Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ADLLPEHPEFLWNNPEPKKSYDVVIVGGGGHGLATAYYLAKNHGITNVAVLEKGWLAGGNMARNTTIIRSNYLWDESAGI
YEKSLKLWEELPEELEYDFLFSQRGVLNLAHTLGDVRESIRRVEANKFNGVDAEWLTPEQVKEVCPIINTGDNIRYPVMG
ATYQPRAGIAKHDHVAWAFARKANEMGVDIIQNCEVTGFLKDGEKVTGVKTTRGTILAGKVALAGAGHSSVLAELAGFEL
PIQSHPLQALVSELFEPVHPTVVMSNHIHVYVSQAHKGELVMGAGIDSYNGYGQRGAFHVIEEQMAAAVELFPIFARAHV
LRTWGGIVDTTMDASPIISKTPIQNLYVNCGWGTGGFKGTPGAGYTLAHTIAHDEPHKLNAPFALERFETGHLIDEHGAA
AV

The query sequence (length=402) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3ad7:B 404 402 1.0000 0.9950 1.0000 0.0 3ad8:B, 3ad9:B, 3ada:B, 2gag:B, 2gah:B, 1vrq:B, 1x31:B
2 1y56:B 374 355 0.2537 0.2727 0.2873 3.78e-37
3 7cyx:A 363 379 0.2363 0.2617 0.2507 1.71e-17 7cyx:B
4 4pab:B 824 394 0.2338 0.1141 0.2386 2.48e-16 5l46:A, 5l46:B, 4p9s:A, 4p9s:B, 4paa:A, 4paa:B, 4pab:A
5 5fjm:A 447 423 0.2587 0.2327 0.2459 1.53e-12 5fjm:B, 5fjn:A, 5fjn:B
6 1zov:A 381 386 0.2338 0.2467 0.2435 4.64e-12 1zov:B
7 3if9:A 364 370 0.2239 0.2473 0.2432 1.16e-10 3if9:B, 3if9:C, 3if9:D, 1ng3:A, 1ng3:B, 1ng4:A, 1ng4:B, 1ryi:A, 1ryi:B, 1ryi:C, 1ryi:D
8 7exs:A 372 264 0.1866 0.2016 0.2841 2.79e-10
9 5i39:A 383 387 0.2264 0.2376 0.2351 3.64e-10
10 2gb0:B 389 371 0.2114 0.2185 0.2291 5.46e-10 2a89:A, 2a89:B, 3bhf:A, 3bhf:B, 3bhk:A, 3bhk:B, 1el5:A, 1el5:B, 1el7:A, 1el7:B, 1el8:A, 1el8:B, 1el9:A, 1el9:B, 1eli:A, 1eli:B, 2gb0:A, 2gf3:A, 2gf3:B, 1l9c:A, 1l9c:B, 1l9d:A, 1l9d:B, 1l9e:A, 1l9e:B, 3m0o:A, 3m0o:B, 3m12:A, 3m12:B, 3m13:A, 3m13:B, 3m13:C, 3m13:D, 3qse:A, 3qse:B, 3qsm:A, 3qsm:B, 3qss:A, 3qss:B
11 1pj6:A 828 226 0.1418 0.0688 0.2522 1.64e-07 3gsi:A, 1pj5:A, 1pj7:A
12 5hxw:A 433 245 0.1517 0.1409 0.2490 1.22e-06 5hxw:B, 5hxw:C, 5hxw:D, 5hxw:E, 5hxw:F
13 5hxw:A 433 80 0.0572 0.0531 0.2875 0.27 5hxw:B, 5hxw:C, 5hxw:D, 5hxw:E, 5hxw:F
14 4ysh:A 370 375 0.2313 0.2514 0.2480 1.50e-06 4ysh:B
15 2uzz:B 372 223 0.1493 0.1613 0.2691 8.58e-06 2uzz:A, 2uzz:C, 2uzz:D
16 3fpz:A 311 97 0.0697 0.0900 0.2887 0.004 3fpz:B, 4y4l:A, 4y4l:B, 4y4l:C, 4y4l:D
17 7koe:C 438 41 0.0547 0.0502 0.5366 0.011 7koe:G
18 3lov:A 451 43 0.0498 0.0443 0.4651 0.015
19 7d9f:A 591 47 0.0448 0.0305 0.3830 0.019 7d9f:B, 7d9g:A, 7d9g:B, 7d9h:A, 7d9h:B, 7d9i:A, 7d9i:B, 7d9j:A, 7d9j:B
20 5kow:A 474 102 0.0672 0.0570 0.2647 0.023 6c7s:A, 5kox:A
21 7rk0:B 262 137 0.1020 0.1565 0.2993 0.045 7rk0:A, 7rk0:C, 7rk0:D
22 1sez:A 465 62 0.0597 0.0516 0.3871 0.061 1sez:B
23 3cgb:A 444 253 0.1368 0.1239 0.2174 0.062 3cgb:B, 3cgc:A, 3cgc:B, 3cgd:A, 3cgd:B, 3cge:A, 3cge:B
24 1jw9:B 240 56 0.0498 0.0833 0.3571 0.064 1jwa:B, 1jwb:B
25 8c16:D 327 81 0.0547 0.0673 0.2716 0.093 8c16:A, 8c16:B, 8c16:C, 6gas:A, 6gas:B, 6gas:C, 6gas:D
26 6j38:A 368 236 0.1294 0.1413 0.2203 0.13 6j38:B, 6j39:A, 6j39:B
27 3nyc:A 381 206 0.1219 0.1286 0.2379 0.15 3nye:A, 3nyf:A, 6p9d:A, 6pld:A, 7rdf:A, 3sm8:A
28 5mh4:A 303 72 0.0672 0.0891 0.3750 0.17 5mip:A, 5miq:A, 5mir:A, 5mis:A, 5mit:A, 5mjk:A, 5mjk:B, 5mjk:C, 5mjk:D
29 1rp0:A 278 38 0.0423 0.0612 0.4474 0.20 1rp0:B
30 5uwy:A 306 97 0.0697 0.0915 0.2887 0.20
31 8uiv:A 375 144 0.0920 0.0987 0.2569 0.30 5eow:A, 8uiq:A
32 1knp:A 529 44 0.0473 0.0359 0.4318 0.31 1knr:A
33 3r9u:A 314 51 0.0522 0.0669 0.4118 0.32 3r9u:B
34 5kxj:A 481 38 0.0448 0.0374 0.4737 0.35
35 4k5r:B 491 143 0.0896 0.0733 0.2517 0.35 3fmw:A, 3fmw:B, 3fmw:C, 4k5r:A, 4k5s:A
36 2q7v:A 313 43 0.0473 0.0607 0.4419 0.43 2q7v:B
37 1o5w:C 512 76 0.0672 0.0527 0.3553 0.43 1o5w:A, 1o5w:B, 1o5w:D
38 6o9n:A 613 37 0.0423 0.0277 0.4595 0.47 6o9n:B
39 3lzw:A 329 80 0.0547 0.0669 0.2750 0.59 3lzx:A, 3lzx:B
40 1gpe:B 587 37 0.0448 0.0307 0.4865 0.84 1gpe:A
41 8bxl:B 590 51 0.0498 0.0339 0.3922 0.87 8bxl:C, 8bxl:D, 8bxl:A, 8bxl:F, 8bxl:E
42 7aaw:A 315 72 0.0622 0.0794 0.3472 1.1 7aaw:B
43 1q1w:A 422 61 0.0572 0.0545 0.3770 1.1 3lb8:A, 3lb8:B, 1q1r:A, 1q1r:B, 1q1w:B
44 3jsk:A 292 38 0.0373 0.0514 0.3947 1.1 3jsk:B, 3jsk:C, 3jsk:D, 3jsk:E, 3jsk:F, 3jsk:G, 3jsk:H, 3jsk:I, 3jsk:J, 3jsk:K, 3jsk:L, 3jsk:M, 3jsk:N, 3jsk:O, 3jsk:P
45 5ez7:A 363 142 0.0920 0.1019 0.2606 1.2
46 4uir:A 641 86 0.0647 0.0406 0.3023 1.2
47 4rgq:B 333 42 0.0473 0.0571 0.4524 1.2 4rfl:A, 4rfl:B, 4rfl:C, 4rfl:D, 4rgq:A, 4rgq:C, 4rgq:D, 4rgv:A, 4rgv:B
48 4x9m:A 384 236 0.1617 0.1693 0.2754 1.3 4x9n:A
49 5mog:B 472 28 0.0373 0.0318 0.5357 1.6 5mog:A, 5mog:C, 5mog:D, 5mog:E
50 7jyp:A 305 51 0.0522 0.0689 0.4118 1.7
51 7c4k:A 614 53 0.0373 0.0244 0.2830 1.7 7c4l:A, 7c4m:A, 7c4n:A
52 5dbj:E 437 34 0.0448 0.0412 0.5294 2.0 5dbj:A, 5dbj:B, 5dbj:C, 5dbj:D
53 5ncc:A 578 102 0.0721 0.0502 0.2843 2.0 7av4:AAA, 5ncc:B, 5ncc:C, 5ncc:D, 5ncc:E, 5ncc:F, 7r33:A, 7r33:B, 7r34:A, 7r34:B, 7r35:A, 7r35:B, 7r36:A, 7r36:B, 6yru:AAA, 6yrv:AAA, 6yrx:AAA, 6yrz:AAA, 6ys1:AAA, 6ys2:AAA, 6zh7:A, 6zh7:B
54 5ufm:A 225 30 0.0323 0.0578 0.4333 2.3 5ufm:B, 5ufn:A, 5ufn:B
55 3red:A 521 41 0.0473 0.0365 0.4634 2.3 3red:B, 3red:C, 3red:D, 3red:E, 3red:F, 3red:G, 3red:H, 3red:I, 3red:J, 3red:K, 3red:L
56 5ts5:A 483 51 0.0597 0.0497 0.4706 2.3 4e0v:A, 4e0v:B, 5ts5:B, 5ts5:C, 5ts5:D
57 8am6:AAA 547 54 0.0522 0.0384 0.3889 2.5 8am3:AAA, 8am3:BBB, 8am6:BaB, 8am8:BBB, 8am8:AAA
58 3gdn:A 521 41 0.0473 0.0365 0.4634 2.6 3gdn:B, 3gdp:A, 3gdp:B, 1ju2:A, 1ju2:B
59 4usq:F 341 23 0.0299 0.0352 0.5217 2.6 4usq:A
60 8b7s:A 458 36 0.0373 0.0328 0.4167 3.2
61 4ynt:A 570 35 0.0373 0.0263 0.4286 3.9 7vkd:A, 7vkf:A, 7vzp:A, 7vzp:B, 7vzs:A, 7vzs:B, 4ynu:A
62 4y4m:F 262 32 0.0448 0.0687 0.5625 3.9 4y4m:A, 4y4m:B, 4y4m:C, 4y4m:D, 4y4m:E, 4y4m:G, 4y4m:H
63 4bay:A 670 63 0.0572 0.0343 0.3651 4.5 3abt:A, 3abu:A, 8bop:A, 8box:A, 7cdc:A, 7cdd:A, 7cde:A, 7cdf:A, 7cdg:A, 4czz:A, 7e0g:A, 2ejr:A, 8f2z:A, 8f30:A, 8f59:A, 8f6s:A, 8fdv:A, 8fj4:A, 8fj6:A, 8fj7:A, 8fqj:A, 8fri:A, 8frq:A, 8frv:A, 8fsk:A, 9fwg:A, 5h6q:A, 5h6r:A, 2h94:A, 2hko:A, 8inl:A, 2iw5:A, 8jf5:A, 6k3e:A, 6kgk:A, 6kgl:A, 6kgm:A, 6kgn:A, 6kgo:A, 6kgp:A, 6kgq:A, 6kgr:A, 4kum:A, 5l3b:A, 5l3c:A, 5l3d:A, 5l3e:A, 5l3f:A, 5l3g:A, 5lbq:A, 5lgn:A, 5lgt:A, 5lgu:A, 5lhg:A, 5lhh:A, 5lhi:A, 6nqm:A, 6nqu:A, 6nr5:A, 8q1g:A, 8q1h:A, 8q1j:A, 6s35:A, 6te1:A, 6tuy:A, 4uv8:A, 4uv9:A, 4uva:A, 4uvb:A, 4uvc:A, 2uxn:A, 2uxx:A, 4uxn:A, 2v1d:A, 7vqs:A, 7vqt:A, 7vqu:A, 6vyp:k, 6vyp:m, 6vyp:M, 6vyp:K, 7w3l:A, 6w4k:A, 6wc6:A, 2x0l:A, 5x60:A, 2xaf:A, 2xag:A, 2xah:A, 2xaj:A, 2xaq:A, 2xas:A, 4xbf:A, 7xw8:A, 2y48:A, 5yjb:A, 8ym7:A, 2z3y:A, 2z5u:A, 3zms:A, 3zmt:A, 3zmu:A, 3zmv:A, 3zmz:A, 3zn0:A, 3zn1:A, 7zry:A
64 3ish:A 311 46 0.0423 0.0547 0.3696 4.5 3ish:B, 3ish:C, 2q0k:A, 2q0k:B, 2q0l:A, 2q0l:B
65 5k0a:D 322 34 0.0398 0.0497 0.4706 4.5 5jri:A, 5jri:B, 5k0a:A, 5k0a:B, 5k0a:C
66 2dw4:A 634 68 0.0622 0.0394 0.3676 4.5
67 3atq:A 452 35 0.0373 0.0332 0.4286 5.0 3atr:A, 4opc:A, 4opd:A, 4opd:B, 4opg:A, 4opi:A, 4opl:A, 4opt:A, 4opu:A
68 4c5o:D 333 23 0.0274 0.0330 0.4783 5.2 4a9w:A, 4a9w:B, 4c5o:A, 4c5o:B, 4c5o:C, 4c5o:E, 4c5o:F, 4c5o:G, 4c5o:H
69 3e1t:A 437 101 0.0622 0.0572 0.2475 5.3
70 1jeh:A 478 59 0.0547 0.0460 0.3729 5.4 1jeh:B, 1v59:A, 1v59:B
71 3c4n:A 359 39 0.0299 0.0334 0.3077 5.5 3c4n:B
72 5xhu:A 329 28 0.0348 0.0426 0.5000 7.0
73 4y4n:A 259 32 0.0423 0.0656 0.5312 7.1 4y4n:H, 4y4n:B, 4y4n:G, 4y4n:C, 4y4n:D, 4y4n:E, 4y4n:F
74 5j60:A 316 39 0.0398 0.0506 0.4103 7.2 5j60:D, 5j60:B, 5j60:C, 6xtf:A, 6xtf:B
75 4usr:A 357 21 0.0249 0.0280 0.4762 7.6
76 7og2:A 622 39 0.0323 0.0209 0.3333 7.6 7og2:B
77 3cty:B 305 33 0.0323 0.0426 0.3939 7.9 3cty:A
78 3hzl:A 394 77 0.0622 0.0635 0.3247 8.5 2oln:A, 2olo:A, 2q6u:A
79 7yx4:A 650 41 0.0398 0.0246 0.3902 8.7 7ptv:A, 7ptv:B, 7yx4:B, 7yx5:A
80 4rep:A 489 60 0.0473 0.0389 0.3167 9.3
81 6vld:B 469 37 0.0348 0.0299 0.3784 9.6 6tkv:A, 6tkv:B, 6vld:A, 6vlg:A, 6vlg:B, 6vlg:C, 6vlg:D, 6x5h:A, 6x5h:B, 6x5h:C, 6x5r:B, 6x5r:A, 6x5s:A, 6x5s:B, 6x5t:A, 6x5t:B, 6x5t:C, 6x5t:D, 6x5t:E, 6x5t:F, 6x5t:G, 6x5t:H, 6x5u:E, 6x5u:B, 6x5u:D, 6x5u:F, 6x5u:A, 6x5u:G, 6x5u:C, 6x5u:H
82 3kve:A 484 40 0.0473 0.0393 0.4750 9.6 3kve:B, 3kve:C, 3kve:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218