Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRG
HTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARA
ADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQ
GASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGSSTPPPSGGGQIKGVGS
GRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVG
VQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT

The query sequence (length=436) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1isv:A 436 436 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 2d20:A, 2d20:B, 2d22:A, 2d22:B, 2d23:A, 2d23:B, 2d24:A, 2d24:B, 1e0v:A, 1e0x:A, 1e0x:B, 2g3j:A, 5gqd:A, 5gqd:B, 5gqe:A, 5gqe:B, 1isv:B, 1isw:A, 1isw:B, 1isx:A, 1isx:B, 1isy:A, 1isy:B, 1isz:A, 1isz:B, 1it0:A, 1it0:B, 1od8:A, 1v0k:A, 1v0l:A, 1v0m:A, 1v0n:A, 1v6u:A, 1v6u:B, 1v6v:A, 1v6v:B, 1v6w:A, 1v6w:B, 1v6x:A, 1v6x:B
2 3cuf:A 314 318 0.3601 0.5000 0.4937 1.25e-99 3cug:A, 3cuh:A, 3cui:A, 3cuj:A, 1exp:A, 1fh7:A, 1fh8:A, 1fh9:A, 1fhd:A, 2his:A, 1j01:A, 2xyl:A
3 1b30:A 302 300 0.3188 0.4603 0.4633 1.32e-81 1b3v:A, 1b3w:A, 1b3x:A, 1b3y:A, 1b3z:A, 1bg4:A
4 7k4u:A 305 302 0.3096 0.4426 0.4470 4.33e-80 2bnj:A, 4bs0:A, 4bs0:B, 8fos:A, 1goq:A, 1gor:A, 7k4q:A, 7k4q:B, 7k4w:A, 7k4x:A, 7k4x:B, 7k4z:A, 8kh3:A, 3nyd:A, 3nyd:B, 8rd5:A, 8rd5:B, 5rga:A, 5rga:B, 5rgb:A, 5rgb:B, 5rgc:A, 5rgc:B, 5rgd:A, 5rgd:B, 5rge:A, 5rgf:A, 5rgf:B, 6srw:A, 6srw:B, 6sry:A, 6sry:B, 6srz:A, 6srz:B, 6ss1:A, 6ss1:B, 6ss3:A, 6ss3:B, 6tu6:A, 6tu6:B, 6tu6:C, 6tu6:D, 6tu6:E, 6tu6:F, 6tu6:G, 6tu6:H, 6tu6:I, 6tu6:J, 6tu6:K, 6tu6:L, 6tu6:M, 6tu6:N, 6tu6:O, 6tu6:P, 8usf:A, 8usf:B, 8ush:A, 8ush:B, 8usj:A, 8usj:B, 8usj:C, 8usl:A, 8usl:B
5 3wub:A 313 315 0.3234 0.4505 0.4476 9.33e-80 3wue:A, 3wuf:A, 3wug:A
6 1knm:A 129 129 0.2638 0.8915 0.8915 2.38e-79 1mc9:A
7 3u7b:B 326 328 0.3142 0.4202 0.4177 5.26e-71
8 6jdy:A 319 318 0.3119 0.4263 0.4277 1.65e-63 6jdy:B, 6jdz:A, 6jdz:B, 6je0:A, 6je0:B, 6je1:A, 6je1:B, 6je2:A, 6je2:B, 7wh7:A, 7wh7:B, 7whe:B
9 3nj3:A 327 294 0.2661 0.3547 0.3946 1.81e-63 3nj3:B, 1vbr:A, 1vbr:B
10 1w3h:A 348 352 0.3234 0.4052 0.4006 7.95e-57 1clx:A, 1clx:B, 1clx:C, 1clx:D, 1e5n:A, 1e5n:B, 1w2p:A, 1w2p:B, 1w2v:A, 1w2v:B, 1w32:A, 1w32:B, 1w3h:B
11 3w25:A 324 317 0.2569 0.3457 0.3533 1.63e-55 3w26:A, 3w27:A, 3w28:A, 3w29:A
12 4xx6:B 321 320 0.2729 0.3707 0.3719 4.40e-54 4xx6:A
13 6q8n:A 321 315 0.2890 0.3925 0.4000 1.85e-53 6q8n:B
14 5d4y:A 314 305 0.2523 0.3503 0.3607 1.30e-52 5d4y:B
15 1us2:A 507 329 0.2683 0.2308 0.3556 1.96e-50 1gny:A
16 5ofk:A 339 323 0.2683 0.3451 0.3622 2.68e-50 5ofl:A
17 4w8l:A 352 335 0.2638 0.3267 0.3433 2.64e-49 4w8l:B, 4w8l:C
18 4pmd:A 329 302 0.2156 0.2857 0.3113 6.50e-48 4l4p:A
19 1hiz:A 375 351 0.2477 0.2880 0.3077 3.92e-47 3mmd:A, 4prw:A, 4pud:A, 4pue:A, 1r85:A, 1r86:A, 1r87:A
20 3msd:A 330 289 0.2248 0.2970 0.3391 9.14e-47 3msd:B, 3msg:A, 3msg:B, 3mua:A, 3mua:B, 3mui:A, 3mui:B
21 8bbi:A 335 324 0.2454 0.3194 0.3302 2.10e-46 8bbi:B, 7nl2:A, 7nl2:B
22 5xzu:A 334 329 0.2569 0.3353 0.3404 2.21e-46
23 3emq:A 331 317 0.2271 0.2991 0.3123 2.35e-46 3emz:A
24 6wqw:A 305 289 0.2248 0.3213 0.3391 2.36e-46
25 7cpl:A 358 348 0.2477 0.3017 0.3103 2.81e-45 7cpk:A, 6lps:A, 2uwf:A, 8xy0:A, 8y1m:A, 8y1m:B
26 3rdk:B 334 330 0.2454 0.3204 0.3242 1.39e-44 4e4p:A, 4e4p:B, 3rdk:A, 3ro8:A, 3ro8:B, 3ro8:C, 3ro8:D, 3ro8:E, 3ro8:F, 3ro8:G, 3ro8:H
27 5eb8:A 354 321 0.2317 0.2853 0.3146 7.77e-39 5eb8:B, 5eba:A, 5efd:A, 5efd:B, 5eff:A, 5eff:B, 2f8q:A, 2f8q:B, 2fgl:A, 2fgl:B, 4qce:A, 4qce:B, 4qcf:A, 4qdm:A, 4qdm:B, 5xc0:A, 5xc0:B, 5xc1:A, 5xc1:B
28 1ur2:A 351 336 0.2385 0.2963 0.3095 9.19e-38 2cnc:A, 1uqy:A, 1uqz:A, 1ur1:A
29 2wys:B 516 337 0.2615 0.2209 0.3383 4.71e-37 2w5f:A, 2w5f:B, 2wys:A, 2wze:A, 2wze:B
30 3a22:A 614 147 0.1743 0.1238 0.5170 5.91e-37 3a22:B, 3a23:A, 3a23:B
31 7d88:A 364 280 0.1812 0.2170 0.2821 2.85e-26 7d89:A
32 4pmx:A 306 271 0.1950 0.2778 0.3137 2.02e-25 4pmy:A, 4pmy:B, 4pmz:A, 4pmz:B, 4pn2:A, 4pn2:B
33 1hwm:B 264 116 0.1009 0.1667 0.3793 1.10e-13 1hwn:B, 1hwo:B, 1hwp:B
34 1hwm:B 264 100 0.0642 0.1061 0.2800 5.70e-05 1hwn:B, 1hwo:B, 1hwp:B
35 1hwm:B 264 37 0.0413 0.0682 0.4865 0.046 1hwn:B, 1hwo:B, 1hwp:B
36 3ca1:A 257 120 0.1009 0.1712 0.3667 2.79e-13 3ca4:A, 3ca5:A, 3cah:A
37 3ca1:A 257 101 0.0642 0.1089 0.2772 4.00e-05 3ca4:A, 3ca5:A, 3cah:A
38 3ca1:A 257 38 0.0413 0.0700 0.4737 0.026 3ca4:A, 3ca5:A, 3cah:A
39 1vcl:A 432 131 0.0986 0.0995 0.3282 6.16e-11 1vcl:B, 3w9t:A, 3w9t:C, 3w9t:G, 3w9t:B, 3w9t:F, 3w9t:E, 3w9t:D, 2z48:A, 2z48:B, 2z49:A, 2z49:B
40 1vcl:A 432 83 0.0619 0.0625 0.3253 0.10 1vcl:B, 3w9t:A, 3w9t:C, 3w9t:G, 3w9t:B, 3w9t:F, 3w9t:E, 3w9t:D, 2z48:A, 2z48:B, 2z49:A, 2z49:B
41 1vcl:A 432 87 0.0596 0.0602 0.2989 0.41 1vcl:B, 3w9t:A, 3w9t:C, 3w9t:G, 3w9t:B, 3w9t:F, 3w9t:E, 3w9t:D, 2z48:A, 2z48:B, 2z49:A, 2z49:B
42 2aai:B 262 121 0.0917 0.1527 0.3306 2.60e-08 7kd0:B, 3rti:B, 3rtj:B
43 2aai:B 262 102 0.0780 0.1298 0.3333 2.79e-05 7kd0:B, 3rti:B, 3rtj:B
44 2aai:B 262 39 0.0413 0.0687 0.4615 1.3 7kd0:B, 3rti:B, 3rtj:B
45 8r8a:A 127 103 0.0803 0.2756 0.3398 4.36e-08
46 8r8a:A 127 33 0.0367 0.1260 0.4848 0.007
47 4zbv:B 261 90 0.0757 0.1264 0.3667 5.68e-08 4zfw:B, 4zfy:B, 4zgr:B, 4zlb:B
48 4zbv:B 261 33 0.0344 0.0575 0.4545 0.022 4zfw:B, 4zfy:B, 4zgr:B, 4zlb:B
49 4zbv:B 261 52 0.0367 0.0613 0.3077 1.6 4zfw:B, 4zfy:B, 4zgr:B, 4zlb:B
50 4zbv:B 261 115 0.0596 0.0996 0.2261 8.1 4zfw:B, 4zfy:B, 4zgr:B, 4zlb:B
51 6pxu:B 532 144 0.0917 0.0752 0.2778 7.32e-08 6pxu:A
52 1rzo:B 262 121 0.0872 0.1450 0.3140 5.47e-07 1rzo:D
53 1rzo:B 262 78 0.0642 0.1069 0.3590 3.12e-04 1rzo:D
54 1rzo:B 262 39 0.0390 0.0649 0.4359 2.4 1rzo:D
55 4hr6:C 264 85 0.0711 0.1174 0.3647 6.41e-07 5y97:C
56 4hr6:C 264 74 0.0573 0.0947 0.3378 0.15 5y97:C
57 4hr6:C 264 33 0.0298 0.0492 0.3939 0.17 5y97:C
58 4hr6:C 264 87 0.0642 0.1061 0.3218 0.34 5y97:C
59 8v9q:B 449 121 0.0734 0.0713 0.2645 3.28e-06
60 6e4q:A 505 128 0.1009 0.0871 0.3438 9.04e-06 6e4q:B, 6e4q:C, 6e4q:D
61 3vsz:C 482 91 0.0734 0.0664 0.3516 8.84e-05 3vsz:A, 3vsz:B, 3vsz:E, 3vsz:F, 3vt0:A, 3vt0:B, 3vt0:C, 3vt0:E, 3vt0:F, 3vt1:B, 3vt1:C, 3vt1:E, 3vt1:F, 3vt1:A, 3vt2:A, 3vt2:B, 3vt2:C, 3vt2:D, 3vt2:E, 3vt2:F
62 3vsz:C 482 215 0.1284 0.1162 0.2605 1.03e-04 3vsz:A, 3vsz:B, 3vsz:E, 3vsz:F, 3vt0:A, 3vt0:B, 3vt0:C, 3vt0:E, 3vt0:F, 3vt1:B, 3vt1:C, 3vt1:E, 3vt1:F, 3vt1:A, 3vt2:A, 3vt2:B, 3vt2:C, 3vt2:D, 3vt2:E, 3vt2:F
63 1abr:B 267 93 0.0642 0.1049 0.3011 3.43e-04
64 1abr:B 267 104 0.0642 0.1049 0.2692 0.023
65 1onk:B 263 108 0.0734 0.1217 0.2963 4.26e-04 3d7w:B, 1oql:B, 1pum:B, 1puu:B, 2r9k:B, 2rg9:B, 1sz6:B, 1tfm:B, 1yf8:B
66 1onk:B 263 97 0.0711 0.1179 0.3196 0.003 3d7w:B, 1oql:B, 1pum:B, 1puu:B, 2r9k:B, 2rg9:B, 1sz6:B, 1tfm:B, 1yf8:B
67 6iwq:A 546 98 0.0688 0.0549 0.3061 0.001 6iwq:B, 6iwq:C, 6iwq:D, 6iwq:E, 6iwq:F, 6iwr:A, 6iwr:B, 6iwr:C, 6iwr:D, 6iwr:E, 6iwr:F
68 6h0b:B 521 136 0.0917 0.0768 0.2941 0.003
69 2d7i:A 536 116 0.0780 0.0634 0.2931 0.004 2d7r:A
70 4ouj:A 281 109 0.0803 0.1246 0.3211 0.005 4ouj:B
71 4ouj:A 281 31 0.0344 0.0534 0.4839 0.25 4ouj:B
72 4end:A 114 120 0.0849 0.3246 0.3083 0.007 4den:A, 4g1r:A, 4g1r:C, 4p6a:A
73 4end:A 114 101 0.0711 0.2719 0.3069 0.26 4den:A, 4g1r:A, 4g1r:C, 4p6a:A
74 5bp5:A 286 108 0.0711 0.1084 0.2870 0.030 5bp5:B, 5bqu:B, 5bqu:A, 4lo1:A, 4lo1:B, 4lo2:A, 4lo2:B, 4lo3:A, 4lo3:B
75 5bp5:A 286 112 0.0757 0.1154 0.2946 0.084 5bp5:B, 5bqu:B, 5bqu:A, 4lo1:A, 4lo1:B, 4lo2:A, 4lo2:B, 4lo3:A, 4lo3:B
76 3phz:A 278 105 0.0711 0.1115 0.2952 0.036 5mua:A, 5mua:B, 3phz:B
77 8v9q:A 500 84 0.0619 0.0540 0.3214 0.27 1xhb:A
78 8v9q:A 500 73 0.0573 0.0500 0.3425 0.27 1xhb:A
79 4iyb:A 140 133 0.0894 0.2786 0.2932 0.34 4izx:A, 4j2s:A
80 1dqg:A 134 85 0.0573 0.1866 0.2941 0.98 1dqo:A, 1fwu:A, 1fwv:A
81 3ah1:B 288 31 0.0321 0.0486 0.4516 2.1 3ah1:A, 3ah4:B
82 3zmr:A 469 179 0.1009 0.0938 0.2458 3.8 3zmr:B
83 5w2r:A 171 32 0.0298 0.0760 0.4062 8.2 5w2z:A, 5w30:A, 5w39:A, 5w3a:A, 5w3c:A
84 4d0t:A 496 44 0.0367 0.0323 0.3636 8.8 5ajn:A, 5ajo:A, 5ajp:A, 4d0t:C, 4d0t:F, 4d0t:B, 4d0t:D, 4d0t:E, 4d0z:B, 4d0z:E, 4d0z:A, 4d0z:C, 4d0z:D, 4d0z:F, 4d11:D, 4d11:E, 4d11:B, 4d11:A, 4d11:F, 6e7i:A, 6egs:A, 6egs:B, 2ffu:A, 2ffv:A, 2ffv:B, 5fv9:A, 5fv9:B, 5fv9:C, 5fv9:D, 5fv9:E, 5fv9:F, 5ndf:A, 5ndf:B, 5ndf:C, 5ndf:D, 5ndf:E, 5ndf:F, 6nqt:A, 6nqt:B, 6nqt:C, 6nqt:D, 6nqt:E, 6nqt:F
85 5y3r:C 3636 84 0.0596 0.0072 0.3095 9.1
86 4v5i:AS 298 100 0.0528 0.0772 0.2300 9.9 4v5i:AT, 4v5i:AU, 4v5i:AV, 4v5i:AW, 4v5i:AX, 4v5i:BS, 4v5i:BT, 4v5i:BU, 4v5i:BV, 4v5i:BW, 4v5i:BX

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218