BioLiP

>protein
ADLSELLKEGTKEAHDRAENTQFVKDFLKGNIKKELFKLATTALYFTYSALEEEMERNKDHPAFAPLYFPMELHRKEALT
KDMEYFFGENWEEQVQCPKAAQKYVERIHYIGQNEPELLVAHAYTRYMGDLSGGQVLKKVAQRALKLPSTGEGTQFYLFE
NVDNAQQFKQLYRARMNALDLNMKTKERIVEEANKAFEYNMQIFNELDQ

The query sequence (length=209) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2qpp:B	219	209	0.9952	0.9498	0.9952	9.31e-156	2q32:A, 2q32:B, 2qpp:A, 2rgz:A, 2rgz:B, 5uc9:A, 5uc9:B, 5uc9:C, 5uc9:D
2	1ni6:C	223	208	0.5598	0.5247	0.5625	4.70e-89	5btq:A, 5btq:B, 3czy:A, 3czy:B, 6eha:A, 6eha:B, 3hok:A, 3hok:B, 3k4f:A, 3k4f:B, 1n3u:A, 1n3u:B, 1n45:A, 1n45:B, 1oyk:A, 1oyk:B, 1oyl:A, 1oyl:B, 1oze:A, 1oze:B, 1ozl:A, 1ozl:B, 1ozr:A, 1ozr:B, 1ozw:A, 1ozw:B, 1s13:A, 1s13:B, 1s8c:A, 1t5p:A, 1t5p:B, 3tgm:A, 3tgm:B, 1twn:A, 1twn:B, 1twr:A, 1twr:B, 4wd4:A, 4wd4:B, 4wd4:C, 4wd4:D, 1xjz:A, 1xjz:B, 1xk0:A, 1xk0:B, 1xk1:A, 1xk1:B, 1xk2:A, 1xk2:B, 1xk3:A, 1xk3:B
3	6j79:A	816	206	0.5646	0.1446	0.5728	3.54e-82	1amo:A, 1amo:B, 1b1c:A, 1dve:A, 1dvg:A, 1dvg:B, 2dy5:A, 2e7e:A, 5emn:A, 5emn:B, 3es9:A, 3es9:B, 3es9:C, 5fa6:A, 5fa6:B, 4g7l:A, 4g7p:A, 4g7t:A, 4g7u:A, 4g8p:A, 4g8u:A, 4g8w:A, 4g98:A, 4g99:A, 3i9t:A, 3i9u:A, 1ivj:A, 1ix3:A, 1ix4:A, 1j02:A, 1j2c:A, 6j79:B, 6j7a:A, 6j7a:B, 6j7i:A, 6j7i:B, 1j9z:A, 1j9z:B, 1ja0:A, 1ja0:B, 1ja1:A, 1ja1:B, 7l18:AAA, 7l18:BBB, 4mec:A, 4mec:B, 4mec:C, 4mec:D, 4mec:E, 6njr:A, 6njr:B, 3ojw:A, 3ojx:A, 3qe2:A, 3qe2:B, 3qfc:A, 3qfc:B, 3qfr:A, 3qfr:B, 1ubb:A, 1ulx:A, 5urd:A, 5urd:B, 5ure:A, 5ure:B, 5urg:A, 5urg:B, 5urh:A, 5urh:B, 5uri:A, 5uri:B, 1vgi:A, 3wkt:A, 3wkt:B, 3wkt:C, 3wkt:D, 4y7c:A, 4y7c:B, 4y9r:A, 4y9r:B, 4y9u:A, 4y9u:B, 4yaf:A, 4yaf:B, 4yal:A, 4yal:B, 4yao:A, 4yao:B, 4yau:A, 4yau:B, 4yaw:A, 4yaw:B, 2zvu:A
4	1we1:A	222	208	0.4976	0.4685	0.5000	3.36e-73	1we1:B, 1we1:C, 1we1:D
5	1wow:A	245	211	0.4402	0.3755	0.4360	6.34e-60	1wov:A, 1wov:B, 1wow:B, 1wox:A, 1wox:B
6	5kzl:A	205	207	0.4402	0.4488	0.4444	6.80e-58
7	4gpc:A	212	209	0.3397	0.3349	0.3397	3.50e-33	4gpc:B, 4gpc:C, 4gpf:A, 4gpf:B, 4gpf:C, 4gph:A, 4gph:B, 4gph:C, 3i8r:A, 3i8r:B, 3i8r:C, 1iw0:B, 1iw0:A, 1iw0:C, 1iw1:A, 1iw1:B, 1iw1:C, 3moo:A, 3moo:B, 1v8x:A, 1v8x:B, 1v8x:C, 1wnv:A, 1wnv:B, 1wnv:C, 1wnw:A, 1wnw:B, 1wnw:C, 1wnx:A, 1wnx:B, 1wzd:A, 1wzd:B, 1wzf:A, 1wzf:B, 1wzg:A, 1wzg:B, 2z68:A, 2z68:B
8	7eqh:A	212	136	0.1770	0.1745	0.2721	3.46e-06	7eqh:B
9	7cka:A	211	158	0.1770	0.1754	0.2342	1.88e-04
10	7sow:A	95	71	0.0909	0.2000	0.2676	0.19	8ey6:A, 8ey7:A, 8ey8:A, 8g90:A, 8g91:A, 7sop:A, 7soq:A, 7sor:A, 7sor:C, 7sos:A, 7sot:A, 7sou:A, 7sov:A
11	1dj2:A	429	59	0.1053	0.0513	0.3729	0.49	1dj2:B
12	3pjr:A	646	70	0.0957	0.0310	0.2857	1.0	2pjr:A, 2pjr:B, 2pjr:F, 2pjr:G, 1qhh:A, 1qhh:D
13	1qhg:A	622	70	0.0957	0.0322	0.2857	1.2
14	7qug:A	397	91	0.1148	0.0605	0.2637	2.0
15	1kru:A	201	65	0.1100	0.1144	0.3538	2.3	1kqa:A, 1kqa:B, 1kqa:C, 1krr:A, 1krr:B, 1krr:C, 1kru:B, 1kru:C, 1krv:A, 1krv:C, 1krv:B
16	8auv:H	127	48	0.0766	0.1260	0.3333	2.4	8b2l:H1, 7qix:U, 7qiz:KA
17	1dj3:A	432	59	0.0909	0.0440	0.3220	3.0	1dj3:B
18	5esw:A	190	20	0.0622	0.0684	0.6500	3.6	5esx:A, 5esx:B
19	1is2:A	637	40	0.0718	0.0235	0.3750	5.4	2ddh:A, 1is2:B
20	5yvm:A	403	112	0.1340	0.0695	0.2500	9.0	5yvr:A, 5yvs:A

[Back]