Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 168 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 1 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    1 6uwi:A (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    2 6uwi:A (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    3 6uwi:A (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    4 6uwi:A (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    5 6uwi:A (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    6 6uwi:A (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    7 6uwi:B (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    8 6uwi:B (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    9 6uwi:B (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    10 6uwi:B (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    11 6uwi:B (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    12 6uwi:B (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    13 6uwi:C (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    14 6uwi:C (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    15 6uwi:C (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    16 6uwi:C (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    17 6uwi:C (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    18 6uwi:C (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    19 6uwi:D (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    20 6uwi:D (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    21 6uwi:D (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    22 6uwi:D (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    23 6uwi:D (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    24 6uwi:D (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    25 6uwi:E (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    26 6uwi:E (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    27 6uwi:E (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    28 6uwi:E (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    29 6uwi:E (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    30 6uwi:E (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    31 6uwi:F (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    32 6uwi:F (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    33 6uwi:F (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    34 6uwi:F (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    35 6uwi:F (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    36 6uwi:F (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    37 6uwi:G (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    38 6uwi:G (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    39 6uwi:G (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    40 6uwi:G (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    41 6uwi:G (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    42 6uwi:G (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    43 6uwi:H (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    44 6uwi:H (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    45 6uwi:H (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    46 6uwi:H (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    47 6uwi:H (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    48 6uwi:H (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    49 6uwi:I (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    50 6uwi:I (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    51 6uwi:I (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    52 6uwi:I (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    53 6uwi:I (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    54 6uwi:I (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    55 6uwi:J (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    56 6uwi:J (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    57 6uwi:J (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    58 6uwi:J (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    59 6uwi:J (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    60 6uwi:J (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    61 6uwi:K (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    62 6uwi:K (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    63 6uwi:K (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    64 6uwi:K (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    65 6uwi:K (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    66 6uwi:K (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    67 6uwi:L (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    68 6uwi:L (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    69 6uwi:L (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    70 6uwi:L (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    71 6uwi:L (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    72 6uwi:L (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    73 6uwi:M (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    74 6uwi:M (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    75 6uwi:M (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    76 6uwi:M (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    77 6uwi:M (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    78 6uwi:M (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    79 6uwi:N (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    80 6uwi:N (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    81 6uwi:N (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    82 6uwi:N (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    83 6uwi:N (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    84 6uwi:N (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    85 6uwi:a (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    86 6uwi:a (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    87 6uwi:a (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    88 6uwi:a (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    89 6uwi:a (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    90 6uwi:a (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    91 6uwi:b (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    92 6uwi:b (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    93 6uwi:b (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    94 6uwi:b (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    95 6uwi:b (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    96 6uwi:b (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    97 6uwi:c (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    98 6uwi:c (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    99 6uwi:c (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    100 6uwi:c (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    101 6uwi:c (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    102 6uwi:c (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    103 6uwi:d (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    104 6uwi:d (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    105 6uwi:d (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    106 6uwi:d (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    107 6uwi:d (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    108 6uwi:d (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    109 6uwi:e (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    110 6uwi:e (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    111 6uwi:e (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    112 6uwi:e (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    113 6uwi:e (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    114 6uwi:e (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    115 6uwi:f (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    116 6uwi:f (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    117 6uwi:f (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    118 6uwi:f (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    119 6uwi:f (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    120 6uwi:f (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    121 6uwi:g (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    122 6uwi:g (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    123 6uwi:g (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    124 6uwi:g (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    125 6uwi:g (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    126 6uwi:g (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    127 6uwi:h (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    128 6uwi:h (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    129 6uwi:h (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    130 6uwi:h (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    131 6uwi:h (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    132 6uwi:h (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    133 6uwi:i (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    134 6uwi:i (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    135 6uwi:i (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    136 6uwi:i (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    137 6uwi:i (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    138 6uwi:i (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    139 6uwi:j (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140 6uwi:j (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    141 6uwi:j (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    142 6uwi:j (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    143 6uwi:j (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    144 6uwi:j (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    145 6uwi:k (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    146 6uwi:k (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    147 6uwi:k (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    148 6uwi:k (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    149 6uwi:k (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    150 6uwi:k (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    151 6uwi:l (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    152 6uwi:l (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    153 6uwi:l (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    154 6uwi:l (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    155 6uwi:l (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    156 6uwi:l (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    157 6uwi:m (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    158 6uwi:m (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    159 6uwi:m (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    160 6uwi:m (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    161 6uwi:m (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    162 6uwi:m (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    163 6uwi:n (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    164 6uwi:n (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    165 6uwi:n (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    166 6uwi:n (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    167 6uwi:n (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    168 6uwi:n (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218