BioLiP

>protein
ADVPIIDLQQDHLLIVQQITKACQDFGLFQVINHGVPEKLMVEAMEVYKEFFALPAEEKEKFQPKGEPAKFELPLEQKAK
LYVEGERRCYWKDTLAHGCYPLHEELLNSWPEKPPTYRDVIAKYSVEVRKLTMRILDYICEGLGLKLGYFDNELTQIQML
LANYYPSCPDGHYDGNLITLLQQDLVGLQQLIVKDDKWIAVEPIPTAFVVNLGLTLKVMSNEKFEGSIHRVVTHPIRNRI
SIGTLIGPDYSCTIEPIKELISQENPPLYKPYPYAEFAEIYLSDKSDYDAGVKPYKINQF

The query sequence (length=300) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6tto:A	311	311	0.9933	0.9582	0.9582	0.0	6ttm:A, 6ttn:A
2	8cvc:A	327	307	0.8633	0.7920	0.8436	0.0	8cv8:A, 8cv9:A, 8cva:A, 8cvb:A, 8cvd:A, 8cve:A, 8cvf:A, 8cvg:A, 8cvh:A
3	6lsv:A	338	290	0.3500	0.3107	0.3621	1.45e-53	6lsv:B
4	8y4u:A	298	287	0.3000	0.3020	0.3136	6.10e-38
5	1gp6:A	349	304	0.2967	0.2550	0.2928	7.49e-37	2brt:A, 1gp4:A, 1gp5:A
6	5o9w:A	356	293	0.3067	0.2584	0.3140	2.39e-35
7	7ekd:A	343	298	0.2667	0.2332	0.2685	6.76e-30
8	5gja:A	299	310	0.2900	0.2910	0.2806	4.53e-29	5gj9:A, 5gj9:B, 5gja:B, 5gja:C, 5gja:D, 5gja:E, 5gja:F, 5gja:G, 5gja:H
9	5tcv:A	299	299	0.2700	0.2709	0.2709	2.63e-28	1wa6:X
10	6ku3:B	318	317	0.2533	0.2390	0.2397	1.06e-25	6ku3:A, 6ku3:D, 6ku3:C
11	6kun:A	294	293	0.2367	0.2415	0.2423	1.29e-18	6kun:B
12	6kwa:A	267	276	0.2267	0.2547	0.2464	1.00e-15	6kwa:B, 6kwb:A, 6kwb:B
13	6xjj:A	291	269	0.2167	0.2234	0.2416	1.83e-12
14	5c3q:B	311	185	0.1567	0.1511	0.2541	4.73e-09	5c3o:A, 5c3p:D, 5c3q:C, 5c3r:B, 5c3r:C, 5c3s:B, 5c3s:C
15	8bbb:A	331	299	0.2433	0.2205	0.2441	5.37e-09	8a4g:A, 8ali:A, 8alj:A, 4bb3:A, 8bb9:A, 8bba:A, 8bbc:A, 8bbd:A, 2bjs:A, 1bk0:A, 1blz:A, 8bsv:A, 8bsw:A, 8bsx:A, 8bsy:A, 2bu9:A, 1hb1:A, 1hb2:A, 1hb3:A, 1hb4:A, 1ips:A, 1ips:B, 2ivi:B, 2ivj:A, 2jb4:A, 1obn:A, 1oc1:A, 1odm:A, 1odn:A, 7p3l:A, 8p46:A, 8p47:A, 8p48:A, 8p7o:A, 8p7p:A, 7poy:A, 7psw:A, 8ptv:A, 8py5:A, 8py6:A, 8py7:A, 8py8:A, 8py9:A, 8pya:A, 1qiq:A, 1qje:A, 1qjf:A, 1uzw:A, 2vau:A, 2vbb:A, 2vbd:A, 2vbp:A, 2vcm:A, 2ve1:A, 1w03:A, 1w04:A, 1w05:A, 1w06:A, 1w3v:A, 1w3x:A, 2wo7:A, 6y0o:A, 6y0p:A, 2y60:A, 2y6f:A, 6zae:A, 6zaf:A, 6zag:A, 6zah:A, 6zai:A, 6zaj:A, 6zak:A, 6zal:A, 6zam:A, 6zan:A, 6zao:A, 6zap:A, 6zaq:A, 3zku:A, 3zky:A, 3zoi:A, 7zoe:A, 6zw8:A
16	5c3q:A	335	185	0.1567	0.1403	0.2541	5.40e-09	5c3p:A, 5c3p:B, 5c3p:C, 5c3q:D, 5c3r:A, 5c3r:D, 5c3s:A, 5c3s:D
17	7e38:A	313	316	0.2433	0.2332	0.2310	6.57e-08	8ci9:C, 7e37:A, 7e37:B, 7e38:B
18	7v3n:A	317	148	0.1300	0.1230	0.2635	3.67e-04	8hiv:A, 7v2t:A, 7v2u:A, 7v2x:A, 7v34:A, 7v36:A, 7v3e:A, 7v3e:B, 7v3e:C, 7v3o:A
19	2ynt:A	221	121	0.1033	0.1403	0.2562	1.1	5acp:A, 5acp:B, 5acq:A, 5acq:B, 5acr:A, 5acr:B, 5acs:A, 5acs:B, 5act:A, 5act:B, 2ynt:B, 2ynt:C, 2ynv:A, 2ynv:B, 2ynw:A, 2ynw:B
20	1iru:B	233	77	0.0700	0.0901	0.2727	1.2	8bzl:O, 8bzl:A, 1iru:P
21	7w5s:A	302	50	0.0567	0.0563	0.3400	1.4	7w5t:A, 7w5v:A
22	5v2z:A	349	292	0.1967	0.1691	0.2021	1.8	6cba:A, 6cf3:A, 5lsq:A, 5lun:A, 5lun:B, 5lun:C, 5lun:D, 5mof:A, 8uc2:A, 5v2t:A, 5v2x:A, 5v2x:B, 5v2y:A, 5v31:A, 5v32:A, 5v34:A, 5vka:A, 5vkb:A, 6vp4:A, 6vp4:B, 6vp4:C, 6vp4:D, 6vp5:A, 6vp5:B, 6vp5:C, 6vp5:D
23	3hpv:A	297	77	0.0767	0.0774	0.2987	2.0	3hpv:B, 3hpv:C, 3hpv:D, 3hpy:A, 3hpy:B, 3hpy:C, 3hpy:D, 3hq0:A, 3hq0:B, 3hq0:C, 3hq0:D
24	7v7x:A	276	49	0.0567	0.0616	0.3469	2.2	7fh5:A, 7v52:A, 7v54:A, 7v56:A, 7v57:A
25	7bj4:A	406	74	0.0700	0.0517	0.2838	2.3	7bj4:B, 7bj4:C, 7bj4:D, 7bj4:E, 7bj4:F, 7bj4:G, 7bj4:H, 7bj4:I, 7bj4:J, 7bjc:A, 7bjc:B, 7bjc:C, 7bjc:D, 7bjc:E, 7bjc:F, 7bjc:G, 7bjc:H, 7bjc:I, 7bjc:J
26	8yo4:C	284	166	0.1200	0.1268	0.2169	2.4	5np6:C, 8yo4:D
27	6mg0:B	1687	59	0.0567	0.0101	0.2881	4.2
28	6mfz:A	1789	59	0.0567	0.0095	0.2881	4.2	5es7:A, 5es8:A, 5es8:B, 5es9:A, 6mfw:A, 6mfx:A, 6mfy:A, 6mg0:A, 6ulz:A

[Back]