Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
AEPLTELEESIETVVTTFFTFARQEGRKDSLSVNEFKELVTQQLPHLLKDVGSLDEKMKSLDVNQDSELKFNEYWRLIGE
LAKEIRKKKDLKI

The query sequence (length=93) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2kot:A 98 93 1.0000 0.9490 1.0000 2.07e-63 2egd:A, 2egd:B, 2h2k:A, 2h2k:B, 2kot:B, 1yut:A, 1yut:B, 1yuu:A, 1yuu:B
2 2l51:A 102 91 0.3118 0.2843 0.3187 2.49e-13 2l51:B
3 6zdy:A 108 81 0.3118 0.2685 0.3580 7.17e-13 6zfe:A
4 2wc8:D 93 78 0.2903 0.2903 0.3462 1.51e-11 1e8a:A, 1e8a:B, 1gqm:A, 1gqm:B, 1gqm:C, 1gqm:F, 1gqm:D, 1gqm:E, 1gqm:G, 1gqm:H, 1gqm:I, 1gqm:J, 1gqm:L, 1gqm:K, 1odb:B, 1odb:A, 1odb:C, 1odb:D, 1odb:E, 1odb:F, 2wc8:A, 2wc8:B, 2wc8:C, 2wcb:A, 2wcb:B
5 2kay:A 92 78 0.3441 0.3478 0.4103 3.01e-11 4dir:A, 4dir:B, 2kay:B, 6wn7:A, 6wn7:B, 6wn7:C, 6wn7:D, 6wn7:F, 6wn7:E
6 7psq:G 108 81 0.3011 0.2593 0.3457 1.81e-10 4cfr:B, 4eto:A, 3ko0:F, 3ko0:G, 3ko0:Q, 3m0w:J, 3m0w:B, 3m0w:C, 3m0w:D, 3m0w:F, 3m0w:G, 7psq:E, 3zwh:B
7 8s9w:A 98 87 0.2688 0.2551 0.2874 2.81e-10 8s9w:B
8 1qls:A 95 81 0.3226 0.3158 0.3704 7.41e-10
9 2k2f:A 93 80 0.3226 0.3226 0.3750 1.18e-09 2k2f:B, 5k89:A, 5k89:C, 5k89:H, 2kbm:A, 2kbm:B, 2lp2:A, 2lp2:B, 2lp3:A, 2lp3:B, 2lux:A, 2lux:B, 8vk4:I, 8vk4:J, 8vk4:K, 8vk4:L, 8vk4:N, 8vk4:M, 8vk4:O, 8vk4:P, 1zfs:A, 1zfs:B
10 6t58:A 524 82 0.3011 0.0534 0.3415 1.59e-09 3c1v:A, 3c1v:B, 3c1v:C, 3c1v:D, 4cfq:A, 4cfq:B, 4cfq:C, 4cfq:D, 4cfr:A, 3cga:A, 3cga:B, 7eq7:A, 4eto:B, 4hre:A, 4hre:C, 4hre:B, 4hre:D, 4hsz:A, 4hsz:B, 4hsz:C, 4hsz:D, 2hyu:A, 2hyv:A, 2hyw:A, 2hyw:B, 3ko0:A, 3ko0:C, 3ko0:B, 3ko0:D, 3ko0:J, 3ko0:I, 3ko0:E, 3ko0:H, 3ko0:K, 3ko0:S, 3ko0:L, 3ko0:N, 3ko0:M, 3ko0:P, 3ko0:O, 3ko0:R, 3ko0:T, 5lpu:A, 5lpu:B, 5lpu:C, 5lpu:D, 5lpx:A, 5lq0:A, 5lq0:B, 5lq2:A, 5lq2:B, 3m0w:I, 3m0w:A, 3m0w:E, 3m0w:H, 5n7g:B, 7psp:A, 7psp:B, 7psq:A, 7psq:C, 2q91:A, 2q91:B, 6t58:B, 4x9p:A, 1xjl:A, 1xjl:B, 7zvn:A, 7zvx:A, 7zvx:B, 3zwh:A
11 6t58:A 524 79 0.3011 0.0534 0.3544 1.68e-09 3c1v:A, 3c1v:B, 3c1v:C, 3c1v:D, 4cfq:A, 4cfq:B, 4cfq:C, 4cfq:D, 4cfr:A, 3cga:A, 3cga:B, 7eq7:A, 4eto:B, 4hre:A, 4hre:C, 4hre:B, 4hre:D, 4hsz:A, 4hsz:B, 4hsz:C, 4hsz:D, 2hyu:A, 2hyv:A, 2hyw:A, 2hyw:B, 3ko0:A, 3ko0:C, 3ko0:B, 3ko0:D, 3ko0:J, 3ko0:I, 3ko0:E, 3ko0:H, 3ko0:K, 3ko0:S, 3ko0:L, 3ko0:N, 3ko0:M, 3ko0:P, 3ko0:O, 3ko0:R, 3ko0:T, 5lpu:A, 5lpu:B, 5lpu:C, 5lpu:D, 5lpx:A, 5lq0:A, 5lq0:B, 5lq2:A, 5lq2:B, 3m0w:I, 3m0w:A, 3m0w:E, 3m0w:H, 5n7g:B, 7psp:A, 7psp:B, 7psq:A, 7psq:C, 2q91:A, 2q91:B, 6t58:B, 4x9p:A, 1xjl:A, 1xjl:B, 7zvn:A, 7zvx:A, 7zvx:B, 3zwh:A
12 7ui5:A 114 83 0.3011 0.2456 0.3373 2.29e-09 6ds2:B, 6ds2:D, 6ds2:F, 6ds2:H, 4ggf:C, 4ggf:L, 4ggf:T, 4ggf:V, 1irj:A, 1irj:B, 1irj:C, 1irj:D, 1irj:E, 1irj:F, 1irj:G, 1irj:H, 7quv:B, 8sjb:C, 8sjb:D, 8sjc:C, 8sjc:D, 7ui5:B, 5w1f:B, 5w1f:D, 5w1f:H, 5w1f:F, 4xjk:B, 4xjk:D, 4xjk:F, 4xjk:H, 4xjk:J, 1xk4:C, 1xk4:D, 1xk4:G, 1xk4:H, 1xk4:K, 1xk4:L
13 4duq:B 90 78 0.3118 0.3222 0.3718 3.14e-09 4duq:A
14 2y5i:C 98 80 0.3011 0.2857 0.3500 4.73e-09 2y5i:A, 2y5i:B, 2y5i:D, 2y5i:E, 2y5i:F
15 5csn:A 94 79 0.2473 0.2447 0.2911 2.96e-08 3cr2:A, 3cr4:X, 3cr5:X, 5csf:A, 5csf:B, 5csi:A, 5csi:B, 5csj:A, 5csj:B, 5csn:B, 3czt:X, 3d0y:A, 3d0y:B, 3d10:A, 3d10:B, 5d7f:A, 5d7f:B, 5dkn:A, 5dkq:A, 5dkr:A, 5dkr:B, 1dt7:A, 1dt7:B, 5er4:X, 5er5:A, 8fj8:A, 4fqo:A, 3gk1:A, 3gk2:A, 3gk4:X, 2h61:A, 2h61:B, 2h61:C, 2h61:D, 2h61:E, 2h61:F, 2h61:G, 2h61:H, 3hcm:A, 3hcm:B, 3iqo:A, 3iqo:B, 3iqq:A, 2k7o:A, 2k7o:B, 3lk0:A, 3lk0:B, 3lk0:C, 3lk0:D, 3lk1:A, 3lle:A, 3lle:B, 1mho:A, 1mq1:A, 1mq1:B, 1mwn:A, 1mwn:B, 4pdz:A, 4pdz:B, 4pe0:X, 4pe0:A, 4pe1:A, 4pe1:B, 4pe4:X, 4pe4:A, 4pe7:A, 1psb:A, 1psb:B, 1qlk:A, 1qlk:B, 3rlz:A, 3rlz:B, 3rm1:A, 1xyd:A, 1xyd:B, 4xyn:A, 4xyn:B, 4xyn:C, 4xyn:D
16 7nmi:B 488 87 0.2688 0.0512 0.2874 3.34e-08 1j55:A
17 7nmi:B 488 84 0.2581 0.0492 0.2857 6.62e-08 1j55:A
18 1k96:A 89 82 0.3011 0.3146 0.3415 7.02e-08 1k9k:A, 1k9k:B, 4p2y:B, 4ybh:B
19 1qx2:A 76 75 0.2903 0.3553 0.3600 2.59e-07 1qx2:B
20 5hlo:C 93 86 0.2258 0.2258 0.2442 4.03e-06 6ds2:A, 6ds2:C, 6ds2:E, 6ds2:G, 4ggf:A, 4ggf:K, 4ggf:S, 4ggf:U, 5hlo:A, 5hlo:B, 5hlo:D, 5hlv:A, 5hlv:D, 5hlv:B, 5hlv:H, 5hlv:C, 5hlv:E, 5hlv:F, 5hlv:G, 1mr8:A, 1mr8:B, 7quv:A, 8sjb:A, 8sjb:B, 8sjc:A, 8sjc:B, 5w1f:A, 5w1f:C, 5w1f:G, 5w1f:E, 4xjk:A, 4xjk:C, 4xjk:E, 4xjk:G, 4xjk:I, 1xk4:A, 1xk4:B, 1xk4:E, 1xk4:F, 1xk4:I, 1xk4:J
21 1ht9:A 76 74 0.2796 0.3421 0.3514 2.30e-04 1b1g:A, 1ht9:B, 3icb:A, 4icb:A, 1ig5:A, 1igv:A, 1n65:A
22 1j0a:A 325 64 0.2258 0.0646 0.3281 0.081 1j0a:B, 1j0a:C, 1j0b:A, 1j0b:B, 1j0b:C, 1j0b:D, 1j0b:E, 1j0b:F, 1j0b:G, 1j0b:H, 1j0b:I, 1j0b:J, 1j0b:K, 1j0b:L, 1j0b:M, 1j0b:N, 1j0b:O, 1j0b:P, 1j0b:Q, 1j0b:R, 1j0b:S, 1j0b:T, 1j0b:U, 1j0b:V, 1j0b:W, 1j0b:X
23 6n69:B 199 53 0.2043 0.0955 0.3585 0.26 6n69:A, 1pd2:1, 1pd2:2, 5y9z:A, 5y9z:B
24 7zqy:B 177 61 0.2258 0.1186 0.3443 0.52 7zqy:A, 7zqy:C, 7zqy:D
25 4jwq:C 73 46 0.1398 0.1781 0.2826 0.67 4jwq:A
26 2m28:A 72 52 0.1398 0.1806 0.2500 1.3
27 3ox5:A 153 50 0.1613 0.0980 0.3000 2.8 2k7b:A, 2k7d:A, 2lan:A, 2lap:A, 3ox5:B, 3ox5:C, 3ox5:D, 3ox5:E, 3ox5:F, 3ox6:A, 3ox6:B, 3ox6:C, 3ox6:D, 3ox6:F
28 1bf6:A 291 27 0.1290 0.0412 0.4444 2.9 1bf6:B, 4lef:C, 4lef:D, 4lef:A, 4lef:B, 4lef:E, 4lef:F, 4lef:G, 4lef:H
29 4og4:A 469 42 0.1613 0.0320 0.3571 3.5 6bxh:A, 6bxy:A, 6by8:A, 5db0:A, 5db1:A, 5db2:A, 5db3:A, 5dd9:A, 5dda:A, 5ddc:A, 5ddd:A, 5dde:A, 5ddf:A, 4gq3:A, 4gq4:A, 4gq6:A, 6o5i:A, 4og3:A, 4og5:A, 4og6:A, 4og7:A, 4og8:A, 6opj:A, 7uj4:A, 7uj4:B, 4x5y:A, 4x5z:A
30 1w66:A 218 31 0.1183 0.0505 0.3548 4.6
31 7pao:9 682 61 0.1613 0.0220 0.2459 5.7 7paq:9, 7par:9, 7pib:9, 7pis:9, 7pit:9
32 2scp:A 174 84 0.2581 0.1379 0.2857 6.1 2scp:B
33 4ec0:B 200 53 0.1613 0.0750 0.2830 6.4 5ais:A, 5ais:B, 5ais:C, 5ais:D, 5aiv:A, 5aiv:B, 5aiv:C, 5aiv:D, 5aix:B, 5aix:C, 2cvd:A, 2cvd:B, 2cvd:C, 2cvd:D, 4ec0:A, 4edy:A, 4edy:B, 4edz:A, 4edz:B, 4edz:C, 4edz:D, 3ee2:A, 4ee0:A, 4ee0:B, 1iyh:A, 1iyh:B, 1iyh:C, 1iyh:D, 1iyi:A, 1iyi:B, 1iyi:C, 1iyi:D, 7jr6:A, 7jr6:B, 7jr8:A, 7jr8:B, 3kxo:A, 3kxo:B, 6n4e:A, 1v40:A, 1v40:B, 1v40:C, 1v40:D, 2vcq:A, 2vcq:B, 2vcq:C, 2vcq:D, 2vcw:A, 2vcw:B, 2vcw:D, 2vcx:A, 2vcx:B, 2vcx:C, 2vcx:D, 2vcz:A, 2vcz:B, 2vcz:D, 2vd0:A, 2vd0:B, 2vd0:D, 2vd1:A, 2vd1:B, 2vd1:C, 2vd1:D, 3vi5:A, 3vi5:B, 3vi5:C, 3vi5:D, 3vi7:A, 3vi7:B, 3vi7:C, 3vi7:D, 6w58:A, 6w58:B, 6w8h:A, 6w8h:C, 5ywe:A, 5ywe:B, 5ywe:C, 5ywe:D, 5ywx:A, 5ywx:B, 5ywx:C, 5ywx:D, 5yx1:A, 5yx1:B, 5yx1:C, 5yx1:D, 6ztc:A, 6ztc:B
34 4pcw:C 91 82 0.2366 0.2418 0.2683 6.5 4pcw:A, 4pcw:B, 4pcw:D
35 2jz8:A 87 49 0.1828 0.1954 0.3469 7.2

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218