Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ADLEDNMETLNDNLKVIEKADNAAQVKDALTKMRAAALDAQKATPPKLEDKSPDSPEMWHFRAGFDHLVGHIDDALKLAN
EGKVKEAQAAAEQLKCHCNHCHQHYR

The query sequence (length=106) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7lsj:C 106 106 1.0000 1.0000 1.0000 2.04e-75 7lsj:A, 7lsl:C, 7lsl:A, 7lsn:C, 7lsn:A
2 3u8p:A 336 106 0.8962 0.2827 0.8962 5.88e-59 3c63:A, 3c63:B, 3c63:C, 3c63:D, 8drj:A, 6dy8:A, 6dy8:B, 6dy8:D, 6dy8:C, 6dyf:A, 6dyf:B, 6dyg:A, 6dyg:B, 6dyh:A, 6dyh:D, 7lr5:C, 7lr5:A, 7lra:C, 7lra:A, 7lrb:A, 7lrb:B, 7lrr:A, 7lrr:B, 7lrv:C, 7lrv:A, 7lv1:C, 7lv1:A, 7lv4:C, 7lv4:A, 7mk4:A, 7mk4:B, 7n4f:C, 7n4f:A, 7n4g:C, 7n4g:A, 3u8p:B, 3u8p:C, 6wyu:A, 6wyu:B, 6wyu:C, 6wz0:A, 6wz0:B, 6wz0:C
3 8tb7:R 328 105 0.8679 0.2805 0.8762 3.89e-58
4 6g7o:A 350 105 0.8679 0.2629 0.8762 6.90e-58 6yxh:A
5 6kux:A 375 105 0.8679 0.2453 0.8762 1.29e-57 6kuy:A
6 5yc8:A 384 105 0.8679 0.2396 0.8762 1.61e-57 5zk3:A, 5zk8:A, 5zkb:A, 5zkc:A
7 9d3g:A 389 105 0.8679 0.2365 0.8762 1.81e-57
8 5wiv:A 379 105 0.8679 0.2427 0.8762 1.90e-57 5wiu:A
9 4pxz:A 392 105 0.8679 0.2347 0.8762 1.95e-57 4py0:A
10 6me9:B 395 105 0.8679 0.2329 0.8762 2.09e-57 6me6:B, 6me7:B, 6me8:B, 7vh0:A
11 7f83:A 396 105 0.8679 0.2323 0.8762 2.14e-57 7f83:B
12 5ung:B 410 105 0.8679 0.2244 0.8762 2.96e-57 7jni:A, 7jni:B, 6jod:A, 5unf:B
13 6lw5:A 427 105 0.8679 0.2155 0.8762 4.35e-57 6omm:R, 7t6s:R, 7t6u:R, 7t6v:R, 7wvv:R, 7wvw:R, 7wvx:R, 7wvy:R
14 4or2:B 366 104 0.8585 0.2486 0.8750 4.53e-57 4or2:A
15 6rz4:A 395 105 0.8679 0.2329 0.8762 5.87e-57 6rz5:B
16 5unf:A 386 95 0.8396 0.2306 0.9368 6.54e-57 5unh:A, 5unh:B
17 6me8:A 449 105 0.8679 0.2049 0.8762 7.02e-57 6me6:A, 6me7:A, 6me9:A
18 4n4w:A 457 105 0.8679 0.2013 0.8762 8.31e-57 4jkv:A, 4jkv:B
19 4yay:A 393 104 0.8585 0.2316 0.8750 8.70e-57 6do1:B, 6do1:A, 7f6g:A, 4zud:A
20 6iiv:A 461 105 0.8679 0.1996 0.8762 9.03e-57 1b13:A, 1b2j:A, 1b2o:A, 1b2o:B, 1be7:A, 1bfy:A, 1c09:A, 1c09:B, 1c09:C, 1fhh:A, 1fhm:A, 6iiu:A, 1irn:A, 1iro:A, 1r0h:A, 4rxn:A, 5rxn:A, 1smm:A, 1smu:A, 1smw:A, 1t9o:A, 1t9o:B, 1t9o:C, 1t9p:A, 1t9p:B, 1t9p:C, 1t9q:A
21 6ko5:A 398 104 0.8585 0.2286 0.8750 9.78e-57 7f9y:R, 7f9z:R, 7na7:R, 7na8:R, 7w2z:R
22 4n6h:A 408 104 0.8585 0.2230 0.8750 1.23e-56 8f7s:R, 8f7s:D, 6pt2:A, 6pt3:A, 4rwa:B, 4rwa:A, 4rwd:B, 4rwd:A
23 8hij:A 498 105 0.8679 0.1847 0.8762 1.89e-56 8dep:A, 8goe:A, 8gof:A, 8hik:A, 7tx6:A, 7tx7:A, 7xq0:A, 7xq1:A, 7xq2:A
24 6usf:A 464 106 0.8585 0.1961 0.8585 2.65e-56 6cnj:A, 6cnj:D, 6cnk:A, 6cnk:B, 6cnk:D, 5kxi:A, 5kxi:D, 6ur8:A, 6ur8:D, 6usf:D
25 5n2s:A 383 94 0.8302 0.2298 0.9362 2.66e-56 6d9h:R, 7ld3:R, 7ld4:R
26 5ndd:A 567 105 0.8679 0.1623 0.8762 6.33e-56 5awi:A, 5awi:B, 2bc5:A, 2bc5:B, 2bc5:C, 2bc5:D, 3c62:A, 3c62:B, 3c62:C, 3c62:D, 3de8:A, 3de8:D, 3de8:B, 3de8:C, 3de9:A, 8drd:A, 8drd:B, 8drf:A, 8drj:C, 8drl:A, 8drm:A, 6dy4:D, 6dy4:A, 6dy6:A, 6dy6:B, 6dyb:A, 6dyb:C, 6dyc:A, 6dyc:B, 6dyd:A, 6dyd:C, 6dye:A, 6dye:B, 6dyi:B, 6dyj:A, 6dyj:E, 6dyj:C, 6dyj:G, 6dyk:A, 6dyk:E, 6dyk:C, 6dyk:G, 6dyl:A, 6dyl:E, 6dyl:C, 6dyl:G, 3foo:A, 3foo:B, 3foo:C, 3foo:D, 3foo:E, 3foo:F, 3foo:G, 3foo:H, 3foo:I, 3foo:J, 3foo:L, 3foo:K, 3fop:A, 3fop:B, 3l1m:A, 5ndz:A, 3nmi:A, 3nmi:B, 3nmi:C, 3nmi:D, 3nmi:E, 3nmi:F, 3nmj:A, 3nmj:C, 3nmj:B, 3nmj:D, 3nmk:A, 3nmk:C, 3nmk:B, 3nmk:D, 2qla:A, 2qla:B, 2qla:C, 2qla:D, 6wza:A, 6wza:B, 6wza:C, 6x8x:A
27 5dhh:B 387 103 0.8491 0.2326 0.8738 6.63e-56 5dhg:A, 5dhg:B, 5dhh:A, 4ea3:A, 4ea3:B, 8f7x:R
28 6ai5:A 106 106 0.8396 0.8396 0.8396 4.79e-52 6ai5:C, 6ai5:E, 6ai5:G, 7dcl:A, 7dcl:B, 6dhz:C, 6dhz:D, 3hni:A, 3hni:B, 3hni:C, 3hni:D, 3hni:E, 3hni:F, 3hni:G, 3hni:H, 3hnj:A, 3hnj:B, 3hnj:C, 3hnj:D, 3hnk:A, 3hnk:B, 3hnl:A, 3hnl:B, 3iq5:A, 3iq5:B, 3iq5:C, 3iq5:D, 3iq6:A, 3iq6:B, 3iq6:C, 3iq6:D, 3iq6:E, 3iq6:F, 3iq6:G, 3iq6:H, 4je9:A, 4je9:B, 4jea:A, 4jea:B, 4jea:C, 4jea:D, 4jeb:A, 4jeb:B, 5l31:A, 5l31:B, 5l31:C, 5l31:D, 5l32:A, 5l32:C, 5l32:D, 5l32:B, 6lde:A, 6lde:C, 6ldf:A, 6ldf:C, 6ldg:A, 6ldg:C, 3m15:A, 3m15:B, 3m15:C, 3m4b:A, 3m4b:B, 3m4b:D, 3m4b:C, 3m4c:A, 3m4c:B, 3m4c:D, 3m4c:C, 3m79:A, 3m79:B, 3m79:C, 3m79:D, 3m79:E, 3m79:F, 3m79:G, 3m79:H, 3qvy:A, 3qvy:B, 3qvy:C, 3qvy:D, 3qvz:A, 3qvz:B, 3qvz:D, 3qvz:C, 3qw0:A, 3qw0:B, 3qw0:C, 3qw0:D, 3qw1:A, 3qw1:B, 3qw1:C, 3qw1:D, 7rwu:A, 7rwv:A, 7rwv:B, 7rwv:C, 7rwv:D, 7rww:A, 7rww:B, 7rww:C, 7rww:D, 7rwx:A, 7rwx:B, 7rwy:A, 7rwy:B, 7rwy:C, 7rwy:F, 7rwy:D, 7rwy:E, 7su2:D, 7su2:A, 7su2:C, 7su2:G, 7tep:A, 7tep:C, 7tep:B, 7tep:D, 4u9d:A, 4u9d:C, 4u9d:B, 4u9d:D, 5xzi:A, 5xzj:A, 5xzj:B, 5xzj:C, 5xzj:D
29 6ot4:A 106 106 0.7736 0.7736 0.7736 9.14e-52 6ot4:B, 6ot4:D, 6ot4:C, 6ot7:D, 6ot7:C, 6ot7:A, 6ot7:B, 6ot8:A, 6ot9:C, 6ot9:A, 6ot9:D, 6ot9:B, 6ovh:A, 6ovh:B, 6ovh:C, 6ovh:L, 6ovh:D, 6ovh:G, 6ovh:E, 6ovh:F, 6ovh:H, 6ovh:K, 6ovh:I, 6ovh:J
30 8del:A 106 106 0.7830 0.7830 0.7830 6.73e-51 8del:B, 8del:C, 6wz1:A, 6wz1:C, 6wz1:B, 6wz2:A, 6wz2:B, 6wz2:C, 6wz3:A, 6wz3:B, 6wz3:C, 6wz7:A, 6wz7:B, 6wz7:C, 6wzc:A, 6x7e:A, 6x7e:B, 6x7e:C
31 5bu7:A 106 106 0.8208 0.8208 0.8208 5.29e-50 5bu7:B, 6dhy:A, 6dhy:B, 6dhy:C, 6dhy:D, 6dhz:A, 6dhz:B, 3tol:A, 3tol:C, 3tol:D, 3tol:B, 3tom:A, 3tom:B, 3tom:C, 3tom:D
32 5tvn:A 393 105 0.8113 0.2188 0.8190 8.21e-50 6drx:A, 6dry:A, 6drz:A, 6ds0:A, 4ib4:A, 4nc3:A, 5tud:A, 5tud:D
33 4ntj:A 369 105 0.7925 0.2276 0.8000 3.53e-48 7pp1:AAA
34 6d35:A 581 105 0.8113 0.1480 0.8190 4.88e-48 6d32:A, 5kzv:A, 5kzy:A, 5kzy:B, 5kzz:A, 1lm3:B, 1lm3:D, 1qq3:A
35 7zi0:A 593 105 0.8019 0.1433 0.8095 1.14e-47 256b:A, 256b:B, 5l7d:A, 5l7i:A, 5l7i:B, 4o9r:A, 4qim:A, 4qin:A, 1qpu:A, 7zi0:B
36 5k2a:A 398 105 0.7830 0.2085 0.7905 3.53e-47 8a2o:A, 8a2p:A, 6aqf:A, 7aro:A, 8c9w:A, 8cic:A, 8cu6:A, 8cu7:A, 8du3:A, 4eiy:A, 7ezc:A, 7ezc:B, 8fyn:A, 8gne:A, 6gt3:A, 5iu4:A, 5iu7:A, 5iu8:A, 5iua:A, 5iub:A, 5jtb:A, 6jzh:A, 5k2b:A, 5k2c:A, 5k2d:A, 6lpj:A, 6lpk:A, 6lpl:A, 6mh8:A, 5mzj:A, 5mzp:A, 5n2r:A, 5nlx:A, 5nm2:A, 5nm4:A, 5olg:A, 5olh:A, 5olo:A, 5olv:A, 5olz:A, 5om1:A, 5om4:A, 6ps7:A, 8pwn:A, 7px4:A, 7pyr:A, 8rln:A, 7rm5:A, 8rqq:A, 6s0l:A, 6s0q:A, 7t32:A, 5uig:A, 5uvi:A, 5vra:A, 6wqa:A, 6zdr:A, 6zdv:A
37 6rz8:A 366 105 0.7830 0.2268 0.7905 6.56e-47 6rz6:A, 6rz7:A, 6rz9:A
38 9d3e:A 360 105 0.7830 0.2306 0.7905 1.04e-46
39 6os0:A 395 94 0.7453 0.2000 0.8404 5.49e-46 6os1:A, 6os2:A, 8th3:A, 8th4:A
40 7tuy:R 371 105 0.7642 0.2183 0.7714 1.24e-44
41 8jj8:F 375 105 0.7642 0.2160 0.7714 1.34e-44 8jjl:A, 8jjo:F
42 8xvj:R 397 105 0.7547 0.2015 0.7619 2.75e-44 8xvk:R, 8xvl:R
43 6m97:A 208 105 0.7547 0.3846 0.7619 2.32e-43
44 5xjm:A 375 105 0.7453 0.2107 0.7524 4.49e-43 7c6a:A
45 6bqg:A 378 105 0.7358 0.2063 0.7429 1.61e-41
46 4z34:A 385 105 0.7358 0.2026 0.7429 1.84e-41 4z35:A, 4z36:A
47 6c1q:B 374 104 0.7264 0.2059 0.7404 2.60e-41 6c1r:B, 5o9h:A, 5o9h:B, 7y65:D, 7y66:D, 7y67:D
48 6iql:A 341 105 0.7264 0.2258 0.7333 3.41e-41 6iql:B
49 7yxa:A 375 95 0.7170 0.2027 0.8000 5.75e-41 7yxa:B
50 6wh4:A 378 76 0.6226 0.1746 0.8684 8.13e-38 6a93:A, 6a94:A, 7wc4:A, 6wgt:A, 6wgt:C, 6wh4:C, 8zmg:A, 8zmg:B
51 4u9e:A 91 106 0.6887 0.8022 0.6887 8.52e-38
52 6rz5:A 369 105 0.6604 0.1897 0.6667 6.01e-35
53 7wc5:A 363 105 0.6604 0.1928 0.6667 2.33e-34 6a93:B, 6a94:B, 8jt8:A, 7vod:A, 7voe:A, 7wc6:A, 7wc7:A, 7wc8:A, 7wc9:A, 6wgt:B, 6wh4:B
54 7dfp:A 335 103 0.6509 0.2060 0.6699 5.91e-34
55 5v54:B 383 105 0.6415 0.1775 0.6476 2.06e-32 7c61:A, 4iaq:A, 4iar:A, 5v54:A
56 8sji:C 114 105 0.6321 0.5877 0.6381 1.91e-29 8sjh:A, 8sji:A
57 5uen:A 384 105 0.6132 0.1693 0.6190 4.02e-29 5uen:B
58 6pt2:B 361 80 0.5094 0.1496 0.6750 3.19e-23 6pt3:B
59 6bqh:A 351 68 0.4245 0.1282 0.6618 4.54e-17 8zmf:A
60 1s05:A 129 98 0.2736 0.2248 0.2959 2.68e-04
61 7bi2:A 1021 44 0.1698 0.0176 0.4091 0.18
62 5msd:A 636 55 0.1698 0.0283 0.3273 0.99 5msc:A, 5msq:A
63 5kz7:A 296 41 0.1321 0.0473 0.3415 1.7 5kz7:B
64 8z97:C 552 88 0.1981 0.0380 0.2386 3.4
65 8z9h:C 748 87 0.1792 0.0254 0.2184 4.0 8z90:C, 8z9r:C
66 3iec:B 313 41 0.1321 0.0447 0.3415 4.5 5eak:A, 5eak:B, 3iec:A, 3iec:C, 3iec:D, 5kz8:A, 5kz8:B, 8txy:A, 8txy:B
67 5a8m:A 337 29 0.1132 0.0356 0.4138 4.6 5a8m:B, 5a8m:C, 5a8n:A, 5a8o:A, 5a8p:A, 5a8q:A, 5a94:A, 5a94:B, 5a94:C, 5a94:D, 5a94:E, 5a94:F, 5a95:A, 5a95:B, 5a95:C
68 8z8x:C 400 58 0.1321 0.0350 0.2414 5.0
69 5es1:A 304 39 0.1321 0.0461 0.3590 5.2
70 3j92:v 136 23 0.1038 0.0809 0.4783 6.8
71 7p1l:A 301 39 0.1226 0.0432 0.3333 7.8 7p1l:B
72 5t62:W 306 40 0.0943 0.0327 0.2500 8.9
73 7r76:A 1834 34 0.1132 0.0065 0.3529 9.1 7r77:A
74 3rg0:A 292 54 0.1509 0.0548 0.2963 9.6

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218