Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ADLEDNMETLNDNLKVIEKADNAAQVKDALTKMKAAALDAQKATPPKLEDKSPDSPEMHDFDHGFDILVGQIHAALHLAN
EGKVKEAQAAAEQLKTTCNACHQKYR

The query sequence (length=106) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3u8p:A 336 106 0.9245 0.2917 0.9245 3.19e-62 3c63:A, 3c63:B, 3c63:C, 3c63:D, 8drj:A, 6dy8:A, 6dy8:B, 6dy8:D, 6dy8:C, 6dyf:A, 6dyf:B, 6dyg:A, 6dyg:B, 6dyh:A, 6dyh:D, 7lr5:C, 7lr5:A, 7lra:C, 7lra:A, 7lrb:A, 7lrb:B, 7lrr:A, 7lrr:B, 7lrv:C, 7lrv:A, 7lv1:C, 7lv1:A, 7lv4:C, 7lv4:A, 7mk4:A, 7mk4:B, 7n4f:C, 7n4f:A, 7n4g:C, 7n4g:A, 3u8p:B, 3u8p:C, 6wyu:A, 6wyu:B, 6wyu:C, 6wz0:A, 6wz0:B, 6wz0:C
2 8tb7:R 328 105 0.8962 0.2896 0.9048 1.01e-61
3 6g7o:A 350 105 0.8962 0.2714 0.9048 1.30e-61 6yxh:A
4 6kux:A 375 105 0.8962 0.2533 0.9048 2.48e-61 6kuy:A
5 5yc8:A 384 105 0.8962 0.2474 0.9048 3.11e-61 5zk3:A, 5zk8:A, 5zkb:A, 5zkc:A
6 9d3g:A 389 105 0.8962 0.2442 0.9048 3.76e-61
7 4pxz:A 392 105 0.8962 0.2423 0.9048 3.79e-61 4py0:A
8 6me9:B 395 105 0.8962 0.2405 0.9048 4.09e-61 6me6:B, 6me7:B, 6me8:B, 7vh0:A
9 7f83:A 396 105 0.8962 0.2399 0.9048 4.19e-61 7f83:B
10 5ung:B 410 105 0.8962 0.2317 0.9048 5.88e-61 7jni:A, 7jni:B, 6jod:A, 5unf:B
11 5wiv:A 379 105 0.8962 0.2507 0.9048 8.08e-61 5wiu:A
12 4or2:B 366 104 0.8868 0.2568 0.9038 8.66e-61 4or2:A
13 6lw5:A 427 105 0.8962 0.2225 0.9048 8.78e-61 6omm:R, 7t6s:R, 7t6u:R, 7t6v:R, 7wvv:R, 7wvw:R, 7wvx:R, 7wvy:R
14 6me8:A 449 105 0.8962 0.2116 0.9048 1.45e-60 6me6:A, 6me7:A, 6me9:A
15 4yay:A 393 104 0.8868 0.2392 0.9038 1.70e-60 6do1:B, 6do1:A, 7f6g:A, 4zud:A
16 4n4w:A 457 105 0.8962 0.2079 0.9048 1.73e-60 4jkv:A, 4jkv:B
17 6iiv:A 461 105 0.8962 0.2061 0.9048 1.89e-60 1b13:A, 1b2j:A, 1b2o:A, 1b2o:B, 1be7:A, 1bfy:A, 1c09:A, 1c09:B, 1c09:C, 1fhh:A, 1fhm:A, 6iiu:A, 1irn:A, 1iro:A, 1r0h:A, 4rxn:A, 5rxn:A, 1smm:A, 1smu:A, 1smw:A, 1t9o:A, 1t9o:B, 1t9o:C, 1t9p:A, 1t9p:B, 1t9p:C, 1t9q:A
18 6ko5:A 398 104 0.8868 0.2362 0.9038 1.92e-60 7f9y:R, 7f9z:R, 7na7:R, 7na8:R, 7w2z:R
19 6ai5:A 106 106 0.8962 0.8962 0.8962 2.08e-60 6ai5:C, 6ai5:E, 6ai5:G, 7dcl:A, 7dcl:B, 6dhz:C, 6dhz:D, 3hni:A, 3hni:B, 3hni:C, 3hni:D, 3hni:E, 3hni:F, 3hni:G, 3hni:H, 3hnj:A, 3hnj:B, 3hnj:C, 3hnj:D, 3hnk:A, 3hnk:B, 3hnl:A, 3hnl:B, 3iq5:A, 3iq5:B, 3iq5:C, 3iq5:D, 3iq6:A, 3iq6:B, 3iq6:C, 3iq6:D, 3iq6:E, 3iq6:F, 3iq6:G, 3iq6:H, 4je9:A, 4je9:B, 4jea:A, 4jea:B, 4jea:C, 4jea:D, 4jeb:A, 4jeb:B, 5l31:A, 5l31:B, 5l31:C, 5l31:D, 5l32:A, 5l32:C, 5l32:D, 5l32:B, 6lde:A, 6lde:C, 6ldf:A, 6ldf:C, 6ldg:A, 6ldg:C, 3m15:A, 3m15:B, 3m15:C, 3m4b:A, 3m4b:B, 3m4b:D, 3m4b:C, 3m4c:A, 3m4c:B, 3m4c:D, 3m4c:C, 3m79:A, 3m79:B, 3m79:C, 3m79:D, 3m79:E, 3m79:F, 3m79:G, 3m79:H, 3qvy:A, 3qvy:B, 3qvy:C, 3qvy:D, 3qvz:A, 3qvz:B, 3qvz:D, 3qvz:C, 3qw0:A, 3qw0:B, 3qw0:C, 3qw0:D, 3qw1:A, 3qw1:B, 3qw1:C, 3qw1:D, 7rwu:A, 7rwv:A, 7rwv:B, 7rwv:C, 7rwv:D, 7rww:A, 7rww:B, 7rww:C, 7rww:D, 7rwx:A, 7rwx:B, 7rwy:A, 7rwy:B, 7rwy:C, 7rwy:F, 7rwy:D, 7rwy:E, 7su2:D, 7su2:A, 7su2:C, 7su2:G, 7tep:A, 7tep:C, 7tep:B, 7tep:D, 4u9d:A, 4u9d:C, 4u9d:B, 4u9d:D, 5xzi:A, 5xzj:A, 5xzj:B, 5xzj:C, 5xzj:D
20 8hij:A 498 105 0.8962 0.1908 0.9048 4.11e-60 8dep:A, 8goe:A, 8gof:A, 8hik:A, 7tx6:A, 7tx7:A, 7xq0:A, 7xq1:A, 7xq2:A
21 4n6h:A 408 104 0.8868 0.2304 0.9038 7.34e-60 8f7s:R, 8f7s:D, 6pt2:A, 6pt3:A, 4rwa:B, 4rwa:A, 4rwd:B, 4rwd:A
22 5dhh:B 387 103 0.8774 0.2403 0.9029 1.30e-59 5dhg:A, 5dhg:B, 5dhh:A, 4ea3:A, 4ea3:B, 8f7x:R
23 5unf:A 386 100 0.8679 0.2383 0.9200 1.87e-59 5unh:A, 5unh:B
24 6usf:A 464 106 0.8774 0.2004 0.8774 3.35e-59 6cnj:A, 6cnj:D, 6cnk:A, 6cnk:B, 6cnk:D, 5kxi:A, 5kxi:D, 6ur8:A, 6ur8:D, 6usf:D
25 7lsj:C 106 106 0.8679 0.8679 0.8679 4.39e-59 7lsj:A, 7lsl:C, 7lsl:A, 7lsn:C, 7lsn:A
26 5n2s:A 383 103 0.8774 0.2428 0.9029 6.46e-59 6d9h:R, 7ld3:R, 7ld4:R
27 6ot4:A 106 106 0.8396 0.8396 0.8396 7.20e-59 6ot4:B, 6ot4:D, 6ot4:C, 6ot7:D, 6ot7:C, 6ot7:A, 6ot7:B, 6ot8:A, 6ot9:C, 6ot9:A, 6ot9:D, 6ot9:B, 6ovh:A, 6ovh:B, 6ovh:C, 6ovh:L, 6ovh:D, 6ovh:G, 6ovh:E, 6ovh:F, 6ovh:H, 6ovh:K, 6ovh:I, 6ovh:J
28 6rz4:A 395 105 0.8962 0.2405 0.9048 1.74e-58 6rz5:B
29 5bu7:A 106 106 0.8868 0.8868 0.8868 2.30e-58 5bu7:B, 6dhy:A, 6dhy:B, 6dhy:C, 6dhy:D, 6dhz:A, 6dhz:B, 3tol:A, 3tol:C, 3tol:D, 3tol:B, 3tom:A, 3tom:B, 3tom:C, 3tom:D
30 5ndd:A 567 105 0.8962 0.1675 0.9048 6.00e-58 5awi:A, 5awi:B, 2bc5:A, 2bc5:B, 2bc5:C, 2bc5:D, 3c62:A, 3c62:B, 3c62:C, 3c62:D, 3de8:A, 3de8:D, 3de8:B, 3de8:C, 3de9:A, 8drd:A, 8drd:B, 8drf:A, 8drj:C, 8drl:A, 8drm:A, 6dy4:D, 6dy4:A, 6dy6:A, 6dy6:B, 6dyb:A, 6dyb:C, 6dyc:A, 6dyc:B, 6dyd:A, 6dyd:C, 6dye:A, 6dye:B, 6dyi:B, 6dyj:A, 6dyj:E, 6dyj:C, 6dyj:G, 6dyk:A, 6dyk:E, 6dyk:C, 6dyk:G, 6dyl:A, 6dyl:E, 6dyl:C, 6dyl:G, 3foo:A, 3foo:B, 3foo:C, 3foo:D, 3foo:E, 3foo:F, 3foo:G, 3foo:H, 3foo:I, 3foo:J, 3foo:L, 3foo:K, 3fop:A, 3fop:B, 3l1m:A, 5ndz:A, 3nmi:A, 3nmi:B, 3nmi:C, 3nmi:D, 3nmi:E, 3nmi:F, 3nmj:A, 3nmj:C, 3nmj:B, 3nmj:D, 3nmk:A, 3nmk:C, 3nmk:B, 3nmk:D, 2qla:A, 2qla:B, 2qla:C, 2qla:D, 6wza:A, 6wza:B, 6wza:C, 6x8x:A
31 8del:A 106 106 0.8208 0.8208 0.8208 1.15e-55 8del:B, 8del:C, 6wz1:A, 6wz1:C, 6wz1:B, 6wz2:A, 6wz2:B, 6wz2:C, 6wz3:A, 6wz3:B, 6wz3:C, 6wz7:A, 6wz7:B, 6wz7:C, 6wzc:A, 6x7e:A, 6x7e:B, 6x7e:C
32 5tvn:A 393 105 0.8396 0.2265 0.8476 1.67e-53 6drx:A, 6dry:A, 6drz:A, 6ds0:A, 4ib4:A, 4nc3:A, 5tud:A, 5tud:D
33 6d35:A 581 105 0.8396 0.1532 0.8476 1.30e-51 6d32:A, 5kzv:A, 5kzy:A, 5kzy:B, 5kzz:A, 1lm3:B, 1lm3:D, 1qq3:A
34 7zi0:A 593 105 0.8302 0.1484 0.8381 3.09e-51 256b:A, 256b:B, 5l7d:A, 5l7i:A, 5l7i:B, 4o9r:A, 4qim:A, 4qin:A, 1qpu:A, 7zi0:B
35 5k2a:A 398 105 0.8113 0.2161 0.8190 7.39e-51 8a2o:A, 8a2p:A, 6aqf:A, 7aro:A, 8c9w:A, 8cic:A, 8cu6:A, 8cu7:A, 8du3:A, 4eiy:A, 7ezc:A, 7ezc:B, 8fyn:A, 8gne:A, 6gt3:A, 5iu4:A, 5iu7:A, 5iu8:A, 5iua:A, 5iub:A, 5jtb:A, 6jzh:A, 5k2b:A, 5k2c:A, 5k2d:A, 6lpj:A, 6lpk:A, 6lpl:A, 6mh8:A, 5mzj:A, 5mzp:A, 5n2r:A, 5nlx:A, 5nm2:A, 5nm4:A, 5olg:A, 5olh:A, 5olo:A, 5olv:A, 5olz:A, 5om1:A, 5om4:A, 6ps7:A, 8pwn:A, 7px4:A, 7pyr:A, 8rln:A, 7rm5:A, 8rqq:A, 6s0l:A, 6s0q:A, 7t32:A, 5uig:A, 5uvi:A, 5vra:A, 6wqa:A, 6zdr:A, 6zdv:A
36 6rz8:A 366 105 0.8113 0.2350 0.8190 1.33e-50 6rz6:A, 6rz7:A, 6rz9:A
37 9d3e:A 360 105 0.8113 0.2389 0.8190 2.09e-50
38 4ntj:A 369 105 0.8113 0.2331 0.8190 2.18e-50 7pp1:AAA
39 7tuy:R 371 105 0.7925 0.2264 0.8000 2.56e-48
40 8jj8:F 375 105 0.7925 0.2240 0.8000 2.79e-48 8jjl:A, 8jjo:F
41 8xvj:R 397 105 0.7830 0.2091 0.7905 1.57e-47 8xvk:R, 8xvl:R
42 6os0:A 395 96 0.7547 0.2025 0.8333 1.66e-47 6os1:A, 6os2:A, 8th3:A, 8th4:A
43 6m97:A 208 105 0.7830 0.3990 0.7905 2.78e-47
44 5xjm:A 375 105 0.7736 0.2187 0.7810 2.18e-46 7c6a:A
45 6bqg:A 378 105 0.7642 0.2143 0.7714 3.46e-45
46 4z34:A 385 105 0.7642 0.2104 0.7714 3.99e-45 4z35:A, 4z36:A
47 6c1q:B 374 104 0.7547 0.2139 0.7692 5.55e-45 6c1r:B, 5o9h:A, 5o9h:B, 7y65:D, 7y66:D, 7y67:D
48 4u9e:A 91 106 0.7264 0.8462 0.7264 1.16e-44
49 6iql:A 341 105 0.7547 0.2346 0.7619 1.61e-44 6iql:B
50 7yxa:A 375 100 0.7453 0.2107 0.7900 4.54e-43 7yxa:B
51 6wh4:A 378 105 0.8113 0.2275 0.8190 2.78e-40 6a93:A, 6a94:A, 7wc4:A, 6wgt:A, 6wgt:C, 6wh4:C, 8zmg:A, 8zmg:B
52 6rz5:A 369 105 0.6981 0.2005 0.7048 1.47e-39
53 5v54:B 383 105 0.6792 0.1880 0.6857 1.47e-36 7c61:A, 4iaq:A, 4iar:A, 5v54:A
54 7wc5:A 363 105 0.6792 0.1983 0.6857 3.34e-36 6a93:B, 6a94:B, 8jt8:A, 7vod:A, 7voe:A, 7wc6:A, 7wc7:A, 7wc8:A, 7wc9:A, 6wgt:B, 6wh4:B
55 7dfp:A 335 103 0.6698 0.2119 0.6893 8.27e-36
56 5uen:A 384 105 0.6415 0.1771 0.6476 1.04e-32 5uen:B
57 8sji:C 114 105 0.6604 0.6140 0.6667 6.89e-31 8sjh:A, 8sji:A
58 6pt2:B 361 103 0.5943 0.1745 0.6117 3.89e-26 6pt3:B
59 6bqh:A 351 105 0.5283 0.1595 0.5333 1.51e-20 8zmf:A
60 7bi2:A 1021 51 0.1887 0.0196 0.3922 0.16
61 7f79:C 458 86 0.2170 0.0502 0.2674 0.84 7f79:A, 7f79:B, 7f79:D, 7f79:E, 7f79:F
62 1bbh:A 131 39 0.1038 0.0840 0.2821 2.1 1bbh:B, 5gyr:A, 5gyr:N, 5gyr:B, 5gyr:E, 5gyr:J, 5gyr:F, 5gyr:I, 5gyr:M
63 1gqa:A 130 33 0.1226 0.1000 0.3939 2.7 1gqa:D
64 5t62:W 306 40 0.0943 0.0327 0.2500 2.8
65 1skq:A 416 33 0.1321 0.0337 0.4242 2.8 1jny:A, 1jny:B, 1skq:B
66 5kz7:A 296 31 0.1038 0.0372 0.3548 4.6 5kz7:B
67 3vrc:B 131 13 0.0755 0.0611 0.6154 5.8 3vrc:A
68 5es1:A 304 30 0.1038 0.0362 0.3667 6.5
69 3iec:B 313 41 0.1415 0.0479 0.3659 6.8 5eak:A, 5eak:B, 3iec:A, 3iec:C, 3iec:D, 5kz8:A, 5kz8:B, 8txy:A, 8txy:B
70 5bpk:C 188 44 0.1792 0.1011 0.4318 7.3 5bpk:D, 3fnm:B, 3fnm:D, 2qm6:B, 2qm6:D, 2qmc:B, 2qmc:D
71 1cpq:A 129 15 0.0755 0.0620 0.5333 7.6 1cpr:A, 1nbb:A, 1nbb:B, 1rcp:A, 1rcp:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218