gta
The query sequence (length=3) is searched through a non-redundant set of database sequences dna_nr.fasta.gz clustered at 100% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.
| # | Hit | Hit length |
Aligned length |
Identity (normalized by query) |
Identity (normalized by hit) |
Identity (normalized by aligned length) |
Alignment score |
Homologs to hit |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1rg2:D | 3 | 3 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 6 | |
| 2 | 1nop:D | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | 1rff:D, 1rff:F, 1rg1:D, 1rg1:F, 7z3x:D |
| 3 | 1rc8:B | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | 1rfi:D, 1rfi:F, 1rgt:D, 1rgt:F, 1rrc:B, 8tp8:L, 8tp8:Y, 8tp8:J, 8tp8:K, 8tpk:L, 8tpk:Y |
| 4 | 3v9w:E | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | 3v9w:F, 3v9w:G, 3v9w:H |
| 5 | 5bnh:B | 3 | 3 | 0.6667 | 0.6667 | 0.6667 | 1 | 1rgu:D |
| 6 | 5cr2:E | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | 1 | 5cr2:F |
| 7 | 1cbv:D | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 2d7d:D, 5d8f:C, 5ith:B, 6jdg:E, 6jip:B, 5k83:I, 5k83:J, 5k83:H, 1krp:B, 1ksp:B, 1lau:D, 7lwa:B, 4mgu:C, 1noy:S, 5odn:P, 5odn:L, 5odp:N, 5odp:P, 8q44:C, 3udg:H, 3udg:I, 8v08:C, 8v08:D, 3vdy:D, 3vdy:G, 1xf2:T, 1xi1:C, 1xi1:D, 7z3x:E |
| 8 | 1d9f:B | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -4 | |
| 9 | 2gm4:Z | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 2gm4:I, 4i2c:C, 4i2e:C, 8ojb:C, 8ojc:C, 3v9x:F, 3v9x:G, 3v9x:H, 1zr2:Z, 1zr2:I, 1zr4:Z, 1zr4:I, 1zr4:W, 1zr4:O |
| 10 | 2i5s:A | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 11 | 2wwy:R | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 12 | 4a8q:F | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 4a8s:F, 4a8w:G, 4a8y:G, 4mky:E, 4mky:G, 4mky:I, 4mky:K |
| 13 | 4iqv:C | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 4iqw:C, 4p4o:G |
| 14 | 4pe8:B | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 15 | 4z8f:A | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 16 | 5bnh:C | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 17 | 6ajo:F | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 18 | 6is7:K | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 19 | 6kij:A | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 20 | 8d9j:H | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 21 | 8q40:D | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 8q40:C |
| 22 | 8t9c:D | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | |
| 23 | 9ca0:E | 3 | 3 | 0.3333 | 0.3333 | 0.3333 | -4 | 9ca1:E |
| 24 | 6b5q:D | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -6 | 6b5q:E |
| 25 | 6jn0:B | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -6 | |
| 26 | 1cw0:N | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 27 | 1kfs:B | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 2kzz:B, 7u02:H, 6wic:U, 6wid:U, 6wie:U |
| 28 | 1rpz:B | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 29 | 2fd8:B | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 2fdf:B, 2fdg:B, 2fdh:B, 2fdi:B, 2fdk:B, 3i2o:B, 4zhn:B |
| 30 | 2kzm:B | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 31 | 3i3m:B | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 3i49:B, 8jnr:B |
| 32 | 3nh0:C | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 3nh0:D, 3v9s:C, 3v9s:D |
| 33 | 3nh1:G | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 3nh1:H |
| 34 | 3v9u:F | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 3v9u:G, 3v9u:H |
| 35 | 3v9z:C | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 3v9z:D |
| 36 | 3zvm:F | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 37 | 4q0r:D | 4 | 3 | 1.0000 | 0.7500 | 1.0000 | -9 | 3zvn:E |
| 38 | 5j37:F | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 5j37:G, 5j37:H, 5j37:I, 5j37:J, 4y00:H |
| 39 | 5xp8:C | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 5xq2:C, 5xq2:D |
| 40 | 6ak8:P | 4 | 3 | 1.0000 | 0.7500 | 1.0000 | -9 | 6ak9:P, 6akh:P, 7co6:P, 7co8:P, 7co9:P, 7coa:P, 7cob:P, 7coc:P, 3g2c:I, 7kss:P, 7ksz:P, 7kt0:P, 7kt3:P, 7kta:P, 7ktj:P, 7ktk:P, 4lzg:P, 4m04:P, 6p1m:P, 6p1n:P, 6p1p:P, 6p1r:P, 6p1t:P, 6p1v:P, 6p1w:P, 5twp:P, 5twr:P, 5txx:P, 6vez:P, 6vf3:P, 6vf7:P, 6vf8:P, 6vf9:P, 6vfa:P, 5vz7:P, 5vza:P, 5vzd:P, 5vzg:P, 6wic:P, 4ycx:P, 4yd1:P |
| 41 | 6kco:1O | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 6kco:2M, 6kco:1P, 6kco:1H, 6kco:4D, 6kco:7E, 6kco:4J, 6kco:3L, 6kco:9N, 6kco:6A, 6kco:7C, 6kco:8K |
| 42 | 6s48:D | 4 | 3 | 1.0000 | 0.7500 | 1.0000 | -9 | 6s48:H |
| 43 | 8d94:F | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | 8d94:G, 8d94:I, 7k5d:R |
| 44 | 8fw7:A | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 45 | 8wh6:T | 3 | 3 | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | -9 | |
| 46 | 1rg2:F | 2 | 2 | 0.6667 | 1.0000 | 1.0000 | -11 | 3u7g:X, 5v0d:E |
| 47 | 8d94:H | 2 | 2 | 0.6667 | 1.0000 | 1.0000 | -11 | 7q8a:D, 5w36:G |
| 48 | 1l2b:C | 5 | 3 | 1.0000 | 0.6000 | 1.0000 | -13 | |
| 49 | 1qzg:C | 5 | 3 | 1.0000 | 0.6000 | 1.0000 | -13 | 1qzg:D |
| 50 | 2w36:D | 5 | 3 | 1.0000 | 0.6000 | 1.0000 | -13 | 2w36:F |
| 51 | 2wwy:O | 5 | 3 | 1.0000 | 0.6000 | 1.0000 | -13 | |
| 52 | 3dlb:X | 5 | 3 | 1.0000 | 0.6000 | 1.0000 | -13 | 3dlb:Y |
| 53 | 3or3:D | 5 | 3 | 1.0000 | 0.6000 | 1.0000 | -13 | |
| 54 | 4fo6:I | 5 | 3 | 1.0000 | 0.6000 | 1.0000 | -13 | 4p4m:D, 4xus:P |
| 55 | 1de9:X | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | 1de9:U |
| 56 | 1rcn:D | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 57 | 2w42:S | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 58 | 3a4k:E | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | 3a4k:G, 3a4k:I, 3a4k:K, 3wvk:E, 3wvk:G, 3wvk:I, 3wvk:K, 3wvp:O, 3wvp:P, 3wvp:S, 3wvp:T |
| 59 | 3or3:E | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 60 | 3or3:F | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 61 | 4csa:G | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 62 | 6s48:F | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 63 | 6u6z:E | 4 | 3 | 0.3333 | 0.2500 | 0.3333 | -14 | 6u6z:F, 6u6z:G |
| 64 | 6ws3:E | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 65 | 7ujl:B | 4 | 3 | 0.6667 | 0.5000 | 0.6667 | -14 | |
| 66 | 5izf:E | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -15 | |
| 67 | 1ehl:A | 2 | 2 | 0.3333 | 0.5000 | 0.5000 | -16 | 1i8m:D, 6j7y:C, 5k97:G, 6kcp:E, 3px7:B, 7q8a:E, 1rh0:D, 1rh0:F, 3u7h:X, 6wg6:M, 6wg6:N, 1xhz:F |
| 68 | 2dwm:F | 2 | 2 | 0.3333 | 0.5000 | 0.5000 | -16 | 8fw7:B, 3v9u:E |
| 69 | 2ok0:D | 2 | 2 | 0.3333 | 0.5000 | 0.5000 | -16 | 4tzd:H, 3u7f:X |
| 70 | 3ngz:C | 2 | 2 | 0.3333 | 0.5000 | 0.5000 | -16 | 3ngz:D, 1oup:G, 4p4p:D, 1rnb:C |
| 71 | 3ra4:D | 2 | 2 | 0.3333 | 0.5000 | 0.5000 | -16 | 3ra9:D |
| 72 | 4i2b:C | 2 | 2 | 0.3333 | 0.5000 | 0.5000 | -16 | 4i2h:C, 6rcn:C, 8suk:J, 8suk:K |
| 73 | 7odf:C | 2 | 2 | 0.3333 | 0.5000 | 0.5000 | -16 | 1rxv:C, 1rxv:D, 3va0:C, 3va0:D |
| 74 | 8d9j:F | 2 | 2 | 0.3333 | 0.5000 | 0.5000 | -16 | 8d9j:G, 8d9j:I, 1rgu:F, 6ws3:F |
| 75 | 8jnr:F | 2 | 2 | 0.3333 | 0.5000 | 0.5000 | -16 | |
| 76 | 2d7g:E | 1 | 1 | 0.3333 | 1.0000 | 1.0000 | -17 | 2d7g:F, 2d7g:G, 2d7g:H |
| 77 | 2dwn:E | 1 | 1 | 0.3333 | 1.0000 | 1.0000 | -17 | 2dwn:F |
| 78 | 2w42:Q | 6 | 3 | 1.0000 | 0.5000 | 1.0000 | -17 | |
| 79 | 4lup:D | 6 | 3 | 1.0000 | 0.5000 | 1.0000 | -17 | |
| 80 | 5ca7:T | 6 | 3 | 1.0000 | 0.5000 | 1.0000 | -17 | 5chg:T, 5cj7:T, 5cp2:T, 5cr0:T, 5ddm:T, 4xq8:T, 4xrh:T |
| 81 | 5or5:B | 6 | 3 | 1.0000 | 0.5000 | 1.0000 | -17 | |
| 82 | 6a2h:B | 6 | 3 | 1.0000 | 0.5000 | 1.0000 | -17 | |
| 83 | 1rzt:C | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | 1rzt:G, 1rzt:K, 1rzt:O |
| 84 | 1tez:N | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | 1tez:P |
| 85 | 2f03:H | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | |
| 86 | 2fdc:D | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | |
| 87 | 3nh1:F | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | |
| 88 | 3zvn:G | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | 3zvn:H, 3zvn:I |
| 89 | 4tup:D | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | 4tuq:D, 4tur:D, 4tus:D, 6u2o:D, 6u6b:D |
| 90 | 5chz:B | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | |
| 91 | 5fb2:B | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | |
| 92 | 5w35:D | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | |
| 93 | 5y3m:F | 5 | 3 | 0.6667 | 0.4000 | 0.6667 | -18 | |
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