Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
ADPAAGEKVFGKCKACHKLDGNDGVGPHLNGVVGRTVAGVDGFNYSDPMKAHGGDWTPEALQEFLTNPKAVVKGTKMAFA
GLPKIEDRANLIAYLEGQQ

The query sequence (length=99) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3m97:X 118 99 1.0000 0.8390 1.0000 1.25e-70 1c7m:A, 1i6d:A, 1i6e:A, 1ql3:A, 1ql3:B, 1ql3:C, 1ql3:D, 1ql4:A, 1ql4:B, 1ql4:C, 1ql4:D
2 8ed4:I 105 96 0.5657 0.5333 0.5833 8.74e-29 8ed4:J, 8ed4:K, 8ed4:L
3 4dy9:A 108 98 0.4747 0.4352 0.4796 2.33e-24 4ged:B
4 2yk3:A 110 98 0.4646 0.4182 0.4694 3.09e-24 2yk3:B, 2yk3:C
5 1co6:A 107 97 0.4242 0.3925 0.4330 6.12e-24 1cry:A, 1io3:A
6 2aiu:A 104 98 0.4343 0.4135 0.4388 1.04e-22
7 1akk:A 104 98 0.4343 0.4135 0.4388 1.05e-22 2b4z:A, 5c0z:A, 5c0z:D, 5c0z:B, 5c0z:C, 5c9m:A, 5c9m:D, 5c9m:B, 5c9m:C, 1crc:A, 1crc:B, 5df5:A, 5df5:B, 5df5:C, 5df5:D, 8dvx:A, 8dvx:D, 8dvx:B, 8dvx:C, 8dzl:A, 8dzl:B, 8dzl:C, 8dzl:D, 6ff5:A, 1fi7:A, 1fi9:A, 2frc:A, 1giw:A, 2giw:A, 1hrc:A, 1i5t:A, 5iy5:1, 5iy5:2, 3j2t:H, 3j2t:I, 3j2t:J, 3j2t:K, 3j2t:L, 3j2t:M, 3j2t:N, 3jbt:B, 3jbt:D, 3jbt:F, 3jbt:H, 3jbt:J, 3jbt:L, 3jbt:N, 5juy:H, 5juy:I, 5juy:J, 5juy:K, 5juy:L, 5juy:M, 5juy:N, 6k9i:A, 6k9j:A, 1lc1:A, 1lc2:A, 7ljx:A, 7ljx:B, 1m60:A, 6n1o:A, 6n1o:B, 6n1o:C, 6n1o:D, 2n3b:A, 3nbs:A, 3nbs:B, 3nbs:C, 3nbs:D, 3nbt:A, 3nbt:E, 3nbt:B, 3nbt:C, 3nbt:D, 3nbt:F, 4nfg:B, 3o1y:A, 3o1y:B, 3o1y:C, 3o20:A, 3o20:B, 3o20:C, 1ocd:A, 2pcb:B, 4rsz:A, 4rsz:B, 4rsz:C, 4rsz:D, 4rsz:E, 4rsz:F, 6suv:AaA, 6suv:BaB, 6suv:CaC, 6suv:DaD, 6suv:EaE, 6suv:FaF, 6suv:GaG, 6suv:HaH, 1u75:B, 3wc8:A, 1wej:F, 3wui:A, 5wve:B, 5wve:D, 5wve:F, 5wve:H, 5wve:J, 5wve:L, 5wve:N, 2ybb:Y, 5zkv:A
8 1qn2:A 99 96 0.4545 0.4545 0.4688 3.88e-22 1qn2:B, 1qn2:C
9 5dfs:A 104 98 0.4141 0.3942 0.4184 4.44e-22 5dfs:B, 6duj:A, 6duj:C, 6ecj:A, 6ecj:B, 6ecj:C, 6ecj:D, 6ecj:E, 6ecj:F, 6ecj:G, 6ecj:H, 5exq:A, 5exq:B, 1j3s:A, 2n3y:A, 2n9i:A, 2n9j:A, 3nwv:A, 3nwv:B, 3nwv:C, 3nwv:D, 5o10:A, 5o10:B, 5ty3:A, 5ty3:B, 6xnk:A, 6xnk:C, 6xnk:E, 6xnk:G, 3zcf:A, 3zcf:B, 3zcf:C, 3zcf:D, 3zoo:A, 3zoo:B, 3zoo:C, 3zoo:D
10 1cyc:A 103 98 0.4242 0.4078 0.4286 5.67e-22 1cyc:B, 3cyt:O, 3cyt:I, 5cyt:R, 1i54:A, 1i54:B, 1i55:A, 1i55:B, 1lfm:A, 1lfm:B
11 1ccr:A 111 98 0.4343 0.3874 0.4388 7.02e-22
12 3cxh:W 112 86 0.3737 0.3304 0.4302 1.34e-21 1yea:A, 1yeb:A, 1ytc:A
13 7tlx:1 102 99 0.3939 0.3824 0.3939 1.52e-21
14 1hro:A 105 97 0.4141 0.3905 0.4227 1.88e-20 1hro:B
15 6c4w:A 109 87 0.3434 0.3119 0.3908 2.07e-19
16 2b0z:B 108 87 0.3535 0.3241 0.4023 7.98e-18 2b10:B, 2b10:D, 2b11:B, 2b11:D, 2b12:B, 7bbt:A, 7bbt:B, 7bbt:C, 7bbt:D, 2bcn:B, 1chh:A, 1chi:A, 1chj:A, 1cie:A, 1cif:A, 1cig:A, 1cih:A, 5cib:B, 5cib:D, 5cic:B, 5cic:D, 5cid:B, 5cid:D, 5cie:B, 5cie:D, 5cif:B, 5cif:D, 5cig:B, 5cig:D, 5cih:B, 5cih:D, 1crg:A, 1crh:A, 1cri:A, 1crj:A, 1csu:A, 1csv:A, 1csw:A, 1csx:A, 1cty:A, 1ctz:A, 3cx5:W, 6egy:A, 6egy:B, 6egz:A, 6egz:B, 1fhb:A, 2gb8:B, 6gd6:A, 6gd7:A, 6gd8:A, 6gd8:C, 6gd8:B, 6gd8:D, 6gd9:A, 6gda:A, 2hv4:A, 1irv:A, 1irw:A, 2jqr:A, 2jti:B, 5kke:A, 5klu:A, 5klu:B, 5kpf:A, 5kpf:B, 1kyo:W, 5lft:A, 2lir:A, 2lit:A, 1lms:A, 5lyc:A, 5lyc:B, 2mhm:A, 7mri:A, 7mri:C, 7mri:E, 4mu8:A, 4mu8:B, 4n0k:A, 4n0k:B, 2n18:B, 2n18:C, 5ncv:A, 5ncv:B, 1nmi:A, 2orl:A, 4p4q:B, 4p4q:D, 6p41:B, 6p41:D, 6p42:B, 6p42:D, 6p43:B, 2pcc:B, 2pcc:D, 7pr2:A, 7pr2:B, 7pr3:A, 7pr3:D, 7pr3:C, 7pr3:B, 7pr4:A, 4q5p:A, 4q5p:B, 4q5p:C, 4qao:A, 4qao:B, 4qao:C, 1rap:A, 1raq:A, 6rsi:A, 6rsj:A, 6rsk:A, 6rsk:B, 6rsl:A, 6rsl:B, 1s6v:B, 1s6v:D, 6s8y:A, 6suy:A, 6suy:B, 5t7h:A, 5t7h:D, 5t7h:B, 5t7h:C, 5t8w:A, 5t8w:B, 3tyi:A, 3tyi:B, 1u74:B, 1u74:D, 6y0j:A, 6y0j:B, 6y0j:C, 6y0j:D, 1ycc:A, 2ycc:A, 4ye1:A, 4ye1:B, 1yfc:A, 1yic:A
17 1jdl:A 118 114 0.4444 0.3729 0.3860 2.72e-17
18 2c2c:A 112 108 0.4747 0.4196 0.4352 6.80e-17 3c2c:A
19 155c:A 134 114 0.4343 0.3209 0.3772 2.75e-14 1cot:A
20 6rgi:A 92 87 0.3434 0.3696 0.3908 1.21e-13
21 1fj0:A 114 112 0.4141 0.3596 0.3661 1.77e-13 1fj0:B, 1fj0:C, 1fj0:D, 1hh7:A, 1i8o:A, 1i8p:A, 1i8p:B, 1i8p:C, 1i8p:D
22 2bh4:X 121 112 0.4242 0.3471 0.3750 2.31e-13 2bgv:X, 2bh5:X
23 1c2n:A 116 83 0.3333 0.2845 0.3976 6.04e-12 1c2r:A, 1c2r:B, 1vyd:A, 1vyd:B
24 7u2v:A 114 97 0.3030 0.2632 0.3093 4.90e-10 7u2v:B
25 1cxa:A 124 116 0.3939 0.3145 0.3362 3.26e-09 1cxc:A, 2cxb:A, 2cxb:B, 1l9b:C, 1l9j:C, 1l9j:D
26 7txe:A 131 108 0.3333 0.2519 0.3056 1.65e-08 7txe:B
27 1w2l:A 97 30 0.1313 0.1340 0.4333 0.009
28 8gth:E 105 104 0.3535 0.3333 0.3365 0.013 8gth:A, 8gth:B, 8gth:C, 8gth:F, 8gth:D
29 2yev:B 319 98 0.3131 0.0972 0.3163 0.039 2yev:E
30 3uoz:A 540 70 0.2020 0.0370 0.2857 0.16 3uov:A, 3uov:B, 3uox:A, 3uox:B, 3uoy:A, 3uoy:B, 3uoz:B, 3up4:A, 3up4:B, 3up5:A, 3up5:B
31 7qcl:A 546 62 0.1717 0.0311 0.2742 0.24 7qcl:B, 7qcn:A, 7qcn:B, 7qcu:A, 7qcu:B
32 7m6j:D 273 59 0.1717 0.0623 0.2881 0.34 7m6j:C, 6n0b:C, 6n0b:A, 6n0b:B, 6n0b:D, 6n12:A, 6n12:B, 3t5d:A, 3t5d:C, 6uqq:A, 6uqq:B
33 6na4:B 448 64 0.1919 0.0424 0.2969 0.88 6na3:A, 6na3:B, 6na3:C, 6na3:D, 6na4:A, 6na4:C, 6na4:D, 6na5:A, 6na5:B, 6na5:C, 6na5:D, 6na6:A, 6na6:B, 6na6:D, 6na6:C, 6owe:A, 6owe:C, 6owe:B, 6owe:D
34 1c52:A 131 44 0.1515 0.1145 0.3409 2.2 1dt1:A, 1foc:A, 1foc:B, 2fwl:A, 1qyz:A, 1r0q:A, 3vnw:A
35 2gu2:A 307 31 0.1212 0.0391 0.3871 2.4 2gu2:B, 2q4z:B
36 6az0:C 439 63 0.1616 0.0364 0.2540 2.6 6az0:D, 6az0:A, 6az0:B, 6az0:E, 6az0:F
37 4mri:B 303 31 0.1313 0.0429 0.4194 4.0 2i3c:A, 2i3c:B, 4mri:A, 4mxu:A, 4mxu:B, 4nfr:A, 4nfr:B, 2o4h:A, 2o4h:B, 2o53:A, 2o53:B, 2q51:A, 2q51:B, 4tnu:A, 4tnu:B
38 1a2s:A 89 29 0.1414 0.1573 0.4828 4.2 1ced:A, 1ctj:A
39 1vb3:A 428 35 0.1313 0.0304 0.3714 5.0
40 5bk7:H 369 21 0.1010 0.0271 0.4762 6.2 5bk7:A, 5bk7:B, 5bk7:C, 5bk7:D, 5bk7:E, 5bk7:F, 5bk7:G, 6c8t:A, 6c8t:B, 6c8t:C, 6c92:A, 6c92:B, 6c92:C, 6c92:D, 6c9b:B, 5dj3:A, 5dj3:B, 5dj3:C, 5dj3:D
41 8uf3:A 187 26 0.1212 0.0642 0.4615 8.2 8uf3:B
42 2c1d:B 137 68 0.1717 0.1241 0.2500 8.3 2c1d:D, 2c1d:F, 2c1d:H
43 7ase:n 225 43 0.1515 0.0667 0.3488 9.4

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218