gtg
The query sequence (length=3) is searched through a non-redundant set of database sequences dna_nr.fasta.gz clustered at 100% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.
| # | Hit | Hit length |
Aligned length |
Identity (normalized by query) |
Identity (normalized by hit) |
Identity (normalized by aligned length) |
Alignment score |
Homologs to hit |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 5bnh:B | 3 | 3 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 6 | 1rgu:D |
| 2 | 1nop:D | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | 1rff:D, 1rff:F, 1rg1:D, 1rg1:F, 7z3x:D |
| 3 | 1rc8:B | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | 1rfi:D, 1rfi:F, 1rgt:D, 1rgt:F, 1rrc:B, 8tp8:L, 8tp8:Y, 8tp8:J, 8tp8:K, 8tpk:L, 8tpk:Y |
| 4 | 1rg2:D | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | |
| 5 | 4a8q:F | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | 4a8s:F, 4a8w:G, 4a8y:G, 4mky:E, 4mky:G, 4mky:I, 4mky:K |
| 6 | 5bnh:C | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | |
| 7 | 8d9j:H | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | |
| 8 | 1cbv:D | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 2d7d:D, 5d8f:C, 5ith:B, 6jdg:E, 6jip:B, 5k83:I, 5k83:J, 5k83:H, 1krp:B, 1ksp:B, 1lau:D, 7lwa:B, 4mgu:C, 1noy:S, 5odn:P, 5odn:L, 5odp:N, 5odp:P, 8q44:C, 3udg:H, 3udg:I, 8v08:C, 8v08:D, 3vdy:D, 3vdy:G, 1xf2:T, 1xi1:C, 1xi1:D, 7z3x:E |
| 9 | 1d9f:B | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -4 | |
| 10 | 1kfs:B | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 2kzz:B, 7u02:H, 6wic:U, 6wid:U, 6wie:U |
| 11 | 2wwy:R | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 12 | 3nh1:G | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 3nh1:H |
| 13 | 3v9w:E | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 3v9w:F, 3v9w:G, 3v9w:H |
| 14 | 4iqv:C | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 4iqw:C, 4p4o:G |
| 15 | 4pe8:B | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 16 | 4z8f:A | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 17 | 5cr2:E | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -4 | 5cr2:F |
| 18 | 6ajo:F | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 19 | 6is7:K | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 20 | 6kij:A | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 21 | 9ca0:E | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 9ca1:E |
| 22 | 6b5q:D | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -6 | 6b5q:E |
| 23 | 6jn0:B | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -6 | |
| 24 | 1cw0:N | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 25 | 1rpz:B | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 26 | 2fd8:B | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 2fdf:B, 2fdg:B, 2fdh:B, 2fdi:B, 2fdk:B, 3i2o:B, 4zhn:B |
| 27 | 2gm4:Z | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 2gm4:I, 4i2c:C, 4i2e:C, 8ojb:C, 8ojc:C, 3v9x:F, 3v9x:G, 3v9x:H, 1zr2:Z, 1zr2:I, 1zr4:Z, 1zr4:I, 1zr4:W, 1zr4:O |
| 28 | 2i5s:A | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 29 | 2kzm:B | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 30 | 3i3m:B | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 3i49:B, 8jnr:B |
| 31 | 3nh0:C | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 3nh0:D, 3v9s:C, 3v9s:D |
| 32 | 3v9u:F | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 3v9u:G, 3v9u:H |
| 33 | 3v9z:C | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 3v9z:D |
| 34 | 3zvm:F | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 35 | 5j37:F | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 5j37:G, 5j37:H, 5j37:I, 5j37:J, 4y00:H |
| 36 | 5xp8:C | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 5xq2:C, 5xq2:D |
| 37 | 6kco:1O | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 6kco:2M, 6kco:1P, 6kco:1H, 6kco:4D, 6kco:7E, 6kco:4J, 6kco:3L, 6kco:9N, 6kco:6A, 6kco:7C, 6kco:8K |
| 38 | 6s48:D | 4 | 3 | 1.0000 | 0.7500 | 1.0000 | -9 | 6s48:H |
| 39 | 6s48:F | 4 | 3 | 1.0000 | 0.7500 | 1.0000 | -9 | |
| 40 | 8d94:F | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 8d94:G, 8d94:I, 7k5d:R |
| 41 | 8fw7:A | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 42 | 8q40:D | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 8q40:C |
| 43 | 8t9c:D | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 44 | 8wh6:T | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 45 | 7odf:C | 2 | 2 | 0.6667 | 1.0000 | 1.0000 | -11 | 1rxv:C, 1rxv:D, 3va0:C, 3va0:D |
| 46 | 8d94:H | 2 | 2 | 0.6667 | 1.0000 | 1.0000 | -11 | 7q8a:D, 5w36:G |
| 47 | 8d9j:F | 2 | 2 | 0.6667 | 1.0000 | 1.0000 | -11 | 8d9j:G, 8d9j:I, 1rgu:F, 6ws3:F |
| 48 | 1rzt:C | 5 | 3 | 1.0000 | 0.6000 | 1.0000 | -13 | 1rzt:G, 1rzt:K, 1rzt:O |
| 49 | 4tup:D | 5 | 3 | 1.0000 | 0.6000 | 1.0000 | -13 | 4tuq:D, 4tur:D, 4tus:D, 6u2o:D, 6u6b:D |
| 50 | 6bel:D | 5 | 3 | 1.0000 | 0.6000 | 1.0000 | -13 | 6bem:D, 5bol:D, 5bom:D, 1bpx:D, 1bpy:D, 1bpz:D, 5bpc:D, 6bte:D, 6btf:D, 3c2k:D, 3c2l:D, 3c2m:D, 6cly:D, 6cpq:D, 6cr3:D, 6cr4:D, 6cr5:D, 6cr6:D, 6cr7:D, 6cr8:D, 6cr9:D, 6crb:D, 6crc:D, 6crh:D, 6cti:D, 6ctj:D, 6ctk:D, 6ctl:D, 6ctm:D, 6ctn:D, 6cto:D, 6ctp:D, 6ctq:D, 6ctr:D, 6ctt:D, 6ctu:D, 6ctv:D, 6ctw:D, 6ctx:D, 6cu9:D, 6cua:D, 6cub:D, 5db6:D, 5db7:D, 5db8:D, 5db9:D, 5dba:D, 5dbb:D, 5dbc:D, 6dia:D, 6dic:D, 4do9:D, 4doa:D, 4dob:D, 4doc:D, 6e3r:D, 6e3v:D, 6e3w:D, 6e3x:D, 5eoz:D, 4f5n:D, 4f5o:D, 4f5p:D, 4f5q:D, 4f5r:D, 4f5r:C, 2fmp:D, 2fmq:D, 2fms:D, 6g2q:D, 3gdx:D, 4gxi:D, 4gxj:D, 4gxk:D, 5hhh:D, 5hhi:D, 2i9g:D, 2iso:D, 2isp:D, 3isb:D, 3isc:D, 3isd:D, 5j0o:D, 5j0p:D, 5j0q:D, 5j0r:D, 5j0s:D, 5j0t:D, 5j0u:D, 5j0w:D, 5j0x:D, 5j0y:D, 5j29:D, 5j2a:D, 5j2b:D, 5j2c:D, 5j2d:D, 5j2e:D, 5j2f:D, 5j2g:D, 5j2h:D, 5j2i:D, 5j2j:D, 5j2k:D, 3jpn:D, 3jpo:D, 3jpp:D, 3jpq:D, 3jpr:D, 3jps:D, 3jpt:D, 4jwm:D, 4jwn:D, 7k96:D, 7k97:D, 4kld:D, 4kle:D, 4klf:D, 4klg:D, 4klh:D, 4kli:D, 4klj:D, 4kll:D, 4klm:D, 4klo:D, 4klq:D, 4kls:D, 4klt:D, 4klu:D, 3lk9:D, 4lvs:D, 4m2y:D, 4m47:D, 4m9g:D, 4m9h:D, 4m9j:D, 4m9l:D, 4m9n:D, 3mby:D, 4mf2:D, 4mf8:D, 4mfa:D, 4mfc:D, 4mff:D, 1mq2:D, 1mq3:D, 6mr7:D, 6mr8:D, 7mz0:D, 7mz1:D, 7mz2:D, 7mz3:D, 7mz4:D, 7mz8:D, 6n2r:D, 6n2s:D, 6n2t:D, 6nkr:D, 6nks:D, 6nkt:D, 4nlk:D, 4nln:D, 4nlz:D, 4nm1:D, 4nm2:D, 4nxz:D, 4ny8:D, 4o5c:D, 4o5e:D, 4o5k:D, 4o9m:D, 4p2h:D, 4pgq:D, 4pgx:D, 4pgy:D, 4ph5:D, 4pha:D, 4phd:D, 4phe:D, 4php:D, 6ph5:D, 6ph6:D, 6pkz:D, 4ppx:D, 2pxi:D, 4r63:D, 4r64:D, 4r65:D, 4r66:D, 7rbe:D, 7rbf:D, 7rbg:D, 7rbh:D, 7rbi:D, 7rbj:D, 7rbk:D, 7rbl:D, 7rbm:D, 7rbn:D, 7rbo:D, 3rh4:D, 3rh5:D, 3rh6:D, 3rje:D, 3rjf:D, 3rjg:D, 3rjh:D, 3rji:D, 3rjj:D, 3rjk:D, 4rpx:D, 4rpy:D, 4rpz:D, 4rq0:D, 4rq1:D, 4rq2:D, 4rq3:D, 4rq4:D, 4rq5:D, 4rq6:D, 4rq7:D, 4rq8:D, 4rt2:D, 4rt3:D, 7s9j:D, 7s9k:D, 7s9l:D, 7s9m:D, 7s9n:D, 7s9o:D, 7s9p:D, 7s9q:D, 5tb8:D, 5tb9:D, 5tba:D, 5tbb:D, 5tbc:D, 3tfr:D, 3tfs:D, 1tv9:D, 1tva:D, 5tzv:D, 5u2r:D, 5u2s:D, 5u2t:D, 5u8g:D, 5u8h:D, 5u8i:D, 5u9h:D, 4uaw:D, 4uay:D, 4uaz:D, 4ub1:D, 4ub2:D, 4ub3:D, 4ub4:D, 4ub5:D, 4ubb:D, 4ubc:D, 5ugn:D, 5ugo:D, 5ugp:D, 6uok:E, 6uok:D, 6uol:D, 6uom:D, 5v1f:D, 5v1g:D, 5v1h:D, 5v1i:D, 5v1j:D, 5v1n:D, 5v1o:D, 5v1p:D, 5v1r:D, 5vez:D, 8vf8:D, 8vf9:D, 8vfa:D, 8vfb:D, 8vfc:D, 8vfd:D, 8vfe:D, 8vff:D, 8vfg:D, 8vfh:D, 8vfi:D, 8vfj:D, 5vrw:D, 5vrx:D, 5vry:D, 5vrz:D, 5vs0:D, 5vs1:D, 5vs2:D, 5vs3:D, 5vs4:D, 6w2m:D, 5wnx:D, 5wny:D, 5wnz:D, 5wo0:D, 4ymm:D, 4ymn:D, 4ymo:D, 4yn4:D, 4z6c:D, 4z6d:D, 4z6e:D, 4z6f:D, 1zjm:D, 1zjn:D |
| 51 | 8dvf:T | 5 | 3 | 1.0000 | 0.6000 | 1.0000 | -13 | 8dvi:T, 8dw6:T |
| 52 | 1fiu:E | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | 1fiu:F, 1fiu:G, 1fiu:H |
| 53 | 1k8g:D | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | 1k8g:E |
| 54 | 2kfn:B | 4 | 3 | 0.3333 | 0.2500 | 0.3333 | -14 | 2kfz:B |
| 55 | 2l4l:B | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 56 | 2z70:B | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 57 | 3bam:D | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 58 | 3mxi:C | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | 3mxi:D, 3mxm:C, 3mxm:D, 2oa8:C, 2oa8:D, 3u3y:C, 3u3y:D, 3u6f:C, 3u6f:D |
| 59 | 3or3:F | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 60 | 3u58:E | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | 3u58:H, 3u58:F, 3u58:G |
| 61 | 3zda:B | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 62 | 4a8f:G | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | 4a8s:G |
| 63 | 4csa:G | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 64 | 4q0r:D | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | 3zvn:E |
| 65 | 4qm7:C | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 66 | 4y00:G | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | 4y0f:D |
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