Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
AASCVLLHTGQKMPLIGLGTWKSEPGQVKAAIKYALTVGYRHIDCAAIYGNELEIGEALTETVGPGKAVPREELFVTSKL
WNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLMHWPYAFERGDNPFPKNADGTIRYDATHYKDTWKALEALVAKGLVRALGL
SNFSSRQIDDVLSVASVRPAVLQVECHPYLAQNELIAHCQARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPNEPVLLEEPVVQALAEKY
NRSPAQILLRWQVQRKVICIPKSVTPSRIPQNIQVFDFTFSPEEMKQLDALNKNLRFIVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPF
NDPY

The query sequence (length=324) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3fx4:A 325 324 0.9938 0.9908 0.9938 0.0 1ae4:A, 3cv7:A, 1cwn:A, 3h4g:A, 1hqt:A
2 4gq0:A 318 297 0.4784 0.4874 0.5219 5.83e-108 4ga8:A, 4gab:A, 4gqg:A, 4i5x:A, 4icc:X, 4jih:A, 4jii:X, 5lik:X, 5liu:X, 5liw:X, 5lix:X, 5liy:X, 5m2f:X, 4wev:X, 4xzl:X, 4xzm:X, 4xzn:X, 5y7n:A, 1zua:X
3 1ah0:A 315 325 0.5000 0.5143 0.4985 1.21e-104 1ah3:A, 1ah4:A, 1eko:A
4 8b34:A 318 325 0.4907 0.5000 0.4892 2.22e-99 8a4n:A, 1abn:A, 2acq:A, 2acr:A, 2acs:A, 2acu:A, 1ads:A, 8ae9:A, 2agt:A, 8aqg:A, 8aqp:A, 8auu:A, 1az1:A, 1az2:A, 8b3n:A, 8b3r:A, 8b66:A, 3bcj:A, 8bjl:A, 8cnf:A, 8cnp:A, 3dn5:A, 2dux:A, 2duz:A, 2dv0:A, 1ef3:A, 1ef3:B, 1el3:A, 2f2k:A, 6f7r:A, 6f81:A, 6f82:A, 6f84:A, 6f8o:A, 8fh5:A, 8fh6:A, 8fh7:A, 8fh8:A, 8fh9:A, 2fz8:A, 2fz9:A, 2fzb:A, 2fzd:A, 3g5e:A, 4gca:A, 3ghr:A, 3ghs:A, 3ght:A, 3ghu:A, 5ha7:A, 5ha7:B, 2hv5:A, 2hvn:A, 2hvo:A, 2i16:A, 2i17:A, 1iei:A, 4igs:A, 2ikg:A, 2ikh:A, 2iki:A, 2ikj:A, 2ine:A, 2inz:A, 2ipw:A, 2iq0:A, 2iqd:A, 2is7:A, 2isf:A, 2j8t:A, 4jir:A, 4lau:A, 4laz:A, 3lbo:A, 4lb3:A, 4lb4:A, 4lbr:A, 4lbs:A, 3ld5:A, 3len:A, 3lep:A, 3lqg:A, 3lql:A, 3lz3:A, 3lz5:A, 3m0i:A, 3m4h:A, 3m64:A, 1mar:A, 3mb9:A, 3mc5:A, 4nkc:A, 2nvc:A, 2nvd:A, 3onb:A, 3onc:A, 5ou0:A, 5ouj:A, 5ouk:A, 8oz2:A, 3p2v:A, 8p2r:A, 2pd5:A, 2pd9:A, 2pdb:A, 2pdc:A, 2pdf:A, 2pdg:A, 2pdh:A, 2pdi:A, 2pdj:A, 2pdk:A, 2pdl:A, 2pdm:A, 2pdn:A, 2pdp:A, 2pdq:A, 2pdu:A, 2pdw:A, 2pdx:A, 2pdy:A, 2pev:A, 2pf8:A, 2pfh:A, 4pr4:A, 4prr:A, 4prt:A, 4puu:A, 4puw:A, 1pwl:A, 1pwm:A, 2pzn:A, 3q65:A, 3q65:B, 3q67:A, 3q67:B, 4q7b:A, 4qbx:A, 4qr6:A, 2qxw:A, 4qx4:A, 4qxi:A, 2r24:A, 4rpq:A, 3rx2:A, 3rx3:A, 3rx4:A, 3s3g:A, 6syw:A, 6t27:A, 6t3p:A, 1t40:A, 1t41:A, 3t42:A, 6t5g:A, 6t7q:A, 6td8:A, 6tuc:A, 6tuf:A, 6txp:A, 3u2c:A, 1us0:A, 3v35:A, 3v36:A, 1x96:A, 1x97:A, 1x98:A, 6xum:A, 4xzh:A, 4xzh:B, 4xzi:A, 6y03:A, 6y1p:A, 4ys1:A, 4yu1:A, 1z3n:A, 1z89:A, 1z8a:A
5 1c9w:A 315 314 0.4691 0.4825 0.4841 7.15e-96 1frb:A
6 3o3r:A 315 311 0.4660 0.4794 0.4855 4.37e-94 3o3r:B, 3qkz:A, 3qkz:B
7 3bur:A 325 331 0.4475 0.4462 0.4381 6.44e-93 3bur:B, 3buv:B, 3buv:A, 3bv7:A, 3bv7:B, 3caq:A, 3caq:B, 3cas:A, 3cas:B, 3cav:A, 3cav:B, 3cmf:A, 3cmf:B, 3cot:A, 3cot:B, 3dop:A, 3dop:B, 3g1r:A, 3g1r:B, 3uzw:A, 3uzw:B, 3uzx:A, 3uzx:B, 3uzy:A, 3uzy:B, 3uzz:A, 3uzz:B
8 4l1w:A 325 327 0.4414 0.4400 0.4373 1.46e-91 6a7a:A, 3c3u:A, 3gug:A, 2hdj:A, 2hdj:B, 1ihi:A, 1ihi:B, 6ijx:A, 2ipj:A, 2ipj:B, 1j96:A, 1j96:B, 8jp2:A, 4jq1:A, 4jq1:B, 4jq2:A, 4jq2:B, 4jq3:A, 4jq3:B, 4jq4:A, 4jq4:B, 4jqa:A, 4jqa:B, 4jtq:A, 4jtq:B, 4jtr:A, 4jtr:B, 4l1w:B, 4l1x:A, 4l1x:B, 1mrq:A, 3nty:A, 1xjb:A, 1xjb:B, 4xo6:A, 4xo6:B, 4xo7:A, 4xo7:B, 4yvp:A, 4yvp:B
9 2fvl:A 323 326 0.4198 0.4211 0.4172 1.58e-89 2fvl:B, 2fvl:C
10 1q13:A 322 326 0.4136 0.4161 0.4110 4.67e-87 1q13:B, 1q5m:A, 1q5m:B
11 3ln3:A 319 327 0.4352 0.4420 0.4312 2.55e-86 6m7k:A, 5uxf:A
12 4zfc:B 320 324 0.4136 0.4188 0.4136 1.96e-85 6a7b:A, 6a7b:B, 8bbs:B, 8bbs:A, 7c7f:A, 7c7f:B, 7c7g:A, 7c7g:B, 7c7h:A, 7c7h:B, 4dbs:A, 4dbs:B, 4dbu:A, 4dbu:B, 4dbw:A, 4dbw:B, 4dz5:A, 6f2u:A, 6f2u:B, 2f38:A, 6f78:A, 6f78:B, 4fa3:A, 4fal:A, 4fam:A, 4fam:B, 9ffd:A, 9ffd:B, 2fgb:A, 6gxk:A, 6gxk:B, 4h7c:A, 4hmn:A, 5hnt:A, 5hnt:C, 5hnu:A, 5hnu:C, 8i0c:A, 8i0c:B, 8jp1:A, 8jp1:B, 3r43:A, 3r58:A, 3r6i:A, 3r7m:A, 3r8g:A, 3r8h:A, 3r94:A, 8rb6:A, 8rb6:B, 1ry0:A, 1ry0:B, 1ry8:A, 1ry8:B, 1s1p:A, 1s1r:A, 1s2a:A, 1s2c:A, 3ufy:A, 3ug8:A, 3ugr:A, 3uwe:A, 4wdt:A, 4wdu:A, 4wdw:A, 4wdw:B, 4wdx:A, 4wdx:B, 7wqm:A, 7wqm:B, 7wqr:A, 7wqr:B, 7wqs:A, 7wqs:B, 4wrh:A, 7x3l:A, 7x3l:B, 7x3m:A, 7x3m:B, 7x3o:A, 7x3o:B, 1xf0:A, 4xvd:A, 4xvd:B, 4xve:A, 4yvv:A, 4yvv:B, 4yvx:A, 4yvx:B, 4zfc:A, 1zq5:A
13 3cv6:A 323 327 0.3981 0.3994 0.3945 6.02e-84 3cv6:B, 2he5:A, 2he5:B, 2he5:C, 2he5:D, 2hej:A, 2hej:B, 2ipf:A, 2ipf:B, 2ipg:A, 2ipg:B, 2p5n:A, 2p5n:B
14 3h7u:A 312 275 0.3981 0.4135 0.4691 5.83e-83
15 5zcm:A 329 322 0.4074 0.4012 0.4099 6.88e-82
16 5jh2:A 257 284 0.4012 0.5058 0.4577 1.35e-81
17 5ket:A 328 333 0.4444 0.4390 0.4324 1.50e-81 5ket:B
18 7s5f:B 309 300 0.3827 0.4013 0.4133 2.27e-81 7s5f:A, 7s5f:C, 7s5f:D
19 7f7k:B 310 304 0.4444 0.4645 0.4737 1.96e-80 7f7k:A, 7f7l:A, 7f7l:B, 7f7m:A, 7f7m:B, 7w1w:A, 7w1w:B, 7w1x:A, 7w1x:B
20 1afs:A 319 299 0.3735 0.3793 0.4047 1.51e-79 1afs:B, 1lwi:A, 1lwi:B
21 3h7r:A 307 280 0.4012 0.4235 0.4643 2.21e-79
22 4g5d:A 283 296 0.3796 0.4346 0.4155 1.11e-76 4g5d:B
23 3wcz:A 307 303 0.3735 0.3941 0.3993 1.70e-75
24 1k8c:B 319 306 0.3951 0.4013 0.4183 3.85e-75 1k8c:A, 1k8c:C, 1k8c:D, 1mi3:A, 1mi3:B, 1mi3:C, 1mi3:D, 1r38:A, 1r38:B, 1r38:C, 1r38:D, 1sm9:A, 1sm9:B, 1sm9:C, 1sm9:D, 1ye4:A, 1ye4:B, 1ye4:C, 1ye4:D, 1ye6:A, 1ye6:B, 1ye6:C, 1ye6:D, 1z9a:A, 1z9a:B, 1z9a:C, 1z9a:D
25 4gie:A 288 296 0.3580 0.4028 0.3919 2.40e-73 4fzi:A, 4fzi:B
26 5z6t:A 317 307 0.3827 0.3912 0.4039 1.84e-72 5z6t:B
27 3krb:A 307 298 0.3611 0.3811 0.3926 1.29e-71 3krb:B
28 2bgs:A 308 295 0.3549 0.3734 0.3898 1.92e-70 2vdg:A
29 1vbj:A 281 292 0.3580 0.4128 0.3973 5.46e-70 1vbj:B
30 3b3d:A 280 291 0.3704 0.4286 0.4124 1.17e-68 3b3d:B, 3b3d:C
31 3d3f:A 275 295 0.3796 0.4473 0.4169 7.91e-66 3d3f:B
32 5az1:A 327 305 0.3364 0.3333 0.3574 1.44e-61 5az0:A
33 5jgw:A 314 294 0.3519 0.3631 0.3878 1.11e-59 5jgw:B, 5jgw:C, 5jgw:D, 5jgy:A, 5jgy:B
34 1zgd:A 308 288 0.3642 0.3831 0.4097 1.13e-58 1zgd:B
35 1vp5:A 284 290 0.3117 0.3556 0.3483 1.38e-56 1vp5:B
36 2wzm:A 274 294 0.2963 0.3504 0.3265 2.21e-55 2wzm:B
37 3wbw:A 271 293 0.2840 0.3395 0.3140 1.17e-52 3wbw:B, 3wby:A, 3wby:B
38 1a80:A 277 289 0.3025 0.3538 0.3391 3.72e-51 1m9h:A
39 4ijr:A 328 308 0.3457 0.3415 0.3636 1.40e-50 4ijr:C
40 3wg6:A 299 306 0.3025 0.3278 0.3203 1.81e-40 3wg6:B, 3wg6:C, 3wg6:D
41 4h8n:A 303 273 0.2654 0.2838 0.3150 2.12e-34 4h8n:B
42 6kik:A 275 304 0.2840 0.3345 0.3026 1.11e-32 5dan:A, 6kiy:A, 6ky6:A, 6ky6:B
43 5c7h:A 281 293 0.2593 0.2989 0.2867 2.82e-25 4pmj:A
44 6cia:A 284 292 0.2747 0.3134 0.3048 1.23e-24 4wgh:A
45 8hnq:A 286 292 0.2099 0.2378 0.2329 5.07e-14
46 3v0s:A 287 298 0.2284 0.2578 0.2483 6.70e-14 3v0t:A
47 5t79:A 315 318 0.2346 0.2413 0.2390 4.94e-10 3erp:A, 3erp:B
48 1lqa:A 346 343 0.2562 0.2399 0.2420 1.01e-09 1lqa:B
49 1pz0:A 311 323 0.2377 0.2476 0.2384 1.30e-09
50 1pz1:A 333 333 0.2407 0.2342 0.2342 6.44e-09 1pz1:B
51 7bc1:A 295 221 0.1883 0.2068 0.2760 5.00e-08
52 8jwo:L 311 315 0.2160 0.2251 0.2222 5.71e-07 8jwk:H, 8jwo:A, 8jwo:C, 8jwo:D, 8jwo:E, 8jwo:G, 8jwo:I, 8jwo:K, 8jwo:M, 8jwo:O
53 6hg6:A 313 319 0.2037 0.2109 0.2069 1.17e-06
54 8hw0:A 329 232 0.1759 0.1733 0.2457 5.66e-06
55 8jwm:B 331 335 0.2160 0.2115 0.2090 1.40e-05 8jwk:D, 8jwk:J, 8jwk:L, 8jwk:N, 8jwk:P, 8jwl:C, 8jwl:H, 8jwm:A, 8jwm:C, 8jwm:D, 8jwm:E, 8jwm:F, 8jwm:G, 8jwm:H, 8jwn:A, 8jwn:B, 8jwn:C, 8jwn:D, 8jwn:E, 8jwn:F, 8jwn:G, 8jwn:H, 8jwo:B, 8jwo:F, 8jwo:H, 8jwo:J, 8jwo:N, 8jwo:P, 8xr4:A, 8xr4:B, 8xr4:C, 8xr4:D, 8xr4:E, 8xr4:F, 8xr4:G, 8xr4:H
56 7twz:A 298 249 0.2006 0.2181 0.2610 2.88e-05 7twz:B, 7twz:C, 7twz:D, 7twz:E, 7twz:F
57 7wf3:C 328 200 0.1512 0.1494 0.2450 3.22e-05 2a79:A, 3eau:A, 3eb3:A, 3eb4:A, 6ebk:A, 6ebk:C, 6ebk:E, 6ebk:G, 6ebl:A, 6ebl:C, 6ebl:E, 6ebl:G, 7ej1:A, 7ej1:C, 7ej1:E, 7ej1:G, 7ej2:A, 7ej2:C, 7ej2:E, 7ej2:G, 1exb:A, 4jta:A, 4jta:P, 4jtc:A, 4jtc:G, 4jtd:A, 4jtd:G, 3lnm:A, 3lnm:C, 3lut:A, 1qrq:A, 1qrq:B, 1qrq:C, 1qrq:D, 2r9r:A, 2r9r:G, 7sit:A, 7sit:C, 7siz:A, 7siz:C, 7wf3:G, 7wf3:I, 7wf3:M, 7wf4:G, 7wf4:I, 7wf4:M, 7wf4:o, 5wie:A, 5wie:G, 1zsx:A
58 1og6:C 298 252 0.2099 0.2282 0.2698 6.62e-04 1og6:A, 1og6:B
59 1gve:A 324 231 0.1636 0.1636 0.2294 0.001
60 8usu:A 316 229 0.1759 0.1804 0.2489 0.002 8usu:B
61 1ynp:B 298 181 0.1204 0.1309 0.2155 0.004 1ynp:A, 1ynq:A, 1ynq:B
62 8hle:A 380 101 0.0926 0.0789 0.2970 0.046 8hle:B, 5xkx:A, 5xky:A, 5y4k:A
63 2c91:A 325 135 0.1019 0.1015 0.2444 0.21 2bp1:A, 2bp1:B, 2bp1:C, 2bp1:D, 2c91:B, 2c91:C, 2c91:D, 2c91:E, 2c91:F, 2c91:G, 2c91:H, 2c91:I, 2c91:J
64 7ezi:A 323 115 0.0864 0.0867 0.2435 0.43 7ezl:A
65 2clp:A 323 142 0.0988 0.0991 0.2254 0.68 2clp:B, 2clp:C, 2clp:D, 2clp:E, 2clp:F, 2clp:G, 2clp:H, 2clp:I, 2clp:J, 2clp:K
66 4kf9:A 318 53 0.0586 0.0597 0.3585 1.5
67 2y27:B 427 91 0.0772 0.0585 0.2747 2.0 2y27:A, 2y4n:A, 2y4n:B
68 4exa:F 259 172 0.1358 0.1699 0.2558 7.4 4exa:A, 4exa:B, 4exa:C, 4exa:D, 4exa:E
69 3ecc:A 182 28 0.0401 0.0714 0.4643 8.7 3ec2:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218