Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
AAQTNAPWGLARISSTSPGTSTYYYDESAGQGSCVYVIDTGIEASHPEFEGRAQMVKTYYYSSRDGNGHGTHCAGTVGSR
TYGVAKKTQLFGVKVLDDNGSGQYSTIIAGMDFVASDKNNRNCPKGVVASLSLGGGYSSSVNSAAARLQSSGVMVAVAAG
NNNADARNYSPASEPSVCTVGASDRYDRRSSFSNYGSVLDIFGPGTDILSTWIGGSTRSISGTSMATPHVAGLAAYLMTL
GKTTAASACRYIADTANKGDLSNIPFGTVNLLAYNNYQA

The query sequence (length=279) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7a9f:A 279 279 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 7a9k:A, 7a9m:A, 3aj8:A, 3aj9:A, 5avj:A, 5b1d:A, 5b1e:A, 4b5l:A, 1bjr:E, 7c0p:A, 1cnm:A, 5cw1:A, 3d9q:X, 3ddz:X, 3de0:X, 3de1:X, 3de2:X, 3de5:X, 3de6:X, 3de7:X, 2dp4:E, 2dqk:A, 2duj:A, 3dvq:X, 3dvr:X, 3dvs:X, 3dw1:X, 3dw3:X, 3dwe:X, 3dyb:A, 8e52:AAA, 8e53:AAA, 1egq:A, 8f05:A, 8f06:A, 8f07:A, 6fjs:A, 4fon:A, 8fyo:A, 8fyp:A, 8fyq:A, 8fyr:A, 8fys:A, 2g4v:A, 3gt3:A, 3gt4:A, 2hd4:A, 2hpz:A, 1ht3:A, 3i2y:X, 3i30:X, 3i34:X, 3i37:X, 1ic6:A, 2id8:A, 6j43:A, 7jsy:A, 6k2p:A, 6k2r:A, 6k2s:A, 6k2t:A, 6k2v:A, 6k2w:A, 5k7s:A, 6k8m:E, 6kkf:A, 5kxu:A, 5kxv:A, 3l1k:A, 7ln7:A, 7lpt:A, 7lpu:A, 7lpv:A, 7lq8:A, 7lq9:A, 7lqa:A, 7lqb:A, 7lqc:A, 7ltd:A, 7lti:A, 7ltv:A, 7lu0:A, 7lu1:A, 7lu2:A, 7lu3:A, 6mh6:A, 5mjl:A, 6n4u:A, 7nuz:A, 3osz:A, 1oyo:A, 1p7v:A, 1p7w:A, 1pek:E, 1pfg:A, 1pj8:A, 2pq2:A, 6pq0:A, 6pq4:A, 2prk:A, 3prk:E, 1ptk:A, 3ptl:A, 6pu4:A, 6pu5:A, 2pwa:A, 2pwb:A, 2pyz:A, 3q40:A, 3q5g:A, 6qf1:A, 3qmp:A, 6qxv:A, 5rof:A, 5rol:A, 5ron:A, 5rop:A, 5roq:A, 5ror:A, 5row:A, 5rp6:A, 5rp7:A, 5rp9:A, 5rpa:A, 5rpc:A, 5rpd:A, 5rpg:A, 5rph:A, 5rpj:A, 5rpk:A, 5rpm:A, 6rug:A, 6ruh:A, 6ruk:A, 6run:A, 6ruw:A, 6rve:A, 6rvg:A, 6rzp:A, 7s4z:A, 8sdk:A, 7skx:C, 8sog:A, 8sou:A, 8sov:A, 8spl:A, 8sqv:A, 6txg:A, 5uvl:A, 2v8b:A, 6v8r:A, 5whw:A, 5wjg:A, 5wjh:A, 5wrc:A, 4zar:A, 6zet:AAA, 6zeu:AAA, 6zev:AAA
2 3f7o:A 284 275 0.6237 0.6127 0.6327 4.15e-115 3f7o:B
3 8gkp:C 282 277 0.4731 0.4681 0.4765 4.41e-75 8gkp:D, 8gkq:C, 8u45:C
4 5z6o:A 282 276 0.4875 0.4823 0.4928 7.76e-75
5 8c4x:A 276 275 0.4910 0.4964 0.4982 7.14e-70
6 5wsl:A 282 285 0.4803 0.4752 0.4702 8.41e-68 5wsl:B, 5wsl:C
7 4dzt:A 276 278 0.4839 0.4891 0.4856 5.51e-64
8 8c4z:B 282 265 0.4552 0.4504 0.4792 3.72e-59
9 2b6n:A 278 280 0.4229 0.4245 0.4214 1.97e-58
10 1s2n:A 281 278 0.4552 0.4520 0.4568 3.93e-56 1s2n:B, 1sh7:A, 1sh7:B
11 3whi:A 355 255 0.3477 0.2732 0.3804 1.92e-39 4dww:A, 5gl8:B, 1mee:A, 6o44:A, 6o44:B, 6pak:A, 6pak:B, 1scj:A, 3vyv:A, 3vyv:B, 3whi:B
12 1bh6:A 274 260 0.3513 0.3577 0.3769 6.01e-37
13 1dbi:A 271 233 0.3190 0.3284 0.3820 6.67e-36
14 5aqe:A 269 243 0.3477 0.3606 0.3992 1.95e-35 5arb:A, 5arc:A, 5ard:A, 3bx1:A, 3bx1:B, 1c9j:A, 1c9m:A, 1c9n:A, 4cfy:A, 4cfz:A, 4cg0:A, 1gci:A, 1iav:A, 1jea:A, 1mpt:A, 1ndq:A, 1ndu:A, 1q5p:A, 1st3:A, 1svn:A, 1tk2:A, 1wsd:A, 6y5s:A, 6y5t:A
15 1tec:E 279 247 0.3405 0.3405 0.3846 2.08e-35 2tec:E, 3tec:E, 1thm:A
16 6u26:B 479 211 0.2832 0.1649 0.3744 3.27e-33 7kev:B, 7kfa:B, 6u2n:B
17 6u2f:A 582 206 0.2796 0.1340 0.3786 1.10e-31 7kev:A, 7kfa:A, 4ne9:B, 4nmx:B, 5oca:A, 3p5b:A, 3p5c:A, 2qtw:B, 7s5g:B, 7s5h:B, 6u2p:B, 6u36:B, 6u38:B, 6u3i:A, 6u3x:B, 5vla:A, 5vlh:A, 5vlk:A, 5vll:A, 5vlp:A, 2w2m:A, 2w2n:A, 2w2q:A, 6xib:B, 6xic:B, 6xid:B, 6xie:B, 6xif:B, 2xtj:A
18 3wiv:C 397 293 0.3548 0.2494 0.3379 9.89e-30 3a3n:A, 3a3n:B, 3a3o:A, 3a3o:B, 3a3p:A, 3a3p:B, 2e1p:A, 4jp8:A, 3vhq:A, 3vv2:A, 3vv2:B, 3wiu:A, 3wiu:B, 3wiu:C, 3wiv:A, 3wiv:B, 2z2x:A, 2z2y:A, 2z2y:B, 2z2y:C, 2z2y:D, 2z2z:A, 2z30:A, 2z30:B, 2z56:A, 2z56:B, 2z57:A, 2z57:B, 2z58:A, 2z58:B, 2zrq:A, 2zwo:A, 2zwo:B, 2zwo:C, 2zwp:A, 2zwp:B
19 7y6m:C 290 233 0.2975 0.2862 0.3562 4.03e-29 7y6m:D
20 5ffn:A 311 280 0.3441 0.3087 0.3429 9.50e-29
21 6uai:S 266 211 0.2975 0.3120 0.3934 3.87e-27 6uao:S, 6ube:S
22 2xrm:A 301 230 0.2939 0.2724 0.3565 4.16e-27
23 3d43:B 310 269 0.3333 0.3000 0.3457 1.09e-26 3d43:A, 1ea7:A, 2ixt:A, 2ixt:B
24 8h7o:A 281 232 0.3082 0.3060 0.3707 1.47e-25 1a2q:A, 1ak9:A, 7am6:C, 7am7:C, 7am8:A, 1aqn:A, 1au9:A, 3bgo:S, 3cnq:S, 1dui:A, 8h7p:A, 1lw6:E, 5ox2:A, 1s01:A, 1s02:A, 1sbh:A, 1sbi:A, 1sbn:E, 1sib:E, 2sic:E, 3sic:E, 5sic:E, 2sni:E, 1st2:A, 2st1:A, 1sua:A, 1sub:A, 1sud:A, 1sue:A, 1sup:A, 1tm1:E, 1tm3:E, 1tm4:E, 1tm5:E, 1tm7:E, 1tmg:E, 1to1:E, 1to2:E, 1ubn:A, 1v5i:A, 1y1k:E, 1y33:E, 1y34:E, 1y3b:E, 1y3c:E, 1y3d:E, 1y3f:E, 1y48:E, 1y4a:E, 1y4d:E, 1yja:A, 1yjb:A, 1yjc:A
25 1af4:A 274 227 0.3047 0.3102 0.3744 1.93e-24 1be6:A, 1be8:A, 1bfk:A, 1bfu:A, 1c3l:A, 4c3u:A, 4c3v:A, 1cse:E, 6dwq:A, 4hx2:A, 4hx2:C, 1oyv:A, 1oyv:B, 1r0r:E, 1sbc:A, 1sca:A, 1scb:A, 1scd:A, 1scn:E, 1sel:A, 1sel:B, 2sec:E, 3unx:A, 2wuv:A, 2wuw:E, 1yu6:A, 1yu6:B
26 3afg:B 507 268 0.3154 0.1736 0.3284 4.60e-24 3afg:A
27 3lpa:A 340 193 0.2652 0.2176 0.3834 8.59e-22 3lpc:A, 3lpd:A
28 2gko:A 309 268 0.3154 0.2848 0.3284 7.55e-21
29 1r6v:A 671 276 0.2975 0.1237 0.3007 3.92e-20
30 7w2a:A 354 192 0.2545 0.2006 0.3698 4.87e-20 7w2a:B
31 3vv3:A 329 243 0.2688 0.2280 0.3086 1.91e-19 3vv3:B
32 3ti9:A 341 290 0.3333 0.2727 0.3207 2.56e-19 3ti7:A
33 1v6c:B 436 225 0.2437 0.1560 0.3022 2.71e-13 1v6c:A, 1wvm:A, 1wvm:B, 1y9z:A, 1y9z:B
34 1v6c:B 436 42 0.0681 0.0436 0.4524 1.5 1v6c:A, 1wvm:A, 1wvm:B, 1y9z:A, 1y9z:B
35 5yl7:A 339 196 0.2473 0.2035 0.3520 3.97e-12
36 8pol:B 479 290 0.2473 0.1441 0.2379 7.97e-12 4lvn:A, 4lvo:A, 8pol:A
37 4tr2:B 474 300 0.2688 0.1582 0.2500 1.41e-09 8coy:A, 8coy:B, 8coz:A, 8coz:B, 8cp0:A, 8qke:A, 8qke:B, 8qkg:A, 8qkg:B, 8qkj:A, 8qkj:B, 4tr2:A
38 8uw8:A 738 228 0.2258 0.0854 0.2763 1.77e-09
39 1wmd:A 434 258 0.2473 0.1590 0.2674 2.67e-07 5fax:A, 5fax:B, 5fbz:A, 5fbz:C, 1wme:A, 1wmf:A
40 4yn3:A 596 61 0.0896 0.0419 0.4098 1.31e-05 3vta:A, 3vta:B
41 4yn3:A 596 30 0.0466 0.0218 0.4333 9.6 3vta:A, 3vta:B
42 4akt:A 330 116 0.1326 0.1121 0.3190 1.48e-05
43 3t41:A 423 310 0.2796 0.1844 0.2516 3.38e-05 3t41:B
44 8e7f:A 614 320 0.2939 0.1336 0.2562 2.55e-04
45 8b4x:A 473 85 0.0968 0.0571 0.3176 6.96e-04 8b4v:A, 8b4w:A, 6eqv:A, 6eqw:A, 6eqx:A, 6hlb:A, 6hld:A, 6hle:A, 6hza:A, 6hzb:A, 6hzc:A, 6hzd:A, 5jmo:A, 5jmo:B, 5jxg:A, 5jxh:A, 5jxi:A, 5jxj:A, 7lcu:A, 5mim:A, 7o1u:A, 7o1w:A, 7o1y:A, 7o20:A, 7o22:A, 4omc:A, 4omc:B, 4omc:C, 4omc:D, 4omc:E, 4omc:F, 4omd:A, 4omd:B, 4omd:C, 4omd:D, 4omd:E, 4omd:F, 8oyh:A, 1p8j:A, 1p8j:D, 1p8j:B, 1p8j:C, 1p8j:E, 1p8j:F, 1p8j:G, 1p8j:H, 7qxy:A, 7qxz:A, 7qy0:A, 7qy1:A, 7qy2:A, 4ryd:A, 4ryd:B, 4ryd:C, 4ryd:D, 4ryd:E, 4ryd:F, 6yd2:A, 6yd3:A, 6yd4:A, 6yd7:A, 4z2a:A
46 8ehe:A 353 280 0.2509 0.1983 0.2500 0.002
47 7edd:A 1394 96 0.1219 0.0244 0.3542 0.002 5xyr:A
48 7edd:A 1394 181 0.1720 0.0344 0.2652 0.027 5xyr:A
49 5xya:A 1358 95 0.1147 0.0236 0.3368 0.002 5xxz:A
50 5xya:A 1358 182 0.1720 0.0353 0.2637 0.037 5xxz:A
51 6vjb:A 1346 96 0.1183 0.0245 0.3438 0.004
52 6vjb:A 1346 105 0.1183 0.0245 0.3143 0.079
53 3wqb:A 597 82 0.0896 0.0419 0.3049 0.016 3hjr:A
54 5xxz:B 1310 171 0.1720 0.0366 0.2807 0.022
55 7bj3:A 936 57 0.0753 0.0224 0.3684 0.043 8bty:A, 3eif:A, 1xf1:A, 1xf1:B, 7yzx:A
56 3i74:A 642 119 0.1290 0.0561 0.3025 0.39 3i74:B
57 3kof:A 316 50 0.0538 0.0475 0.3000 0.81 3kof:B, 4s2b:A, 4s2b:B, 4s2c:A, 4s2c:B
58 4m1z:A 317 254 0.2294 0.2019 0.2520 1.0 4m1z:B
59 1l3w:A 540 51 0.0609 0.0315 0.3333 1.4 1q55:A, 1q55:B, 1q55:C, 1q55:D, 1q5a:A, 1q5a:B, 1q5b:A, 1q5b:B, 1q5b:C, 1q5c:A, 1q5c:B, 1q5c:C, 1q5c:D
60 8opt:A 783 74 0.0681 0.0243 0.2568 1.9 8ops:A, 5w0m:B, 5w0n:C, 5w0o:A, 5w0o:B
61 8opp:A 670 74 0.0681 0.0284 0.2568 2.2
62 1r64:A 481 259 0.2007 0.1164 0.2162 2.3 2id4:A, 2id4:B, 1ot5:A, 1ot5:B, 1r64:B
63 2yik:A 493 33 0.0466 0.0264 0.3939 5.0
64 8og0:H 211 76 0.0789 0.1043 0.2895 5.0
65 5zrq:A 263 50 0.0538 0.0570 0.3000 6.6 7cef:A, 7cef:B, 7ceh:A, 7cts:A, 8ibl:A, 8ibl:B, 8ibm:A, 8ibm:B, 4wfj:A, 4wfk:A, 5zno:A, 5zno:B, 5zrr:A, 5zrs:A
66 7un9:G 241 39 0.0394 0.0456 0.2821 6.7
67 7un9:H 261 39 0.0394 0.0421 0.2821 6.8
68 7un8:A 297 39 0.0394 0.0370 0.2821 6.9 7un8:B, 7un8:C, 7un8:D, 7un8:E, 7un8:F, 7un9:A, 7un9:B, 7un9:C, 7un9:D, 7un9:I, 7un9:J, 7un9:E, 7un9:F, 7un9:K, 7un9:L, 7una:A, 7una:B, 7una:C
69 7una:D 143 39 0.0394 0.0769 0.2821 7.0 7una:E, 7una:F, 7una:G, 7una:H

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218