BioLiP

>protein
AEIKIGITMSASGPGAALGQPQSKTVAALPKEIGGEKVTYFALDDESDPTKAAQNARKLLSEEKVDVLIGSSLTPVSLPL
IDIAAEAKTPLMTMAAAAILVAPMDERRKWVYKVVPNDDIMAEAIGKYIAKTGAKKVGYIGFSDAYGEGYYKVLAAAAPK
LGFELTTHEVYARSDASVTGQVLKIIATKPDAVFIASAGTPAVLPQKALRERGFKGAIYQTHGVATEEFIKLGGKDVEGA
IFAGEAFSGAEDMPADSPFRKVKARFVDAYKAANGGAAPTIFGVHLWDSMTLVENAIPAALKAAKPGTPEFRAAIRDQIE
KSKDLALNNGLSNMTPDNHNGYDERSAFLIEIRDGAFRLKQ

The query sequence (length=361) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4dqd:A	361	361	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	3sg0:A
2	4jb0:A	367	344	0.3712	0.3651	0.3895	4.95e-83	4eyq:A, 4fb4:A, 3tx6:A, 3uk0:A, 3ukj:A
3	3td9:A	350	362	0.2715	0.2800	0.2707	5.39e-18
4	4q6w:A	376	286	0.2050	0.1968	0.2587	4.36e-11	4q6w:B
5	4n0q:B	345	250	0.1745	0.1826	0.2520	4.80e-11	4n0q:A, 4n0q:C, 4n0q:D
6	4gnr:A	348	361	0.2327	0.2414	0.2327	1.22e-08
7	4nqr:A	364	329	0.2216	0.2198	0.2432	5.82e-08	4nqr:B, 4nv3:A, 4nv3:B, 4oat:A, 4oat:B, 4obb:A, 4obb:B, 4og2:A, 4og2:B, 4otz:A, 4otz:B, 4qym:A, 4qym:B, 4rdc:A, 4rv5:A, 4rv5:B
8	3ip5:A	348	280	0.1828	0.1897	0.2357	1.40e-07	3ip6:A, 3ip7:A, 3ip9:A, 3ipa:A, 3ipc:A
9	3i45:A	378	249	0.1801	0.1720	0.2610	1.03e-05
10	4eyg:B	364	139	0.1053	0.1044	0.2734	7.29e-04	4eyg:A
11	4mlc:A	336	168	0.1025	0.1101	0.2202	0.002	4q6b:A
12	8wch:A	396	208	0.1247	0.1136	0.2163	0.018	8wch:B
13	3i09:A	375	218	0.1440	0.1387	0.2385	0.027	3i09:B
14	3lop:A	353	193	0.1357	0.1388	0.2539	0.027
15	5c5c:A	432	90	0.0720	0.0602	0.2889	0.053
16	5k5t:A	578	199	0.1080	0.0675	0.1960	0.100
17	1z16:A	344	280	0.1662	0.1744	0.2143	0.14	1z17:A, 1z18:A
18	3mq4:A	386	86	0.0720	0.0674	0.3023	0.30
19	6e5v:B	447	110	0.0776	0.0626	0.2545	0.49	6bsz:A, 6bsz:B, 6bt5:A, 6bt5:B, 6e5v:A
20	8szh:A	835	208	0.1136	0.0491	0.1971	0.55	9asb:Q, 9asb:R, 9avg:R, 9avl:Q, 9avl:R, 9axf:R, 9ayf:R, 7dd5:A, 7dd5:B, 7e6t:B, 7e6t:A, 5fbh:B, 5fbh:A, 5fbk:A, 5fbk:B, 5k5s:A, 5k5s:B, 7m3e:A, 7m3e:B, 7m3f:A, 7m3f:B, 7m3g:A, 7m3g:B, 8szg:A, 8szh:B, 8szi:A, 8wpg:B, 8wpg:A, 8wpu:B, 8wpu:A
21	7dtv:A	779	213	0.1136	0.0526	0.1925	2.1	7dtu:A, 7dtu:B, 7dtv:B
22	8jd6:R	774	108	0.0776	0.0362	0.2593	2.2	7e9h:R, 7e9h:S, 8jd4:4, 8jd5:4, 8jd6:S
23	1usi:A	345	157	0.0997	0.1043	0.2293	2.3	1usi:C, 1usk:A, 1usk:D, 1usk:B, 1usk:C
24	8x38:A	430	90	0.0803	0.0674	0.3222	2.6
25	8szi:B	802	199	0.1080	0.0486	0.1960	3.3	9avg:Q, 9axf:Q, 9ayf:Q, 7dd6:A, 7dd6:B, 7dd7:A, 7dd7:B, 7m3j:A, 7m3j:B, 7sil:A, 7sil:B, 7sim:A, 7sim:B, 7sin:A, 7sin:B, 8szf:A, 8szf:B, 8szg:B
26	4df9:C	405	129	0.0970	0.0864	0.2713	3.6	4df9:A, 4df9:B, 4df9:D, 4df9:E, 4df9:F
27	3o0f:A	287	81	0.0693	0.0871	0.3086	8.8	3e0f:A

[Back]