Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
AFRPISVFREANEDESGFTCCAFSARERFLMLGTCTGQLKLYNVFSGQEEASYNCHNSAITHLEPSRDGSLLLTSATWSQ
PLSALWGMKSVFDMKHSFTEDHYVEFSKHSQDRVIGTKGDIAHIYDIQTGNKLLTLFNPDLANNYKRNCATFNPTDDLVL
NDGVLWDVRSAQAIHKFDKFNMNISGVFHPNGLEVIINTEIWDLRTFHLLHTVPALDQCRVVFNHTGTVMYGAMLQMKSP
FGSSFRTFNATDYKPIATIDVKRNIFDLCTDTKDCYLAVIENQGNMDTVCRLYEV

The query sequence (length=295) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4cc9:A 307 299 0.9898 0.9511 0.9766 0.0 9bhr:A, 9bhr:B, 9bhs:A, 9bhs:B, 9c1q:A, 8f8e:A, 8f8e:B, 8og5:A, 8og6:A, 8og7:A, 8og8:A, 8og9:A, 8oga:P, 8ogb:A, 8ogc:A, 8oo5:P, 8ood:A, 7sse:A, 7ufv:A, 7ufv:B
2 8r09:E 307 210 0.1559 0.1498 0.2190 2.32e-04 7abg:D, 6ahd:E, 9fmd:E, 8h6k:5E, 8h6l:5E, 8i0p:E, 8q7q:D, 8q7v:D, 6qdv:N, 6qw6:5O, 6qx9:5O, 8r0b:E, 8rm5:E, 8y6o:F
3 8ro0:E 312 204 0.1492 0.1410 0.2157 3.13e-04 8ro1:E
4 8rm5:F 412 241 0.1831 0.1311 0.2241 7.40e-04 8qpe:F, 8qzs:F
5 8q7n:F 431 241 0.1831 0.1253 0.2241 7.55e-04 5o9z:F, 8qpa:F
6 6b3x:A 327 191 0.1525 0.1376 0.2356 0.002
7 8q1n:A 320 120 0.0881 0.0813 0.2167 0.005 4a7j:A, 7axp:A, 7axq:A, 7axs:A, 7axx:A, 8bb2:B, 8bb3:B, 8bb4:Q, 8bb5:D, 7bcy:A, 7bcy:B, 7bed:A, 7cfp:A, 7cfq:A, 2cnx:A, 2co0:A, 2co0:C, 4cy1:B, 4cy1:A, 4cy2:A, 4cy3:A, 4cy5:A, 6d9x:A, 6dai:A, 6dak:A, 6dar:A, 6das:A, 6das:B, 7dno:A, 7dno:B, 6dy7:A, 6dya:A, 6e1y:A, 6e1y:B, 6e1z:A, 6e1z:B, 6e22:A, 6e22:B, 6e23:A, 6e23:B, 8e9f:A, 5eal:A, 5eal:B, 5eam:A, 5eam:B, 5eap:A, 5ear:A, 5ear:B, 3eg6:A, 3emh:A, 4erq:A, 4erq:B, 4erq:C, 4ery:A, 4erz:C, 4erz:A, 4erz:B, 4es0:A, 4esg:B, 4esg:A, 4ewr:A, 8f1g:A, 8f1g:B, 8f93:A, 8f93:B, 8g3c:A, 8g3e:A, 8g3e:B, 2g99:B, 2g99:A, 2g9a:A, 4gm3:A, 4gm3:B, 4gm3:C, 4gm3:D, 4gm3:E, 4gm3:F, 4gm3:G, 4gm3:H, 4gm8:A, 4gm8:B, 4gm8:C, 4gm8:D, 4gm9:A, 4gm9:B, 4gmb:A, 2h13:A, 2h6k:A, 2h6k:B, 2h6n:A, 2h6n:B, 2h6q:A, 2h6q:B, 2h9m:A, 2h9m:C, 2h9n:A, 2h9n:C, 2h9p:A, 8hmx:A, 4ia9:A, 6iam:A, 7jto:B, 7jtp:A, 5m23:A, 5m25:A, 4o45:A, 2o9k:A, 2o9k:C, 6oi0:A, 6oi1:A, 6oi2:A, 6oi3:A, 8okf:A, 3p4f:A, 6pg3:A, 6pg3:B, 6pg4:A, 6pg5:A, 6pg6:A, 6pg6:B, 6pg7:A, 6pg8:A, 6pg8:B, 6pg8:C, 6pg8:D, 6pg9:A, 6pg9:B, 6pga:A, 6pgb:A, 6pgc:A, 6pgd:A, 6pge:A, 6pgf:A, 3psl:A, 3psl:B, 8q1n:B, 7q2j:D, 4ql1:A, 4ql1:B, 4qqe:A, 3smr:A, 3smr:B, 3smr:C, 3smr:D, 5sxm:B, 5sxm:A, 8t5i:A, 8t5i:B, 6u5m:A, 6u5m:B, 6u5y:A, 6u5y:B, 6u6w:A, 6u6w:B, 6u80:A, 6u80:B, 6u8b:A, 6u8b:B, 6u8l:A, 6u8l:B, 6u8o:A, 7u9y:A, 7uas:A, 7uas:B, 6ucs:A, 6ucs:B, 6ufx:A, 6uhy:A, 6uhy:B, 6uhz:A, 6uhz:B, 6uif:A, 6uif:B, 6uik:A, 6uik:B, 6uj4:A, 6uj4:B, 6ujh:A, 6ujh:B, 6ujj:A, 6ujl:A, 8ujy:A, 8ujy:B, 6uoz:A, 6uoz:B, 3ur4:A, 3ur4:B, 3uvk:A, 3uvl:A, 3uvm:A, 3uvn:A, 3uvn:C, 3uvo:A, 5vfc:A, 6wjq:A, 6wjq:B, 7wvk:A, 8wxq:A, 8wxq:B, 8wxr:A, 8wxr:B, 8wxt:A, 8wxu:B, 8wxv:A, 8wxv:C, 8wxx:B, 8wxx:A, 8x3r:A, 8x3s:A, 2xl2:A, 2xl2:B, 2xl3:A, 2xl3:B, 4y7r:A
8 8q1n:A 320 222 0.1729 0.1594 0.2297 0.34 4a7j:A, 7axp:A, 7axq:A, 7axs:A, 7axx:A, 8bb2:B, 8bb3:B, 8bb4:Q, 8bb5:D, 7bcy:A, 7bcy:B, 7bed:A, 7cfp:A, 7cfq:A, 2cnx:A, 2co0:A, 2co0:C, 4cy1:B, 4cy1:A, 4cy2:A, 4cy3:A, 4cy5:A, 6d9x:A, 6dai:A, 6dak:A, 6dar:A, 6das:A, 6das:B, 7dno:A, 7dno:B, 6dy7:A, 6dya:A, 6e1y:A, 6e1y:B, 6e1z:A, 6e1z:B, 6e22:A, 6e22:B, 6e23:A, 6e23:B, 8e9f:A, 5eal:A, 5eal:B, 5eam:A, 5eam:B, 5eap:A, 5ear:A, 5ear:B, 3eg6:A, 3emh:A, 4erq:A, 4erq:B, 4erq:C, 4ery:A, 4erz:C, 4erz:A, 4erz:B, 4es0:A, 4esg:B, 4esg:A, 4ewr:A, 8f1g:A, 8f1g:B, 8f93:A, 8f93:B, 8g3c:A, 8g3e:A, 8g3e:B, 2g99:B, 2g99:A, 2g9a:A, 4gm3:A, 4gm3:B, 4gm3:C, 4gm3:D, 4gm3:E, 4gm3:F, 4gm3:G, 4gm3:H, 4gm8:A, 4gm8:B, 4gm8:C, 4gm8:D, 4gm9:A, 4gm9:B, 4gmb:A, 2h13:A, 2h6k:A, 2h6k:B, 2h6n:A, 2h6n:B, 2h6q:A, 2h6q:B, 2h9m:A, 2h9m:C, 2h9n:A, 2h9n:C, 2h9p:A, 8hmx:A, 4ia9:A, 6iam:A, 7jto:B, 7jtp:A, 5m23:A, 5m25:A, 4o45:A, 2o9k:A, 2o9k:C, 6oi0:A, 6oi1:A, 6oi2:A, 6oi3:A, 8okf:A, 3p4f:A, 6pg3:A, 6pg3:B, 6pg4:A, 6pg5:A, 6pg6:A, 6pg6:B, 6pg7:A, 6pg8:A, 6pg8:B, 6pg8:C, 6pg8:D, 6pg9:A, 6pg9:B, 6pga:A, 6pgb:A, 6pgc:A, 6pgd:A, 6pge:A, 6pgf:A, 3psl:A, 3psl:B, 8q1n:B, 7q2j:D, 4ql1:A, 4ql1:B, 4qqe:A, 3smr:A, 3smr:B, 3smr:C, 3smr:D, 5sxm:B, 5sxm:A, 8t5i:A, 8t5i:B, 6u5m:A, 6u5m:B, 6u5y:A, 6u5y:B, 6u6w:A, 6u6w:B, 6u80:A, 6u80:B, 6u8b:A, 6u8b:B, 6u8l:A, 6u8l:B, 6u8o:A, 7u9y:A, 7uas:A, 7uas:B, 6ucs:A, 6ucs:B, 6ufx:A, 6uhy:A, 6uhy:B, 6uhz:A, 6uhz:B, 6uif:A, 6uif:B, 6uik:A, 6uik:B, 6uj4:A, 6uj4:B, 6ujh:A, 6ujh:B, 6ujj:A, 6ujl:A, 8ujy:A, 8ujy:B, 6uoz:A, 6uoz:B, 3ur4:A, 3ur4:B, 3uvk:A, 3uvl:A, 3uvm:A, 3uvn:A, 3uvn:C, 3uvo:A, 5vfc:A, 6wjq:A, 6wjq:B, 7wvk:A, 8wxq:A, 8wxq:B, 8wxr:A, 8wxr:B, 8wxt:A, 8wxu:B, 8wxv:A, 8wxv:C, 8wxx:B, 8wxx:A, 8x3r:A, 8x3s:A, 2xl2:A, 2xl2:B, 2xl3:A, 2xl3:B, 4y7r:A
9 6y7p:A 319 228 0.1458 0.1348 0.1886 0.011 6y7o:A, 6y7o:B
10 6y7p:A 319 137 0.1051 0.0972 0.2263 2.1 6y7o:A, 6y7o:B
11 6rxt:UL 785 59 0.0610 0.0229 0.3051 0.013 6rxu:UL, 6rxv:UL, 6rxx:UL, 6rxy:UL, 6rxz:UL
12 5juy:B 1234 79 0.0712 0.0170 0.2658 0.033 1cy5:A, 3j2t:A, 3j2t:B, 3j2t:C, 3j2t:D, 3j2t:E, 3j2t:F, 3j2t:G, 3jbt:A, 3jbt:C, 3jbt:E, 3jbt:G, 3jbt:I, 3jbt:K, 3jbt:M, 5juy:A, 5juy:C, 5juy:D, 5juy:E, 5juy:F, 5juy:G, 2p1h:A, 5wve:A, 5wve:C, 5wve:E, 5wve:G, 5wve:I, 5wve:K, 5wve:M, 1z6t:A, 1z6t:B, 1z6t:C, 1z6t:D
13 5juy:B 1234 106 0.0814 0.0194 0.2264 0.85 1cy5:A, 3j2t:A, 3j2t:B, 3j2t:C, 3j2t:D, 3j2t:E, 3j2t:F, 3j2t:G, 3jbt:A, 3jbt:C, 3jbt:E, 3jbt:G, 3jbt:I, 3jbt:K, 3jbt:M, 5juy:A, 5juy:C, 5juy:D, 5juy:E, 5juy:F, 5juy:G, 2p1h:A, 5wve:A, 5wve:C, 5wve:E, 5wve:G, 5wve:I, 5wve:K, 5wve:M, 1z6t:A, 1z6t:B, 1z6t:C, 1z6t:D
14 5juy:B 1234 65 0.0610 0.0146 0.2769 1.8 1cy5:A, 3j2t:A, 3j2t:B, 3j2t:C, 3j2t:D, 3j2t:E, 3j2t:F, 3j2t:G, 3jbt:A, 3jbt:C, 3jbt:E, 3jbt:G, 3jbt:I, 3jbt:K, 3jbt:M, 5juy:A, 5juy:C, 5juy:D, 5juy:E, 5juy:F, 5juy:G, 2p1h:A, 5wve:A, 5wve:C, 5wve:E, 5wve:G, 5wve:I, 5wve:K, 5wve:M, 1z6t:A, 1z6t:B, 1z6t:C, 1z6t:D
15 5juy:B 1234 120 0.0847 0.0203 0.2083 3.6 1cy5:A, 3j2t:A, 3j2t:B, 3j2t:C, 3j2t:D, 3j2t:E, 3j2t:F, 3j2t:G, 3jbt:A, 3jbt:C, 3jbt:E, 3jbt:G, 3jbt:I, 3jbt:K, 3jbt:M, 5juy:A, 5juy:C, 5juy:D, 5juy:E, 5juy:F, 5juy:G, 2p1h:A, 5wve:A, 5wve:C, 5wve:E, 5wve:G, 5wve:I, 5wve:K, 5wve:M, 1z6t:A, 1z6t:B, 1z6t:C, 1z6t:D
16 7mqa:LQ 830 49 0.0542 0.0193 0.3265 0.17 7mq8:LQ, 7mq9:LQ
17 7mqa:LQ 830 58 0.0542 0.0193 0.2759 0.71 7mq8:LQ, 7mq9:LQ
18 6wnx:A 410 225 0.1729 0.1244 0.2267 0.36 6m90:A, 6m91:A, 6m92:A, 6m93:A, 6m94:A, 1p22:A, 6ttu:T, 6wnx:D, 6wnx:G
19 3sfz:A 1133 62 0.0508 0.0132 0.2419 0.37 3shf:A
20 3sfz:A 1133 84 0.0644 0.0168 0.2262 3.4 3shf:A
21 3sfz:A 1133 51 0.0441 0.0115 0.2549 3.9 3shf:A
22 8pv6:Ch 389 56 0.0508 0.0386 0.2679 0.40 8pv8:Ch
23 3nhe:A 338 80 0.0847 0.0740 0.3125 0.50 6dgf:A, 2ibi:A, 3v6c:A, 3v6e:A, 5xu8:A, 5xve:A
24 2hd5:A 315 80 0.0847 0.0794 0.3125 0.53
25 6y7o:C 313 226 0.1627 0.1534 0.2124 0.58
26 6y7o:C 313 138 0.1051 0.0990 0.2246 0.91
27 7aju:UL 779 64 0.0644 0.0244 0.2969 0.89 5wyj:BB, 5wyk:BB, 6zqd:UL, 6zqe:UL, 6zqf:UL
28 7aju:UL 779 167 0.1254 0.0475 0.2216 2.9 5wyj:BB, 5wyk:BB, 6zqd:UL, 6zqe:UL, 6zqf:UL
29 7d5s:B2 851 64 0.0644 0.0223 0.2969 0.97 7ajt:UL, 7d4i:B2, 7d5t:B2, 7d63:B2, 6ke6:B2, 6lqp:B2, 6lqq:B2, 6lqr:B2, 6lqs:B2, 6lqt:B2, 6lqu:B2, 6lqv:B2, 7suk:LQ, 5wlc:LQ, 6zqa:UL, 6zqb:UL, 6zqc:UL
30 7d5s:B2 851 167 0.1254 0.0435 0.2216 3.6 7ajt:UL, 7d4i:B2, 7d5t:B2, 7d63:B2, 6ke6:B2, 6lqp:B2, 6lqq:B2, 6lqr:B2, 6lqs:B2, 6lqt:B2, 6lqu:B2, 6lqv:B2, 7suk:LQ, 5wlc:LQ, 6zqa:UL, 6zqb:UL, 6zqc:UL
31 5t2a:7 308 64 0.0542 0.0519 0.2500 1.2 6az1:g, 8ovj:Sg, 8rxh:Sg
32 5yzg:s 374 91 0.0780 0.0615 0.2527 1.2
33 5zb8:A 400 35 0.0475 0.0350 0.4000 1.8 7k30:A, 7k31:A, 7k32:A, 7k33:A, 5zb8:B, 5zb8:C, 5zb8:D, 5zb8:E
34 3jb9:L 293 200 0.1390 0.1399 0.2050 2.4
35 6h3r:A 121 38 0.0407 0.0992 0.3158 3.1 6h3r:B
36 7d4i:BE 890 54 0.0576 0.0191 0.3148 3.4 7aju:UU, 6zqd:UU, 6zqf:UU
37 7d4i:BE 890 56 0.0576 0.0191 0.3036 4.5 7aju:UU, 6zqd:UU, 6zqf:UU
38 7d5s:BE 865 54 0.0576 0.0197 0.3148 3.5 7ajt:UU, 6ke6:BE, 6lqp:BE, 6lqq:BE, 6lqu:BE, 7suk:LT, 5wlc:LT, 6zqa:UU, 6zqb:UU, 6zqc:UU
39 7d5s:BE 865 56 0.0576 0.0197 0.3036 4.3 7ajt:UU, 6ke6:BE, 6lqp:BE, 6lqq:BE, 6lqu:BE, 7suk:LT, 5wlc:LT, 6zqa:UU, 6zqb:UU, 6zqc:UU
40 6lqs:BE 823 54 0.0576 0.0207 0.3148 3.5 7d63:BE, 6lqr:BE, 6lqt:BE, 6lqv:BE, 6nd4:T
41 6lqs:BE 823 56 0.0576 0.0207 0.3036 4.1 7d63:BE, 6lqr:BE, 6lqt:BE, 6lqv:BE, 6nd4:T
42 5wyj:BE 753 54 0.0576 0.0226 0.3148 3.5 5wyk:BE
43 5wyj:BE 753 56 0.0576 0.0226 0.3036 4.4 5wyk:BE
44 5tzs:T 749 54 0.0576 0.0227 0.3148 3.7
45 5tzs:T 749 56 0.0576 0.0227 0.3036 4.6
46 5o9z:L 459 74 0.0508 0.0327 0.2027 3.7
47 6rxt:UA 839 104 0.1017 0.0358 0.2885 3.8 5oql:A, 6rxu:UA, 6rxv:UA, 6rxx:UA, 6rxy:UA, 6rxz:UA
48 7mqa:LO 819 211 0.1492 0.0537 0.2085 3.9
49 7mq8:LO 848 211 0.1492 0.0519 0.2085 4.0 7mq9:LO
50 7mq8:LR 773 224 0.1525 0.0582 0.2009 4.9 7mq9:LR, 7mqa:LR
51 8ip8:ha 322 57 0.0576 0.0528 0.2982 5.3 8ip9:ha, 8ipa:ha, 8ipb:ha, 8r57:g
52 6zrd:A 411 95 0.0814 0.0584 0.2526 5.6 7m40:A, 4pby:B, 4pc0:A, 4pc0:B, 5xwr:A, 2yba:A
53 7mq8:LH 746 75 0.0644 0.0255 0.2533 6.3 7mq9:LH, 7mqa:LH
54 7trc:K 330 66 0.0678 0.0606 0.3030 6.7 7bgb:K
55 7v9a:B 377 66 0.0678 0.0531 0.3030 6.9 8oue:K, 8ouf:K
56 5xxu:d 51 23 0.0407 0.2353 0.5217 7.7
57 2yba:B 382 77 0.0678 0.0524 0.2597 7.8 3c9c:A, 2xyi:A, 2yb8:B
58 7mq8:LL 510 30 0.0373 0.0216 0.3667 8.2 7mq9:LL
59 8shj:A 334 110 0.0915 0.0808 0.2455 8.9 8shj:B, 8t55:A, 8t55:B
60 3cfv:B 393 77 0.0712 0.0534 0.2727 8.9 6bw3:C, 6bw3:A, 6bw4:C, 6bw4:A, 3cfs:B, 3cfv:A, 7m40:B, 4pby:A, 4pbz:A, 4r7a:B, 5vtb:A, 2xu7:B, 2xu7:A, 5xwr:B, 5xxq:B, 5xxq:A, 5y1u:B, 5y1u:A, 6zrc:A, 6zrc:B, 6zrd:B
61 7ajt:UM 762 70 0.0475 0.0184 0.2000 9.9 7aju:UM, 7d4i:B3, 7d5s:B3, 7d5t:B3, 7d63:B3, 6ke6:B3, 6lqp:B3, 6lqq:B3, 6lqr:B3, 6lqs:B3, 6lqt:B3, 6lqu:B3, 6lqv:B3, 7suk:LR, 6zqa:UM, 6zqb:UM, 6zqc:UM, 6zqd:UM, 6zqf:UM

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218