4:A, 2dy4:B, 2dy4:C, 2dy4:D, 4e3s:A, 7f4y:A, 7f4y:B, 4fj5:A, 4fj7:A, 4fj8:A, 4fj9:A, 4fjg:A, 4fjh:A, 4fji:A, 4fjj:A, 4fjk:A, 4fjl:A, 4fjm:A, 4fjn:A, 4fjx:A, 4fk0:A, 4fk2:A, 4fk4:A, 4i9l:A, 1ig9:A, 1ih7:A, 4j2a:A, 4j2b:A, 4j2d:A, 4j2e:A, 3kd1:E, 3kd5:E, 4khn:A, 4khq:A, 4khs:A, 4khu:A, 4khw:A, 4khy:A, 4ki4:A, 4ki6:A, 3l8b:A, 3l8b:B, 3lds:A, 3lzi:A, 3lzj:A, 4m3r:A, 4m3t:A, 4m3u:A, 4m3w:A, 4m3x:A, 4m3y:A, 4m3z:A, 4m41:A, 4m42:A, 4m45:A, 3nae:A, 3nci:A, 3ndk:A, 3ne6:A, 3ngi:A, 3nhg:A, 2oyq:C, 2oyq:D, 2ozm:A, 2ozs:A, 2p5g:A, 2p5g:C, 2p5g:D, 1q9x:A, 1q9x:B, 1q9x:C, 1q9x:D, 1q9y:A, 3qei:A, 3qep:A, 3qer:A, 3qes:A, 3qet:A, 3qev:A, 3qew:A, 3qex:A, 3qnn:A, 3qno:A, 3rma:A, 3rma:B, 3rma:C, 3rma:D, 3rmb:A, 3rmb:B, 3rmb:C, 3rmb:D, 3rmc:A, 3rmc:B, 3rmc:C, 3rmc:D, 3rmd:A, 3rmd:B, 3rmd:C, 3rmd:D, 3rwu:A, 3s9h:A, 3scx:A, 3si6:A, 3sjj:A, 3snn:A, 3spy:A, 3spz:A, 3sq0:A, 3sq1:A, 3sq2:A, 3sq4:A, 3sun:A, 3suo:A, 3sup:A, 3suq:A, 3tab:A, 3tab:B, 3tab:C, 3tab:D, 3tae:A, 3tae:C, 3tae:B, 3tae:D, 3taf:A, 3taf:B, 3taf:C, 3taf:D, 3tag:A, 3tag:C, 3tag:B, 3tag:D, 3uiq:A, 1waf:A, 1waf:B, 1waj:A
39 4ecw:A 432 133 0.0451 0.0787 0.2556 0.060 9chw:A, 9ci9:A, 9cih:A, 9ciq:A, 9cj9:A, 6d0m:A, 6d0z:A, 5dg7:A, 5dg8:A, 5dg9:A, 5dga:A, 5dgb:A, 4dl2:A, 4dl3:A, 4dl4:A, 4dl5:A, 4dl6:A, 4dl7:A, 5dlf:A, 5dlg:A, 5dqg:A, 5dqh:A, 5dqi:A, 8e85:A, 8e86:A, 8e87:A, 8e88:A, 8e89:A, 8e8a:A, 8e8b:A, 8e8c:A, 8e8d:A, 8e8e:A, 8e8f:A, 8e8g:A, 8e8h:A, 8e8j:A, 8e8k:A, 4ecq:A, 4ecr:A, 4ecs:A, 4ect:A, 4ecu:A, 4ecv:A, 4ecx:A, 4ecy:A, 4ecz:A, 4ed0:A, 4ed1:A, 4ed2:A, 4ed3:A, 4ed6:A, 4ed7:A, 4ed8:A, 4eey:A, 8eve:A, 8evf:A, 5ewe:A, 5ewf:A, 5ewg:A, 5f9l:A, 5f9n:A, 8fn3:A, 8fog:A, 8g8h:A, 8g8j:A, 8gbf:A, 8gkr:A, 8gml:A, 4j9k:A, 4j9l:A, 4j9m:A, 4j9n:A, 4j9o:A, 4j9p:A, 4j9q:A, 4j9r:A, 4j9s:A, 3jaa:A, 5jum:A, 5kfa:A, 5kfb:A, 5kfc:A, 5kfd:A, 5kfe:A, 5kff:A, 5kfg:A, 5kfh:A, 5kfi:A, 5kfj:A, 5kfk:A, 5kfl:A, 5kfm:A, 5kfn:A, 5kfo:A, 5kfp:A, 5kfq:A, 5kfr:A, 5kfs:A, 5kft:A, 5kfu:A, 5kfv:A, 5kfw:A, 5kfx:A, 5kfy:A, 5kfz:A, 5kg0:A, 5kg1:A, 5kg2:A, 5kg3:A, 5kg4:A, 5kg5:A, 5kg6:A, 5kg7:A, 5l1i:A, 5l1j:A, 5l1k:A, 5l1l:A, 7l69:A, 5l9x:A, 7lcd:A, 6m7o:A, 6m7p:A, 6m7t:A, 6m7u:A, 6m7v:A, 7m7l:A, 7m7m:A, 7m7n:A, 7m7o:A, 7m7p:A, 7m7q:A, 7m7r:A, 7m7s:A, 7m7t:A, 7m7u:A, 7m7y:A, 7m7z:A, 7m80:A, 7m81:A, 7m82:A, 7m83:A, 7m84:A, 7m85:A, 7m86:A, 7m87:A, 7m88:A, 7m89:A, 7m8a:A, 7m8b:A, 7m8c:A, 7m8d:A, 6mp3:A, 6mq8:A, 3mr2:A, 3mr3:A, 3mr5:A, 3mr6:A, 6mxo:A, 4o3n:A, 4o3o:A, 4o3p:A, 4o3q:A, 4o3r:A, 4o3s:A, 6pl7:A, 6pl8:A, 6plc:A, 6pz3:A, 6q02:A, 4q8e:A, 4q8f:A, 4rnm:A, 4rnn:A, 4rno:A, 4ru9:A, 3si8:A, 8ski:A, 3tq1:A, 7u72:A, 7u73:A, 7u74:A, 7u75:A, 7u76:A, 7u77:A, 7u78:A, 7u79:A, 7u7a:A, 7u7b:A, 7u7c:A, 7u7d:A, 7u7e:A, 7u7f:A, 7u7g:A, 7u7i:A, 7u7j:A, 7u7k:A, 7u7l:A, 7u7r:A, 7u7s:A, 7u7t:A, 7u7u:A, 7u7v:A, 7u7w:A, 7u7x:A, 7u7y:A, 7u7z:A, 7u80:A, 7u81:A, 7u82:A, 7u83:A, 7u84:A, 6ui2:A, 8ujt:A, 8ujv:A, 8ujx:A, 8uk4:A, 6uqi:A, 6v5k:A, 8v7a:A, 8v7b:A, 8v7c:A, 8v7d:A, 8v7e:A, 8v7f:A, 8v7g:A, 8v7h:A, 8v7i:A, 8v7j:A, 8v7k:A, 6w5x:A, 6wk6:A, 4yp3:A, 4yqw:A, 4yr0:A, 4yr2:A, 4yr3:A
40 1noy:B 346 123 0.0398 0.0867 0.2439 0.53
41 3rko:M 504 105 0.0385 0.0575 0.2762 2.0 3rko:C
42 1kzl:A 202 97 0.0424 0.1584 0.3299 2.4
43 8il5:B 595 39 0.0186 0.0235 0.3590 3.0
44 5dx5:A 399 116 0.0398 0.0752 0.2586 3.2 5dx5:B
45 6a47:A 224 33 0.0146 0.0491 0.3333 3.5 6a46:A, 6a46:B, 6a47:B, 6a4b:B, 6a4b:A, 6a4b:C, 6a4b:D, 6a4b:E, 6a4b:F
46 4v6w:CJ 182 57 0.0265 0.1099 0.3509 3.6 6xu6:CJ, 6xu7:CJ, 6xu8:CJ
47 3qvq:A 251 79 0.0279 0.0837 0.2658 4.8 3qvq:B, 3qvq:C, 3qvq:D
48 6geh:A 256 49 0.0186 0.0547 0.2857 4.9
49 8d3p:B 346 42 0.0225 0.0491 0.4048 5.4 8d3l:A, 8d3l:B, 8d3l:C, 8d3l:D, 8d3m:A, 8d3m:B, 8d3m:C, 8d3p:C, 8d3p:A, 8d3p:D, 8d3q:B, 8d3q:C, 8d3q:A
50 1e5j:A 302 116 0.0398 0.0993 0.2586 6.8 2a3h:A, 3a3h:A, 4a3h:A, 5a3h:A, 6a3h:A, 8a3h:A, 1h11:A, 1h2j:A, 1h5v:A, 1hf6:A, 1ocq:A, 1qhz:A, 1qi0:A, 1qi2:A, 2v38:A, 1w3k:A, 1w3l:A
51 6zj3:LS 178 127 0.0424 0.1798 0.2520 7.1
52 3pzt:B 296 116 0.0424 0.1081 0.2759 7.4 3pzt:A
53 6tg9:B 493 30 0.0172 0.0264 0.4333 7.6 6tg9:F, 6tga:B, 6tga:F
54 1oao:C 729 51 0.0199 0.0206 0.2941 7.7 3git:A, 3git:B, 3git:C, 3git:D, 3git:E, 3git:F, 3i01:M, 3i01:N, 3i01:O, 3i01:P, 3i04:M, 3i04:N, 3i04:O, 3i04:P, 1mjg:M, 1mjg:N, 1mjg:O, 1mjg:P, 1oao:D, 6x5k:M, 6x5k:N, 6x5k:O, 6x5k:P, 2z8y:M, 2z8y:N, 2z8y:O, 2z8y:P
55 2zjl:A 344 58 0.0225 0.0494 0.2931 7.7
56 6pnr:A 667 87 0.0358 0.0405 0.3103 9.1 6pnr:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218