Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ADLEDNMETLNDNLKVIEKADNAAQVKDALTKMAAAAADAWSATPPKLEDKSPDSPEMHDFRHGFWILIGQIHDALHLAN
EGKVKEAQHAAEQLKCTCNHCHQKYR

The query sequence (length=106) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6ai5:A 106 106 0.9811 0.9811 0.9811 3.88e-74 6ai5:C, 6ai5:E, 6ai5:G, 7dcl:A, 7dcl:B, 6dhz:C, 6dhz:D, 3hni:A, 3hni:B, 3hni:C, 3hni:D, 3hni:E, 3hni:F, 3hni:G, 3hni:H, 3hnj:A, 3hnj:B, 3hnj:C, 3hnj:D, 3hnk:A, 3hnk:B, 3hnl:A, 3hnl:B, 3iq5:A, 3iq5:B, 3iq5:C, 3iq5:D, 3iq6:A, 3iq6:B, 3iq6:C, 3iq6:D, 3iq6:E, 3iq6:F, 3iq6:G, 3iq6:H, 4je9:A, 4je9:B, 4jea:A, 4jea:B, 4jea:C, 4jea:D, 4jeb:A, 4jeb:B, 5l31:A, 5l31:B, 5l31:C, 5l31:D, 5l32:A, 5l32:C, 5l32:D, 5l32:B, 6lde:A, 6lde:C, 6ldf:A, 6ldf:C, 6ldg:A, 6ldg:C, 3m15:A, 3m15:B, 3m15:C, 3m4b:A, 3m4b:B, 3m4b:D, 3m4b:C, 3m4c:A, 3m4c:B, 3m4c:D, 3m4c:C, 3m79:A, 3m79:B, 3m79:C, 3m79:D, 3m79:E, 3m79:F, 3m79:G, 3m79:H, 3qvy:A, 3qvy:B, 3qvy:C, 3qvy:D, 3qvz:A, 3qvz:B, 3qvz:D, 3qvz:C, 3qw0:A, 3qw0:B, 3qw0:C, 3qw0:D, 3qw1:A, 3qw1:B, 3qw1:C, 3qw1:D, 7rwu:A, 7rwv:A, 7rwv:B, 7rwv:C, 7rwv:D, 7rww:A, 7rww:B, 7rww:C, 7rww:D, 7rwx:A, 7rwx:B, 7rwy:A, 7rwy:B, 7rwy:C, 7rwy:F, 7rwy:D, 7rwy:E, 7su2:D, 7su2:A, 7su2:C, 7su2:G, 7tep:A, 7tep:C, 7tep:B, 7tep:D, 4u9d:A, 4u9d:C, 4u9d:B, 4u9d:D, 5xzi:A, 5xzj:A, 5xzj:B, 5xzj:C, 5xzj:D
2 5bu7:A 106 106 0.8962 0.8962 0.8962 1.65e-60 5bu7:B, 6dhy:A, 6dhy:B, 6dhy:C, 6dhy:D, 6dhz:A, 6dhz:B, 3tol:A, 3tol:C, 3tol:D, 3tol:B, 3tom:A, 3tom:B, 3tom:C, 3tom:D
3 6ot4:A 106 106 0.8491 0.8491 0.8491 3.44e-60 6ot4:B, 6ot4:D, 6ot4:C, 6ot7:D, 6ot7:C, 6ot7:A, 6ot7:B, 6ot8:A, 6ot9:C, 6ot9:A, 6ot9:D, 6ot9:B, 6ovh:A, 6ovh:B, 6ovh:C, 6ovh:L, 6ovh:D, 6ovh:G, 6ovh:E, 6ovh:F, 6ovh:H, 6ovh:K, 6ovh:I, 6ovh:J
4 4u9e:A 91 106 0.8491 0.9890 0.8491 3.79e-59
5 3u8p:A 336 106 0.8679 0.2738 0.8679 9.20e-58 3c63:A, 3c63:B, 3c63:C, 3c63:D, 8drj:A, 6dy8:A, 6dy8:B, 6dy8:D, 6dy8:C, 6dyf:A, 6dyf:B, 6dyg:A, 6dyg:B, 6dyh:A, 6dyh:D, 7lr5:C, 7lr5:A, 7lra:C, 7lra:A, 7lrb:A, 7lrb:B, 7lrr:A, 7lrr:B, 7lrv:C, 7lrv:A, 7lv1:C, 7lv1:A, 7lv4:C, 7lv4:A, 7mk4:A, 7mk4:B, 7n4f:C, 7n4f:A, 7n4g:C, 7n4g:A, 3u8p:B, 3u8p:C, 6wyu:A, 6wyu:B, 6wyu:C, 6wz0:A, 6wz0:B, 6wz0:C
6 7lsj:C 106 106 0.8491 0.8491 0.8491 2.11e-57 7lsj:A, 7lsl:C, 7lsl:A, 7lsn:C, 7lsn:A
7 8tb7:R 328 105 0.8396 0.2713 0.8476 2.68e-56
8 6g7o:A 350 105 0.8396 0.2543 0.8476 4.71e-56 6yxh:A
9 6kux:A 375 105 0.8396 0.2373 0.8476 8.72e-56 6kuy:A
10 5yc8:A 384 105 0.8396 0.2318 0.8476 1.08e-55 5zk3:A, 5zk8:A, 5zkb:A, 5zkc:A
11 9d3g:A 389 105 0.8396 0.2288 0.8476 1.22e-55
12 4pxz:A 392 105 0.8396 0.2270 0.8476 1.30e-55 4py0:A
13 6me9:B 395 105 0.8396 0.2253 0.8476 1.40e-55 6me6:B, 6me7:B, 6me8:B, 7vh0:A
14 5wiv:A 379 105 0.8396 0.2348 0.8476 1.40e-55 5wiu:A
15 7f83:A 396 105 0.8396 0.2247 0.8476 1.43e-55 7f83:B
16 5ung:B 410 105 0.8396 0.2171 0.8476 1.97e-55 7jni:A, 7jni:B, 6jod:A, 5unf:B
17 6lw5:A 427 105 0.8396 0.2084 0.8476 2.86e-55 6omm:R, 7t6s:R, 7t6u:R, 7t6v:R, 7wvv:R, 7wvw:R, 7wvx:R, 7wvy:R
18 4or2:B 366 104 0.8302 0.2404 0.8462 3.07e-55 4or2:A
19 6rz4:A 395 105 0.8396 0.2253 0.8476 3.16e-55 6rz5:B
20 6me8:A 449 105 0.8396 0.1982 0.8476 4.57e-55 6me6:A, 6me7:A, 6me9:A
21 4n4w:A 457 105 0.8396 0.1947 0.8476 5.38e-55 4jkv:A, 4jkv:B
22 4yay:A 393 104 0.8302 0.2239 0.8462 5.81e-55 6do1:B, 6do1:A, 7f6g:A, 4zud:A
23 6iiv:A 461 105 0.8396 0.1931 0.8476 5.84e-55 1b13:A, 1b2j:A, 1b2o:A, 1b2o:B, 1be7:A, 1bfy:A, 1c09:A, 1c09:B, 1c09:C, 1fhh:A, 1fhm:A, 6iiu:A, 1irn:A, 1iro:A, 1r0h:A, 4rxn:A, 5rxn:A, 1smm:A, 1smu:A, 1smw:A, 1t9o:A, 1t9o:B, 1t9o:C, 1t9p:A, 1t9p:B, 1t9p:C, 1t9q:A
24 6ko5:A 398 104 0.8302 0.2211 0.8462 6.52e-55 7f9y:R, 7f9z:R, 7na7:R, 7na8:R, 7w2z:R
25 8hij:A 498 105 0.8396 0.1787 0.8476 1.19e-54 8dep:A, 8goe:A, 8gof:A, 8hik:A, 7tx6:A, 7tx7:A, 7xq0:A, 7xq1:A, 7xq2:A
26 4n6h:A 408 104 0.8302 0.2157 0.8462 1.32e-54 8f7s:R, 8f7s:D, 6pt2:A, 6pt3:A, 4rwa:B, 4rwa:A, 4rwd:B, 4rwd:A
27 5unf:A 386 99 0.8113 0.2228 0.8687 3.46e-54 5unh:A, 5unh:B
28 5dhh:B 387 103 0.8208 0.2248 0.8447 4.43e-54 5dhg:A, 5dhg:B, 5dhh:A, 4ea3:A, 4ea3:B, 8f7x:R
29 5ndd:A 567 105 0.8396 0.1570 0.8476 5.70e-54 5awi:A, 5awi:B, 2bc5:A, 2bc5:B, 2bc5:C, 2bc5:D, 3c62:A, 3c62:B, 3c62:C, 3c62:D, 3de8:A, 3de8:D, 3de8:B, 3de8:C, 3de9:A, 8drd:A, 8drd:B, 8drf:A, 8drj:C, 8drl:A, 8drm:A, 6dy4:D, 6dy4:A, 6dy6:A, 6dy6:B, 6dyb:A, 6dyb:C, 6dyc:A, 6dyc:B, 6dyd:A, 6dyd:C, 6dye:A, 6dye:B, 6dyi:B, 6dyj:A, 6dyj:E, 6dyj:C, 6dyj:G, 6dyk:A, 6dyk:E, 6dyk:C, 6dyk:G, 6dyl:A, 6dyl:E, 6dyl:C, 6dyl:G, 3foo:A, 3foo:B, 3foo:C, 3foo:D, 3foo:E, 3foo:F, 3foo:G, 3foo:H, 3foo:I, 3foo:J, 3foo:L, 3foo:K, 3fop:A, 3fop:B, 3l1m:A, 5ndz:A, 3nmi:A, 3nmi:B, 3nmi:C, 3nmi:D, 3nmi:E, 3nmi:F, 3nmj:A, 3nmj:C, 3nmj:B, 3nmj:D, 3nmk:A, 3nmk:C, 3nmk:B, 3nmk:D, 2qla:A, 2qla:B, 2qla:C, 2qla:D, 6wza:A, 6wza:B, 6wza:C, 6x8x:A
30 5n2s:A 383 103 0.8208 0.2272 0.8447 1.42e-53 6d9h:R, 7ld3:R, 7ld4:R
31 6usf:A 464 106 0.8208 0.1875 0.8208 5.70e-53 6cnj:A, 6cnj:D, 6cnk:A, 6cnk:B, 6cnk:D, 5kxi:A, 5kxi:D, 6ur8:A, 6ur8:D, 6usf:D
32 8del:A 106 106 0.7830 0.7830 0.7830 2.22e-49 8del:B, 8del:C, 6wz1:A, 6wz1:C, 6wz1:B, 6wz2:A, 6wz2:B, 6wz2:C, 6wz3:A, 6wz3:B, 6wz3:C, 6wz7:A, 6wz7:B, 6wz7:C, 6wzc:A, 6x7e:A, 6x7e:B, 6x7e:C
33 5tvn:A 393 105 0.7830 0.2112 0.7905 5.36e-48 6drx:A, 6dry:A, 6drz:A, 6ds0:A, 4ib4:A, 4nc3:A, 5tud:A, 5tud:D
34 6d35:A 581 105 0.7830 0.1429 0.7905 2.77e-46 6d32:A, 5kzv:A, 5kzy:A, 5kzy:B, 5kzz:A, 1lm3:B, 1lm3:D, 1qq3:A
35 7zi0:A 593 105 0.7736 0.1383 0.7810 6.37e-46 256b:A, 256b:B, 5l7d:A, 5l7i:A, 5l7i:B, 4o9r:A, 4qim:A, 4qin:A, 1qpu:A, 7zi0:B
36 5k2a:A 398 105 0.7547 0.2010 0.7619 2.28e-45 8a2o:A, 8a2p:A, 6aqf:A, 7aro:A, 8c9w:A, 8cic:A, 8cu6:A, 8cu7:A, 8du3:A, 4eiy:A, 7ezc:A, 7ezc:B, 8fyn:A, 8gne:A, 6gt3:A, 5iu4:A, 5iu7:A, 5iu8:A, 5iua:A, 5iub:A, 5jtb:A, 6jzh:A, 5k2b:A, 5k2c:A, 5k2d:A, 6lpj:A, 6lpk:A, 6lpl:A, 6mh8:A, 5mzj:A, 5mzp:A, 5n2r:A, 5nlx:A, 5nm2:A, 5nm4:A, 5olg:A, 5olh:A, 5olo:A, 5olv:A, 5olz:A, 5om1:A, 5om4:A, 6ps7:A, 8pwn:A, 7px4:A, 7pyr:A, 8rln:A, 7rm5:A, 8rqq:A, 6s0l:A, 6s0q:A, 7t32:A, 5uig:A, 5uvi:A, 5vra:A, 6wqa:A, 6zdr:A, 6zdv:A
37 6rz8:A 366 105 0.7547 0.2186 0.7619 4.31e-45 6rz6:A, 6rz7:A, 6rz9:A
38 9d3e:A 360 105 0.7547 0.2222 0.7619 6.83e-45
39 4ntj:A 369 105 0.7547 0.2168 0.7619 7.04e-45 7pp1:AAA
40 6os0:A 395 96 0.7075 0.1899 0.7812 6.28e-43 6os1:A, 6os2:A, 8th3:A, 8th4:A
41 7tuy:R 371 105 0.7358 0.2102 0.7429 8.03e-43
42 8jj8:F 375 105 0.7358 0.2080 0.7429 8.69e-43 8jjl:A, 8jjo:F
43 8xvj:R 397 105 0.7264 0.1940 0.7333 4.64e-42 8xvk:R, 8xvl:R
44 6m97:A 208 105 0.7264 0.3702 0.7333 1.67e-41
45 6c1q:B 374 104 0.7170 0.2032 0.7308 1.97e-41 6c1r:B, 5o9h:A, 5o9h:B, 7y65:D, 7y66:D, 7y67:D
46 5xjm:A 375 105 0.7170 0.2027 0.7238 6.60e-41 7c6a:A
47 6bqg:A 378 105 0.7075 0.1984 0.7143 1.03e-39
48 4z34:A 385 105 0.7075 0.1948 0.7143 1.16e-39 4z35:A, 4z36:A
49 6iql:A 341 105 0.6981 0.2170 0.7048 5.11e-39 6iql:B
50 7yxa:A 375 99 0.6887 0.1947 0.7374 1.83e-38 7yxa:B
51 6wh4:A 378 76 0.5943 0.1667 0.8289 6.51e-36 6a93:A, 6a94:A, 7wc4:A, 6wgt:A, 6wgt:C, 6wh4:C, 8zmg:A, 8zmg:B
52 6rz5:A 369 105 0.6509 0.1870 0.6571 7.04e-35
53 5v54:B 383 105 0.6415 0.1775 0.6476 2.48e-33 7c61:A, 4iaq:A, 4iar:A, 5v54:A
54 7wc5:A 363 105 0.6321 0.1846 0.6381 4.45e-32 6a93:B, 6a94:B, 8jt8:A, 7vod:A, 7voe:A, 7wc6:A, 7wc7:A, 7wc8:A, 7wc9:A, 6wgt:B, 6wh4:B
55 7dfp:A 335 103 0.6226 0.1970 0.6408 2.97e-31
56 5uen:A 384 105 0.6038 0.1667 0.6095 3.07e-29 5uen:B
57 8sji:C 114 105 0.6415 0.5965 0.6476 1.44e-28 8sjh:A, 8sji:A
58 6pt2:B 361 103 0.5472 0.1607 0.5631 5.72e-22 6pt3:B
59 6bqh:A 351 68 0.4057 0.1225 0.6324 9.14e-16 8zmf:A
60 5kz7:A 296 36 0.1132 0.0405 0.3333 1.4 5kz7:B
61 5hzd:A 476 28 0.1132 0.0252 0.4286 2.1 5i49:A, 5ido:A
62 7bi2:A 1021 51 0.1792 0.0186 0.3725 2.3
63 8vlx:A 2431 29 0.0849 0.0037 0.3103 2.4
64 7p1l:A 301 35 0.1132 0.0399 0.3429 2.8 7p1l:B
65 3vti:C 305 107 0.2642 0.0918 0.2617 3.8 3vti:D
66 7bvc:A 1078 25 0.1038 0.0102 0.4400 4.0 7bvg:A
67 1bbh:A 131 39 0.0943 0.0763 0.2564 4.3 1bbh:B, 5gyr:A, 5gyr:N, 5gyr:B, 5gyr:E, 5gyr:J, 5gyr:F, 5gyr:I, 5gyr:M
68 6wbo:A 555 19 0.1132 0.0216 0.6316 4.6
69 4h3h:E 192 45 0.0943 0.0521 0.2222 5.0 4h3k:E, 3o2q:E
70 3iec:B 313 36 0.1132 0.0383 0.3333 5.2 5eak:A, 5eak:B, 3iec:A, 3iec:C, 3iec:D, 5kz8:A, 5kz8:B, 8txy:A, 8txy:B
71 5es1:A 304 35 0.1132 0.0395 0.3429 7.1
72 5jrz:A 443 24 0.1132 0.0271 0.5000 7.2 6adx:A, 6ady:A, 7g9k:A, 7g9l:A, 7g9m:A, 7g9o:A, 7g9p:A, 7g9q:A, 7g9r:A, 7g9s:A, 7g9t:A, 7g9u:A, 7g9v:A, 7g9w:A, 7g9x:A, 7g9y:A, 7ga0:A, 7ga1:A, 7ga2:A, 7ga3:A, 7ga5:A, 7ga6:A, 7ga7:A, 5gjb:A, 5gjc:A, 5k8i:A, 5k8l:A, 5k8t:A, 5k8u:A, 5mfx:A, 5rhg:A, 5rhi:A, 5rhj:A, 5rhk:A, 5rhl:A, 5rhm:A, 5rho:A, 5rhp:A, 5rhq:A, 5rhr:A, 5rhs:A, 5rht:A, 5rhu:A, 5rhv:A, 5rhw:A, 5rhx:A, 6rwz:A, 6s0j:A, 8um3:A, 7v2z:A, 8v7r:A, 8v7u:A, 5y4z:A, 5y6m:A, 5y6n:A
73 7m1n:A 71 22 0.0660 0.0986 0.3182 8.1 7m1n:B, 7m1o:A, 7m1o:B
74 4o6m:B 341 33 0.1226 0.0381 0.3939 9.2 4o6m:A, 4o6n:A, 4o6n:B, 4q7c:A, 4q7c:B
75 8wm7:C 658 42 0.1415 0.0228 0.3571 9.2 8w9m:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218