Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
ADLEDNMETLNDNLKVIEKADNAAQVKDALTKMRAAALDAQKATPPKLEDKSPDSPEMWHFRHGFDHLVGHIDDALKLAN
EGKVKEAQAAAEQLKCHCNHCHQHYR

The query sequence (length=106) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7lsj:C 106 106 0.9906 0.9906 0.9906 2.61e-74 7lsj:A, 7lsl:C, 7lsl:A, 7lsn:C, 7lsn:A
2 3u8p:A 336 106 0.9057 0.2857 0.9057 1.39e-60 3c63:A, 3c63:B, 3c63:C, 3c63:D, 8drj:A, 6dy8:A, 6dy8:B, 6dy8:D, 6dy8:C, 6dyf:A, 6dyf:B, 6dyg:A, 6dyg:B, 6dyh:A, 6dyh:D, 7lr5:C, 7lr5:A, 7lra:C, 7lra:A, 7lrb:A, 7lrb:B, 7lrr:A, 7lrr:B, 7lrv:C, 7lrv:A, 7lv1:C, 7lv1:A, 7lv4:C, 7lv4:A, 7mk4:A, 7mk4:B, 7n4f:C, 7n4f:A, 7n4g:C, 7n4g:A, 3u8p:B, 3u8p:C, 6wyu:A, 6wyu:B, 6wyu:C, 6wz0:A, 6wz0:B, 6wz0:C
3 8tb7:R 328 105 0.8774 0.2835 0.8857 1.23e-59
4 6g7o:A 350 105 0.8774 0.2657 0.8857 2.19e-59 6yxh:A
5 6kux:A 375 105 0.8774 0.2480 0.8857 4.14e-59 6kuy:A
6 5wiv:A 379 105 0.8774 0.2454 0.8857 4.57e-59 5wiu:A
7 5yc8:A 384 105 0.8774 0.2422 0.8857 5.17e-59 5zk3:A, 5zk8:A, 5zkb:A, 5zkc:A
8 9d3g:A 389 105 0.8774 0.2391 0.8857 5.84e-59
9 4pxz:A 392 105 0.8774 0.2372 0.8857 6.28e-59 4py0:A
10 6me9:B 395 105 0.8774 0.2354 0.8857 6.75e-59 6me6:B, 6me7:B, 6me8:B, 7vh0:A
11 7f83:A 396 105 0.8774 0.2348 0.8857 6.91e-59 7f83:B
12 5ung:B 410 105 0.8774 0.2268 0.8857 9.63e-59 7jni:A, 7jni:B, 6jod:A, 5unf:B
13 6lw5:A 427 105 0.8774 0.2178 0.8857 1.42e-58 6omm:R, 7t6s:R, 7t6u:R, 7t6v:R, 7wvv:R, 7wvw:R, 7wvx:R, 7wvy:R
14 4or2:B 366 104 0.8679 0.2514 0.8846 1.45e-58 4or2:A
15 5unf:A 386 95 0.8491 0.2332 0.9474 2.11e-58 5unh:A, 5unh:B
16 6rz4:A 395 105 0.8774 0.2354 0.8857 2.16e-58 6rz5:B
17 6me8:A 449 105 0.8774 0.2071 0.8857 2.32e-58 6me6:A, 6me7:A, 6me9:A
18 4n4w:A 457 105 0.8774 0.2035 0.8857 2.75e-58 4jkv:A, 4jkv:B
19 4yay:A 393 104 0.8679 0.2341 0.8846 2.81e-58 6do1:B, 6do1:A, 7f6g:A, 4zud:A
20 6iiv:A 461 105 0.8774 0.2017 0.8857 3.00e-58 1b13:A, 1b2j:A, 1b2o:A, 1b2o:B, 1be7:A, 1bfy:A, 1c09:A, 1c09:B, 1c09:C, 1fhh:A, 1fhm:A, 6iiu:A, 1irn:A, 1iro:A, 1r0h:A, 4rxn:A, 5rxn:A, 1smm:A, 1smu:A, 1smw:A, 1t9o:A, 1t9o:B, 1t9o:C, 1t9p:A, 1t9p:B, 1t9p:C, 1t9q:A
21 6ko5:A 398 104 0.8679 0.2312 0.8846 3.17e-58 7f9y:R, 7f9z:R, 7na7:R, 7na8:R, 7w2z:R
22 4n6h:A 408 104 0.8679 0.2255 0.8846 4.00e-58 8f7s:R, 8f7s:D, 6pt2:A, 6pt3:A, 4rwa:B, 4rwa:A, 4rwd:B, 4rwd:A
23 8hij:A 498 105 0.8774 0.1867 0.8857 6.37e-58 8dep:A, 8goe:A, 8gof:A, 8hik:A, 7tx6:A, 7tx7:A, 7xq0:A, 7xq1:A, 7xq2:A
24 5n2s:A 383 94 0.8396 0.2324 0.9468 8.58e-58 6d9h:R, 7ld3:R, 7ld4:R
25 6usf:A 464 106 0.8679 0.1983 0.8679 8.81e-58 6cnj:A, 6cnj:D, 6cnk:A, 6cnk:B, 6cnk:D, 5kxi:A, 5kxi:D, 6ur8:A, 6ur8:D, 6usf:D
26 5dhh:B 387 103 0.8585 0.2351 0.8835 2.14e-57 5dhg:A, 5dhg:B, 5dhh:A, 4ea3:A, 4ea3:B, 8f7x:R
27 5ndd:A 567 105 0.8774 0.1640 0.8857 2.21e-57 5awi:A, 5awi:B, 2bc5:A, 2bc5:B, 2bc5:C, 2bc5:D, 3c62:A, 3c62:B, 3c62:C, 3c62:D, 3de8:A, 3de8:D, 3de8:B, 3de8:C, 3de9:A, 8drd:A, 8drd:B, 8drf:A, 8drj:C, 8drl:A, 8drm:A, 6dy4:D, 6dy4:A, 6dy6:A, 6dy6:B, 6dyb:A, 6dyb:C, 6dyc:A, 6dyc:B, 6dyd:A, 6dyd:C, 6dye:A, 6dye:B, 6dyi:B, 6dyj:A, 6dyj:E, 6dyj:C, 6dyj:G, 6dyk:A, 6dyk:E, 6dyk:C, 6dyk:G, 6dyl:A, 6dyl:E, 6dyl:C, 6dyl:G, 3foo:A, 3foo:B, 3foo:C, 3foo:D, 3foo:E, 3foo:F, 3foo:G, 3foo:H, 3foo:I, 3foo:J, 3foo:L, 3foo:K, 3fop:A, 3fop:B, 3l1m:A, 5ndz:A, 3nmi:A, 3nmi:B, 3nmi:C, 3nmi:D, 3nmi:E, 3nmi:F, 3nmj:A, 3nmj:C, 3nmj:B, 3nmj:D, 3nmk:A, 3nmk:C, 3nmk:B, 3nmk:D, 2qla:A, 2qla:B, 2qla:C, 2qla:D, 6wza:A, 6wza:B, 6wza:C, 6x8x:A
28 6ai5:A 106 106 0.8491 0.8491 0.8491 2.95e-53 6ai5:C, 6ai5:E, 6ai5:G, 7dcl:A, 7dcl:B, 6dhz:C, 6dhz:D, 3hni:A, 3hni:B, 3hni:C, 3hni:D, 3hni:E, 3hni:F, 3hni:G, 3hni:H, 3hnj:A, 3hnj:B, 3hnj:C, 3hnj:D, 3hnk:A, 3hnk:B, 3hnl:A, 3hnl:B, 3iq5:A, 3iq5:B, 3iq5:C, 3iq5:D, 3iq6:A, 3iq6:B, 3iq6:C, 3iq6:D, 3iq6:E, 3iq6:F, 3iq6:G, 3iq6:H, 4je9:A, 4je9:B, 4jea:A, 4jea:B, 4jea:C, 4jea:D, 4jeb:A, 4jeb:B, 5l31:A, 5l31:B, 5l31:C, 5l31:D, 5l32:A, 5l32:C, 5l32:D, 5l32:B, 6lde:A, 6lde:C, 6ldf:A, 6ldf:C, 6ldg:A, 6ldg:C, 3m15:A, 3m15:B, 3m15:C, 3m4b:A, 3m4b:B, 3m4b:D, 3m4b:C, 3m4c:A, 3m4c:B, 3m4c:D, 3m4c:C, 3m79:A, 3m79:B, 3m79:C, 3m79:D, 3m79:E, 3m79:F, 3m79:G, 3m79:H, 3qvy:A, 3qvy:B, 3qvy:C, 3qvy:D, 3qvz:A, 3qvz:B, 3qvz:D, 3qvz:C, 3qw0:A, 3qw0:B, 3qw0:C, 3qw0:D, 3qw1:A, 3qw1:B, 3qw1:C, 3qw1:D, 7rwu:A, 7rwv:A, 7rwv:B, 7rwv:C, 7rwv:D, 7rww:A, 7rww:B, 7rww:C, 7rww:D, 7rwx:A, 7rwx:B, 7rwy:A, 7rwy:B, 7rwy:C, 7rwy:F, 7rwy:D, 7rwy:E, 7su2:D, 7su2:A, 7su2:C, 7su2:G, 7tep:A, 7tep:C, 7tep:B, 7tep:D, 4u9d:A, 4u9d:C, 4u9d:B, 4u9d:D, 5xzi:A, 5xzj:A, 5xzj:B, 5xzj:C, 5xzj:D
29 6ot4:A 106 106 0.7736 0.7736 0.7736 1.42e-51 6ot4:B, 6ot4:D, 6ot4:C, 6ot7:D, 6ot7:C, 6ot7:A, 6ot7:B, 6ot8:A, 6ot9:C, 6ot9:A, 6ot9:D, 6ot9:B, 6ovh:A, 6ovh:B, 6ovh:C, 6ovh:L, 6ovh:D, 6ovh:G, 6ovh:E, 6ovh:F, 6ovh:H, 6ovh:K, 6ovh:I, 6ovh:J
30 5bu7:A 106 106 0.8302 0.8302 0.8302 1.95e-51 5bu7:B, 6dhy:A, 6dhy:B, 6dhy:C, 6dhy:D, 6dhz:A, 6dhz:B, 3tol:A, 3tol:C, 3tol:D, 3tol:B, 3tom:A, 3tom:B, 3tom:C, 3tom:D
31 5tvn:A 393 105 0.8208 0.2214 0.8286 2.70e-51 6drx:A, 6dry:A, 6drz:A, 6ds0:A, 4ib4:A, 4nc3:A, 5tud:A, 5tud:D
32 8del:A 106 106 0.7830 0.7830 0.7830 1.45e-50 8del:B, 8del:C, 6wz1:A, 6wz1:C, 6wz1:B, 6wz2:A, 6wz2:B, 6wz2:C, 6wz3:A, 6wz3:B, 6wz3:C, 6wz7:A, 6wz7:B, 6wz7:C, 6wzc:A, 6x7e:A, 6x7e:B, 6x7e:C
33 4ntj:A 369 105 0.8019 0.2304 0.8095 1.15e-49 7pp1:AAA
34 6d35:A 581 105 0.8208 0.1497 0.8286 1.79e-49 6d32:A, 5kzv:A, 5kzy:A, 5kzy:B, 5kzz:A, 1lm3:B, 1lm3:D, 1qq3:A
35 7zi0:A 593 105 0.8113 0.1450 0.8190 4.20e-49 256b:A, 256b:B, 5l7d:A, 5l7i:A, 5l7i:B, 4o9r:A, 4qim:A, 4qin:A, 1qpu:A, 7zi0:B
36 5k2a:A 398 105 0.7925 0.2111 0.8000 1.17e-48 8a2o:A, 8a2p:A, 6aqf:A, 7aro:A, 8c9w:A, 8cic:A, 8cu6:A, 8cu7:A, 8du3:A, 4eiy:A, 7ezc:A, 7ezc:B, 8fyn:A, 8gne:A, 6gt3:A, 5iu4:A, 5iu7:A, 5iu8:A, 5iua:A, 5iub:A, 5jtb:A, 6jzh:A, 5k2b:A, 5k2c:A, 5k2d:A, 6lpj:A, 6lpk:A, 6lpl:A, 6mh8:A, 5mzj:A, 5mzp:A, 5n2r:A, 5nlx:A, 5nm2:A, 5nm4:A, 5olg:A, 5olh:A, 5olo:A, 5olv:A, 5olz:A, 5om1:A, 5om4:A, 6ps7:A, 8pwn:A, 7px4:A, 7pyr:A, 8rln:A, 7rm5:A, 8rqq:A, 6s0l:A, 6s0q:A, 7t32:A, 5uig:A, 5uvi:A, 5vra:A, 6wqa:A, 6zdr:A, 6zdv:A
37 6rz8:A 366 105 0.7925 0.2295 0.8000 2.15e-48 6rz6:A, 6rz7:A, 6rz9:A
38 9d3e:A 360 105 0.7925 0.2333 0.8000 3.39e-48
39 6os0:A 395 94 0.7547 0.2025 0.8511 1.83e-47 6os1:A, 6os2:A, 8th3:A, 8th4:A
40 7tuy:R 371 105 0.7736 0.2210 0.7810 4.09e-46
41 8jj8:F 375 105 0.7736 0.2187 0.7810 4.46e-46 8jjl:A, 8jjo:F
42 8xvj:R 397 105 0.7642 0.2040 0.7714 9.23e-46 8xvk:R, 8xvl:R
43 6m97:A 208 105 0.7642 0.3894 0.7714 3.11e-45
44 5xjm:A 375 105 0.7547 0.2133 0.7619 1.50e-44 7c6a:A
45 6bqg:A 378 105 0.7453 0.2090 0.7524 5.42e-43
46 7yxa:A 375 95 0.7264 0.2053 0.8105 5.80e-43 7yxa:B
47 4z34:A 385 105 0.7453 0.2052 0.7524 6.21e-43 4z35:A, 4z36:A
48 6c1q:B 374 104 0.7358 0.2086 0.7500 8.71e-43 6c1r:B, 5o9h:A, 5o9h:B, 7y65:D, 7y66:D, 7y67:D
49 6iql:A 341 105 0.7358 0.2287 0.7429 1.12e-42 6iql:B
50 6wh4:A 378 76 0.6321 0.1772 0.8816 2.78e-39 6a93:A, 6a94:A, 7wc4:A, 6wgt:A, 6wgt:C, 6wh4:C, 8zmg:A, 8zmg:B
51 4u9e:A 91 106 0.6981 0.8132 0.6981 4.32e-39
52 6rz5:A 369 105 0.6698 0.1924 0.6762 2.07e-36
53 7wc5:A 363 105 0.6604 0.1928 0.6667 2.33e-34 6a93:B, 6a94:B, 8jt8:A, 7vod:A, 7voe:A, 7wc6:A, 7wc7:A, 7wc8:A, 7wc9:A, 6wgt:B, 6wh4:B
54 7dfp:A 335 103 0.6509 0.2060 0.6699 5.91e-34
55 5v54:B 383 105 0.6509 0.1802 0.6571 7.28e-34 7c61:A, 4iaq:A, 4iar:A, 5v54:A
56 5uen:A 384 105 0.6226 0.1719 0.6286 1.46e-30 5uen:B
57 8sji:C 114 105 0.6321 0.5877 0.6381 1.89e-29 8sjh:A, 8sji:A
58 6pt2:B 361 80 0.5189 0.1524 0.6875 1.20e-24 6pt3:B
59 6bqh:A 351 68 0.4340 0.1311 0.6765 1.83e-18 8zmf:A
60 7bi2:A 1021 31 0.1509 0.0157 0.5161 0.44
61 5msd:A 636 55 0.1698 0.0283 0.3273 1.4 5msc:A, 5msq:A
62 5kz7:A 296 41 0.1321 0.0473 0.3415 1.7 5kz7:B
63 3iuu:A 494 38 0.1132 0.0243 0.3158 4.1
64 3iec:B 313 41 0.1321 0.0447 0.3415 4.4 5eak:A, 5eak:B, 3iec:A, 3iec:C, 3iec:D, 5kz8:A, 5kz8:B, 8txy:A, 8txy:B
65 5es1:A 304 39 0.1321 0.0461 0.3590 5.9
66 3j92:v 136 23 0.1038 0.0809 0.4783 6.5
67 8z8x:C 400 50 0.1132 0.0300 0.2400 7.1
68 5a8m:A 337 29 0.1132 0.0356 0.4138 7.1 5a8m:B, 5a8m:C, 5a8n:A, 5a8o:A, 5a8p:A, 5a8q:A, 5a94:A, 5a94:B, 5a94:C, 5a94:D, 5a94:E, 5a94:F, 5a95:A, 5a95:B, 5a95:C
69 8aaf:p 233 56 0.1415 0.0644 0.2679 7.3 8agt:p, 8agu:p, 8agv:p, 8agw:p, 8agx:p, 8agz:p, 5apn:G, 5apo:G, 7azy:b, 7b7d:LJ, 8bip:LG, 8bjq:LG, 8bn3:L8, 8bqd:AA, 8bqx:AA, 7bt6:G, 7btb:G, 6c0f:G, 6cb1:G, 8ccs:KK, 8cdl:KK, 8cdr:KK, 8ceh:KK, 8cf5:KK, 8cg8:KK, 8cgn:KK, 8civ:KK, 8cku:KK, 8cmj:KK, 5dat:L8, 5dat:l8, 5dc3:L8, 5dc3:l8, 5dge:L8, 5dge:l8, 5dgf:L8, 5dgf:l8, 5dgv:L8, 5dgv:l8, 8e5t:G, 6elz:G, 6em1:G, 6em3:G, 6em4:G, 6em5:G, 8eub:AG, 8evp:AG, 8evq:AG, 8evr:AG, 8evs:AG, 8evt:AG, 8ewb:AG, 8ewc:AG, 5fci:L8, 5fci:l8, 5fcj:L8, 5fcj:l8, 6ft6:G, 5gak:K, 6gq1:G, 6gqb:G, 6gqv:G, 5h4p:G, 6hd7:K, 8hfr:Hj, 6hhq:p, 6hhq:CJ, 5i4l:L8, 5i4l:l8, 6i7o:AA, 6i7o:XA, 3j6x:L8, 3j6y:L8, 3j77:L8, 3j78:L8, 3jct:G, 5jcs:G, 5juo:L, 5jup:L, 5jus:L, 5jut:L, 5juu:L, 8k2d:LG, 8k82:LG, 5lyb:L8, 5lyb:l8, 5m1j:G5, 6m62:G, 5mc6:AA, 5mei:p, 5mei:CJ, 7mpi:AG, 7mpj:AG, 6n8j:G, 6n8k:G, 6n8l:G, 6n8m:J, 6n8n:J, 6n8o:J, 7n8b:AG, 7nac:G, 5ndg:L8, 5ndg:l8, 5ndv:L8, 5ndv:l8, 5ndw:L8, 5ndw:l8, 7nrc:LJ, 7nrd:LJ, 5obm:L8, 5obm:l8, 7of1:G, 7oh3:G, 7ohp:G, 7ohq:G, 7ohr:G, 7ohs:G, 7ohu:G, 7ohv:G, 7ohw:G, 7ohx:G, 7ohy:G, 6oig:G, 5on6:p, 5on6:CJ, 7osa:eL8, 7osm:eL8, 8p8m:LL, 8p8n:LL, 8p8u:LL, 8pfr:LL, 6q8y:AA, 6qik:H, 6qt0:H, 6qtz:H, 7r6q:G, 7r7a:G, 6r84:K, 6r86:K, 6r87:K, 6ri5:H, 7rr5:LG, 6rzz:H, 6s05:H, 6s47:AJ, 6snt:n, 6sv4:AA, 6sv4:XA, 6sv4:zA, 6t4q:LG, 5t62:J, 5t6r:J, 6t7i:LG, 6t7t:LG, 6t83:Gy, 6t83:Ja, 5tbw:p, 5tbw:CJ, 6tb3:AA, 5tga:L8, 5tga:l8, 5tgm:L8, 5tgm:l8, 6tnu:AA, 7too:AL08, 7top:AL08, 7u0h:G, 4u3m:L8, 4u3m:l8, 4u3n:L8, 4u3n:l8, 4u3u:L8, 4u3u:l8, 4u4n:L8, 4u4n:l8, 4u4o:L8, 4u4o:l8, 4u4q:L8, 4u4q:l8, 4u4r:L8, 4u4r:l8, 4u4u:L8, 4u4u:l8, 4u4y:L8, 4u4y:l8, 4u4z:L8, 4u4z:l8, 4u50:L8, 4u50:l8, 4u51:L8, 4u51:l8, 4u52:L8, 4u52:l8, 4u53:L8, 4u53:l8, 4u55:L8, 4u55:l8, 4u56:L8, 4u56:l8, 4u6f:L8, 4u6f:l8, 7ug6:G, 7uoo:G, 7uqb:G, 7uqz:G, 7v08:G, 4v4b:BG, 4v6i:BH, 4v7h:BG, 4v7r:BH, 4v7r:DH, 4v88:BG, 4v88:DG, 4v8t:G, 4v8y:BG, 4v8z:BG, 8v83:G, 8v84:G, 8v87:G, 4v91:G, 6woo:G, 6xiq:G, 6xir:G, 8y0u:LG, 6ylg:G, 6ylh:G, 6ylx:G, 6yly:G, 5z3g:K, 7z34:G, 6z6j:LG, 6z6k:LG, 7zpq:BG, 7zrs:BG, 7zs5:BI, 7zuw:BG, 7zux:EG, 7zw0:LK
70 8z9h:C 748 50 0.1132 0.0160 0.2400 7.6 8z90:C, 8z9r:C
71 8z97:C 552 50 0.1132 0.0217 0.2400 7.6
72 7p1l:A 301 39 0.1226 0.0432 0.3333 8.3 7p1l:B
73 5t62:W 306 40 0.0943 0.0327 0.2500 9.3

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218