gtt
The query sequence (length=3) is searched through a non-redundant set of database sequences dna_nr.fasta.gz clustered at 100% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.
| # | Hit | Hit length |
Aligned length |
Identity (normalized by query) |
Identity (normalized by hit) |
Identity (normalized by aligned length) |
Alignment score |
Homologs to hit |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1nop:D | 3 | 3 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 6 | 1rff:D, 1rff:F, 1rg1:D, 1rg1:F, 7z3x:D |
| 2 | 1cbv:D | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | 2d7d:D, 5d8f:C, 5ith:B, 6jdg:E, 6jip:B, 5k83:I, 5k83:J, 5k83:H, 1krp:B, 1ksp:B, 1lau:D, 7lwa:B, 4mgu:C, 1noy:S, 5odn:P, 5odn:L, 5odp:N, 5odp:P, 8q44:C, 3udg:H, 3udg:I, 8v08:C, 8v08:D, 3vdy:D, 3vdy:G, 1xf2:T, 1xi1:C, 1xi1:D, 7z3x:E |
| 3 | 1d9f:B | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | 1 | |
| 4 | 1rc8:B | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | 1rfi:D, 1rfi:F, 1rgt:D, 1rgt:F, 1rrc:B, 8tp8:L, 8tp8:Y, 8tp8:J, 8tp8:K, 8tpk:L, 8tpk:Y |
| 5 | 1rg2:D | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | |
| 6 | 2wwy:R | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | |
| 7 | 4pe8:B | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | |
| 8 | 4z8f:A | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | 1 | |
| 9 | 5bnh:B | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | 1rgu:D |
| 10 | 6ajo:F | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | |
| 11 | 6is7:K | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | |
| 12 | 9ca0:E | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | 9ca1:E |
| 13 | 6jn0:B | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -1 | |
| 14 | 2fd8:B | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 2fdf:B, 2fdg:B, 2fdh:B, 2fdi:B, 2fdk:B, 3i2o:B, 4zhn:B |
| 15 | 3i3m:B | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 3i49:B, 8jnr:B |
| 16 | 3v9u:F | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 3v9u:G, 3v9u:H |
| 17 | 3v9w:E | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 3v9w:F, 3v9w:G, 3v9w:H |
| 18 | 4a8q:F | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 4a8s:F, 4a8w:G, 4a8y:G, 4mky:E, 4mky:G, 4mky:I, 4mky:K |
| 19 | 4iqv:C | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 4iqw:C, 4p4o:G |
| 20 | 5bnh:C | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 21 | 5cr2:E | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -4 | 5cr2:F |
| 22 | 5j37:F | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 5j37:G, 5j37:H, 5j37:I, 5j37:J, 4y00:H |
| 23 | 5xp8:C | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 5xq2:C, 5xq2:D |
| 24 | 6kij:A | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 25 | 8d94:F | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 8d94:G, 8d94:I, 7k5d:R |
| 26 | 8d9j:H | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 27 | 8fw7:A | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 28 | 6b5q:D | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -6 | 6b5q:E |
| 29 | 1cw0:N | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 30 | 1kfs:B | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 2kzz:B, 7u02:H, 6wic:U, 6wid:U, 6wie:U |
| 31 | 1rpz:B | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 32 | 2gm4:Z | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 2gm4:I, 4i2c:C, 4i2e:C, 8ojb:C, 8ojc:C, 3v9x:F, 3v9x:G, 3v9x:H, 1zr2:Z, 1zr2:I, 1zr4:Z, 1zr4:I, 1zr4:W, 1zr4:O |
| 33 | 2i5s:A | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 34 | 2kzm:B | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 35 | 3nh0:C | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 3nh0:D, 3v9s:C, 3v9s:D |
| 36 | 3nh1:G | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 3nh1:H |
| 37 | 3v9z:C | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 3v9z:D |
| 38 | 3zvm:F | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 39 | 4csa:G | 4 | 3 | 1.0000 | 0.7500 | 1.0000 | -9 | |
| 40 | 6kco:1O | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 6kco:2M, 6kco:1P, 6kco:1H, 6kco:4D, 6kco:7E, 6kco:4J, 6kco:3L, 6kco:9N, 6kco:6A, 6kco:7C, 6kco:8K |
| 41 | 6u6z:E | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -9 | 6u6z:F, 6u6z:G |
| 42 | 8q40:D | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 8q40:C |
| 43 | 8t9c:D | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 44 | 8wh6:T | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 45 | 1ehl:A | 2 | 2 | 0.6667 | 1.0000 | 1.0000 | -11 | 1i8m:D, 6j7y:C, 5k97:G, 6kcp:E, 3px7:B, 7q8a:E, 1rh0:D, 1rh0:F, 3u7h:X, 6wg6:M, 6wg6:N, 1xhz:F |
| 46 | 8d94:H | 2 | 2 | 0.6667 | 1.0000 | 1.0000 | -11 | 7q8a:D, 5w36:G |
| 47 | 3or3:D | 5 | 3 | 1.0000 | 0.6000 | 1.0000 | -13 | |
| 48 | 5y3m:F | 5 | 3 | 1.0000 | 0.6000 | 1.0000 | -13 | |
| 49 | 8axa:D | 5 | 3 | 1.0000 | 0.6000 | 1.0000 | -13 | |
| 50 | 8yey:D | 5 | 3 | 1.0000 | 0.6000 | 1.0000 | -13 | 8yey:B |
| 51 | 1kdh:D | 4 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -14 | |
| 52 | 2py5:L | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 53 | 3or3:F | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 54 | 3u58:E | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | 3u58:H, 3u58:F, 3u58:G |
| 55 | 3va3:D | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 56 | 4a76:F | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | 5chi:D, 5chi:E, 5chi:F, 1d8y:B, 5gkr:T, 4hqb:M, 6jiq:B, 1keg:A, 5odn:I, 5odn:M, 5odn:J, 5odn:K, 5odn:N, 5odn:Q, 5odp:O, 4pog:V, 4pso:X, 4pso:Z, 1rta:C, 4s0n:F, 4s0n:G, 4s0n:H, 3sz5:B, 3udg:F, 3vdy:C, 3vdy:E, 2vtb:K, 2vtb:L, 2y35:B, 4yox:B, 4yox:D, 4yox:F, 4yoy:B, 4yoy:D, 4yoy:F, 4z8f:E |
| 57 | 4q0r:D | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | 3zvn:E |
| 58 | 6ak8:P | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | 6ak9:P, 6akh:P, 7co6:P, 7co8:P, 7co9:P, 7coa:P, 7cob:P, 7coc:P, 3g2c:I, 7kss:P, 7ksz:P, 7kt0:P, 7kt3:P, 7kta:P, 7ktj:P, 7ktk:P, 4lzg:P, 4m04:P, 6p1m:P, 6p1n:P, 6p1p:P, 6p1r:P, 6p1t:P, 6p1v:P, 6p1w:P, 5twp:P, 5twr:P, 5txx:P, 6vez:P, 6vf3:P, 6vf7:P, 6vf8:P, 6vf9:P, 6vfa:P, 5vz7:P, 5vza:P, 5vzd:P, 5vzg:P, 6wic:P, 4ycx:P, 4yd1:P |
| 59 | 6is7:L | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | 6u6z:H |
| 60 | 6s48:D | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | 6s48:H |
| 61 | 6s48:F | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 62 | 6xb8:F | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 63 | 8wa1:Q | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 64 | 5izf:E | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -15 | |
| 65 | 1rg2:F | 2 | 2 | 0.3333 | 0.5000 | 0.5000 | -16 | 3u7g:X, 5v0d:E |
| 66 | 2dwm:F | 2 | 2 | 0.3333 | 0.5000 | 0.5000 | -16 | 8fw7:B, 3v9u:E |
| 67 | 2ok0:D | 2 | 2 | 0.3333 | 0.5000 | 0.5000 | -16 | 4tzd:H, 3u7f:X |
| 68 | 3ngz:C | 2 | 2 | 0.3333 | 0.5000 | 0.5000 | -16 | 3ngz:D, 1oup:G, 4p4p:D, 1rnb:C |
| 69 | 7odf:C | 2 | 2 | 0.3333 | 0.5000 | 0.5000 | -16 | 1rxv:C, 1rxv:D, 3va0:C, 3va0:D |
| 70 | 8d9j:F | 2 | 2 | 0.3333 | 0.5000 | 0.5000 | -16 | 8d9j:G, 8d9j:I, 1rgu:F, 6ws3:F |
| 71 | 8jnr:F | 2 | 2 | 0.3333 | 0.5000 | 0.5000 | -16 | |
| 72 | 2dwm:E | 1 | 1 | 0.3333 | 1.0000 | 1.0000 | -17 | 2dwm:G, 4ljr:D, 1nop:F |
| 73 | 2dwn:E | 1 | 1 | 0.3333 | 1.0000 | 1.0000 | -17 | 2dwn:F |
| 74 | 2py5:J | 6 | 3 | 1.0000 | 0.5000 | 1.0000 | -17 | |
| 75 | 2py5:Y | 6 | 3 | 1.0000 | 0.5000 | 1.0000 | -17 | 2py5:D, 2py5:E |
| 76 | 3wpe:C | 6 | 3 | 1.0000 | 0.5000 | 1.0000 | -17 | |
| 77 | 5o6b:C | 6 | 3 | 1.0000 | 0.5000 | 1.0000 | -17 | 5o6b:D |
| 78 | 5y3m:D | 6 | 3 | 1.0000 | 0.5000 | 1.0000 | -17 | 5y3m:C |
| 79 | 6a2h:B | 6 | 3 | 1.0000 | 0.5000 | 1.0000 | -17 | |
| 80 | 6xb8:E | 6 | 3 | 1.0000 | 0.5000 | 1.0000 | -17 | |
| 81 | 1hht:D | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | 1hht:E, 1hht:F, 2jlg:D, 2jlg:E |
| 82 | 1l2b:C | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | |
| 83 | 1qzg:C | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | 1qzg:D |
| 84 | 1rzt:C | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | 1rzt:G, 1rzt:K, 1rzt:O |
| 85 | 1u8b:B | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | |
| 86 | 1u8b:C | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | |
| 87 | 2nq9:C | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | |
| 88 | 2w36:D | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | 2w36:F |
| 89 | 2wwy:O | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | |
| 90 | 2xm3:H | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | 2xm3:J, 2xm3:L, 2xm3:N, 2xm3:P, 2xm3:R |
| 91 | 3dlb:X | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | 3dlb:Y |
| 92 | 3erc:E | 5 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -18 | 3erc:F |
| 93 | 3g3y:I | 5 | 3 | 0.3333 | 0.2000 | 0.3333 | -18 | |
| 94 | 3igc:C | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | |
| 95 | 3or3:C | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | |
| 96 | 3zvn:G | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | 3zvn:H, 3zvn:I |
| 97 | 4a75:B | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | 4a75:F, 4a76:H, 5gkp:C, 5gkp:D, 4hqb:N, 1i8m:T, 5ip3:D, 2nmv:D, 2pjr:C, 2pjr:D, 6s3h:E, 6s3i:C, 8s9i:B, 3udg:D, 3udg:E, 3udg:G, 2vtb:G, 2vtb:H, 2vtb:I, 2vtb:J, 1xhz:E, 1xhz:G, 1xhz:H, 5zkl:B |
| 98 | 4b5i:U | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | 4b5m:U, 4b5m:W, 4b5m:Y, 4iem:E, 4iem:H, 4iem:K, 4iem:N |
| 99 | 4fo6:I | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | 4p4m:D, 4xus:P |
| 100 | 4tup:D | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | 4tuq:D, 4tur:D, 4tus:D, 6u2o:D, 6u6b:D |
| 101 | 5hk3:C | 5 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -18 | |
| 102 | 5hlk:E | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | 1rvc:D, 1rvc:F, 1stx:D, 1stx:F, 1sx5:D, 1sx5:F |
| 103 | 5keg:B | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | |
| 104 | 5td5:C | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | |
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