BioLiP

>protein
AATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTYRPCGSYVGRRGGGPQAISIG
KNCDKFGIVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVRENIQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMHYARNTFSRGIF
LDTIVPKYEKPPIGQRTRLSKGDIAQARKLYKCPA

The query sequence (length=195) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6bsl:A	201	201	1.0000	0.9701	0.9701	1.85e-143	6bsl:B, 6bsm:A, 6btn:A, 6btn:B, 6bto:A, 6bto:B, 6btp:A, 6btp:B, 6btq:A, 6btq:B, 3edg:A, 3edh:A
2	3edi:A	195	199	0.8513	0.8513	0.8342	1.29e-121
3	3vtg:A	200	183	0.4000	0.3900	0.4262	7.94e-40
4	3lqb:A	198	182	0.3692	0.3636	0.3956	4.23e-37
5	8a28:A	382	192	0.3590	0.1832	0.3646	6.75e-36	8a28:B
6	3lq0:A	235	201	0.3538	0.2936	0.3433	3.67e-31	1ast:A, 6ht9:A, 6ht9:C, 1iaa:A, 1iab:A, 1iac:A, 1iae:A, 1qji:A, 1qjj:A, 6saz:A, 6saz:C
7	4gwm:A	561	189	0.3538	0.1230	0.3651	4.60e-31	7aq1:A, 7aq1:B, 7auw:A, 7auw:C, 4gwm:B, 4gwn:A
8	7uac:H	546	182	0.3077	0.1099	0.3297	8.15e-25	7uab:E, 7uab:H, 7uae:A, 7uaf:B, 7uaf:A, 7uaf:C, 7uaf:D, 7uai:E, 7uai:B, 7uai:C, 7uai:D
9	7uab:A	481	180	0.2718	0.1102	0.2944	3.58e-14	7uab:D
10	5gwd:A	239	168	0.2308	0.1883	0.2679	4.81e-04	5czw:A, 5gwd:B, 5zjk:A, 5zjk:B, 5zjk:C, 5zjk:D, 5zjk:E, 5zjk:F, 5zjk:G, 5zjk:H, 5zjk:I, 5zjk:J, 5zjk:K, 5zjk:L, 5zjk:M, 5zjk:N, 5zjk:O, 5zjk:P, 5zjk:Q, 5zjk:R
11	2azh:A	147	46	0.0821	0.1088	0.3478	0.25	6jzv:A, 6jzv:B, 6jzv:C, 6jzv:D, 6jzw:A, 6jzw:B, 6jzw:C, 6jzw:D, 1xjs:A, 5xt5:D, 5xt5:C, 5xt6:D, 5xt6:C
12	2aig:P	201	39	0.0718	0.0697	0.3590	0.29	3aig:A, 4aig:A, 1iag:A
13	1slm:A	226	97	0.1282	0.1106	0.2577	3.6	1b3d:A, 1b3d:B, 1b8y:A, 1biw:A, 1biw:B, 1bm6:A, 1bqo:A, 1bqo:B, 1c3i:A, 1c3i:B, 1c8t:A, 1c8t:B, 1caq:A, 1ciz:A, 1cqr:A, 1cqr:B, 2d1o:A, 2d1o:B, 1d5j:A, 1d5j:B, 1d7x:A, 1d7x:B, 1d8f:A, 1d8f:B, 1d8m:A, 1d8m:B, 4dpe:A, 4dpe:B, 1g05:A, 1g05:B, 1g49:A, 1g49:B, 1g4k:A, 1g4k:B, 1g4k:C, 4g9l:A, 4g9l:B, 1hfs:A, 1hy7:A, 1hy7:B, 4ja1:A, 4ja1:B, 2jnp:A, 2jt5:A, 2jt6:A, 6mav:A, 6n9d:A, 3ohl:A, 3oho:A, 1qia:A, 1qia:B, 1qia:C, 1qia:D, 1qic:A, 1qic:B, 1qic:C, 1qic:D, 7s7l:A, 7s7m:A, 1sln:A, 2srt:A, 1uea:A, 1uea:C, 1ums:A, 1umt:A, 1usn:A, 2usn:A, 3usn:A
14	2o7d:A	515	42	0.0821	0.0311	0.3810	4.6	2o7d:D, 2o7d:B, 2o7d:C, 2o7d:E, 2o7d:H, 2o7d:F, 2o7d:G, 2o7e:A, 2o7e:D, 2o7e:B, 2o7e:C, 2o7e:E, 2o7e:H, 2o7e:F, 2o7e:G
15	1dth:A	202	39	0.0667	0.0644	0.3333	4.9	1atl:A, 1atl:B, 1dth:B, 1htd:A, 1htd:B
16	8h3x:C	357	23	0.0564	0.0308	0.4783	4.9	8h3y:A, 8h3y:B, 8h3y:C, 3p24:A, 3p24:B, 3p24:C, 3p24:D, 7pnd:A, 7pnd:B, 7pol:A, 7poo:A, 7poo:B, 7poq:A, 7poq:B, 7pou:A, 7pou:B, 8wem:C, 8wem:A, 8weo:B, 8weo:A
17	8fpj:A	1345	51	0.0872	0.0126	0.3333	7.0

[Back]