Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
AEKLTLEAITGSAPLSGPTLTKPQIAPDGSRVTFLRGKDRDRNRLDLWEYDIASGQTRLLVDSSVVLPGEEVLSDEEKAR
RERQRIAALSGIVDYQWSPDGKALLFPLGGELYFYDLTKSGRDAVRKLTNGGGFATDPKISPKGGFVSFIRDRNLWAIDL
ASGKEVQLTRDGSDTIGNGVAEFVADEEMDRHTGYWWAPDDAAIAFARIDETPVPVQKRYEVYPDRTEVVEQRYPAAGDH
NVRVQLGVIAPKTGARPRWIDLGKDPDIYLARVDWRDPQRLTFQRQSRDQKKIELIETTLTNGTQRTLVTETSTTWVPLH
NDLRFLKDGRFLWSSERSGFEHLYVASEDGSTLTALTQGEWVVDSLLAIDEAAGLAYVSGTRDGATEAHVYAVPLSGGEP
RRLTQAPGMHAATFARNASVFVDSWSSDTTLPQIELFKADGTKLATLLVNDVSDATHPYAKYRAAHQPTAYGTLTAADGT
TPLHYSLIKPAGFDPKKQYPVVVFVYGGPAAQTVTRAWPGRSDSFFNQYLAQQGYVVFTLDNRGTPRRGAAFGGALYGKQ
GTVEVDDQLRGIEWLKSQAFVDPARIGVYGWSNGGYMTLMLLAKHDEAYACGVAGAPVTDWALYDTHYTERYMDLPKANE
AGYREASVFTHVDGIGAGKLLLIHGMADDNVLFTNSTKLMSELQKRGTPFELMTYPGAKHGLRGSDLLHRYRLTEDFFAR
CLKP

The query sequence (length=724) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5yp2:A 724 724 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 5yp2:B, 5yp3:A, 5yp3:B, 5yp3:C, 5yp3:D, 5yp4:A, 5yp4:B, 5yp4:C, 5yp4:D
2 2dcm:A 662 632 0.2859 0.3127 0.3275 4.61e-100 2eep:A, 2z3z:A
3 4q1v:A 707 672 0.2914 0.2984 0.3140 6.73e-94 4q1v:B
4 7y4g:A 715 682 0.2997 0.3035 0.3182 9.48e-91 8hay:A, 8hay:B, 8hay:C, 7y4g:B, 7y4g:C
5 6eor:B 805 745 0.3039 0.2733 0.2953 5.48e-90 6qzv:B
6 7jn7:A 846 762 0.3052 0.2612 0.2900 5.52e-85 6eor:A, 6eor:C, 6eor:D, 7jn7:D, 6qzv:A, 6qzv:C, 6qzv:D, 7svl:A, 7svl:B, 7svl:C, 7svl:D, 7svn:A, 7svn:B, 7svn:C, 7svn:D, 6x6c:A, 6x6c:D, 7zxs:A, 7zxs:B, 7zxs:C, 7zxs:D
7 7svm:A 852 739 0.2997 0.2547 0.2936 6.86e-85 7a3g:B, 7a3g:A, 7a3i:B, 7a3i:C, 7a3j:C, 7a3j:A, 7a3j:B, 7a3k:C, 7a3k:A, 7a3k:B, 7a3l:A, 7a3l:B, 7a3l:C, 7ayq:B, 7ayr:A, 7ayr:B, 6eop:A, 6eop:B, 6eop:C, 6eot:A, 6eot:B, 6eot:D, 6eot:G, 6eot:I, 6eot:K, 6hp8:A, 6hp8:B, 6hp8:C, 7or4:B, 7or4:A, 7oz7:A, 7oz7:B, 6qzw:A, 6qzw:B, 6qzw:C, 7svm:B, 7svm:C, 7svo:A, 7svo:B, 7svo:C, 6trw:A, 6trw:B, 6trw:C, 6trx:B, 6trx:C, 6trx:A
8 7ayq:A 808 683 0.2776 0.2488 0.2943 8.60e-79 7a3i:A
9 2aj8:A 728 684 0.2555 0.2541 0.2705 2.43e-60 2aj8:B, 2aj8:C, 2aj8:D, 2ajb:A, 2ajb:B, 2ajb:C, 2ajb:D, 2ajc:A, 2ajc:B, 2ajc:C, 2ajc:D, 2ajd:A, 2ajd:B, 2ajd:C, 2ajd:D, 2bua:A, 2bua:B, 2bua:C, 2bua:D, 2buc:A, 2buc:B, 2buc:C, 2buc:D, 5lls:A, 5lls:B, 5lls:D, 5lls:C, 1orw:A, 1orw:B, 1orw:C, 1orw:D, 7xnm:B, 7xnm:A
10 4n8e:B 734 686 0.2569 0.2534 0.2711 4.05e-57 4a5s:A, 4a5s:B, 2ajl:I, 2ajl:J, 6b1e:A, 6b1e:B, 6b1o:A, 6b1o:B, 2bgn:A, 2bgn:B, 2bgn:C, 2bgn:D, 2bgr:A, 2bgr:B, 3bjm:A, 3bjm:B, 2bub:A, 2bub:B, 3c43:A, 3c43:B, 3c45:A, 3c45:B, 3ccb:A, 3ccb:B, 3ccb:C, 3ccb:D, 3ccc:A, 3ccc:B, 3ccc:C, 3ccc:D, 3d4l:A, 3d4l:B, 4dsa:A, 4dsz:A, 4dsz:B, 4dtc:A, 4dtc:B, 3eio:A, 3eio:B, 3f8s:A, 3f8s:B, 2fjp:A, 2fjp:B, 3g0b:A, 3g0b:B, 3g0b:C, 3g0b:D, 3g0c:A, 3g0c:B, 3g0c:C, 3g0c:D, 3g0d:A, 3g0d:B, 3g0d:C, 3g0d:D, 3g0g:A, 3g0g:B, 3g0g:C, 3g0g:D, 4g1f:A, 4g1f:B, 4g1f:C, 4g1f:D, 2g5p:A, 2g5t:A, 2g63:B, 3h0c:A, 3h0c:B, 3hab:A, 3hab:B, 3hac:A, 3hac:B, 2hha:A, 2hha:B, 2i03:B, 2i78:B, 5i7u:A, 5i7u:B, 2iit:A, 2iit:B, 2iiv:A, 2iiv:B, 5ism:A, 5ism:B, 4j3j:A, 4j3j:B, 5j3j:A, 5j3j:B, 4jh0:A, 4jh0:B, 2jid:A, 2jid:B, 5kby:A, 5kby:B, 5kby:C, 5kby:D, 3kwf:A, 3kwf:B, 3kwj:A, 3kwj:B, 4lko:A, 4lko:B, 1n1m:A, 1n1m:B, 4n8d:A, 4n8d:B, 4n8e:A, 3nox:A, 3nox:B, 1nu8:B, 3o95:A, 3o95:B, 3o95:C, 3o95:D, 3o9v:A, 3o9v:B, 3o9v:C, 3o9v:D, 2oag:B, 3oc0:A, 3oc0:B, 2ogz:A, 2ogz:B, 2ole:A, 2ole:B, 2onc:A, 2onc:B, 2onc:C, 2onc:D, 2oph:A, 2oph:B, 3opm:A, 3opm:B, 3opm:C, 3opm:D, 2oqi:B, 2oqv:A, 2p8s:A, 2p8s:B, 4pnz:A, 4pnz:B, 4pv7:A, 4pv7:B, 3q0t:A, 3q0t:B, 3q8w:A, 3q8w:B, 3qbj:A, 3qbj:B, 2qjr:A, 2qjr:B, 2qky:A, 2qky:B, 2qky:C, 2qky:D, 2qoe:A, 2qoe:B, 2qt9:A, 2qt9:B, 2qtb:A, 2qtb:B, 1r9n:A, 1r9n:B, 1r9n:C, 1r9n:D, 2rgu:A, 2rgu:B, 2rip:A, 1rwq:A, 1rwq:B, 3sww:A, 3sww:B, 3sx4:A, 3sx4:B, 5t4b:A, 5t4b:B, 5t4e:A, 5t4e:B, 5t4f:A, 5t4f:B, 5t4h:A, 5t4h:B, 1tkr:A, 1tkr:B, 3vjk:A, 3vjk:B, 3vjl:A, 3vjl:B, 3vjm:A, 3vjm:B, 3w2t:A, 3w2t:B, 1wcy:A, 1wcy:B, 3wqh:A, 3wqh:B, 1x70:A, 1x70:B, 5y7h:A, 5y7h:B, 5y7j:A, 5y7j:B, 5y7j:C, 5y7j:D, 5y7k:A, 5y7k:B, 5y7k:C, 5y7k:D, 5zid:A, 5zid:B
11 6y0f:C 722 619 0.2113 0.2119 0.2472 1.97e-51 6y0f:A, 6y0f:B, 6y0f:D
12 2gbf:A 730 685 0.2445 0.2425 0.2584 4.77e-51 4ffw:A, 4ffw:B, 2gbg:A, 2gbi:A, 2i3z:A, 2oae:A, 5vta:A, 5vta:B, 5vta:C, 5vta:D
13 8wt1:C 651 654 0.2196 0.2442 0.2431 3.24e-17 8wt1:A, 8wt1:B, 8wt1:D, 8wt1:E, 8wt1:F, 8wt1:G, 8wt1:H
14 4re6:A 577 225 0.0939 0.1179 0.3022 1.21e-14 2hu5:A, 2hu5:B, 2hu7:A, 2hu7:B, 2hu8:A, 2hu8:B, 4re5:A, 4re5:B, 4re6:C, 1ve7:A, 1ve7:B
15 4hxg:F 614 248 0.1022 0.1205 0.2984 1.27e-14 4hxe:B, 4hxf:B, 4hxg:A, 4hxg:B, 4hxg:C, 4hxg:D, 4hxg:E, 4hxg:G, 4hxg:H, 4hxg:I, 4hxg:L
16 7qun:A 694 223 0.0801 0.0836 0.2601 2.02e-14 7qun:B, 7qun:C, 7qun:D
17 3azq:A 661 250 0.0939 0.1029 0.2720 2.57e-08 3azq:B
18 5aob:A 278 266 0.0925 0.2410 0.2519 3.53e-07 5aoc:A, 7bfr:A
19 6ikg:A 644 236 0.0746 0.0839 0.2288 1.79e-06 6ikg:B
20 6ikg:A 644 131 0.0497 0.0559 0.2748 0.54 6ikg:B
21 6ikg:A 644 145 0.0552 0.0621 0.2759 1.5 6ikg:B
22 5g5m:A 253 136 0.0497 0.1423 0.2647 3.23e-05
23 7vgb:A 681 262 0.0912 0.0969 0.2519 2.22e-04 7vgb:B, 7vgc:A
24 6nkf:A 301 261 0.0898 0.2159 0.2490 3.27e-04 6nkf:D
25 5jrk:A 695 263 0.0898 0.0935 0.2471 3.80e-04 5jrk:B
26 2bkl:B 677 356 0.1202 0.1285 0.2444 0.002 2bkl:A
27 4amy:A 710 271 0.0856 0.0873 0.2288 0.009 4amz:A, 4an0:A, 4an1:A, 4bcb:A, 4bcc:A, 4bcd:A, 3ddu:A, 1e8m:A, 1e8n:A, 3eq7:A, 3eq8:A, 3eq9:A, 1h2y:A, 1h2z:A, 1o6f:A, 1o6g:A, 1qfm:A, 1qfs:A, 1uoo:A, 1uop:A, 1uoq:A, 2xdw:A
28 3iax:A 399 198 0.0718 0.1303 0.2626 0.012 2ivz:A, 2ivz:B, 2ivz:C, 2ivz:D, 4jml:A
29 3iax:A 399 40 0.0221 0.0401 0.4000 1.6 2ivz:A, 2ivz:B, 2ivz:C, 2ivz:D, 4jml:A
30 3iax:A 399 80 0.0359 0.0652 0.3250 2.1 2ivz:A, 2ivz:B, 2ivz:C, 2ivz:D, 4jml:A
31 5uw3:D 698 85 0.0318 0.0330 0.2706 0.039 5uw5:D, 5uw6:D, 5uw7:A, 5uw7:B, 5uzw:D
32 6jci:A 704 198 0.0622 0.0639 0.2273 0.060
33 5o3w:B 717 85 0.0304 0.0307 0.2588 0.082 5o3u:A, 5o3u:B, 5o3u:C, 5o3u:D, 5o3v:B, 5o3v:A, 5o3w:A, 5o3w:C, 5o3w:D, 5uw3:A, 5uw3:B, 5uw3:C, 5uw5:A, 5uw5:B, 5uw5:C, 5uw6:A, 5uw6:B, 5uw6:C, 5uzw:A, 5uzw:B, 5uzw:C
34 6can:A 616 259 0.0870 0.1023 0.2432 0.13 6can:B, 5t88:A, 5t88:B
35 6xyc:A 285 265 0.0746 0.1895 0.2038 0.20
36 7vmd:A 266 79 0.0387 0.1053 0.3544 0.32 7vme:A
37 8a2c:A 268 110 0.0470 0.1269 0.3091 0.35 8a2c:B
38 1c7i:A 483 185 0.0622 0.0932 0.2432 0.44 1qe3:A
39 4bp9:A 710 149 0.0539 0.0549 0.2617 0.56 4bp9:B, 4bp9:C, 4bp9:D, 4bp9:E, 4bp9:F
40 5dky:A 928 92 0.0331 0.0259 0.2609 0.65 5dkz:A, 5dl0:A
41 1qz3:A 309 131 0.0525 0.1230 0.2901 0.78
42 5wyj:BC 783 78 0.0318 0.0294 0.2949 0.78 5wyk:BC
43 7ajt:UM 762 78 0.0318 0.0302 0.2949 0.81 7aju:UM, 7d4i:B3, 7d5s:B3, 7d5t:B3, 7d63:B3, 6ke6:B3, 6lqp:B3, 6lqq:B3, 6lqr:B3, 6lqs:B3, 6lqt:B3, 6lqu:B3, 6lqv:B3, 7suk:LR, 6zqa:UM, 6zqb:UM, 6zqc:UM, 6zqd:UM, 6zqf:UM
44 4fnm:A 569 173 0.0511 0.0650 0.2139 0.87 5ch5:A, 5ivi:A, 5ivk:A, 4qwm:A, 5tyj:A, 5tyk:A, 5tyl:A, 5tym:A, 5tyn:A, 5tyo:A, 5typ:A, 4ubi:A, 4ubj:A, 4ubk:A, 4ubl:A, 4ubm:A, 4ubn:A, 4ubo:A, 4w1p:A, 4w1q:A, 4w1r:A, 4w1s:A
45 8b9s:A 259 134 0.0414 0.1158 0.2239 0.90 8b9s:B, 8b9s:C, 8b9s:E, 8b9s:F, 7q4h:A, 7q4h:B, 7q4j:A, 7q4j:B
46 8qd8:B 413 36 0.0180 0.0315 0.3611 1.0 8qd8:A, 8qd9:A, 8qd9:B
47 6vu9:A 631 215 0.0732 0.0840 0.2465 1.1
48 5txe:A 652 165 0.0566 0.0629 0.2485 1.1 5txe:B
49 7zaz:CCC 690 78 0.0276 0.0290 0.2564 1.3
50 4i4c:A 402 128 0.0456 0.0821 0.2578 1.3 4i4c:B
51 7zaz:AAA 727 78 0.0276 0.0275 0.2564 1.3 7zaz:BBB, 7zaz:DDD, 7zb0:A, 7zb0:B, 7zb0:C, 7zb0:D, 7zb1:A, 7zb1:B, 7zb1:C, 7zb1:D, 7zb2:CCC, 7zb2:FFF
52 3muo:A 684 152 0.0525 0.0556 0.2500 2.5 3iuq:A, 3iur:A, 3ivm:A
53 7mp4:A 534 130 0.0456 0.0618 0.2538 2.7 7mp4:B, 7mp4:C, 7mp4:D, 7mp4:E, 7mp4:F, 7mp4:G, 7mp4:H
54 5cxx:B 274 48 0.0221 0.0584 0.3333 3.9 5cxx:A, 5cxx:C
55 3fcx:B 275 43 0.0207 0.0545 0.3488 4.4 3fcx:A
56 3kez:B 448 175 0.0483 0.0781 0.2000 4.7 3kez:A
57 3a6o:A 585 29 0.0180 0.0222 0.4483 7.1 3a6o:B, 2d2o:A, 2d2o:B, 1g1y:A, 1g1y:B, 1jf5:A, 1jf5:B, 1jf6:A, 1jf6:B, 1ji2:A, 1ji2:B, 1jib:A, 1jib:B, 1jl8:A, 1jl8:B, 1vb9:A, 1vb9:B, 1vfm:A, 1vfm:B, 1vfo:A, 1vfo:B, 1vfu:A, 1vfu:B, 1wzk:A, 1wzk:B, 1wzl:A, 1wzl:B, 1wzm:A, 1wzm:B
58 7pp8:A 402 74 0.0331 0.0597 0.3243 8.3 7pp8:B, 7pp8:C, 7pp8:D, 7pp8:E, 7pp8:F, 7pp8:G, 7pp8:H, 7pu6:A, 7pu6:B, 7pu6:C, 7pu6:D, 7pu6:E, 7pu6:F, 7pu6:G, 7pu6:H
59 8pi1:B 276 244 0.0815 0.2138 0.2418 8.4 3hea:A, 3hea:B, 3hea:C, 3hea:D, 3hea:E, 3hea:F, 3hi4:A, 3hi4:B, 3hi4:C, 3hi4:D, 3hi4:E, 3hi4:F, 3ia2:A, 3ia2:B, 3ia2:C, 3ia2:D, 3ia2:E, 3ia2:F, 8pi1:A, 8pi1:C, 8pi1:D, 8pi1:E, 8pi1:F, 8pi1:G, 8pi1:H, 8pi1:I, 8pi1:J, 8pi1:K, 8pi1:M, 8pi1:N, 8pi1:O
60 1gkl:A 283 36 0.0193 0.0495 0.3889 9.0 1gkl:B, 1wb4:A, 1wb4:B, 1wb5:A, 1wb5:B, 1wb6:A, 1wb6:B
61 7c7u:A 579 40 0.0207 0.0259 0.3750 9.9 7c7r:B, 7c7r:A, 7c7u:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218