BioLiP

>protein
ADFQPSIWGDLFLNCPDDAETEKRHQQLKEEVRKMIVAPMANSTQKLAFIDSVQRLGVSYHFTKEIEDELENIYHNNNDA
ENDLYTTSIRFRLLREHGYNVSCDVFNKFKDEQGNFKSSVTSDVRGLLELYQASYLRVHGEDILDEAISFTTHHLSLAVA
SLDHPLSEEVSHALKQSIRRGLPRVEARHYLSVYQDESHNKALLEFAKIDFNMLQFLHRKELSEICRWWKDLDFQRKLPY
ARDRVVEGYFWISGVYFEPQYSLGRKMLTKVIAMASIVDDTYDSYATYEELIPYTNAIERWDIKCIDEIPEYMKPSYKAL
LDVYEEMVQLVAEHGRQYRVEYAKNAMIRLAQSYLVEAKWTLQNYKPSFEEFKANALPTCGYAMLAITSFVGMGDIVTPE
TFKWAASDPKIIQASTIICRFMDDVAEHKFDCSAIECYMEEYGVTAQEAYDVFNKHVESAWKDLNQEFLKPTEMPTEVLN
RSLNLARVMDVLYREYVGKAAKGGITSLLIEPIAL

The query sequence (length=515) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3g4f:A	515	515	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	3g4f:B
2	5dhi:A	536	533	0.4835	0.4646	0.4672	4.32e-168	5dhk:A, 4di5:A, 5eas:A, 5eat:A, 5eau:A, 1hx9:A, 1hxa:A, 1hxc:A, 1hxg:A, 5ik0:A, 5ik6:A, 5ik9:A, 5ika:A, 5ikh:A, 5il3:A, 5il8:A, 5ild:A, 5ilh:A, 5ili:A, 5ily:A, 3lz9:A, 3m00:A, 3m01:A, 3m02:A, 4rnq:A
3	7xkw:A	499	504	0.4194	0.4329	0.4286	1.26e-146
4	7bzc:A	535	538	0.3864	0.3720	0.3699	1.53e-111	7bzb:A
5	6a1i:A	522	499	0.3495	0.3448	0.3607	1.46e-98	6a1d:A, 6a1e:A, 6a3x:A, 7e9r:B, 7e9r:C, 6k16:A, 6o9p:A
6	6a2d:A	519	521	0.3515	0.3487	0.3474	2.55e-95	6a2c:A, 6a2c:B, 6a2d:B
7	5uv2:A	514	525	0.3456	0.3463	0.3390	3.46e-94	6onm:A, 5uv1:A
8	1n1z:A	537	544	0.3359	0.3222	0.3180	2.68e-89	1n1b:A, 1n1b:B, 1n1z:B, 1n20:A, 1n20:B, 1n21:A, 1n22:A, 1n22:B, 1n23:A, 1n23:B, 1n24:A, 1n24:B
9	3n0g:B	524	506	0.3126	0.3073	0.3182	7.10e-89	3n0g:A
10	2ong:A	543	539	0.3301	0.3131	0.3154	9.76e-88	2ong:B, 2onh:A, 2onh:B
11	3sae:A	780	520	0.3243	0.2141	0.3212	4.06e-76	3sdr:A, 3sdt:A, 3sdu:A, 3sdv:A
12	3p5r:A	750	511	0.2913	0.2000	0.2935	8.11e-61	3p5p:A, 3p5r:B
13	7y47:B	767	500	0.2485	0.1669	0.2560	8.00e-40
14	3pya:A	688	255	0.1476	0.1105	0.2980	1.22e-18	4lix:A, 3pyb:A
15	8ih5:A	689	299	0.1631	0.1219	0.2809	3.17e-17	8ih5:F, 8ih5:B, 8ih5:C, 8ih5:D, 8ih5:E
16	5hlo:C	93	86	0.0485	0.2688	0.2907	0.25	6ds2:A, 6ds2:C, 6ds2:E, 6ds2:G, 4ggf:A, 4ggf:K, 4ggf:S, 4ggf:U, 5hlo:A, 5hlo:B, 5hlo:D, 5hlv:A, 5hlv:D, 5hlv:B, 5hlv:H, 5hlv:C, 5hlv:E, 5hlv:F, 5hlv:G, 1mr8:A, 1mr8:B, 7quv:A, 8sjb:A, 8sjb:B, 8sjc:A, 8sjc:B, 5w1f:A, 5w1f:C, 5w1f:G, 5w1f:E, 4xjk:A, 4xjk:C, 4xjk:E, 4xjk:G, 4xjk:I, 1xk4:A, 1xk4:B, 1xk4:E, 1xk4:F, 1xk4:I, 1xk4:J
17	8wce:A	994	124	0.0641	0.0332	0.2661	2.4
18	5b6p:B	145	71	0.0447	0.1586	0.3239	3.1	5b6p:C, 5b6p:G, 5ydb:A, 5ydb:B, 5ydb:C, 5ydb:D
19	7alt:A	270	35	0.0311	0.0593	0.4571	5.2	7alt:B
20	8esq:I	460	44	0.0252	0.0283	0.2955	5.5
21	6xyw:Bz	123	62	0.0330	0.1382	0.2742	5.5
22	6bhd:A	217	80	0.0466	0.1106	0.3000	6.2	6au2:A, 6au3:A, 6bhe:A, 6bhg:A, 6bhh:A, 6bhi:A, 6bpi:A, 7c9n:B, 7c9n:A, 7caj:D, 7caj:A, 7cd9:A, 7cd9:B, 7cjt:D, 7cjt:A, 7cjt:B, 7cjt:C, 8g5e:A, 5kch:A, 5kco:A, 5ke2:A, 5ke3:A, 5kh6:A, 5qt1:A, 5qt2:A, 8uwp:A, 8uwp:B
23	2ph5:A	459	71	0.0447	0.0501	0.3239	6.8
24	8d32:A	186	96	0.0447	0.1237	0.2396	7.1	6wgs:A, 6wgv:A, 6wh5:A, 6wh5:B, 6wh5:C
25	6t0q:A	340	54	0.0311	0.0471	0.2963	7.4	6kbj:A, 6kbq:A, 6kc2:A, 6li7:A, 6lik:A, 6t1d:A, 6t1d:B, 6t1d:C, 6t1d:D, 6t1d:E, 6t1d:F
26	5buo:A	185	87	0.0408	0.1135	0.2414	8.8	3umi:A, 3umk:A
27	7n2x:A	201	63	0.0408	0.1045	0.3333	9.9	2d5i:A, 1v4b:A, 2z98:A, 2z9b:A, 2z9c:A, 2z9d:A, 2z9d:B

[Back]