Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
AEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGIFVQLVQANSPASLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEK
ITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEINGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVV
TITIMPAFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTIPEV

The query sequence (length=193) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8blu:B 195 193 1.0000 0.9897 1.0000 1.16e-142 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
2 3jxt:A 96 87 0.1606 0.3229 0.3563 1.05e-06 3jxt:B
3 4wyu:A 201 160 0.1865 0.1791 0.2250 4.83e-06 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
4 5heb:A 119 79 0.1451 0.2353 0.3544 7.60e-06 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
5 2l4t:A 124 67 0.0984 0.1532 0.2836 9.33e-06 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
6 8b82:A 108 72 0.1295 0.2315 0.3472 4.23e-05 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
7 8b82:A 108 87 0.1088 0.1944 0.2414 1.7 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
8 2os6:A 89 82 0.1399 0.3034 0.3293 9.32e-05
9 5wou:A 95 69 0.1244 0.2526 0.3478 1.06e-04
10 8sxg:A 366 79 0.1399 0.0738 0.3418 2.95e-04 8sxe:A, 8sxe:B, 8sxf:A, 8sxh:A, 8sxh:E, 8sxh:I
11 8sxg:A 366 62 0.0984 0.0519 0.3065 2.1 8sxe:A, 8sxe:B, 8sxf:A, 8sxh:A, 8sxh:E, 8sxh:I
12 7qqn:C 414 82 0.1295 0.0604 0.3049 0.002 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
13 7qqn:C 414 56 0.1088 0.0507 0.3750 0.030 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
14 7x2e:A 163 72 0.1244 0.1472 0.3333 0.002 2kbs:A
15 2m0u:A 117 31 0.0725 0.1197 0.4516 0.003
16 2m0u:A 117 92 0.1088 0.1795 0.2283 7.1
17 7qqm:A 413 63 0.1244 0.0581 0.3810 0.005
18 2egn:A 83 77 0.1192 0.2771 0.2987 0.007
19 2egn:A 83 32 0.0777 0.1807 0.4688 0.047
20 1ihj:B 95 48 0.0829 0.1684 0.3333 0.009 1ihj:A
21 4c2c:A 433 86 0.1503 0.0670 0.3372 0.009 4c2d:A, 4c2d:B, 4c2d:C, 4c2f:A, 4c2g:A
22 3tsz:A 341 39 0.1036 0.0587 0.5128 0.013 3shw:A
23 1n7t:A 103 57 0.1088 0.2039 0.3684 0.019 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
24 6hks:B 94 85 0.1244 0.2553 0.2824 0.023 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
25 6yx0:B 112 94 0.0984 0.1696 0.2021 0.029 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
26 2m0v:A 128 90 0.1244 0.1875 0.2667 0.031
27 2m0v:A 128 70 0.1140 0.1719 0.3143 0.62
28 5f67:A 98 52 0.0881 0.1735 0.3269 0.031 5f67:B
29 1zub:A 109 51 0.0881 0.1560 0.3333 0.036
30 7w6z:A 414 46 0.0881 0.0411 0.3696 0.037 7w6y:A
31 7w6z:A 414 82 0.1295 0.0604 0.3049 3.2 7w6y:A
32 6x23:A 89 86 0.1244 0.2697 0.2791 0.039
33 6x23:A 89 52 0.0829 0.1798 0.3077 0.13
34 3ch8:A 190 57 0.1088 0.1105 0.3684 0.040 2qbw:A
35 6ezi:A 86 76 0.1192 0.2674 0.3026 0.053 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
36 6ezi:A 86 52 0.0881 0.1977 0.3269 0.75 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
37 4wsi:A 372 56 0.0984 0.0511 0.3393 0.056 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
38 2kqf:A 96 67 0.1088 0.2188 0.3134 0.059 2kyl:A
39 8tua:A 1329 138 0.1554 0.0226 0.2174 0.063 5d3x:A, 5d3x:B, 5d3y:A, 5d3y:B, 5fi0:A, 5fi0:C, 5fi0:E, 5fi0:G
40 8bv7:A 95 48 0.0881 0.1789 0.3542 0.067 8buw:A, 8buw:B
41 6q0m:B 94 80 0.1244 0.2553 0.3000 0.077
42 7p73:A 420 64 0.0984 0.0452 0.2969 0.083 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
43 2koh:A 111 51 0.0933 0.1622 0.3529 0.092 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
44 2exg:A 101 90 0.0984 0.1881 0.2111 0.096 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
45 2ejy:A 85 32 0.0674 0.1529 0.4062 0.10
46 4e34:A 87 80 0.1295 0.2874 0.3125 0.12 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
47 2r4h:C 98 57 0.0777 0.1531 0.2632 0.13
48 4ynn:A 400 28 0.0777 0.0375 0.5357 0.13 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
49 7w6x:A 447 76 0.0984 0.0425 0.2500 0.16
50 3pv3:A 392 28 0.0777 0.0383 0.5357 0.21 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
51 3gwg:A 123 76 0.0984 0.1545 0.2500 0.26 3h1e:A, 3h1g:A
52 2i0i:A 81 80 0.1295 0.3086 0.3125 0.31 2i0i:B, 2i0i:C
53 6xa7:B 96 60 0.1088 0.2188 0.3500 0.44 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
54 3cs0:A 392 59 0.0984 0.0485 0.3220 0.53 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
55 3cs0:A 392 33 0.0622 0.0306 0.3636 9.5 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
56 7d6f:A 87 82 0.1088 0.2414 0.2561 0.57
57 4ifd:A 300 73 0.0984 0.0633 0.2603 0.61 6fsz:AA
58 5ez0:D 95 59 0.0984 0.2000 0.3220 0.77 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
59 5oak:A 90 37 0.0777 0.1667 0.4054 0.89 5oak:C
60 7xf0:C 598 28 0.0777 0.0251 0.5357 1.0 7xf0:A, 7xf0:B, 7xf1:A, 7xg3:L, 7xg4:L
61 6nid:B 88 74 0.0933 0.2045 0.2432 1.3 6nid:A, 6nid:C
62 3r0h:D 199 86 0.1295 0.1256 0.2907 1.5 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
63 1rzx:A 98 56 0.0881 0.1735 0.3036 1.6 5i7z:A, 1x8s:A
64 2pdz:A 86 87 0.1140 0.2558 0.2529 1.6
65 4c9d:A 262 39 0.0674 0.0496 0.3333 1.8 4c9d:B
66 6ar4:B 87 78 0.1192 0.2644 0.2949 1.9 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
67 4gvc:A 94 73 0.1088 0.2234 0.2877 1.9 4gvd:A, 4gvd:B, 3kze:A, 3kze:B, 3kze:C, 4nxq:A, 4nxq:B, 4nxq:C, 4nxr:A
68 2kaw:A 90 49 0.0777 0.1667 0.3061 1.9 6lcb:A, 2mx6:A
69 8bp4:A 93 51 0.0881 0.1828 0.3333 2.3 8bp4:C, 8bp4:B
70 2qt5:A 194 142 0.1710 0.1701 0.2324 2.7 2qt5:B
71 2qt5:A 194 56 0.0829 0.0825 0.2857 8.0 2qt5:B
72 3c7a:A 403 57 0.0933 0.0447 0.3158 2.8 3c7c:B, 3c7d:B, 3iqd:B
73 3u24:A 546 49 0.0829 0.0293 0.3265 3.1
74 9bh5:CF 213 20 0.0570 0.0516 0.5500 3.3 9cai:CF
75 4xh7:A 110 61 0.0829 0.1455 0.2623 4.6
76 6o1e:A 431 34 0.0674 0.0302 0.3824 4.7 5ix1:B, 5ix2:A, 5ix2:B, 4qq4:A, 4qq4:B, 5svi:A, 5svi:B, 5svx:A, 5svy:A
77 1l6o:A 95 48 0.0777 0.1579 0.3125 4.9 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
78 5mmd:E 221 114 0.1606 0.1403 0.2719 5.0 5mmd:F
79 5h3z:B 1113 43 0.0829 0.0144 0.3721 5.3 5h40:A, 5h40:B, 5h41:A, 5h41:B, 5h42:A, 5h42:B
80 3bpu:A 86 55 0.0933 0.2093 0.3273 6.3
81 8j9c:A 605 130 0.1710 0.0545 0.2538 7.4 8j9c:B, 8j9c:C, 8j9c:D, 8j9d:A, 8j9d:B, 8j9d:C, 8j9d:D
82 3ca1:A 257 45 0.0881 0.0661 0.3778 7.9 3ca4:A, 3ca5:A, 3cah:A
83 4xb1:A 319 47 0.0622 0.0376 0.2553 8.9 4xb1:B, 4xb2:A, 4xb2:B
84 7pcb:A 415 76 0.1088 0.0506 0.2763 10.0 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218